NFYC - NFYC

NFYC
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1N1J, 4AWL, 4CSR
Идентификаторы
Псевдонимы	NFYC, CBF-C, CBFC, H1TF2A, HAP5, HSM, NF-YC, субъединица Y ядерного транскрипционного фактора гамма
Внешние идентификаторы	OMIM: 605344 MGI: 107901 ГомолоГен: 7440 Генные карты: NFYC
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1п34.2 Начните 40,691,648 бп[1] Конец 40,771,603 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 4 (мышь)[2] Группа 4 D2.2 | 4 56,52 см Начните 120,757,438 бп[2] Конец 120,831,572 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II • Связывание ДНК • GO: 0001105 активность коактиватора транскрипции • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • GO: 0001948 связывание с белками • активность гетеродимеризации белков • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • связывание фактора транскрипции • последовательное связывание ДНК Сотовый компонент • CCAAT-связывающий факторный комплекс • белок-ДНК комплекс • ядро клетки • нуклеоплазма • Комплекс факторов транскрипции РНК-полимеразы II Биологический процесс • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • сворачивание белка • транскрипция, ДНК-шаблон • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • регуляция процесса биосинтеза холестерина • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	4802	18046
Ансамбль	ENSG00000066136	ENSMUSG00000032897
UniProt	Q13952	P70353
RefSeq (мРНК)	NM_001142587 NM_001142588 NM_001142589 NM_001142590 NM_001308114 NM_001308115 NM_014223	NM_001048168 NM_001277095 NM_008692 NM_001357192 NM_001357193 NM_001357194
RefSeq (белок)	NP_001136059 NP_001136060 NP_001136061 NP_001136062 NP_001295043 NP_001295044 NP_055038	NP_001041633 NP_001264024 NP_032718 NP_001344121 NP_001344122 NP_001344123
Расположение (UCSC)	Chr 1: 40.69 - 40.77 Мб	Chr 4: 120,76 - 120,83 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Субъединица фактора ядерной транскрипции Y гамма это белок что у людей кодируется NFYC ген.^[5][6][7]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, представляет собой одну субъединицу тримерного комплекса, образующего высококонсервативный фактор транскрипции связывается с высокой специфичностью CCAAT мотивы в промоутер регионы во множестве генов. Этот генный продукт, субъединица C, образует плотный димер с субъединицей B (NFYB ), что является предпосылкой для субъединицы A (NFYA ) ассоциация. Полученный тример связывается с ДНК с высокой специфичностью и аффинностью. Каждая из субъединиц B и C содержит гистон -подобный мотив. Наблюдение за гистоновой природой этих субъединиц подтверждается двумя типами доказательств; выравнивание последовательностей белков и эксперименты с мутантами. Дополнительная регуляция, предварительно поддержанная базой данных EST, может быть представлена ​​альтернативным сплайсингом в этой субъединице.^[7]

Два микроРНК; miR-30c и miR-30e расположены внутри интроны из nfyc ген. Эти микроРНК активно транскрибируются в продуцирующих человеческий инсулин бета-клетки в островки поджелудочной железы которые также демонстрируют высокую экспрессию nfyc и CDH1 гены. Экспрессия этих интронных микроРНК важна для поддержания дифференцированного фенотипа островковых бета-клеток человека. Ингибирование микроРНК семейства miR-30 индуцирует эпителиально-мезенхимальный переход клеток островков поджелудочной железы человека.^[8]

Взаимодействия

NFYC было показано взаимодействовать с участием Мой с.^[9]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000066136 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032897 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Синха С., Мэйти С. Н., Селдин М. Ф., де Кромбруге Б. (февраль 1997 г.). «Хромосомное назначение и тканевая экспрессия CBF-C / NFY-C, третьей субъединицы CCAAT-связывающего фактора млекопитающих». Геномика. 37 (2): 260–3. Дои:10.1006 / geno.1996.0555. PMID  8921405.
6. Беллорини М., Земзуми К., Фарина А., Бертельсен Дж., Пьяджио Дж., Мантовани Р. (август 1997 г.). «Клонирование и экспрессия человеческого NF-YC». Ген. 193 (1): 119–25. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00109-1. PMID  9249075.
7. «Ген Entrez: фактор ядерной транскрипции NFYC Y, гамма».
8. Джоглекар М. В., Патил Д., Джоглекар В. М., Рао Г. В., Редди Д. Н., Митнала С., Шуш Й., Хардикар А. А. (сентябрь – октябрь 2009 г.). «МикроРНК семейства miR-30 придают эпителиальный фенотип клеткам поджелудочной железы человека». Островки. 1 (2): 137–147. Дои:10.4161 / isl.1.2.9578. PMID  21099261.
9. Тайра Т., Савай М., Икеда М., Тамай К., Игучи-Арига С.М., Арига Х. (август 1999 г.). «Зависимое от клеточного цикла переключение на повышающую и понижающую регуляцию экспрессии гена hsp70 человека посредством взаимодействия между c-Myc и CBF / NF-Y». J. Biol. Chem. 274 (34): 24270–9. Дои:10.1074 / jbc.274.34.24270. PMID  10446203.

дальнейшее чтение

• Мантовани Р. (1999). «Молекулярная биология CCAAT-связывающего фактора NF-Y». Ген. 239 (1): 15–27. Дои:10.1016 / S0378-1119 (99) 00368-6. PMID  10571030.
• Мартинелли Р., Хайнц Н. (1994). «H1TF2A, большая субъединица гетеродимерного, богатого глутамином CCAAT-связывающего фактора транскрипции, участвующего в регуляции клеточного цикла гистона H1». Мол. Cell. Биол. 14 (12): 8322–32. Дои:10.1128 / mcb.14.12.8322. ЧВК  359371. PMID  7969168.
• Накшатри Х., Бхат-Накшатри П., Карри Р.А. (1997). «Субъединичная ассоциация и активность связывания ДНК гетеротримерного фактора транскрипции NF-Y регулируется клеточным окислительно-восстановительным потенциалом». J. Biol. Chem. 271 (46): 28784–91. Дои:10.1074 / jbc.271.46.28784. PMID  8910521.
• Дмитренко В, Гарифулин О, Кавсан В (1997). «Выделение и анализ последовательности кДНК, кодирующей субъединицу C человеческого фактора транскрипции, связывающего CCAAT». Ген. 197 (1–2): 161–3. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00255-2. PMID  9332362.
• Карри Р.А. (1998). «Функциональное взаимодействие между доменом тримеризации ДНК-связывающей субъединицы NF-Y и белком группы высокой подвижности HMG-I (Y)». J. Biol. Chem. 272 (49): 30880–8. Дои:10.1074 / jbc.272.49.30880. PMID  9388234.
• Тайра Т., Савай М., Икеда М., Тамай К., Игучи-Арига С.М., Арига Х. (1999). «Зависимое от клеточного цикла переключение на повышающую и понижающую регуляцию экспрессии гена hsp70 человека посредством взаимодействия между c-Myc и CBF / NF-Y». J. Biol. Chem. 274 (34): 24270–9. Дои:10.1074 / jbc.274.34.24270. PMID  10446203.
• Йошида Х., Окада Т., Хейз К., Янаги Х., Юра Т, Негиси М., Мори К. (2001). «Стресс-индуцированное эндоплазматическим ретикулумом образование комплекса факторов транскрипции ERSF, включающего NF-Y (CBF) и активирующие факторы транскрипции 6альфа и 6бета, которые активируют ответ развернутого белка млекопитающих». Мол. Cell. Биол. 21 (4): 1239–48. Дои:10.1128 / MCB.21.4.1239-1248.2001. ЧВК  99577. PMID  11158310.
• Идзуми Х., Моландер С., Пенн Л.З., Исисаки А., Коно К., Фуна К. (2001). «Механизм репрессии транскрипции c-Myc на бета-рецепторе PDGF». J. Cell Sci. 114 (Pt 8): 1533–44. PMID  11282029.
• Чен Ф, Огава К., Лю X, Stringfield TM, Чен Y (2002). «Подавление трансактивирующей активности Smad2 и Smad3 за счет ассоциации с новым вариантом сплайсинга субъединицы фактора C связывания CCAAT». Biochem. J. 364 (Pt 2): 571–7. Дои:10.1042 / BJ20011703. ЧВК  1222603. PMID  12023901.
• Ромье C, Cocchiarella F, Mantovani R, Moras D (2003). «Структура NF-YB / NF-YC дает представление о связывании ДНК и регуляции транскрипции с помощью фактора CCAAT NF-Y». J. Biol. Chem. 278 (2): 1336–45. Дои:10.1074 / jbc.M209635200. PMID  12401788.
• Сальси В., Каретти Г., Васнер М., Райнхард В., Хаугвиц Ю., Энгеланд К., Мантовани Р. (2003). «Взаимодействие между p300 и множественными тримерами NF-Y регулирует функцию промотора циклина B2». J. Biol. Chem. 278 (9): 6642–50. Дои:10.1074 / jbc.M210065200. PMID  12482752.
• Хиросе Т., Сова И., Такахаши С., Сайто С., Ясуда С., Синдо Н., Фуруичи К., Сакаи Т. (2003). «p53-независимая индукция Gadd45 ингибитором гистондеацетилазы: координирующая регуляция транскрипционными факторами Oct-1 и NF-Y». Онкоген. 22 (49): 7762–73. Дои:10.1038 / sj.onc.1207091. PMID  14586402.
• Chattopadhyay C, Hawke D, Kobayashi R, Maity SN (2004). «Человеческий p32, взаимодействует с субъединицей B CCAAT-связывающего фактора, CBF / NF-Y, и ингибирует CBF-опосредованную активацию транскрипции in vitro». Нуклеиновые кислоты Res. 32 (12): 3632–41. Дои:10.1093 / нар / гх692. ЧВК  484179. PMID  15243141.
• Ван Б., Гао С., Пондер КП (2005). «C / EBPbeta способствует индуцированной фактором роста гепатоцитов репликации гепатоцитов грызунов». J. Hepatol. 43 (2): 294–302. Дои:10.1016 / j.jhep.2005.02.029. PMID  15922473.

внешние ссылки

• NFYC + белок, + человек в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.