FOXA3 - FOXA3

FOXA3
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1VTN
Идентификаторы
Псевдонимы	FOXA3, FKHH3, HNF3G, TCF3G, вилочная коробка A3
Внешние идентификаторы	OMIM: 602295 MGI: 1347477 ГомолоГен: 3308 Генные карты: FOXA3
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек)[1] Группа 19q13.32 Начинать 45,863,989 бп[1] Конец 45,873,797 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 7 (мышь)[2] Группа 7 A3 | 7 9,46 см Начинать 19,013,284 бп[2] Конец 19,023,538 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • последовательное связывание ДНК • Связывание ДНК • связывание фактора транскрипции • специфическое связывание белкового домена • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II Сотовый компонент • нуклеоплазма • актиновый цитоскелет • ядро клетки Биологический процесс • клеточный гомеостаз глюкозы • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • клеточный ответ на голодание • развитие многоклеточного организма • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • транскрипция, ДНК-шаблон • сперматогенез • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • морфогенез анатомической структуры • дифференциация клеток • организация хроматина Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	3171	15377
Ансамбль	ENSG00000170608	ENSMUSG00000040891
UniProt	P55318	P35584
RefSeq (мРНК)	NM_004497	NM_008260
RefSeq (белок)	NP_004488	NP_032286
Расположение (UCSC)	Chr 19: 45,86 - 45,87 Мб	Chr 7: 19.01 - 19.02 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Ядерный фактор гепатоцитов 3-гамма (HNF-3G), также известный как вилка для протеина A3 (FOXA3) или фактор транскрипции 3G (TCF-3G) - это белок что у людей кодируется FOXA3 ген.^[5][6]

Функция

HNF-3G является членом вилка ДНК-связывающих белков. Эти ядерные факторы гепатоцитов являются активаторами транскрипции для печеночно-специфичных транскриптов, таких как альбумин и транстиретин, и они также взаимодействуют с хроматин. Подобные члены семейства у мышей играют роль в регуляции метаболизма и дифференцировке поджелудочной железы и печени.^[5]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000170608 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000040891 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. "Entrez Gene: вилка A3".
6. Минчева А., Лихтер П., Шютц Г., Кестнер К. Х. (февраль 1997 г.). «Присвоение человеческих генов ядерного фактора гепатоцитов 3-альфа, -бета и -гамма (HNF3A, HNF3B, HNF3G) 14q12-q13, 20p11 и 19q13.2-q13.4». Геномика. 39 (3): 417–9. Дои:10.1006 / geno.1996.4477. PMID  9119385.

дальнейшее чтение

• Коррочер Р., Тедеско Ф, Рабусин П., Де Сандре Дж. (1975). «Влияние стромы эритроцитов человека на активацию комплемента». Br. J. Haematol. 29 (2): 235–41. Дои:10.1111 / j.1365-2141.1975.tb01817.x. PMID  33. S2CID  45491647.
• Вершуур М., де Йонг М., Фелида Л. и др. (2005). «Участок ядерного фактора-3 гепатоцитов в промоторе фибриногена бета важен для индуцированной интерлейкином 6 экспрессии, и на его активность влияет соседний полиморфизм -148C / T». J. Biol. Chem. 280 (17): 16763–71. Дои:10.1074 / jbc.M501973200. PMID  15737987.
• Кларк К.Л., Халай Э.Д., Лай Э., Берли С.К. (1993). «Сокристаллическая структура ДНК-распознавающего мотива HNF-3 / вилки головы напоминает гистон H5». Природа. 364 (6436): 412–20. Дои:10.1038 / 364412a0. PMID  8332212. S2CID  4363526.
• Цянь X, Коста Р.Х. (1995). «Анализ доменов бета-белка ядерного фактора-3 гепатоцитов, необходимых для активации транскрипции и ядерного нацеливания». Нуклеиновые кислоты Res. 23 (7): 1184–91. Дои:10.1093 / nar / 23.7.1184. ЧВК  306829. PMID  7739897.
• Родригес-Антона С., Борт Р., Ховер Р. и др. (2003). «Транскрипционная регуляция базовой экспрессии человеческого CYP3A4 с помощью CCAAT энхансер-связывающего белка альфа и ядерного фактора гепатоцитов-3 гамма». Мол. Pharmacol. 63 (5): 1180–9. Дои:10.1124 / моль.63.5.1180. PMID  12695546.
• Ламба В., Панетта Дж. К., Стром С., Шютц Э. Г. (2010). «Генетические предикторы вариабельности экспрессии CYP3A4 в печени». J. Pharmacol. Exp. Ther. 332 (3): 1088–99. Дои:10.1124 / jpet.109.160804. ЧВК  2835441. PMID  19934400.
• Хори Й, Гу Икс, Се Икс, Ким СК (2005). «Дифференциация инсулин-продуцирующих клеток от клеток-предшественников нейронов человека». PLOS Med. 2 (4): e103. Дои:10.1371 / journal.pmed.0020103. ЧВК  1087208. PMID  15839736.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Motallebipour M, Ameur A, Reddy Bysani MS и др. (2009). «Дифференциальное связывание и паттерн совместного связывания FOXA1 и FOXA3 и их связь с H3K4me3 в клетках HepG2, выявленная с помощью ChIP-seq». Геном Биол. 10 (11): R129. Дои:10.1186 / gb-2009-10-11-r129. ЧВК  3091322. PMID  19919681.
• Чжоу Б., Чжун К., Мину П. и др. (2008). «Foxp2 ингибирует Nkx2.1-опосредованную транскрипцию SP-C посредством взаимодействия с гомеодоменом Nkx2.1». Являюсь. J. Respir. Cell Mol. Биол. 38 (6): 750–8. Дои:10.1165 / rcmb.2007-0350OC. ЧВК  2396252. PMID  18239190.
• Навас М.А., Вайсс С., Богер С. и др. (2000). «Гены HNF-3 человека: клонирование, частичная последовательность и скрининг мутаций у пациентов с нарушенным гомеостазом глюкозы». Гм. Наследник. 50 (6): 370–81. Дои:10.1159/000022943. PMID  10899756. S2CID  24745151.
• Kaestner KH (2000). «Семейство ядерного фактора гепатоцита 3 (HNF3 или FOXA) в метаболизме». Тенденции Endocrinol. Метаб. 11 (7): 281–5. Дои:10.1016 / S1043-2760 (00) 00271-X. PMID  10920385. S2CID  40600315.
• Линь Б., Моррис Д. В., Чжоу Ю. Ю. (1997). «Роль HNF1alpha, HNF3gamma и циклического AMP в активации гена глюкозо-6-фосфатазы». Биохимия. 36 (46): 14096–106. Дои:10.1021 / bi9703249. PMID  9369482.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Dintilhac A, Bernués J (2002). «HMGB1 взаимодействует со многими очевидно неродственными белками, распознавая короткие аминокислотные последовательности». J. Biol. Chem. 277 (9): 7021–8. Дои:10.1074 / jbc.M108417200. PMID  11748221.
• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2002). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Kaestner KH, Hiemisch H, Schütz G (1998). «Целенаправленное нарушение гена, кодирующего ядерный фактор гепатоцитов 3gamma, приводит к снижению транскрипции генов, специфичных для гепатоцитов». Мол. Клетка. Биол. 18 (7): 4245–51. Дои:10.1128 / mcb.18.7.4245. ЧВК  109008. PMID  9632808.
• Хромас Р., Мур Дж., Джонстон Т. и др. (1993). «Гомологи вилочной головки дрозофилы экспрессируются ограниченным по клону способом в гемопоэтических клетках человека». Кровь. 81 (11): 2854–9. Дои:10.1182 / blood.V81.11.2854.2854. PMID  8499623.

внешняя ссылка

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: P55318 (Ядерный фактор гепатоцитов 3-гамма) на PDBe-KB.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.