IRF7 - IRF7

IRF7
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2O61
Идентификаторы
Псевдонимы	IRF7, IRF-7H, IRF7A, IRF7B, IRF7C, IRF7H, IMD39, фактор регуляции интерферона 7, IRF-7
Внешние идентификаторы	OMIM: 605047 MGI: 1859212 ГомолоГен: 128624 Генные карты: IRF7
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 11 (человек)[1] Группа 11p15.5 Начинать 612,553 бп[1] Конец 615,983 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 7 (мышь)[2] Группа 7 | 7 F5 Начинать 141,262,706 бп[2] Конец 141,266,481 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание ДНК с последовательностью корового промотора РНК-полимеразы II • активность фактора транскрипции, связывание с последовательностью проксимальной области корового промотора РНК-полимеразы II • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II • GO: 0001158 Связывание проксимальной области корового промотора с последовательностью ДНК Сотовый компонент • нуклеоплазма • эндосомная мембрана • ядро клетки • цитоплазма • цитозоль Биологический процесс • позитивная регуляция опосредованного интерфероном сигнального пути I типа • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • положительное регулирование выработки интерферона-альфа • Сигнальный путь MDA-5 • интерферон-гамма-опосредованный сигнальный путь • иммунная система • регуляция адаптивного иммунного ответа • ответ на вирус • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция, ДНК-шаблон • регулирование выработки интерферона I типа • клеточный ответ на стимул повреждения ДНК • TRIF-зависимый сигнальный путь толл-подобных рецепторов • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • отрицательная регуляция процесса апоптоза макрофагов • сигнальный путь интерферона I типа • иммуноглобулиновый иммунный ответ • установление вирусной латентности • регуляция иммунного ответа • GO: 0022415 вирусный процесс • регуляция дифференцировки моноцитов • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • положительное регулирование выработки интерферона-бета • производство интерферона-бета • регуляция MyD88-независимого сигнального пути толл-подобных рецепторов • положительное регулирование выработки интерферона I типа • врожденная иммунная система • регуляция MyD88-зависимого сигнального пути толл-подобных рецепторов • производство интерферона-альфа • защитный ответ на вирус • регуляция экспрессии генов Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	3665	54123
Ансамбль	ENSG00000276561 ENSG00000185507	ENSMUSG00000025498
UniProt	Q92985	P70434
RefSeq (мРНК)	NM_001572 NM_004029 NM_004030 NM_004031	NM_001252600 NM_001252601 NM_016850
RefSeq (белок)	NP_001563 NP_004020 NP_004022	NP_001239529 NP_001239530 NP_058546
Расположение (UCSC)	Chr 11: 0,61 - 0,62 Мб	Chr 7: 141.26 - 141.27 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Регуляторный фактор интерферона 7, также известный как IRF7, является членом регуляторный фактор интерферона семья факторы транскрипции.

Функция

IRF7 кодирует фактор регуляции 7 интерферона, член семейства факторов регуляции транскрипции интерферона (IRF). Было показано, что IRF7 играет роль в транскрипционной активации вирус-индуцируемые клеточные гены, в том числе интерферон I типа гены. В частности, IRF7 регулирует многие интерферон-альфа гены.^[5] Конститутивная экспрессия IRF7 в значительной степени ограничена лимфоидная ткань, в основном плазмацитоидные дендритные клетки, тогда как IRF7 индуцируется во многих тканях. Идентифицировано несколько вариантов транскрипта IRF7, хотя их функциональные последствия еще не установлены.^[6]

Было показано, что путь IRF7 подавляется в некоторых линиях клеток метастатического рака молочной железы, что может помочь клеткам избежать иммунного ответа хозяина.^[7] Восстановление IRF7 в этих клеточных линиях уменьшало метастазы и увеличивало время выживания хозяина в моделях на животных.

Было показано, что ген и продукт IRF7 являются дефектными у пациента с тяжелой восприимчивостью к H1N1. грипп, в то время как восприимчивость к другим вирусным заболеваниям, таким как ЦМВ, РСВ и парагрипп не пострадали.^[8]

Взаимодействия

IRF7 был показан взаимодействовать с IRF3.^[9] Также было показано, что IRF7 взаимодействует с Белок, взаимодействующий с арилуглеводородным рецептором (AIP), который является негативным регулятором противовирусного пути.^[10]

Смотрите также

• Факторы регуляции интерферона

Рекомендации

1. ENSG00000185507 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000276561, ENSG00000185507 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000025498 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Марие I, Дурбин Дж. Э., Леви Д. Е. (ноябрь 1998 г.). «Дифференциальная вирусная индукция отдельных генов интерферона-альфа по положительной обратной связи через фактор регуляции интерферона-7». Журнал EMBO. 17 (22): 6660–9. Дои:10.1093 / emboj / 17.22.6660. ЧВК  1171011. PMID  9822609.
6. «Энтрез Ген: фактор 7 регуляции интерферона IRF7».
7. Бидуэлл (2012). «Замалчивание путей Irf7 в клетках рака груди способствует метастазированию в кости за счет ускользания иммунной системы». Природа Медицина. 18 (8): 1224–1231. Дои:10,1038 / нм 2830. PMID  22820642. S2CID  6727932.
8. Ciancanelli MJ, Huang SX, Luthra P, Garner H, Itan Y, Volpi S, Lafaille FG, Trouillet C, Schmolke M, Albrecht RA, Israelsson E, Lim HK, Casadio M, Hermesh T, Lorenzo L, Leung LW, Pedergnana V , Boisson B, Okada S, Picard C, Ringuier B, Troussier F, Chaussabel D, Abel L, Pellier I, Notarangelo LD, García-Sastre A, Basler CF, Geissmann F, Zhang SY, Snoeck HW, Casanova JL (апрель 2015 г. ). «Инфекционное заболевание. Опасный для жизни грипп и нарушение амплификации интерферона при дефиците IRF7 у человека». Наука. 348 (6233): 448–53. Дои:10.1126 / science.aaa1578. ЧВК  4431581. PMID  25814066.
9. Au WC, Yeow WS, Pitha PM (февраль 2001 г.). «Анализ функциональных доменов фактора регуляции интерферона 7 и его связь с IRF-3». Вирусология. 280 (2): 273–82. Дои:10.1006 / viro.2000.0782. PMID  11162841.
10. Чжоу К., Лаворгна А., Боуман М., Хискотт Дж., Хархадж Е.В. (июнь 2015 г.). «Белок, взаимодействующий с арилуглеводородным рецептором, нацелен на IRF7 для подавления передачи противовирусных сигналов и индукции интерферона I типа». Журнал биологической химии. 290 (23): 14729–39. Дои:10.1074 / jbc.M114.633065. ЧВК  4505538. PMID  25911105.

дальнейшее чтение

• Нинг С., Пагано Дж. С., Барбер Г. Н. (сентябрь 2011 г.). «IRF7: активация, регулировка, модификация и функция». Гены и иммунитет. 12 (6): 399–414. Дои:10.1038 / gene.2011.21. ЧВК  4437765. PMID  21490621.
• Pitha PM, Au WC, Lowther W, Juang YT, Schafer SL, Burysek L, Hiscott J, Moore PA (1999). «Роль факторов регуляции интерферона (IRF) в вирусной передаче сигналов и регуляции роста клеток». Биохимия. 80 (8–9): 651–8. Дои:10.1016 / S0300-9084 (99) 80018-2. PMID  9865487.
• Чжан Л., Pagano JS (январь 2002 г.). «Устройство и функции ИРФ-7». Журнал исследований интерферона и цитокинов. 22 (1): 95–101. Дои:10.1089/107999002753452700. PMID  11846980.
• Чжан Л., Пагано Дж.С. (октябрь 1997 г.). «IRF-7, новый фактор регуляции интерферона, связанный с латентным периодом вируса Эпштейна-Барра». Молекулярная и клеточная биология. 17 (10): 5748–57. Дои:10.1128 / MCB.17.10.5748. ЧВК  232423. PMID  9315633.
• Уотелет М.Г., Лин С.Х., Парех Б.С., Ронко Л.В., Хоули П.М., Маниатис Т. (март 1998 г.). «Вирусная инфекция индуцирует сборку скоординированно активированных факторов транскрипции на энхансере IFN-бета in vivo». Молекулярная клетка. 1 (4): 507–18. Дои:10.1016 / S1097-2765 (00) 80051-9. PMID  9660935.
• Au WC, Мур PA, LaFleur DW, Tombal B, Pitha PM (октябрь 1998 г.). «Характеристика регуляторного фактора интерферона-7 и его потенциальной роли в активации транскрипции генов интерферона А». Журнал биологической химии. 273 (44): 29210–7. Дои:10.1074 / jbc.273.44.29210. PMID  9786932.
• Лу Р., Ау В.С., Йео В.С., Хагеман Н., Пита П.М. (октябрь 2000 г.). «Регулирование промоторной активности гена фактора регуляции интерферона-7. Активация интерфероном и подавление его гиперметилированием». Журнал биологической химии. 275 (41): 31805–12. Дои:10.1074 / jbc.M005288200. PMID  10924517.
• Пэрис MJ, Williams BR (октябрь 2000 г.). «Характеристика контига размером 500 т.п.н., охватывающего область между c-Ha-Ras и MUC2 на хромосоме 11p15.5». Геномика. 69 (2): 196–202. Дои:10.1006 / geno.2000.6339. PMID  11031102.
• Мари I, Смит Э., Пракаш А., Леви Д.Е. (декабрь 2000 г.). «Индуцированная фосфорилированием димеризация фактора регуляции интерферона 7 разоблачает связывание ДНК и домен двусторонней трансактивации». Молекулярная и клеточная биология. 20 (23): 8803–14. Дои:10.1128 / MCB.20.23.8803-8814.2000. ЧВК  86519. PMID  11073981.
• Смит Э. Дж., Марие I, Пракаш А., Гарсия-Састре А., Леви Д. Е. (март 2001 г.). «Фосфорилирование IRF3 и IRF7 в инфицированных вирусом клетках не требует двухцепочечной РНК-зависимой протеинкиназы R или Ikappa B киназы, но блокируется белком E3L вируса осповакцины». Журнал биологической химии. 276 (12): 8951–7. Дои:10.1074 / jbc.M008717200. PMID  11124948.
• Au WC, Yeow WS, Pitha PM (февраль 2001 г.). «Анализ функциональных доменов фактора регуляции интерферона 7 и его связь с IRF-3». Вирусология. 280 (2): 273–82. Дои:10.1006 / viro.2000.0782. PMID  11162841.
• Лу Р, Мур PA, Pitha PM (май 2002 г.). «Стимуляция экспрессии гена IRF-7 с помощью фактора некроза опухоли альфа: потребность в факторе транскрипции NFkappa B и доступность гена». Журнал биологической химии. 277 (19): 16592–8. Дои:10.1074 / jbc.M111440200. PMID  11877397.
• Морин П., Браганса Дж., Банду М.Т., Лин Р., Хискотт Дж., Доли Дж., Сивас А. (март 2002 г.). «Предпочтительные сайты связывания для факторов регуляции интерферона 3 и 7, участвующих в транскрипции гена интерферона-А». Журнал молекулярной биологии. 316 (5): 1009–22. Дои:10.1006 / jmbi.2001.5401. PMID  11884139.
• Кайо А., Пракаш А., Смит Э., Масуми А., Ованесян А.Г., Леви Д.Е., Мари I (декабрь 2002 г.). «Ацетилирование фактора-7, регулирующего интерферон, с помощью фактора, ассоциированного с p300 / CREB-связывающим белком (CBP) (PCAF), нарушает его связывание с ДНК». Журнал биологической химии. 277 (51): 49417–21. Дои:10.1074 / jbc.M207484200. PMID  12374802.
• Измайлова Э., Бертли Ф.М., Хуанг К., Макори Н., Миллер С.Дж., Янг Р.А., Альдовини А. (февраль 2003 г.). «ВИЧ-1 Tat перепрограммирует незрелые дендритные клетки для экспрессии хемоаттрактантов для активированных Т-клеток и макрофагов». Природа Медицина. 9 (2): 191–7. Дои:10,1038 / нм 822. PMID  12539042. S2CID  26145639.
• Ян Х., Лин Ч., Ма Г, Баффи МО, Уотелет М.Г. (май 2003 г.). «Фактор-7, регулирующий интерферон, взаимодействует с другими факторами транскрипции за счет множественных взаимодействий с коактиваторами p300 / CBP». Журнал биологической химии. 278 (18): 15495–504. Дои:10.1074 / jbc.M212940200. PMID  12604599.
• Нинг С., Хан А.М., Хуйе Л.Э., Пагано Дж.С. (сентябрь 2003 г.). «Интерфероновый регуляторный фактор 7 регулирует экспрессию латентного мембранного белка 1 вируса Эпштейна-Барра: регуляторный контур». Журнал вирусологии. 77 (17): 9359–68. Дои:10.1128 / JVI.77.17.9359-9368.2003. ЧВК  187426. PMID  12915551.
• Фицджеральд К.А., Роу, округ Колумбия, Барнс Б.Дж., Кэффри Д.Р., Визинтин А., Латц Э., Монах Б., Пита П.М., Голенбок Д.Т. (октябрь 2003 г.). «Сигнализация LPS-TLR4 для IRF-3/7 и NF-kappaB включает в себя платные адаптеры TRAM и TRIF». Журнал экспериментальной медицины. 198 (7): 1043–55. Дои:10.1084 / jem.20031023. ЧВК  2194210. PMID  14517278.
• Лин Р., Нойс Р. С., Коллинз С. Е., Эверетт Р. Д., Моссман К. Л. (февраль 2004 г.). «Пальцевый домен ICP0 RING вируса простого герпеса ингибирует IRF3- и IRF7-опосредованную активацию генов, стимулированных интерфероном». Журнал вирусологии. 78 (4): 1675–84. Дои:10.1128 / JVI.78.4.1675-1684.2004. ЧВК  369457. PMID  14747533.

внешняя ссылка

• СМИ, связанные с Регуляторный фактор интерферона-7 в Wikimedia Commons
• IRF7 + белок, + человек в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.