SOCS5 - SOCS5

SOCS5
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2N34
Идентификаторы
Псевдонимы	SOCS5, CIS6, CISH6, Cish5, SOCS-5, супрессор передачи сигналов цитокинов 5
Внешние идентификаторы	OMIM: 607094 MGI: 2385459 ГомолоГен: 10495 Генные карты: SOCS5
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2п21 Начинать 46,698,952 бп[1] Конец 46,780,245 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 17 (мышь)[2] Группа 17 | 17 E4 Начинать 87,107,679 бп[2] Конец 87,137,839 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • связывание рецептора эпидермального фактора роста • активность ингибитора протеинкиназы • связывание рецепторной тирозинкиназы • GO: 0001948 связывание с белками • Активность регулятора 1-фосфатидилинозитол-3-киназы Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • фосфатидилинозитол-3-киназный комплекс Биологический процесс • Каскад JAK-STAT • GO: 0007243 внутриклеточная передача сигнала • сигнальный путь рецептора эпидермального фактора роста • отрицательная регуляция активности рецепторов, активируемых эпидермальным фактором роста • рост клеток • убиквитинирование белков • регулирование роста • положительная регуляция протеасомного убиквитин-зависимого белкового катаболического процесса • отрицательная регуляция каскада JAK-STAT • отрицательная регуляция дифференцировки Т-хелперов 2 клеток • положительная регуляция дифференцировки Т-хелперов 1 клетки • отрицательная регуляция передачи сигнала • отрицательная регуляция продукции интерлейкина-6 • отрицательная регуляция воспалительного ответа • клеточный ответ на стимул липопротеинов низкой плотности • отрицательная регуляция продукции хемотаксического белка-1 моноцитами • реакция эндотелиальных клеток сосудов на напряжение сдвига жидкости • посттрансляционная модификация • цитокин-опосредованный сигнальный путь • регуляция активности фосфатидилинозитол-3-киназы • фосфатидилинозитол фосфорилирование Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	9655	56468
Ансамбль	ENSG00000171150	ENSMUSG00000037104
UniProt	O75159	O54928
RefSeq (мРНК)	NM_144949 NM_014011	NM_019654
RefSeq (белок)	NP_054730 NP_659198	NP_062628
Расположение (UCSC)	Chr 2: 46,7 - 46,78 Мб	Chr 17: 87.11 - 87.14 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Супрессор передачи сигналов цитокинов 5 это белок что у людей кодируется SOCS5 ген.^[5][6][7]

Белок, кодируемый этим геном, содержит SH2 домен и домен SOCS BOX. Таким образом, белок принадлежит к супрессор передачи сигналов цитокинов (SOCS), также известное как семейство белков STAT-индуцированных ингибиторов STAT (SSI). Известно, что члены семейства SOCS индуцируются цитокинами. негативные регуляторы из цитокин сигнализация. Специфическая функция этого белка еще не определена. Два попеременно соединенных варианты расшифровки кодируют идентичный белок.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000171150 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000037104 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Исикава К., Нагасе Т., Суяма М., Миядзима Н., Танака А., Котани Х., Номура Н., Охара О. (декабрь 1998 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. X. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro». ДНК Res. 5 (3): 169–76. Дои:10.1093 / dnares / 5.3.169. PMID  9734811.
6. Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Bocher M, Blocker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Dusterhoft A, Beyer A, Kohrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwalder B , Обермайер Б., Тампе Дж., Хойбнер Д., Вамбутт Р., Корн Б., Кляйн М., Поустка А. (март 2001 г.). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Genome Res. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК  311072. PMID  11230166.
7. "Ген Entrez: SOCS5 супрессор передачи сигналов цитокинов 5".

дальнейшее чтение

• Кайл Б.Т., Шульман Б.А., Александр В.С. и др. (2002). «Коробка SOCS: история разрушения и деградации». Trends Biochem. Наука. 27 (5): 235–41. Дои:10.1016 / S0968-0004 (02) 02085-6. PMID  12076535.
• Ван Дж, Кэмпбелл Иллинойс (2002). «Цитокиновая передача сигналов в головном мозге: включение в него SOCS?». J. Neurosci. Res. 67 (4): 423–7. Дои:10.1002 / jnr.10145. PMID  11835308. S2CID  33269663.
• Кребс Д.Л., Hilton DJ (2001). «Белки SOCS: негативные регуляторы передачи сигналов цитокинов». Стволовые клетки. 19 (5): 378–87. Дои:10.1634 / стволовые клетки.19-5-378. PMID  11553846. S2CID  20847942.
• Одзаки А, Секи Й, Фукусима А, Кубо М (2005). «Контроль аллергического конъюнктивита с помощью супрессора передачи сигналов цитокинов (SOCS) 3 и SOCS5 в мышиной модели». J. Immunol. 175 (8): 5489–97. Дои:10.4049 / jimmunol.175.8.5489. PMID  16210657.
• Карио Э., Мармор М.Д., Адамский К. и др. (2005). «Супрессоры передачи сигналов цитокинов 4 и 5 регулируют передачу сигналов рецептора эпидермального фактора роста». J. Biol. Chem. 280 (8): 7038–48. Дои:10.1074 / jbc.M408575200. PMID  15590694.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Бейл Дж., Летард С., Франк Р. и др. (2004). «Супрессор передачи сигналов цитокинов 6 связывается с KIT и регулирует передачу сигналов рецептора KIT». J. Biol. Chem. 279 (13): 12249–59. Дои:10.1074 / jbc.M313381200. PMID  14707129.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Секи Ю., Хаяси К., Мацумото А. и др. (2002). «Экспрессия супрессора передачи сигналов цитокинов-5 (SOCS5) негативно регулирует IL-4-зависимую активацию STAT6 и дифференцировку Th2». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (20): 13003–8. Дои:10.1073 / pnas.202477099. ЧВК  130576. PMID  12242343.
• Magrangeas F, Apiou F, Denis S и др. (2000). «Клонирование и экспрессия CIS6, отнесение хромосом к 3p22 и 2p21 путем гибридизации in situ». Cytogenet. Cell Genet. 88 (1–2): 78–81. Дои:10.1159/000015490. PMID  10773671. S2CID  19983548.
• Hilton DJ, Ричардсон RT, Александр WS и др. (1998). «Двадцать белков, содержащих С-концевой SOCS-бокс, образуют пять структурных классов». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 95 (1): 114–9. Дои:10.1073 / пнас.95.1.114. ЧВК  18144. PMID  9419338.