GATA5 - GATA5

GATA5
Идентификаторы
Псевдонимы	GATA5, GATAS, bB379O24.1, GATA-связывающий белок 5, CHTD5
Внешние идентификаторы	OMIM: 611496 MGI: 109497 ГомолоГен: 32031 Генные карты: GATA5
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 20 (человек)
Конец	62,475,995 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 2 (мышь)
Конец	180,334,699 бп
Генная онтология
Молекулярная функция	• Связывание ДНК; • последовательное связывание ДНК; • Связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области РНК-полимеразы II; • Связывание фактора транскрипции РНК-полимеразы II; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II; • связывание ионов цинка; • связывание хроматина; • связывание ионов металлов; • GO: 0001158 Связывание проксимальной области корового промотора с последовательностью ДНК; • активность фактора транскрипции, связывание с дистальной энхансерной последовательностью РНК-полимеразы II; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II; • активность фактора транскрипции, связывание с последовательностью проксимальной области корового промотора РНК-полимеразы II; • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II; • GO: 0001948 связывание с белками;
Сотовый компонент	• комплекс регуляторов транскрипции; • нуклеоплазма; • ядро клетки; • ядерный хроматин;
Биологический процесс	• регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • клеточный ответ на стимул BMP; • коагуляция крови; • транскрипция, ДНК-шаблон; • положительная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • дифференцировка кишечных эпителиальных клеток; • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II; • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • морфогенез аортального клапана; • эндокардиальная подушка; • отрицательная регуляция гипертрофии сердечной мышцы; • положительная регуляция экспрессии генов; • отрицательная регуляция экспрессии генов; • положительная регуляция сигнального пути Notch, участвующего в индукции сердца; • положительная регуляция перехода сердечного эндотелия в мезенхиму; • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II, участвующего в развитии сердца; • развитие сердца; • морфогенез органов животных; • гистогенез; • развитие клеток; • формирование анатомической структуры, участвующее в морфогенезе; • развитие пищеварительного тракта; • развитие сердечной мышечной ткани; • развитие системы кровообращения;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	140628
	14464
	ENSG00000130700
	ENSMUSG00000015627
	Q9BWX5
	P97489
	NM_080473
	NM_008093
	NP_536721
	NP_032119
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Фактор транскрипции GATA-5 это белок что у людей кодируется GATA5 ген.^[5]^[6]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, представляет собой фактор транскрипции, содержащий два цинковых пальца GATA-типа. Кодируемый белок, как известно, связывается с ядерным фактором-1альфа гепатоцитов (HNF-1альфа), и это взаимодействие необходимо для совместной активации промотора кишечной лактазы-флоризингидролазы. У других организмов подобные белки могут участвовать в установлении разнообразия клеток гладких мышц сердца.^[6]

Роль в развитии

Gata5 - фактор транскрипции. Gata5 регулирует правильное развитие сердца. На ранних этапах развития эмбриона Gata5 помогает убедиться, что вырабатывается достаточно клеток-предшественников сердечной мышцы, чтобы дифференцироваться в конечные клетки миокарда. Он также регулирует другие гены, которые имеют решающее значение для успешного развития сердца.^[7] По мере того, как беременность прогрессирует, Gata 5 участвует в спецификации сердечной ткани, которая становится желудочками. Проблемы могут возникнуть при чрезмерной экспрессии Gata5. Эта сверхэкспрессия может привести к эктопическим очагам. Эктопические очаги также известны как эктопические кардиостимуляторы. Они представляют собой связки клеток, которые могут вызывать кардиостимуляцию и расположены в местах в сердце, где они не должны находиться. Эти клетки могут возбуждаться раньше, чем предполагается, что сердце будет возбуждено. Это заставляет сердце биться и сокращаться раньше, чем должно. Часто это не имеет большого значения, и сердце естественным образом возвращается к своему нормальному ритму. Однако, если это вызвано проблемами с развитием в сердце - если Gata5 не экспрессируется должным образом в эмбрионе - это может привести к постоянным проблемам с эктопическими очагами. Эти проблемы включают тахикардию (слишком частое сердцебиение), брадикардия (сердце бьется слишком медленно) или фибрилляция желудочков^[8] Это серьезное заболевание, при котором желудочки сердца не работают постоянно и не могут выводить кровь в организм.

Смотрите также

Фактор транскрипции GATA

дальнейшее чтение

Какита Т., Хасегава К., Моримото Т., Кабураги С., Вада Х., Сасаяма С. (ноябрь 1999 г.). «Белок p300 как коактиватор GATA-5 в транскрипции сердечного ограниченного гена предсердного натрийуретического фактора». Журнал биологической химии. 274 (48): 34096–102. Дои:10.1074 / jbc.274.48.34096. PMID 10567378.
Красински С.Д., Ван Веринг Х.М., Таннемаат М.Р., Гранд Р.Дж. (июль 2001 г.). «Дифференциальная активация промоторов кишечных генов: функциональные взаимодействия между GATA-5 и HNF-1 альфа». Американский журнал физиологии. Физиология желудочно-кишечного тракта и печени. 281 (1): G69–84. Дои:10.1152 / ajpgi.2001.281.1.g69. PMID 11408257.
van Wering HM, Huibregtse IL, van der Zwan SM, de Bie MS, Dowling LN, Boudreau F, Rings EH, Grand RJ, Krasinski SD (август 2002 г.). «Физическое взаимодействие между GATA-5 и ядерным фактором гепатоцитов-1альфа приводит к синергической активации промотора человеческой лактазы-флоризингидролазы». Журнал биологической химии. 277 (31): 27659–67. Дои:10.1074 / jbc.M203645200. PMID 12011060.
Benchabane H, Wrana JL (сентябрь 2003 г.). «GATA- и Smad1-зависимые энхансеры в гене Smad7 по-разному интерпретируют концентрации морфогенетических белков кости». Молекулярная и клеточная биология. 23 (18): 6646–61. Дои:10.1128 / MCB.23.18.6646-6661.2003. ЧВК 193708. PMID 12944489.
Акияма Й., Уоткинс Н., Сузуки Х., Джаир К.В., ван Энгеланд М., Эстеллер М., Сакаи Х., Рен С.Й., Юаса Ю. Герман Дж. Г., Байлин С.Б. (Декабрь 2003 г.). «Гены факторов транскрипции GATA-4 и GATA-5 и потенциальные противоопухолевые гены-мишени подавляются эпигенетически при колоректальном раке и раке желудка». Молекулярная и клеточная биология. 23 (23): 8429–39. Дои:10.1128 / MCB.23.23.8429-8439.2003. ЧВК 262684. PMID 14612389.
Дивайн Дж. К., Сталоч Л. Дж., Хавери Х., Якобсен К. М., Уилсон Д. Б., Хейкинхеймо М., Саймон Т. К. (ноябрь 2004 г.). «GATA-4, GATA-5 и GATA-6 активируют ген белка, связывающего жирные кислоты печени крысы, вместе с HNF-1альфа». Американский журнал физиологии. Физиология желудочно-кишечного тракта и печени. 287 (5): G1086–99. Дои:10.1152 / ajpgi.00421.2003. PMID 14715527.
Гуо М., Акияма Ю., Хаус М.Г., Хукер К.М., Хит Е., Габриэльсон Е., Ян С.К., Хан И., Бейлин С.Б., Герман Дж. Г., Брок М.В. (декабрь 2004 г.). «Гиперметилирование генов GATA при раке легких». Клинические исследования рака. 10 (23): 7917–24. Дои:10.1158 / 1078-0432.CCR-04-1140. PMID 15585625.
Вакана К., Акияма Ю., Асо Т., Юаса Ю. (сентябрь 2006 г.). «Участие факторов транскрипции GATA-4 / -5 в канцерогенезе яичников». Письма о раке. 241 (2): 281–8. Дои:10.1016 / j.canlet.2005.10.039. PMID 16337738.
Го М., Дом MG, Акияма Ю., Ци Ю., Капанья Д., Хармон Дж., Бейлин С.Б., Брок М.В., Герман Дж. Г. (ноябрь 2006 г.). «Гиперметилирование семейства генов GATA при раке пищевода». Международный журнал рака. 119 (9): 2078–83. Дои:10.1002 / ijc.22092. PMID 16823849.

внешняя ссылка

GATA5 + белок, + человеческий в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.

Эта статья о ген на хромосома человека 20 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000130700 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000015627 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid9566909-5] Гао X, Седжвик Т., Ши Ю.Б., Эванс Т. (май 1998 г.). «Определенные функции вовлечены в факторы транскрипции GATA-4, -5 и -6 в регуляции дифференцировки эпителиальных клеток кишечника». Молекулярная и клеточная биология. 18 (5): 2901–11. Дои:10.1128 / mcb.18.5.2901. ЧВК 110669. PMID 9566909.

[entrez-6] а ^б «Ген Entrez: GATA5 GATA связывающий белок 5».

[7] Reiter JF, Alexander J, Rodaway A, Yelon D., Patient R, Holder N, Stainier DY (ноябрь 1999 г.). «Gata5 необходим для развития сердца и энтодермы у рыбок данио». Гены и развитие. 13 (22): 2983–95. Дои:10.1101 / gad.13.22.2983. ЧВК 317161. PMID 10580005.

[8] "Мерцание желудочков". Клиника Майо.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]