KLF13 - KLF13
Фактор Круппеля 13, также известный как KLF13, это белок что у людей кодируется KLF13 ген.[5][6][7]
Есть некоторые свидетельства того, что KLF13 играет роль в ожирении. Сайт метилирования, cg07814318, в пределах первого интрон из KLF13 был связан с ожирением и орексигенными процессами.[8] Грелин уровни также положительно коррелировали с уровнями метилирования cg07814318.[8] Более того, уровни экспрессии KLF13 были уменьшены и увеличены в мозге голодных и страдающих ожирением мышей, соответственно.[8]
Функция
KLF13 принадлежит к семейству факторы транскрипции которые содержат 3 классических цинковый палец ДНК-связывающие домены, состоящие из атома цинка, тетраэдрически координированного 2 цистеинами и 2 гистидинами (мотив C2H2). Эти факторы транскрипции связываются с GC-богатыми последовательностями и родственными GT и CACCC-боксами.[5][9]
KLF13 впервые был описан как RANTES фактор поздней активации Т-лимфоциты (РФЛАТ) -1.[7] Регулирует выражение хемокин RANTES в Т-лимфоцитах. Он действует как стержень, вызывая большой энхансом. У мышей с нокаутом KLF13 обнаружен дефект в выживаемости лимфоцитов, поскольку KLF13 является регулятором Bcl-xL выражение.[7][10][11][12][13][14][15]
Взаимодействия
KLF13 был показан взаимодействовать с CREB-связывающий белок,[16] Белок теплового шока 47[16] и PCAF.[16]
Смотрите также
Рекомендации
- ^ а б c ENSG00000275746 GRCh38: Общий выпуск 89: ENSG00000169926, ENSG00000275746 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000052040 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ а б "Entrez Gene: KLF13 Kruppel-подобный фактор 13".
- ^ Кук Т., Гебелейн Б., Уррутия Р. (июнь 1999 г.). «Sp1 и ему подобные: биохимические и функциональные прогнозы для растущего семейства факторов транскрипции цинкового пальца». Летопись Нью-Йоркской академии наук. 880 (1 ЯЧЕЙКА И МОЛЬ): 94–102. Bibcode:1999НЯСА.880 ... 94С. Дои:10.1111 / j.1749-6632.1999.tb09513.x. PMID 10415854.
- ^ а б c Сонг А, Чен Ю.Ф., Тхаматракольн К., Шторм Т.А., Кренский А.М. (январь 1999 г.). «RFLAT-1: новый фактор транскрипции цинкового пальца, который активирует экспрессию гена RANTES в Т-лимфоцитах». Иммунитет. 10 (1): 93–103. Дои:10.1016 / S1074-7613 (00) 80010-2. PMID 10023774.
- ^ а б c Wiemerslage L, Islam R, van der Kamp C, Cao H, Olivo G, Ence-Eriksson F, Castillo S, Larsen AL, Bandstein M, Dahlberg LS, Perland E, Gustavsson V, Nilsson J, Vogel H, Schürmann A, Larsson EM, Раск-Андерсен М., Бенедикт С., Шёт HB (14 февраля 2017 г.). «Сайт метилирования ДНК в гене KLF13 связан с орексигенными процессами, основанными на нейронных ответах и уровнях грелина». Int J Obes (Лондон). 43 (6): 990–994. Дои:10.1038 / ijo.2017.43. PMID 28194012. S2CID 52835570.
- ^ Scohy S, Gabant P, Van Reeth T., Hertveldt V, Drèze PL, Van Vooren P, Rivière M, Szpirer J, Szpirer C (ноябрь 2000 г.). «Идентификация KLF13 и KLF14 (SP6), новых членов семейства факторов транскрипции SP / XKLF». Геномика. 70 (1): 93–101. Дои:10.1006 / geno.2000.6362. PMID 11087666.
- ^ Песня А, Никольчева Т., Кренский А.М. (октябрь 2000 г.). «Транскрипционная регуляция экспрессии RANTES в Т-лимфоцитах». Иммунологические обзоры. 177 (1): 236–45. Дои:10.1034 / j.1600-065X.2000.17610.x. PMID 11138780.
- ^ Никольчева Т., Пироннет С., Чжоу С.Ю., Соненберг Н., Сонг А, Клейбергер С., Кренский А.М. (июль 2002 г.). «Трансляционный реостат для RFLAT-1 регулирует экспрессию RANTES в Т-лимфоцитах». Журнал клинических исследований. 110 (1): 119–26. Дои:10.1172 / JCI15336. ЧВК 151028. PMID 12093895.
- ^ Песня А, Патель А., Тхаматракольн К., Лю С., Фэн Д., Клейбергер С., Кренски А.М. (август 2002 г.). «Функциональные домены и ДНК-связывающие последовательности RFLAT-1 / KLF13, Krüppel-подобного фактора транскрипции активированных Т-лимфоцитов». Журнал биологической химии. 277 (33): 30055–65. Дои:10.1074 / jbc.M204278200. PMID 12050170.
- ^ Чжоу М., Макферсон Л., Фэн Д., Сонг А, Донг С., Лю С.К., Чжоу Л., Ши Икс, Ан Ю.Т., Ван Д., Клейбергер С., Кренски А.М. (май 2007 г.). «Kruppel-подобный фактор транскрипции 13 регулирует выживание Т-лимфоцитов in vivo». Журнал иммунологии. 178 (9): 5496–504. Дои:10.4049 / jimmunol.178.9.5496. ЧВК 2664650. PMID 17442931.
- ^ Хуанг Б., Ан Ю.Т., Макферсон Л., Клейбергер С., Кренски А.М. (июнь 2007 г.). «Взаимодействие PRP4 с Kruppel-подобным фактором 13 регулирует транскрипцию CCL5». Журнал иммунологии. 178 (11): 7081–7. Дои:10.4049 / jimmunol.178.11.7081. ЧВК 2674583. PMID 17513757.
- ^ Ан Ю.Т., Хуанг Б., Макферсон Л., Клейбергер С., Кренски А.М. (январь 2007 г.). «Динамическое взаимодействие транскрипционного аппарата и хроматина регулирует« позднюю »экспрессию хемокина RANTES в Т-лимфоцитах». Молекулярная и клеточная биология. 27 (1): 253–66. Дои:10.1128 / MCB.01071-06. ЧВК 1800668. PMID 17074812.
- ^ а б c Сонг Ч.З., Келлер К., Мурата К., Асано Х., Стаматояннопулос Г (Март 2002 г.). «Функциональное взаимодействие между коактиваторами CBP / p300, PCAF и фактором транскрипции FKLF2». Журнал биологической химии. 277 (9): 7029–36. Дои:10.1074 / jbc.M108826200. ЧВК 2808425. PMID 11748222.
дальнейшее чтение
- Кук Т., Гебелейн Б., Уррутия Р. (июнь 1999 г.). «Sp1 и ему подобные: биохимические и функциональные прогнозы для растущего семейства факторов транскрипции цинкового пальца». Летопись Нью-Йоркской академии наук. 880 (1 ЯЧЕЙКА И МОЛЬ): 94–102. Bibcode:1999НЯСА.880 ... 94С. Дои:10.1111 / j.1749-6632.1999.tb09513.x. PMID 10415854.
- Сонг А, Чен Ю.Ф., Тхаматракольн К., Шторм Т.А., Кренский А.М. (январь 1999 г.). «RFLAT-1: новый фактор транскрипции цинкового пальца, который активирует экспрессию гена RANTES в Т-лимфоцитах». Иммунитет. 10 (1): 93–103. Дои:10.1016 / S1074-7613 (00) 80010-2. PMID 10023774.
- Асано Х., Ли XS, Стаматояннопулос Г. (июнь 2000 г.). «FKLF-2: новый транскрипционный фактор, подобный Крюппелю, который активирует глобин и другие гены эритроидного происхождения». Кровь. 95 (11): 3578–84. Дои:10.1182 / кровь.V95.11.3578. PMID 10828046.
- Scohy S, Gabant P, Van Reeth T., Hertveldt V, Drèze PL, Van Vooren P, Rivière M, Szpirer J, Szpirer C (ноябрь 2000 г.). «Идентификация KLF13 и KLF14 (SP6), новых членов семейства факторов транскрипции SP / XKLF». Геномика. 70 (1): 93–101. Дои:10.1006 / geno.2000.6362. PMID 11087666.
- Качиньски Дж., Чжан Дж. С., Элленридер В., Конли А., Дуэнс Т., Кестер Х., ван Дер Бург Б., Уррутия Р. (сентябрь 2001 г.). «Sp1-подобный белок BTEB3 ингибирует транскрипцию через блок основного элемента транскрипции, взаимодействуя с корепрессорами mSin3A и HDAC-1 и конкурируя с Sp1». Журнал биологической химии. 276 (39): 36749–56. Дои:10.1074 / jbc.M105831200. PMID 11477107.
- Song CZ, Keller K, Murata K, Asano H, Stamatoyannopoulos G (март 2002 г.). «Функциональное взаимодействие между коактиваторами CBP / p300, PCAF и фактором транскрипции FKLF2». Журнал биологической химии. 277 (9): 7029–36. Дои:10.1074 / jbc.M108826200. ЧВК 2808425. PMID 11748222.
- Качиньский Дж. А., Конли А. А., Фернандес Сапико М., Дельгадо С. М., Чжан Дж. С., Уррутия Р. (сентябрь 2002 г.). «Функциональный анализ белка, связывающего основной транскрипционный элемент (BTE) (BTEB) 3, и BTEB4, нового Sp1-подобного белка, выявляет подсемейство репрессоров транскрипции для сайта BTE промотора гена цитохрома P4501A1». Биохимический журнал. 366 (Pt 3): 873–82. Дои:10.1042 / BJ20020388. ЧВК 1222816. PMID 12036432.
- Песня А, Патель А., Тхаматракольн К., Лю С., Фэн Д., Клейбергер С., Кренски А.М. (август 2002 г.). «Функциональные домены и ДНК-связывающие последовательности RFLAT-1 / KLF13, Krüppel-подобного фактора транскрипции активированных Т-лимфоцитов». Журнал биологической химии. 277 (33): 30055–65. Дои:10.1074 / jbc.M204278200. PMID 12050170.
- Никольчева Т., Пироннет С., Чжоу С.Ю., Соненберг Н., Сонг А, Клейбергер С., Кренский А.М. (июль 2002 г.). «Трансляционный реостат для RFLAT-1 регулирует экспрессию RANTES в Т-лимфоцитах». Журнал клинических исследований. 110 (1): 119–26. Дои:10.1172 / JCI15336. ЧВК 151028. PMID 12093895.
- Мицума А., Асано Х., Киношита Т., Мурате Т., Сайто Х., Стаматояннопулос Г., Наое Т. (февраль 2005 г.). «Регуляция транскрипции гена FKLF-2 (KLF13) в эритроидных клетках». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Структура и экспрессия гена. 1727 (2): 125–33. Дои:10.1016 / j.bbaexp.2004.12.007. ЧВК 2808416. PMID 15716005.
- Чжан П., Басу П., Редмонд Л.С., Моррис П.Е., Рупон Дж. У., Гиндер Г. Д., Ллойд Дж. А. (2006). «Функциональный скрининг на Krüppel-подобные факторы, которые регулируют ген гамма-глобина человека через элемент промотора CACCC». Клетки, молекулы и болезни крови. 35 (2): 227–35. Дои:10.1016 / j.bcmd.2005.04.009. PMID 16023392.
- Ан Ю.Т., Хуанг Б., Макферсон Л., Клейбергер С., Кренски А.М. (январь 2007 г.). «Динамическое взаимодействие транскрипционного аппарата и хроматина регулирует« позднюю »экспрессию хемокина RANTES в Т-лимфоцитах». Молекулярная и клеточная биология. 27 (1): 253–66. Дои:10.1128 / MCB.01071-06. ЧВК 1800668. PMID 17074812.
- Хуанг Б., Ан Ю.Т., Макферсон Л., Клейбергер С., Кренски А.М. (июнь 2007 г.). «Взаимодействие PRP4 с Kruppel-подобным фактором 13 регулирует транскрипцию CCL5». Журнал иммунологии. 178 (11): 7081–7. Дои:10.4049 / jimmunol.178.11.7081. ЧВК 2674583. PMID 17513757.
внешняя ссылка
- KLF13 + белок, + человек в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.