ATF7 - ATF7

ATF7
Идентификаторы
Псевдонимы	ATF7, ATFA, активирующий фактор транскрипции 7
Внешние идентификаторы	OMIM: 606371 MGI: 2443472 ГомолоГен: 4994 Генные карты: ATF7
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 12 (человек)[1] Группа 12q13.13 Начинать 53,507,856 бп[1] Конец 53,626,410 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 15 (мышь)[2] Группа 15 | 15 F3 Начинать 102,525,946 бп[2] Конец 102,625,464 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II • связывание ферментов • Связывание ДНК • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 ДНК-связывающая активность репрессора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • связывание фактора транскрипции • GO: 0001948 связывание с белками • связывание ионов металлов • Связывание митоген-активированной протеинкиназы • связывание нуклеиновой кислоты • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II Сотовый компонент • цитоплазма • ядерная периферия • ядро клетки • нуклеоплазма Биологический процесс • GO: 0022415 вирусный процесс • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция, ДНК-шаблон • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	11016	223922
Ансамбль	ENSG00000170653	ENSMUSG00000099083
UniProt	P17544	Q8R0S1
RefSeq (мРНК)	NM_001130059 NM_001130060 NM_001206682 NM_001206683 NM_006856 NM_001366555 NM_001366556 NM_001366558 NM_001366561 NM_001366562 NM_001366563	NM_146065 NM_001310066 NM_001310067 NM_001310070
RefSeq (белок)	NP_001123532 NP_001193611 NP_001193612 NP_006847 NP_001353484 NP_001353485 NP_001353487 NP_001353490 NP_001353491 NP_001353492	NP_001296995 NP_001296996 NP_001296999
Расположение (UCSC)	Chr 12: 53.51 - 53.63 Мб	Chr 15: 102,53 - 102,63 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Циклический АМФ-зависимый фактор транскрипции ATF-7 это белок что у людей кодируется ATF7 ген.^[5][6][7]

Омоним

В 2001 году Peters et al. опубликовал статью, показывающую, что ATF-7, новый белок bZIP, взаимодействует с PTP4A1.^[6]Этот ATF-7 на самом деле ATF5 а не ATF7, как отмечают авторы в конце своей статьи («Примечание добавлено в доказательство - пока эта рукопись находилась на рассмотрении, последовательности для мышиных и человеческих ATF-5 были депонированы в GenBank TM. Похоже, что ATF-7 и ATF -5, вероятно, будет одним и тем же белком. Кроме того, неродственная последовательность, названная ATF7, также была депонирована в GenBankTM. Во избежание путаницы, будущая работа над белком, описанным в этой публикации, вероятно, будет называться ATF-5 или ATF-5/7. ")^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000170653 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000099083 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Гайр М., Чаттон Б., Кединджер С. (август 1990 г.). «Выделение и характеристика двух новых, тесно связанных клонов кДНК ATF из клеток HeLa». Нуклеиновые кислоты Res. 18 (12): 3467–73. Дои:10.1093 / nar / 18.12.3467. ЧВК  330998. PMID  1694576.
6. Петерс С.С., Лян Х, Ли С., Каннан С., Пэн Й., Тауб Р., Даймонд Р.Х. (апрель 2001 г.). «ATF-7, новый белок bZIP, взаимодействует с протеинтирозинфосфатазой PRL-1». J Biol Chem. 276 (17): 13718–26. Дои:10.1074 / jbc.M011562200. PMID  11278933.
7. «Ген Entrez: ATF7, активирующий фактор транскрипции 7».

дальнейшее чтение

• Олсен Дж. В., Благоев Б., Гнад Ф, Мацек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.
• Хамард П.Дж., Далбиес-Тран Р., Хаус С., Дэвидсон И., Кединджер С., Чаттон Б. (2005). «Функциональное взаимодействие между ATF7 и TAF12, которое модулируется TAF4». Онкоген. 24 (21): 3472–83. Дои:10.1038 / sj.onc.1208565. PMID  15735663.
• Hamard PJ, Boyer-Guittaut M, Camuzeaux B, Dujardin D, Hauss C, Oelgeschläger T, Vigneron M, Kedinger C, Chatton B (2007). «Сумоилирование задерживает субклеточную локализацию фактора транскрипции ATF7 и подавляет его транскрипционную активность». Нуклеиновые кислоты Res. 35 (4): 1134–44. Дои:10.1093 / нар / gkl1168. ЧВК  1851647. PMID  17264123.
• Брейтвизер В., Лайонс С., Фленникен А.М., Эштон Дж., Брудер Дж., Виллингтон М., Лако Дж., Кускофф В., Джонс Н. (2007). «Обратная регуляция активности p38 через ATF2 необходима для выживания эмбриональных клеток печени». Genes Dev. 21 (16): 2069–82. Дои:10.1101 / gad.430207. ЧВК  1948861. PMID  17699753.
• Ньюман Дж. Р., Китинг А. Э. (2003). «Всесторонняя идентификация человеческих взаимодействий bZIP с массивами спиральных катушек». Наука. 300 (5628): 2097–101. Bibcode:2003Наука ... 300.2097N. Дои:10.1126 / science.1084648. PMID  12805554. S2CID  36715183.
• Ньюман С.П., Бейтс Н.П., Верниммен Д., Паркер М.Г., Херст ХК (2000). «Конкуренция кофакторов между рецептором эстрогена, связанным с лигандом, и энхансером интрона 1 приводит к эстрогеновой репрессии экспрессии ERBB2 при раке груди». Онкоген. 19 (4): 490–7. Дои:10.1038 / sj.onc.1203416. PMID  10698518.
• Гетц Дж, Чаттон Б., Маттей М.Г., Кединджер С. (1997). «Структура и экспрессия гена ATFa». J. Biol. Chem. 271 (47): 29589–98. Дои:10.1074 / jbc.271.47.29589. PMID  8939888.
• Bocco JL, Bahr A, Goetz J, Hauss C, Kallunki T, Kedinger C, Chatton B (1996). «In vivo ассоциация ATFa с активностью киназы JNK / SAP». Онкоген. 12 (9): 1971–80. PMID  8649858.
• Pescini R, Kaszubska W, Whelan J, DeLamarter JF, Hooft van Huijsduijnen R (1994). «ATF-a0, новый вариант семейства факторов транскрипции ATF / CREB, образует доминирующий ингибитор транскрипции в гетеродимерах ATF-a». J. Biol. Chem. 269 (2): 1159–65. PMID  8288576.
• Чжоу К., Гедрич Р.В., Энгель Д.А. (1995). «Транскрипционная репрессия гена c-fos с помощью YY1 опосредуется прямым взаимодействием с ATF / CREB». Дж. Вирол. 69 (7): 4323–30. Дои:10.1128 / JVI.69.7.4323-4330.1995. ЧВК  189172. PMID  7769693.

внешняя ссылка

• ATF7 + белок, + человеческий в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
• Человек ATF7 расположение генома и ATF7 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.