RYBP - RYBP

RYBP
Доступные конструкции PDB Поиск Human UniProt: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3IXS
Идентификаторы
Псевдонимы	RYBP, AAP1, DEDAF, YEAF1, APAP-1, RING1 и YY1 связывающий белок
Внешние идентификаторы	OMIM: 607535 MGI: 3648043 ГомолоГен: 8159 Генные карты: RYBP
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 3 (человек)[1] Группа 3п13 Начинать 72,371,825 бп[1] Конец 72,446,621 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • GO: 0001948 связывание с белками • GO: 0001106 транскрипционная корепрессорная активность • связывание ионов металлов Сотовый компонент • цитоплазма • Белковый комплекс PcG • ядро клетки • нуклеоплазма Биологический процесс • развитие многоклеточного организма • моноубиквитинирование гистона H2A • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • транскрипция, ДНК-шаблон • апоптотический процесс • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • отрицательная регуляция протеасомного убиквитин-зависимого белкового катаболического процесса • положительная регуляция апоптотического процесса • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • отрицательное регулирование перехода G0 на G1 Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	23429	628746
Ансамбль	ENSG00000281766 ENSG00000163602	н / д
UniProt	Q8N488	н / д
RefSeq (мРНК)	NM_012234	н / д
RefSeq (белок)	NP_036366	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 3: 72.37 - 72.45 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

RING1 и YY1-связывающий белок это белок что у людей кодируется RYBP ген.^[4][5]

Взаимодействия

RYBP был показан взаимодействовать с:

• Abl ген,^[6]
• CBX2,^[4]
• Caspase 10,^[7]
• E2F2,^[8]
• E2F3,^[8]
• Mdm2,^[9]
• RING1,^[4][10] и
• YY1.^[4]

Рекомендации

1. ENSG00000163602 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000281766, ENSG00000163602 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Гарсия Э., Маркос-Гутьеррес К., дель Мар Лоренте М., Морено Дж. К., Видаль М. (июнь 1999 г.). «RYBP, новый белок-репрессор, который взаимодействует с компонентами комплекса Polycomb млекопитающих и с фактором транскрипции YY1». Журнал EMBO. 18 (12): 3404–18. Дои:10.1093 / emboj / 18.12.3404. ЧВК  1171420. PMID  10369680.
5. «Ген Entrez: связывающий белок RYBP RING1 и YY1».
6. Чжу Дж., Шор СК (декабрь 1996 г.). «Активность тирозинкиназы c-ABL регулируется путем ассоциации с новым белком, связывающим SH3-домен». Молекулярная и клеточная биология. 16 (12): 7054–62. Дои:10.1128 / mcb.16.12.7054. ЧВК  231708. PMID  8943360.
7. Чжэн Л., Шиклинг О., Питер М.Э., Ленардо М.Дж. (август 2001 г.). «Фактор, связанный с эффекторным доменом смерти, играет различные регуляторные роли в ядре и цитоплазме». Журнал биологической химии. 276 (34): 31945–52. Дои:10.1074 / jbc.M102799200. PMID  11395500.
8. Schlisio S, Halperin T, Vidal M, Nevins JR (ноябрь 2002 г.). «Взаимодействие YY1 с E2F, опосредованное RYBP, обеспечивает механизм специфичности функции E2F». Журнал EMBO. 21 (21): 5775–86. Дои:10.1093 / emboj / cdf577. ЧВК  131074. PMID  12411495.
9. Чен Д., Чжан Дж., Ли М., Рейберн ER, Ван Х., Чжан Р. (февраль 2009 г.). «RYBP стабилизирует p53, модулируя MDM2». EMBO отчеты. 10 (2): 166–72. Дои:10.1038 / embor.2008.231. ЧВК  2637313. PMID  19098711.
10. Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Берриз Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Дж., Ли С., Альбала Дж. С., Лим Дж., Фраутон С., Лламосас Э, Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р. С., Ванденхаут Дж., Зогби HY, Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусет-Штамм Л., Кусик М.Э., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видаль М. (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.

дальнейшее чтение

• Чжу Дж., Шор СК (декабрь 1996 г.). «Активность тирозинкиназы c-ABL регулируется путем ассоциации с новым белком, связывающим SH3-домен». Молекулярная и клеточная биология. 16 (12): 7054–62. Дои:10.1128 / mcb.16.12.7054. ЧВК  231708. PMID  8943360.
• Тримарчи Дж. М., Фэирчайлд Б., Вен Дж., Лис Дж. А. (февраль 2001 г.). «Фактор транскрипции E2F6 является компонентом Bmi1-содержащего поликомб комплекса млекопитающих». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 98 (4): 1519–24. Дои:10.1073 / pnas.041597698. ЧВК  29289. PMID  11171983.
• Чжэн Л., Шиклинг О., Питер М.Э., Ленардо М.Дж. (август 2001 г.). «Фактор, связанный с эффекторным доменом смерти, играет различные регуляторные роли в ядре и цитоплазме». Журнал биологической химии. 276 (34): 31945–52. Дои:10.1074 / jbc.M102799200. PMID  11395500.
• Сава К., Йошикава Т., Мацуда-Судзуки Ф., Делехузи С., Гото М., Ватанабэ Х., Савада Дж., Катаока К., Ханда Х (июнь 2002 г.). «YEAF1 / RYBP и YAF-2 являются функционально разными членами семейства кофакторов для факторов транскрипции YY1 и E4TF1 / hGABP». Журнал биологической химии. 277 (25): 22484–90. Дои:10.1074 / jbc.M203060200. PMID  11953439.
• Schlisio S, Halperin T, Vidal M, Nevins JR (ноябрь 2002 г.). «Взаимодействие YY1 с E2F, опосредованное RYBP, обеспечивает механизм специфичности функции E2F». Журнал EMBO. 21 (21): 5775–86. Дои:10.1093 / emboj / cdf577. ЧВК  131074. PMID  12411495.
• Гелен Л., Патерсон Х., Гекен Дж., Мейерс М., Фарзане Ф., Тавассоли М. (февраль 2004 г.). «ТАТ-апоптин эффективно доставляется и вызывает апоптоз в раковых клетках». Онкоген. 23 (5): 1153–65. Дои:10.1038 / sj.onc.1207224. PMID  14691460.
• Данен-ван Оршот А.А., Воскамп П., Зелен М.С., ван Милтенбург М.Х., Болк М.В., Тейт С.В., Боесен-де-Кок Ю.Г., Рон Дж. Л., Борст Дж., Нотеборн М. Х. (май 2004 г.). «Фактор, связанный с эффекторным доменом смерти человека, взаимодействует с вирусным агонистом апоптоза апоптином и вызывает предпочтительное для опухоли уничтожение клеток». Гибель клеток и дифференциация. 11 (5): 564–73. Дои:10.1038 / sj.cdd.4401391. PMID  14765135.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Берриз Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Милштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.