RING1 - RING1

RING1
Идентификаторы
Псевдонимы	RING1, RING1A, RNF1, белок безымянного пальца 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 602045 MGI: 1101770 ГомолоГен: 68283 Генные карты: RING1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6п21.32 Начните 33,208,500 бп[1] Конец 33,212,722 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 17 (мышь)[2] Группа 17 | 17 B1 Начните 34,020,792 бп[2] Конец 34,024,680 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание хроматина • связывание ионов металлов • GO: 0001948 связывание с белками • активность активатора убиквитин-протеинтрансферазы • трансферазная активность Сотовый компонент • ядерное пятнышко • ядерное тело • половой хроматин • убиквитинлигазный комплекс • нуклеоплазма • Белковый комплекс PcG • ядро клетки • цитозоль • PRC1 комплекс Биологический процесс • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • моноубиквитинирование гистона H2A • транскрипция, ДНК-шаблон • убиквитинирование белков • GO: 0048552 регуляция каталитической активности • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • убиквитинирование гистонов • морфогенез глаза камерного типа • спецификация переднего / заднего рисунка • отрицательное регулирование перехода G0 на G1 • организация хроматина Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	6015	19763
Ансамбль	ENSG00000235107 ENSG00000231115 ENSG00000204227 ENSG00000226788 ENSG00000228520 ENSG00000206287	ENSMUSG00000024325
UniProt	Q06587	O35730
RefSeq (мРНК)	NM_002931	NM_009066
RefSeq (белок)	NP_002922	NP_033092
Расположение (UCSC)	Chr 6: 33.21 - 33.21 Мб	Chr 17: 34.02 - 34.02 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

E3 убиквитин-протеинлигаза RING1 является фермент что у людей кодируется RING1 ген.^[5][6]

Функция

Этот ген принадлежит к семейству RING finger, члены которого кодируют белки, характеризующиеся RING домен, цинк-связывающий мотив, связанный с доменом цинкового пальца. Продукт гена может связывать ДНК и действовать как репрессор транскрипции. Он связан с мультимерным белковым комплексом группы поликомб. Продукт гена взаимодействует с белками поликомб-группы BMI1, EDR1 и CBX4 и колокализуется с этими белками в больших ядерных доменах. Он взаимодействует с белком CBX4 через его богатый глицином С-концевой домен. Ген отображается в области HLA класса II, где он смежный с генами RING finger FABGL и HKE4.^[6]

Взаимодействия

RING1 был показан взаимодействовать с участием CBX8,^[7] ИМТ1^[8][9] и RYBP.^[10][11]

использованная литература

1. ENSG00000231115, ENSG00000204227, ENSG00000226788, ENSG00000228520, ENSG00000206287 GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000235107, ENSG00000231115, ENSG00000204227, ENSGS20006228000, ENSGS20006226722 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024325 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Хэнсон И.М., Поустка А., Троусдейл Дж. (Июнь 1991 г.). «Новые гены в области класса II главного комплекса гистосовместимости человека». Геномика. 10 (2): 417–24. Дои:10.1016 / 0888-7543 (91) 90327-Б. PMID  1906426.
6. «Entrez Gene: RING1, белок 1 безымянного пальца».
7. Bárdos JI, Saurin AJ, Tissot C, Duprez E, Freemont PS (сентябрь 2000 г.). «HPC3 - это новый ортолог поликомб человека, который взаимодействует и связывается с RING1 и Bmi1 и обладает свойствами репрессии транскрипции». Журнал биологической химии. 275 (37): 28785–92. Дои:10.1074 / jbc.M001835200. PMID  10825164.
8. Сатин Д.П., Гунстер М.Дж., ван дер Влаг Дж., Хамер К.М., Шуль В., Алкема М.Дж., Саурин А.Дж., Фримонт П.С., ван Дриэль Р., Отте А.П. (июль 1997 г.). «RING1 связан с белковым комплексом поликомб-группы и действует как репрессор транскрипции». Молекулярная и клеточная биология. 17 (7): 4105–13. Дои:10.1128 / mcb.17.7.4105. ЧВК  232264. PMID  9199346.
9. Сатин Д.П., Отте А.П. (январь 1999 г.). «RING1 взаимодействует с множеством белков группы Polycomb и проявляет онкогенную активность». Молекулярная и клеточная биология. 19 (1): 57–68. Дои:10.1128 / mcb.19.1.57. ЧВК  83865. PMID  9858531.
10. Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
11. Гарсия Э., Маркос-Гутьеррес К., дель Мар Лоренте М., Морено Дж. К., Видаль М. (июнь 1999 г.). «RYBP, новый белок-репрессор, который взаимодействует с компонентами комплекса Polycomb млекопитающих и с фактором транскрипции YY1». Журнал EMBO. 18 (12): 3404–18. Дои:10.1093 / emboj / 18.12.3404. ЧВК  1171420. PMID  10369680.

дальнейшее чтение

• Ловеринг Р., Хэнсон И.М., Борден К.Л., Мартин С., О'Рейли, штат Нью-Джерси, Эван Дж. И., Рахман Д., Паппин Д. Д., Троусдейл Дж., Фримонт П. С. (март 1993 г.). «Идентификация и предварительная характеристика белкового мотива, связанного с цинковым пальцем». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 90 (6): 2112–6. Bibcode:1993ПНАС ... 90.2112Л. Дои:10.1073 / пнас.90.6.2112. ЧВК  46035. PMID  7681583.
• Сатин Д.П., Гунстер М.Дж., ван дер Влаг Дж., Хамер К.М., Шуль В., Алкема М.Дж., Саурин А.Дж., Фримонт П.С., ван Дриэль Р., Отте А.П. (июль 1997 г.). «RING1 связан с белковым комплексом поликомб-группы и действует как репрессор транскрипции». Молекулярная и клеточная биология. 17 (7): 4105–13. Дои:10.1128 / mcb.17.7.4105. ЧВК  232264. PMID  9199346.
• Кикути Ю.Ю., Тамия Дж., Андо А., Чен Л., Кимура М., Феррейра Е., Цуджи К., Троусдейл Дж., Иноко Х. (июнь 1997 г.). «Физическое картирование центромеры 220 т.п.н. человеческого MHC и анализ последовательности ДНК сегмента 43 т.п.н., включая гены RING1, HKE6 и HKE4». Геномика. 42 (3): 422–35. Дои:10.1006 / geno.1997.4745. PMID  9205114.
• Сатин Д.П., Отте А.П. (январь 1999 г.). «RING1 взаимодействует с множеством белков группы Polycomb и проявляет онкогенную активность». Молекулярная и клеточная биология. 19 (1): 57–68. Дои:10.1128 / mcb.19.1.57. ЧВК  83865. PMID  9858531.
• Гарсия Э., Маркос-Гутьеррес К., дель Мар Лоренте М., Морено Дж. К., Видаль М. (июнь 1999 г.). «RYBP, новый белок-репрессор, который взаимодействует с компонентами комплекса Polycomb млекопитающих и с фактором транскрипции YY1». Журнал EMBO. 18 (12): 3404–18. Дои:10.1093 / emboj / 18.12.3404. ЧВК  1171420. PMID  10369680.
• Bárdos JI, Saurin AJ, Tissot C, Duprez E, Freemont PS (сентябрь 2000 г.). «HPC3 - это новый ортолог поликомб человека, который взаимодействует и связывается с RING1 и Bmi1 и обладает свойствами репрессии транскрипции». Журнал биологической химии. 275 (37): 28785–92. Дои:10.1074 / jbc.M001835200. PMID  10825164.
• Тримарчи Дж. М., Фэйрчайлд Б., Вен Дж., Лис Дж. А. (февраль 2001 г.). «Фактор транскрипции E2F6 является компонентом Bmi1-содержащего поликомб комплекса млекопитающих». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 98 (4): 1519–24. Дои:10.1073 / pnas.041597698. ЧВК  29289. PMID  11171983.
• Дахия А., Вонг С., Гонсало С., Гэвин М., декан округ Колумбия (сентябрь 2001 г.). «Связывание путей Rb и polycomb». Молекулярная клетка. 8 (3): 557–69. Дои:10.1016 / S1097-2765 (01) 00346-X. PMID  11583618.
• Огава Х., Исигуро К., Гаубац С., Ливингстон Д.М., Накатани И. (май 2002 г.). «Комплекс с модификаторами хроматина, который занимает E2F- и Myc-чувствительные гены в клетках G0». Наука. 296 (5570): 1132–6. Bibcode:2002Наука ... 296.1132O. Дои:10.1126 / science.1069861. PMID  12004135. S2CID  34863978.
• Акасака Т., Такахаши Н., Судзуки М., Косеки Х., Бодмер Р., Кога Х. (август 2002 г.). «MBLR, новый белок пальца RING, напоминающий генные продукты Polycomb млекопитающих, регулируется зависимым от клеточного цикла фосфорилированием» (PDF). Гены в клетки. 7 (8): 835–50. Дои:10.1046 / j.1365-2443.2002.00565.x. HDL:2027.42/72663. PMID  12167161. S2CID  23060582.
• Левин С.С., Вайс А., Эрдджумент-Бромаж Х, Шао З., Темпст П., Кингстон РЭ (сентябрь 2002 г.). «Ядро репрессивного комплекса polycomb композиционно и функционально консервативно у мух и людей». Молекулярная и клеточная биология. 22 (17): 6070–8. Дои:10.1128 / MCB.22.17.6070-6078.2002. ЧВК  134016. PMID  12167701.
• Хиль Дж., Бернард Д., Мартинес Д., Пляж Д. (январь 2004 г.). «Polycomb CBX7 играет объединяющую роль в продолжительности жизни клеток». Природа клеточной биологии. 6 (1): 67–72. Дои:10.1038 / ncb1077. PMID  14647293. S2CID  23315124.
• Обусе С., Ян Х., Нодзаки Н., Гото С., Окадзаки Т., Йода К. (февраль 2004 г.). «Протеомический анализ центромерного комплекса из интерфазных клеток HeLa: поврежденный УФ излучением ДНК-связывающий белок 1 (DDB-1) является компонентом CEN-комплекса, в то время как BMI-1 временно совмещен с центромерной областью в интерфазе». Гены в клетки. 9 (2): 105–20. Дои:10.1111 / j.1365-2443.2004.00705.x. PMID  15009096. S2CID  21813024.
• Wang H, Wang L, Erdjument-Bromage H, Vidal M, Tempst P, Jones RS, Zhang Y (октябрь 2004 г.). «Роль убиквитинирования гистона H2A в сайленсинге Polycomb». Природа. 431 (7010): 873–8. Bibcode:2004 Натур.431..873Вт. Дои:10.1038 / природа02985. PMID  15386022. S2CID  4344378.
• Цинь Х, Ду Д, Чжу Й, Ли Дж, Фэн Л., Лян И, Хань Х (февраль 2005 г.). «Белок PcG HPC2 ингибирует опосредованную RBP-J транскрипцию, взаимодействуя с LIM-белком KyoT2». Письма FEBS. 579 (5): 1220–6. Дои:10.1016 / j.febslet.2005.01.022. PMID  15710417. S2CID  8214807.

внешние ссылки

• RING1 + белок, + человек в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.