POLR2E - POLR2E

POLR2E
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 5IY6, 5IY9, 5IY8, 5IYA, 5IYB, 5IY7, 5IYC, 5IYD
Идентификаторы
Псевдонимы	POLR2E, RPABC1, RPB5, XAP4, hRPB25, hsRPB5, субъединица E полимеразы (РНК) II, субъединица E РНК-полимеразы II, РНК-полимераза II, субъединица I и III E
Внешние идентификаторы	OMIM: 180664 MGI: 1913670 ГомолоГен: 2018 Генные карты: POLR2E
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек)[1] Группа 19p13.3 Начинать 1,086,574 бп[1] Конец 1,095,380 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • Активность РНК-полимеразы II • Активность РНК-полимеразы III • GO: 0001948 связывание с белками • Активность РНК-полимеразы I • ДНК-направленная активность 5'-3 'РНК-полимеразы Сотовый компонент • цитозоль • ДНК-направленный комплекс РНК-полимеразы I • ДНК-направленный комплекс РНК-полимеразы III • ДНК-направленная РНК-полимераза II, основной комплекс • ядро клетки • нуклеоплазма Биологический процесс • прекращение транскрипции РНК-полимеразы I • Сплайсинг мРНК через сплайсосомы • положительная регуляция экспрессии генов, эпигенетическая • инициация транскрипции с промотора РНК-полимеразы I • элонгация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • Кеппинг мРНК 7-метилгуанозина • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • транскрипционно-связанная эксцизионная репарация нуклеотидов • инициация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • GO: 0022415 вирусный процесс • транскрипция с промотора РНК-полимеразы III • сигнальный путь рецептора фактора роста фибробластов • транскрипция мяРНК с промотора РНК-полимеразы II • Метаболический процесс РНК • регуляция сайленсинга генов с помощью miRNA • транскрипция, ДНК-шаблон • элонгация транскрипции с промотора РНК-полимеразы I • положительное регулирование выработки интерферона I типа • поддержание популяции соматических стволовых клеток • положительная регуляция вирусной транскрипции Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	5434	66420
Ансамбль	ENSG00000099817	ENSMUSG00000004667
UniProt	P19388	Q80UW8
RefSeq (мРНК)	NM_002695 NM_001316323 NM_001316324	NM_025554
RefSeq (белок)	NP_001303252 NP_001303253 NP_002686	NP_079830
Расположение (UCSC)	Chr 19: 1.09 - 1.1 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

ДНК-направленные РНК-полимеразы субъединицы I, II и III RPABC1 это белок что у людей кодируется POLR2E ген.^[4]

Этот ген кодирует пятую по величине субъединицу РНК-полимеразы II, полимеразы, ответственной за синтез информационной РНК у эукариот. Эта субъединица является общей для двух других ДНК-направленных РНК-полимераз и присутствует в двукратном молярном избытке по сравнению с другими субъединицами полимеразы. Было продемонстрировано взаимодействие между этой субъединицей и трансактивирующим белком вируса гепатита, что позволяет предположить, что взаимодействие между активаторами транскрипции и полимеразой может происходить через эту субъединицу. Псевдоген находится на хромосоме 11.^[5]

Взаимодействия

POLR2E был показан взаимодействовать с TAF15,^[6] POLR2C,^[7] POLR2G,^[7] POLR2H,^[7] POLR2A,^[7] POLR2B,^[7] POLR2L^[7] и GTF2F2.^[8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000099817 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Акер Дж., Маттей М.Г., Винцерит М., Рокель Н., Депетрис Д., Виньерон М., Кединджер С. (август 1994 г.). «Хромосомная локализация генов субъединиц РНК-полимеразы II человека». Геномика. 20 (3): 496–499. Дои:10.1006 / geno.1994.1208. PMID  8034326.
5. «Ген Entrez: полипептид E полимеразы POLR2E (РНК) II (ДНК-направленный), 25 кДа».
6. Бертолотти, А; Мелот Т; Acker J; Виньерон М; Delattre O; Tora L (март 1998 г.). «EWS, но не EWS-FLI-1, связан как с TFIID, так и с РНК-полимеразой II: взаимодействия между двумя членами семейства TET, EWS и hTAFII68, и субъединицами комплексов TFIID и РНК-полимеразы II». Мол. Клетка. Биол. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 18 (3): 1489–1497. Дои:10.1128 / mcb.18.3.1489. ISSN  0270-7306. ЧВК  108863. PMID  9488465.
7. Акер, Дж; de Graaff M; Чейнел I; Хазак В; Kedinger C; Vigneron M (июль 1997 г.). «Взаимодействие между субъединицами РНК-полимеразы II человека». J. Biol. Chem. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 272 (27): 16815–16821. Дои:10.1074 / jbc.272.27.16815. ISSN  0021-9258. PMID  9201987.
8. Вэй, Вт; Dorjsuren D; Lin Y; Qin W; Номура Т; Hayashi N; Мураками С (апрель 2001 г.). «Прямое взаимодействие между субъединицей RAP30 фактора транскрипции IIF (TFIIF) и субъединицей 5 РНК-полимеразы, которое способствует ассоциации между TFIIF и РНК-полимеразой II». J. Biol. Chem. Соединенные Штаты. 276 (15): 12266–12273. Дои:10.1074 / jbc.M009634200. ISSN  0021-9258. PMID  11278533.

дальнейшее чтение

• Джанг К.Т. (1998). «Tat, Tat-ассоциированная киназа и транскрипция». J. Biomed. Наука. 5 (1): 24–27. Дои:10.1007 / BF02253352. PMID  9570510.
• Янкулов К, Бентли Д (1998). «Транскрипционный контроль: кофакторы Tat и удлинение транскрипции». Curr. Биол. 8 (13): R447–9. Дои:10.1016 / S0960-9822 (98) 70289-1. PMID  9651670. S2CID  15480646.
• Романо Дж., Кастен М., Де Фалько Дж. И др. (2000). «Регуляторные функции Cdk9 и циклина T1 в экспрессии гена пути трансактивации tat ВИЧ». J. Cell. Биохим. 75 (3): 357–368. Дои:10.1002 / (SICI) 1097-4644 (19991201) 75: 3 <357 :: AID-JCB1> 3.0.CO; 2-K. PMID  10536359.
• Марчелло А., Зоппе М., Джакка М. (2002). «Множественные способы регуляции транскрипции трансактиватором HIV-1 Tat». IUBMB Life. 51 (3): 175–181. Дои:10.1080/152165401753544241. PMID  11547919. S2CID  10931640.
• Стивенс М., Де Клерк Э., Бальзарини Дж. (2007). «Регуляция транскрипции ВИЧ-1: молекулярные мишени для химиотерапевтического вмешательства». Med Res Rev. 26 (5): 595–625. Дои:10.1002 / med.20081. ЧВК  7168390. PMID  16838299.
• Харрич Д., Макмиллан Н., Муньос Л. и др. (2007). «Приведут ли разнообразные взаимодействия Tat к новым мишеням для антиретровирусных препаратов?». Текущие цели в отношении лекарств. 7 (12): 1595–1606. Дои:10.2174/138945006779025338. PMID  17168834.
• Като Х., Сумимото Х., Погнонек П. и др. (1992). «ВИЧ-1 Tat действует как фактор процессивности in vitro в сочетании с факторами клеточного удлинения». Genes Dev. 6 (4): 655–666. Дои:10.1101 / gad.6.4.655. PMID  1559613.
• Пати УК, Вайсман С.М. (1991). «Выделение и молекулярная характеристика кДНК, кодирующей субъединицу 23 кДа РНК-полимеразы II человека». J. Biol. Chem. 266 (20): 13468. PMID  2071613.
• Саутгейт С., Запп М.Л., Грин М.Р. (1990). «Активация транскрипции с помощью белка Tat ВИЧ-1, связанного с формирующейся РНК через другой белок». Природа. 345 (6276): 640–642. Bibcode:1990Натура.345..640С. Дои:10.1038 / 345640a0. PMID  2190099. S2CID  4233742.
• Пати Великобритания, Вайсман С.М. (1989). «Выделение и молекулярная характеристика кДНК, кодирующей субъединицу 23 кДа РНК-полимеразы II человека». J. Biol. Chem. 264 (22): 13114–13121. PMID  2753903.
• Ву-Баер Ф, Сигман Д., Гейнор РБ (1995). «Специфическое связывание РНК-полимеразы II с РНК трансактивирующей области вируса иммунодефицита человека регулируется клеточными кофакторами и Tat». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 92 (16): 7153–7157. Bibcode:1995PNAS ... 92.7153W. Дои:10.1073 / пнас.92.16.7153. ЧВК  41297. PMID  7638159.
• Cheong JH, Yi M, Lin Y, Murakami S (1995). «Человеческий RPB5, субъединица, разделяемая эукариотическими ядерными РНК-полимеразами, связывает белок Х вируса гепатита В человека и может играть роль в трансактивации Х». EMBO J. 14 (1): 143–150. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb06984.x. ЧВК  398061. PMID  7828586.
• Herrmann CH, Rice AP (1995). «Белки Tat лентивируса специфически связываются с клеточной протеинкиназой TAK, которая гиперфосфорилирует карбоксиконцевой домен большой субъединицы РНК-полимеразы II: кандидат в кофактор Tat». Дж. Вирол. 69 (3): 1612–1620. Дои:10.1128 / jvi.69.3.1612-1620.1995. ЧВК  188757. PMID  7853496.
• Кин Нью-Джерси, Гейт MJ, Карн Дж (1996). «Вирус иммунодефицита человека типа 1 Tat является неотъемлемым компонентом активированного комплекса транскрипции-элонгации». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 93 (6): 2505–2510. Bibcode:1996PNAS ... 93.2505K. Дои:10.1073 / пнас.93.6.2505. ЧВК  39827. PMID  8637904.
• Ян X, Herrmann CH, Rice AP (1996). «Белки Tat вируса иммунодефицита человека специфически связываются с TAK in vivo и требуют для функционирования карбоксиконцевого домена РНК-полимеразы II». Дж. Вирол. 70 (7): 4576–4584. Дои:10.1128 / jvi.70.7.4576-4584.1996. ЧВК  190394. PMID  8676484.
• Агостини I, Наварро Дж. М., Рей Ф. и др. (1996). «Трансактиватор Vpr вируса иммунодефицита человека типа 1: взаимодействие с промоторными активаторными доменами и связывание с TFIIB». J. Mol. Биол. 261 (5): 599–606. Дои:10.1006 / jmbi.1996.0485. PMID  8800208.
• Чжоу Q, Шарп PA (1996). «Tat-SF1: кофактор для стимуляции элонгации транскрипции с помощью Tat ВИЧ-1». Наука. 274 (5287): 605–610. Bibcode:1996Sci ... 274..605Z. Дои:10.1126 / science.274.5287.605. PMID  8849451. S2CID  13266489.
• Окамото Х., Шелин С.Т., Корден Дж.Л. и др. (1996). «Для трансактивации белком Tat вируса иммунодефицита человека требуется С-концевой домен РНК-полимеразы II». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 93 (21): 11575–11579. Bibcode:1996PNAS ... 9311575O. Дои:10.1073 / пнас.93.21.11575. ЧВК  38099. PMID  8876177.
• Чун РФ, Чжан К.Т. (1996). «Требования к карбоксиконцевому домену РНК-полимеразы II для активированной транскрипции ретровирусов человека, лимфотропного вируса I Т-клеток человека и ВИЧ-1». J. Biol. Chem. 271 (44): 27888–27894. Дои:10.1074 / jbc.271.44.27888. PMID  8910388.