POLR2B - POLR2B

POLR2B
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 5IY9, 5IYA, 5IYC, 5IYB, 5IY7, 5IY8, 5IYD, 5IY6
Идентификаторы
Псевдонимы	POLR2B, POL2RB, RPB2, hRPB140, hsRPB2, субъединица B полимеразы (РНК) II, субъединица B РНК-полимеразы II
Внешние идентификаторы	OMIM: 180661 MGI: 2388280 ГомолоГен: 722 Генные карты: POLR2B
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 4 (человек)[1] Группа 4q12 Начните 56,977,722 бп[1] Конец 57,031,158 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 5 (мышь)[2] Группа 5 | 5 C3.3 Начните 77,310,147 бп[2] Конец 77,349,324 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Онтология генов Молекулярная функция • трансферазная активность • Связывание ДНК • нуклеотидилтрансферазная активность • связывание рибонуклеозидов • Активность РНК-полимеразы II • связывание хроматина • связывание ионов металлов • ДНК-направленная активность 5'-3 'РНК-полимеразы • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание РНК Сотовый компонент • мембрана • ДНК-направленная РНК-полимераза II, основной комплекс • ядро клетки • ядерная хромосома, теломерная область • нуклеоплазма Биологический процесс • Сплайсинг мРНК через сплайсосомы • поддержание популяции соматических стволовых клеток • элонгация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • Кеппинг мРНК 7-метилгуанозина • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • положительная регуляция вирусной транскрипции • транскрипционно-связанная эксцизионная репарация нуклеотидов • инициация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция мяРНК с промотора РНК-полимеразы II • сигнальный путь рецептора фактора роста фибробластов • транскрипция, ДНК-шаблон • Метаболический процесс РНК • регуляция сайленсинга генов с помощью miRNA Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	5431	231329
Ансамбль	ENSG00000047315	ENSMUSG00000029250
UniProt	P30876	Q8CFI7
RefSeq (мРНК)	NM_001303269 NM_000938 NM_001303268	NM_153798
RefSeq (белок)	NP_000929 NP_001290197 NP_001290198	NP_722493
Расположение (UCSC)	Chr 4: 56.98 - 57.03 Мб	Chr 5: 77.31 - 77.35 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

ДНК-направленная субъединица РНК-полимеразы II RPB2 является фермент что у людей кодируется POLR2B ген.^[5][6]

Этот ген кодирует вторую по величине субъединицу РНК-полимеразы II, полимеразы, ответственной за синтез информационной РНК у эукариот. Эта субъединица в сочетании по меньшей мере с двумя другими субъединицами полимеразы образует структуру внутри полимеразы, которая поддерживает контакт в активном сайте фермента между матрицей ДНК и вновь синтезированной РНК.^[7]

Взаимодействия

POLR2B был показан взаимодействовать с участием POLR2C,^[8] POLR2E,^[8] POLR2H^[8] и POLR2L.^[8]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000047315 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029250 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Акер Дж., Винцерит М., Виньерон М., Кединджер С. (октябрь 1992 г.). «Первичная структура второй по величине субъединицы РНК-полимеразы II (или B) человека». Дж Мол Биол. 226 (4): 1295–9. Дои:10.1016 / 0022-2836 (92) 91071-В. PMID  1518060.
6. Акер Дж., Маттей М.Г., Винцерит М., Рокель Н., Депетрис Д., Виньерон М., Кединджер С. (август 1994 г.). «Хромосомная локализация генов субъединиц РНК-полимеразы II человека». Геномика. 20 (3): 496–9. Дои:10.1006 / geno.1994.1208. PMID  8034326.
7. «Ген Entrez: полипептид B полимеразы (РНК) II (ДНК-направленный) POLR2B, 140 кДа».
8. Акер, Дж; de Graaff M; Чейнел I; Хазак В; Kedinger C; Vigneron M (июль 1997 г.). «Взаимодействие между субъединицами РНК-полимеразы II человека». J. Biol. Chem. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 272 (27): 16815–21. Дои:10.1074 / jbc.272.27.16815. ISSN  0021-9258. PMID  9201987.

дальнейшее чтение

• Джанг К.Т. (1998). «Tat, Tat-ассоциированная киназа и транскрипция». J. Biomed. Наука. 5 (1): 24–7. Дои:10.1007 / BF02253352. PMID  9570510.
• Янкулов К, Бентли Д (1998). «Транскрипционный контроль: кофакторы Tat и удлинение транскрипции». Curr. Биол. 8 (13): R447–9. Дои:10.1016 / S0960-9822 (98) 70289-1. PMID  9651670. S2CID  15480646.
• Романо Дж., Кастен М., Де Фалько Дж. И др. (2000). «Регуляторные функции Cdk9 и циклина T1 в экспрессии гена пути трансактивации tat ВИЧ». J. Cell. Биохим. 75 (3): 357–68. Дои:10.1002 / (SICI) 1097-4644 (19991201) 75: 3 <357 :: AID-JCB1> 3.0.CO; 2-K. PMID  10536359.
• Марчелло А., Зоппе М., Джакка М. (2002). «Множественные способы регуляции транскрипции трансактиватором ВИЧ-1 Tat». IUBMB Life. 51 (3): 175–81. Дои:10.1080/152165401753544241. PMID  11547919. S2CID  10931640.
• Стивенс М., Де Клерк Э., Бальзарини Дж. (2007). «Регуляция транскрипции ВИЧ-1: молекулярные мишени для химиотерапевтического вмешательства». Med Res Rev. 26 (5): 595–625. Дои:10.1002 / med.20081. ЧВК  7168390. PMID  16838299.
• Харрич Д., Макмиллан Н., Муньос Л. и др. (2007). «Приведут ли разнообразные взаимодействия Tat к новым мишеням для антиретровирусных препаратов?». Текущие цели в отношении лекарств. 7 (12): 1595–606. Дои:10.2174/138945006779025338. PMID  17168834.
• Като Х., Сумимото Х., Погнонек П. и др. (1992). «ВИЧ-1 Tat действует как фактор процессивности in vitro в сочетании с факторами клеточного удлинения». Genes Dev. 6 (4): 655–66. Дои:10.1101 / gad.6.4.655. PMID  1559613.
• Саутгейт C, Zapp ML, Green MR (1990). «Активация транскрипции с помощью белка Tat ВИЧ-1, связанного с формирующейся РНК через другой белок». Природа. 345 (6276): 640–2. Bibcode:1990Натура.345..640С. Дои:10.1038 / 345640a0. PMID  2190099. S2CID  4233742.
• Чжэн XM, Черный D, Chambon P, Egly JM (1990). «Секвенирование и экспрессия комплементарной ДНК для общего фактора транскрипции BTF3». Природа. 344 (6266): 556–9. Bibcode:1990Натура.344..556Z. Дои:10.1038 / 344556a0. PMID  2320128. S2CID  4227320.
• Ву-Баер Ф, Сигман Д., Гейнор РБ (1995). «Специфическое связывание РНК-полимеразы II с РНК трансактивирующей области вируса иммунодефицита человека регулируется клеточными кофакторами и Tat». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 92 (16): 7153–7. Bibcode:1995PNAS ... 92.7153W. Дои:10.1073 / пнас.92.16.7153. ЧВК  41297. PMID  7638159.
• Herrmann CH, Rice AP (1995). «Белки Tat лентивируса специфически связываются с клеточной протеинкиназой, TAK, которая гиперфосфорилирует карбоксиконцевой домен большой субъединицы РНК-полимеразы II: кандидат в кофактор Tat». Дж. Вирол. 69 (3): 1612–20. Дои:10.1128 / JVI.69.3.1612-1620.1995. ЧВК  188757. PMID  7853496.
• Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Д.Ю. и др. (1996). «Метод« двойного адаптера »для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Анальный. Биохим. 236 (1): 107–13. Дои:10.1006 / abio.1996.0138. PMID  8619474.
• Кин Нью-Джерси, Походка MJ, Карн Дж (1996). «Вирус иммунодефицита человека типа 1 Tat является неотъемлемым компонентом активированного комплекса транскрипции-элонгации». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 93 (6): 2505–10. Bibcode:1996PNAS ... 93.2505K. Дои:10.1073 / пнас.93.6.2505. ЧВК  39827. PMID  8637904.
• Ян X, Herrmann CH, Rice AP (1996). «Белки Tat вируса иммунодефицита человека специфически связываются с TAK in vivo и требуют для функционирования карбоксиконцевого домена РНК-полимеразы II». Дж. Вирол. 70 (7): 4576–84. Дои:10.1128 / JVI.70.7.4576-4584.1996. ЧВК  190394. PMID  8676484.
• Агостини I, Наварро Дж. М., Рей Ф. и др. (1996). «Трансактиватор Vpr вируса иммунодефицита человека типа 1: взаимодействие с активаторными доменами, связанными с промотором, и связывание с TFIIB». J. Mol. Биол. 261 (5): 599–606. Дои:10.1006 / jmbi.1996.0485. PMID  8800208.
• Чжоу Q, Шарп PA (1996). «Tat-SF1: кофактор для стимуляции элонгации транскрипции с помощью Tat ВИЧ-1». Наука. 274 (5287): 605–10. Bibcode:1996Sci ... 274..605Z. Дои:10.1126 / science.274.5287.605. PMID  8849451. S2CID  13266489.
• Окамото Х., Шелин С.Т., Корден Дж.Л. и др. (1996). «Для трансактивации белка Tat вируса иммунодефицита человека требуется С-концевой домен РНК-полимеразы II». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 93 (21): 11575–9. Bibcode:1996PNAS ... 9311575O. Дои:10.1073 / пнас.93.21.11575. ЧВК  38099. PMID  8876177.
• Чун РФ, Чжан К.Т. (1996). «Требования к карбоксиконцевому домену РНК-полимеразы II для активированной транскрипции ретровирусов человека, лимфотропного вируса Т-клеток человека I и ВИЧ-1». J. Biol. Chem. 271 (44): 27888–94. Дои:10.1074 / jbc.271.44.27888. PMID  8910388.