HTATSF1 - HTATSF1

HTATSF1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2DIT
Идентификаторы
Псевдонимы	HTATSF1, TAT-SF1, TATSF1, dJ196E23.2, ВИЧ-1 Tat-специфический фактор 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 300346 MGI: 1919709 ГомолоГен: 40950 Генные карты: HTATSF1
Расположение гена (человек) Chr. Х-хромосома (человек)[1] Группа Xq26.3 Начинать 136,497,079 бп[1] Конец 136,512,346 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Х-хромосома (мышь)[2] Группа X | X A6 Начинать 57,053,583 бп[2] Конец 57,067,183 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание нуклеиновой кислоты • Связывание РНК Сотовый компонент • Сплайсосомальный комплекс типа U2 • ядро клетки • U2 snRNP • нуклеоплазма Биологический процесс • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • вирусная репликация • регуляция ДНК-шаблонной транскрипции, элонгации • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • транскрипция, ДНК-шаблон • Сплайсинг мРНК через сплайсосомы Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	27336	72459
Ансамбль	ENSG00000102241	ENSMUSG00000067873
UniProt	O43719	Q8BGC0
RefSeq (мРНК)	NM_001163280 NM_014500	NM_028242 NM_029371
RefSeq (белок)	NP_001156752 NP_055315	NP_082518 NP_083647
Расположение (UCSC)	Chr X: 136,5 - 136,51 Мб	Chr X: 57.05 - 57.07 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Tat-специфический фактор 1 ВИЧ это белок что у людей кодируется HTATSF1 ген.^[5][6]

В то время как большинство факторов транскрипции, специфичных для последовательности ДНК, увеличивают скорость инициации и взаимодействуют с энхансером или промоторной ДНК, Tat вируса иммунодефицита человека-1 (ВИЧ-1) преимущественно стимулирует удлинение и взаимодействует с транс-действующим чувствительным (TAR) элементом РНК. Tat необходим для репликации ВИЧ. [Предоставлено OMIM]^[6]

Взаимодействия

HTATSF1 показал взаимодействовать с SUPT5H^[7] и GTF2F2.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000102241 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000067873 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Чжоу Кью, Шарп, Пенсильвания (ноябрь 1996 г.). «Tat-SF1: кофактор для стимуляции элонгации транскрипции с помощью Tat ВИЧ-1». Наука. 274 (5287): 605–10. Bibcode:1996Sci ... 274..605Z. Дои:10.1126 / science.274.5287.605. PMID  8849451.
6. "Ген Entrez: HTATSF1 ВИЧ-1 Tat специфический фактор 1".
7. Ким, Джей Би; Yamaguchi Y; Wada T; Handa H; Sharp P A (сентябрь 1999 г.). «Белок Tat-SF1 связывается с белками RAP30 и SPT5 человека». Мол. Клетка. Биол. 19 (9): 5960–8. Дои:10.1128 / mcb.19.9.5960. ISSN  0270-7306. ЧВК  84462. PMID  10454543.

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Чжоу К., Чен Д., Пьерсторф Э., Ло К. (1998). «Фактор элонгации транскрипции P-TEFb опосредует активацию Tat транскрипции ВИЧ-1 на нескольких этапах». EMBO J. 17 (13): 3681–91. Дои:10.1093 / emboj / 17.13.3681. ЧВК  1170704. PMID  9649438.
• Ян Д., Перриман Р., Игель Х. и др. (1998). «CUS2, дрожжевой гомолог человеческого Tat-SF1, восстанавливает функцию неправильно свернутого U2 через необычный мотив распознавания РНК». Мол. Клетка. Биол. 18 (9): 5000–9. Дои:10.1128 / MCB.18.9.5000. ЧВК  109085. PMID  9710584.
• Ли XY, Грин М.Р. (1998). «Клеточный коактиватор Tat ВИЧ-1 Tat-SF1 представляет собой общий фактор элонгации транскрипции». Genes Dev. 12 (19): 2992–6. Дои:10.1101 / gad.12.19.2992. ЧВК  317190. PMID  9765201.
• Parada CA, Roeder RG (1999). «Новый комплекс, содержащий РНК-полимеразу II, усиливает транскрипцию ВИЧ-1, усиленную Tat». EMBO J. 18 (13): 3688–701. Дои:10.1093 / emboj / 18.13.3688. ЧВК  1171446. PMID  10393184.
• Ким Дж. Б., Ямагути Ю., Вада Т. и др. (1999). «Белок Tat-SF1 связывается с белками RAP30 и SPT5 человека». Мол. Клетка. Биол. 19 (9): 5960–8. Дои:10.1128 / mcb.19.9.5960. ЧВК  84462. PMID  10454543.
• Фонг YW, Чжоу Q (2000). «Освобождение от двух встроенных аутоингибиторных механизмов в P-TEFb необходимо для сборки многокомпонентного комплекса элонгации транскрипции на промоторе вируса иммунодефицита человека типа 1». Мол. Клетка. Биол. 20 (16): 5897–907. Дои:10.1128 / MCB.20.16.5897-5907.2000. ЧВК  86067. PMID  10913173.
• Suñé C, Goldstrohm AC, Peng J, et al. (2000). «Система транскрипции in vitro, которая воспроизводит tat-опосредованное tat подавление активности Tat вируса иммунодефицита человека типа 1, демонстрирует роль положительного фактора элонгации транскрипции b и связанных белков в механизме активации Tat». Вирусология. 274 (2): 356–66. Дои:10.1006 / viro.2000.0480. PMID  10964778.
• Симмонс А., Алувихар В., МакМайкл А. (2001). «Nef запускает программу транскрипции в Т-клетках, имитируя активацию Т-клеток с одним сигналом и индуцируя медиаторы вирулентности ВИЧ». Иммунитет. 14 (6): 763–77. Дои:10.1016 / S1074-7613 (01) 00158-3. PMID  11420046.
• Фонг YW, Чжоу Q (2002). «Стимулирующее действие факторов сплайсинга на удлинение транскрипции». Природа. 414 (6866): 929–33. Дои:10.1038 / 414929a. PMID  11780068.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Чжоу BY, Он JJ (2004). «Ингибирование пролиферации астроцитов, нейронов и неглиальных клеток с помощью внутриклеточного экспрессированного белка Tat вируса иммунодефицита человека типа 1 (ВИЧ-1)». Neurosci. Латыш. 359 (3): 155–8. Дои:10.1016 / j.neulet.2004.02.012. PMID  15050687.
• Баллиф Б.А., Виллен Дж., Босолей С.А. и др. (2005). «Фосфопротеомный анализ развивающегося мозга мыши». Мол. Клетка. Протеомика. 3 (11): 1093–101. Дои:10.1074 / mcp.M400085-MCP200. PMID  15345747.
• Смит MJ, Kulkarni S, Pawson T (2004). «Домены FF CA150 связывают факторы транскрипции и сплайсинга посредством множественных слабых взаимодействий». Мол. Клетка. Биол. 24 (21): 9274–85. Дои:10.1128 / MCB.24.21.9274-9285.2004. ЧВК  522232. PMID  15485897.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Чжоу М., Дэн Л., Лакост В. и др. (2004). «Координация фосфорилирования фактора транскрипции и метилирования гистонов киназой P-TEFb во время транскрипции вируса иммунодефицита человека 1 типа». Дж. Вирол. 78 (24): 13522–33. Дои:10.1128 / JVI.78.24.13522-13533.2004. ЧВК  533906. PMID  15564463.
• Росс М.Т., Графхэм Д.В., Коффи А.Дж. и др. (2005). «Последовательность ДНК Х-хромосомы человека». Природа. 434 (7031): 325–37. Bibcode:2005Натура.434..325р. Дои:10.1038 / природа03440. ЧВК  2665286. PMID  15772651.
• Missé D, Gajardo J, Oblet C и др. (2005). «Растворимый gp120 ВИЧ-1 усиливает репликацию ВИЧ-1 в неделящихся CD4 + Т-клетках, опосредованно посредством передачи сигналов клеток и сверхэкспрессии кофактора Tat». СПИД. 19 (9): 897–905. Дои:10.1097 / 01.aids.0000171403.07995.92. PMID  15905670.