Фактор ингибирования лейкемии - Leukemia inhibitory factor

LIF
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1EMR, 1ПВХ, 2Q7N
Идентификаторы
Псевдонимы	LIF, CDF, DIA, HILDA, MLPLI, фактор ингибирования лейкемии, цитокин семейства интерлейкинов 6, цитокин семейства интерлейкинов 6 LIF
Внешние идентификаторы	OMIM: 159540 MGI: 96787 ГомолоГен: 1734 Генные карты: LIF
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 22 (человек)[1] Группа 22q12.2 Начните 30,240,453 бп[1] Конец 30,246,759 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 A1 | 11 2,94 см Начните 4,257,557 бп[2] Конец 4,272,514 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • рецепторное связывание • активность фактора роста • цитокиновая активность • GO: 0001948 связывание с белками • связывание рецептора фактора ингибирования лейкемии Сотовый компонент • внеклеточная область • внеклеточный • цитозоль Биологический процесс • отрицательное регулирование пролиферации клеток • дифференцировка стволовых клеток • положительное регулирование фосфорилирования пептидил-серина белка STAT • положительное регулирование каскада МАПК • положительная регуляция фосфорилирования пептидил-серина • дифференцировка спонгиотрофобластов • развитие легких • положительная регуляция ацетилирования гистонов H3-K27 • развитие многоклеточного организма • морфогенез доли легкого • морфогенез мышечных органов • материнский процесс, связанный с беременностью женщины • отрицательная регуляция секреции гормонов • сигнальный путь фактора ингибирования лейкемии • регуляция дифференцировки эпителиальных клеток метанефрических канальцев нефрона • регулирование дифференцировки клеток • положительная регуляция экспрессии генов • поддержание популяции стволовых клеток • положительная регуляция фосфорилирования пептидилтирозина • регуляция связывания ДНК, специфичного для последовательности регуляторной области РНК-полимеразы II • положительная регуляция дифференцировки астроцитов • отрицательная регуляция каскада ERK1 и ERK2 • развитие нейрона • децидуализация • позитивная регуляция мезенхимального перехода в эпителиальный, участвующего в морфогенезе метанефроса • развитие альвеол легких • положительная регуляция дифференцировки макрофагов • ремоделирование кровеносных сосудов • дифференцировка гигантских клеток трофобласта • развитие сосудистой сети легких • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • положительная регуляция локализации белка в ядре • имплантация эмбриона • отрицательная регуляция мейотического деления ядра • иммунная реакция • положительное регулирование пролиферации клеток • положительная регуляция фосфорилирования тирозина белка STAT • фосфорилирование тирозина белка STAT • регуляция рецепторной активности • цитокин-опосредованный сигнальный путь Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	3976	16878
Ансамбль	ENSG00000128342	ENSMUSG00000034394
UniProt	P15018	P09056
RefSeq (мРНК)	NM_001257135 NM_002309	NM_001039537 NM_008501
RefSeq (белок)	NP_001244064 NP_002300	NP_001034626 NP_032527
Расположение (UCSC)	Chr 22: 30.24 - 30.25 Мб	Chr 11: 4.26 - 4.27 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фактор ингибирования лейкемии, или же LIF, является интерлейкин 6 класс цитокин это влияет ячейка рост путем ингибирования дифференциации. Когда уровни LIF падают, клетки дифференцируются.

Функция

LIF получил свое название от своей способности вызывать терминальный дифференциация из миелоидный лейкоз клетки, тем самым предотвращая их дальнейший рост. Другие свойства, приписываемые цитокину, включают: стимуляцию роста и дифференцировку клеток различных типов клеток-мишеней, влияние на кость метаболизм, кахексия, нейронное развитие, эмбриогенез и воспаление. p53 было показано, что регулируемый LIF способствует имплантация в модели мышей и, возможно, у людей.^[5] Было высказано предположение, что рекомбинантный человеческий LIF может помочь улучшить частоту имплантации у женщин с необъяснимым бесплодием.^[6]

Привязка / активация

LIF связывается с конкретным LIF рецептор (LIFR -α), который образует гетеродимер со специфической субъединицей, общей для всех членов этого семейства рецепторов, GP130 субъединица передачи сигнала. Это приводит к активации JAK /СТАТ (Янус киназа /преобразователь сигнала и активатор транскрипция ) и MAPK (митоген активирован белок киназа ) каскады.^{[нужна цитата ]}

Выражение

LIF обычно выражается в трофэктодерма развивающегося эмбриона с его рецептором LIFR, экспрессируемым на всем протяжении внутренняя клеточная масса. Поскольку эмбриональные стволовые клетки происходят из внутренней клеточной массы на стадии бластоцисты, удаление их из внутренней клеточной массы также удаляет их источник LIF. Рекомбинантный LIF был произведен в растениях InVitria.

Использование в культуре стволовых клеток

LIF часто добавляют в среду для культивирования стволовых клеток в качестве альтернативы культуре питающих клеток из-за ограничения, которое присутствуют питающие клетки, производя LIF только на их клеточной поверхности. Фидерные ячейки без LIF ген не поддерживают стволовые клетки.^[7] LIF способствует самообновлению за счет привлечения преобразователя сигнала и активатора транскрипции 3 (Stat3 ). Stat3 рекрутируется на активированный рецептор LIF и фосфорилируется Янус киназа. Следует отметить, что LIF и Stat3 недостаточны для подавления дифференцировки стволовых клеток, поскольку клетки будут дифференцироваться после удаления сыворотки. Во время фазы обратимости дифференцировки от наивной плюрипотентности можно вернуть клетки обратно к наивной плюрипотентности путем добавления LIF.^[8]Удаление LIF подталкивает стволовые клетки к дифференциация однако генетические манипуляции с эмбриональными стволовыми клетками позволяют LIF-независимый рост, особенно сверхэкспрессию гена Наног.

LIF обычно добавляют в среду для культивирования стволовых клеток для уменьшения спонтанной дифференцировки.^[9][10]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000128342 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000034394 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Ху В., Фэн З., Терески А.К., Левин А.Дж. (ноябрь 2007 г.). «p53 регулирует материнское воспроизводство через LIF». Природа. 450 (7170): 721–4. Bibcode:2007Натура.450..721H. Дои:10.1038 / природа05993. PMID  18046411.
6. Агаджанова Л. (декабрь 2004 г.). «Фактор ингибирования лейкемии и имплантация человеческого эмбриона». Летопись Нью-Йоркской академии наук. 1034 (1): 176–83. Bibcode:2004НЯСА1034..176А. Дои:10.1196 / летопись.1335.020. PMID  15731310.
7. Стюарт К.Л., Каспар П., Брюнет Л.Дж., Бхатт Х., Гади И., Кентген Ф., Аббонданцо С.Дж. (сентябрь 1992 г.). «Имплантация бластоцисты зависит от материнской экспрессии фактора ингибирования лейкемии». Природа. 359 (6390): 76–9. Bibcode:1992Натура 359 ... 76С. Дои:10.1038 / 359076a0. PMID  1522892.
8. Мартелло Г., Смит А. (2014). «Природа эмбриональных стволовых клеток». Ежегодный обзор клеточной биологии и биологии развития. 30: 647–75. Дои:10.1146 / annurev-cellbio-100913-013116. PMID  25288119.
9. Кавахара Ю., Манабэ Т., Мацумото М., Кадзиумэ Т., Мацумото М., Юге Л. (июль 2009 г.). Zwaka T (ред.). «Культура эмбриональных стволовых клеток без LIF в моделируемой микрогравитации». PLOS ONE. 4 (7): e6343. Bibcode:2009PLoSO ... 4.6343K. Дои:10.1371 / journal.pone.0006343. ЧВК  2710515. PMID  19626124.
10. "CGS: PTO обнаруживает ожидаемый патент на стволовые клетки, очевидный в свете" важных ориентиров'". Архивировано из оригинал на 2011-10-04.

дальнейшее чтение

• Паттерсон PH (август 1994 г.). «Фактор ингибирования лейкемии, цитокин на стыке нейробиологии и иммунологии». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 91 (17): 7833–5. Bibcode:1994PNAS ... 91.7833P. Дои:10.1073 / пнас.91.17.7833. ЧВК  44497. PMID  8058719.
• Агаджанова Л. (декабрь 2004 г.). «Фактор ингибирования лейкемии и имплантация человеческого эмбриона». Летопись Нью-Йоркской академии наук. 1034: 176–83. Bibcode:2004НЯСА1034..176А. Дои:10.1196 / летопись.1335.020. PMID  15731310.
• Králícková M, Síma P, Rokyta Z (2005). «Роль мутаций гена фактора, ингибирующего лейкоз, у бесплодных женщин: перекрестная связь между эмбриональными и эндометриальными цитокинами во время имплантации - хрупкое гомеостатическое равновесие». Folia Microbiologica. 50 (3): 179–86. Дои:10.1007 / BF02931563. PMID  16295654.
• Шталь Дж., Геринг Д.П., Уилсон Т.А., Браун М.А., Кинг Д.А., Гоф Н.М. (май 1990 г.). «Структурная организация генов фактора ингибирования лейкемии мышей и человека. Эволюционное сохранение кодирующих и некодирующих областей». Журнал биологической химии. 265 (15): 8833–41. PMID  1692837.
• Базан Дж. Ф. (август 1991 г.). «Нейропоэтические цитокины кроветворной складки». Нейрон. 7 (2): 197–208. Дои:10.1016/0896-6273(91)90258-2. PMID  1714745.
• Лоу Д.Г., Нуньес В., Бомбара М., МакКейб С., Диапазоны Г.Е., Хензель В., Томида М., Ямамото-Ямагути Ю., Ходзуми М., Геддел Д.В. (июнь 1989 г.). «Геномное клонирование и гетерологичная экспрессия человеческого фактора, стимулирующего дифференцировку». ДНК. 8 (5): 351–9. Дои:10.1089 / dna.1.1989.8.351. PMID  2475312.
• Сазерленд Г.Р., Бейкер Э., Хайленд В.Дж., Каллен Д.Ф., Шталь Дж., Гоф Н.М. (январь 1989 г.). «Ген фактора ингибирования лейкемии человека (LIF) соответствует 22q12». Лейкемия. 3 (1): 9–13. PMID  2491897.
• Мори М., Ямагути К., Абе К. (май 1989 г.). «Очистка белка, ингибирующего липопротеинлипазу, продуцируемого линией клеток меланомы, связанной с раковой кахексией». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 160 (3): 1085–92. Дои:10.1016 / S0006-291X (89) 80114-7. PMID  2730639.
• Gough NM, Gearing DP, King JA, Willson TA, Hilton DJ, Nicola NA, Metcalf D (апрель 1988 г.). «Молекулярное клонирование и экспрессия человеческого гомолога мышиного гена, кодирующего фактор ингибирования миелоидной лейкемии». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 85 (8): 2623–7. Bibcode:1988PNAS ... 85.2623G. Дои:10.1073 / pnas.85.8.2623. ЧВК  280050. PMID  3128791.
• Уильямс Р.Л., Хилтон Д.Д., Пиз С., Уилсон Т.А., Стюарт К.Л., Геринг Д.П., Вагнер Э.Ф., Меткалф Д., Никола Н.А., Гоф Н.М. (декабрь 1988 г.). «Фактор ингибирования миелоидной лейкемии поддерживает потенциал развития эмбриональных стволовых клеток». Природа. 336 (6200): 684–7. Bibcode:1988 Натур. 336..684Вт. Дои:10.1038 / 336684a0. PMID  3143916.
• Моро Дж. Ф., Дональдсон Д. Д., Беннетт Ф., Витек-Джаннотти Дж., Кларк С. К., Вонг Г. Г. (декабрь 1988 г.). «Фактор ингибирования лейкемии идентичен человеческому интерлейкину миелоидного фактора роста для DA-клеток». Природа. 336 (6200): 690–2. Bibcode:1988Натура.336..690М. Дои:10.1038 / 336690a0. PMID  3143918.
• Ямагути М., Мики Н., Оно М., Оцука С., Демура Х., Курачи Х., Иноуэ М., Эндо Х., Тага Т., Кисимото Т. (март 1995 г.). «Ингибирование выработки фактора высвобождения гормона роста в плаценте мыши цитокинами с использованием gp130 в качестве преобразователя сигнала». Эндокринология. 136 (3): 1072–8. Дои:10.1210 / en.136.3.1072. PMID  7867561.
• Schmelzer CH, Harris RJ, Butler D, Yedinak CM, Wagner KL, Burton LE (май 1993 г.). «Паттерн гликозилирования и дисульфидные отнесения рекомбинантного человеческого фактора, стимулирующего дифференцировку». Архивы биохимии и биофизики. 302 (2): 484–9. Дои:10.1006 / abbi.1993.1243. PMID  8489250.
• Айкава Дж., Икеда-Наики С., Огане Дж., Мин К.С., Имамура Т., Сасай К., Сиота К., Огава Т. (сентябрь 1997 г.). «Молекулярное клонирование гена альфа-цепи рецептора фактора ингибирования лейкемии крыс и его экспрессия во время беременности». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Структура и экспрессия гена. 1353 (3): 266–76. Дои:10.1016 / s0167-4781 (97) 00079-1. PMID  9349722.
• Хайндс М.Г., Маурер Т., Чжан Дж.Г., Никола Н.А., Нортон Р.С. (май 1998 г.). «Структура раствора фактора ингибирования лейкемии». Журнал биологической химии. 273 (22): 13738–45. Дои:10.1074 / jbc.273.22.13738. PMID  9593715.
• Центр Сангера, The; Центр секвенирования генома Вашингтонского университета, The (ноябрь 1998 г.). «К полной последовательности человеческого генома». Геномные исследования. 8 (11): 1097–108. Дои:10.1101 / гр. 8.11.1097. PMID  9847074.
• Танака М., Хара Т., Коупленд Н. Г., Гилберт Д. Д., Дженкинс Н. А., Миядзима А. (февраль 1999 г.). «Восстановление функционального мышиного рецептора онкостатина М (OSM): молекулярное клонирование бета-субъединицы мышиного рецептора OSM». Кровь. 93 (3): 804–15. Дои:10.1182 / кровь.V93.3.804. PMID  9920829.
• Накашима К., Янагисава М., Аракава Н., Кимура Н., Хисацунэ Т., Кавабата М., Миядзоно К., Тага Т. (апрель 1999 г.). «Синергетическая передача сигналов в мозге плода с помощью комплекса STAT3-Smad1, соединенного мостиком p300». Наука. 284 (5413): 479–82. Bibcode:1999Научный ... 284..479N. Дои:10.1126 / science.284.5413.479. PMID  10205054.
• Данхэм I, Симидзу Н., Роу Б.А., Чиссо С., Хант А.Р., Коллинз Дж. Э., Брускевич Р., Беар Д.М., Зажим М., Сминк Л.Дж., Эйнскау Р., Алмейда Дж. П., Бэббидж А., Баггулей С., Бейли Дж., Барлоу К., Бейтс К. , Бисли О., Берд С. П., Блейки С., Бриджман А. М., Бак Д., Берджесс Дж., Беррилл В. Д., О'Брайен КП (декабрь 1999 г.). «Последовательность ДНК хромосомы 22 человека». Природа. 402 (6761): 489–95. Bibcode:1999Натура.402..489D. Дои:10.1038/990031. PMID  10591208.

внешняя ссылка

• Лейкемия + ингибирующий + фактор в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
• Источник рекомбинированного фактора ингибирования лейкемии (http://www.invitria.com/cell-culture-products-services/leukemia-inhibitory-factor-culture-media.html )
• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: P15018 (Фактор ингибирования лейкемии) на PDBe-KB.