CXCL11 - CXCL11

CXCL11
Доступные конструкции PDB Human UniProt search: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1RJT
Идентификаторы
Псевдонимы	CXCL11, H174, I-TAC, IP-9, IP9, SCYB11, SCYB9B, b-R1, хемокиновый лиганд с мотивом C-X-C 11
Внешние идентификаторы	OMIM: 604852 ГомолоГен: 3944 Генные карты: CXCL11
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 4 (человек)[1] Группа 4q21.1 Начинать 76,033,682 бп[1] Конец 76,041,415 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • хемокиновая активность • цитокиновая активность • связывание гепарина • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание с хемокиновым рецептором CXCR3 Сотовый компонент • внеклеточная область • внеклеточный • внутриклеточный Биологический процесс • хемотаксис • положительная регуляция хемотаксиса лейкоцитов • Хемотаксис Т-клеток • хемокин-опосредованный сигнальный путь • ответ на липополисахарид • передача сигналов от клетки к клетке • положительное регулирование высвобождения секвестрированного иона кальция в цитозоль • положительная регуляция передачи сигналов с помощью цАМФ • регулирование пролиферации клеток • иммунная реакция • преобразование сигнала • ответ защиты • воспалительная реакция • антимикробный гуморальный иммунный ответ, опосредованный антимикробным пептидом • регуляция рецепторной активности • Путь передачи сигналов рецептора, сопряженного с G-белком • Путь передачи сигналов рецептора, активирующего аденилатциклазу, сопряженного с G-белком • хемотаксис нейтрофилов • хемотаксис лейкоцитов • клеточный ответ на липополисахарид Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	6373	н / д
Ансамбль	ENSG00000169248	н / д
UniProt	O14625	н / д
RefSeq (мРНК)	NM_005409 NM_001302123	н / д
RefSeq (белок)	NP_001289052 NP_005400	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 4: 76.03 - 76.04 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	н / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека

Хемокин с мотивом C-X-C 11 (CXCL11) - это белок что у людей кодируется CXCL11 ген.^[3]

Хемокин 11 с мотивом C-X-C представляет собой небольшой цитокин принадлежащий CXC хемокин семья, которую еще называют Интерферон-индуцируемые Т-клетки альфа хемоаттрактант (I-TAC) и Интерферон-гамма-индуцируемый белок 9 (ИП-9). Высоко экспрессируется в периферической крови. лейкоциты, поджелудочная железа и печень, с умеренным уровнем в вилочковая железа, селезенка и легкое и низкие уровни экспрессии были в тонкий кишечник, плацента и предстательная железа.^[4]

Экспрессия гена CXCL11 сильно индуцируется IFN-γ и IFN-β, и слабо индуцируется IFN-α.^[5] Этот хемокин оказывает свое действие на свои клетки-мишени, взаимодействуя с клеточной поверхностью. хемокиновый рецептор CXCR3, с более высокой близость чем другие лиганды этого рецептора, CXCL9 и CXCL10.^[4][6] CXCL11 - это хемотаксический для активированного Т-клетки. Его ген расположен у человека хромосома 4 наряду со многими другими членами семейства хемокинов CXC.^[7][8]

Биомаркеры

CXCL9, -10, -11 оказались действительными биомаркерами для развития сердечной недостаточности и дисфункции левого желудочка, что указывает на патофизиологическую связь между уровнями этих хемокинов и развитием неблагоприятного ремоделирования сердца.^[9][10]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000169248 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. «Ген Entrez: хемокин CXCL11 (мотив C-X-C), лиганд 11».
4. Коул К.Э., Стрик К.А., Парадис Т.Дж., Огборн К.Т., Лутшер М., Глэду Р.П., Лин В., Бойд Дж. Г., Мозер Б., Вуд Д. Е., Сахаган Б. Г., Неот К. (июнь 1998 г.). «Интерферон-индуцируемый альфа-хемоаттрактант Т-клеток (I-TAC): новый хемокин CXC, не связанный с ELR, с сильной активностью в отношении активированных Т-клеток посредством селективного связывания с высоким сродством с CXCR3». Журнал экспериментальной медицины. 187 (12): 2009–21. Дои:10.1084 / jem.187.12.2009. ЧВК  2212354. PMID  9625760.
5. Рани М.Р., Фостер Г.Р., Леунг С., Лиман Д., Старк Г.Р., Рансохофф Р.М. (сентябрь 1996 г.). «Характеристика бета-R1, гена, который селективно индуцируется интерфероном бета (IFN-бета) по сравнению с IFN-альфа». Журнал биологической химии. 271 (37): 22878–84. Дои:10.1074 / jbc.271.37.22878. PMID  8798467.
6. Tensen CP, Flier J, Van Der Raaij-Helmer EM, Sampat-Sardjoepersad S, Van Der Schors RC, Leurs R, Scheper RJ, Boorsma DM, Willemze R (май 1999). «Человеческий IP-9: полученный из кератиноцитов высокоаффинный CXC-хемокиновый лиганд для рецептора IP-10 / Mig (CXCR3)». Журнал следственной дерматологии. 112 (5): 716–22. Дои:10.1046 / j.1523-1747.1999.00581.x. PMID  10233762.
7. Эрдель М., Лайх А., Утерманн Г., Вернер Э. Р., Вернер-Фельмайер Г. (1998). «Ген человека, кодирующий SCYB9B, предполагаемый новый хемокин CXC, картируется на хромосоме 4q21 человека, как близкородственные гены MIG (SCYB9) и INP10 (SCYB10)». Цитогенетика и клеточная генетика. 81 (3–4): 271–2. Дои:10.1159/000015043. PMID  9730616. S2CID  46846304.
8. О'Донован Н., Гэлвин М., Морган Дж. Г. (1999). «Физическое картирование хемокинового локуса CXC на хромосоме 4 человека». Цитогенетика и клеточная генетика. 84 (1–2): 39–42. Дои:10.1159/000015209. PMID  10343098. S2CID  8087808.
9. Алтара Р., Гу Ю.М., Струйкер-Будье Х.А., Тийс Л., Стэссен Я.А., Бланкестейн В.М. (2015). «Дисфункция левого желудочка и лиганды CXCR3 при гипертонии: от экспериментов на животных к пилотному исследованию на популяционном уровне». PLOS ONE. 10 (10): e0141394. Дои:10.1371 / journal.pone.0141394. ЧВК  4624781. PMID  26506526.
10. Altara R, Manca M, Hessel MH, Gu Y, van Vark LC, Akkerhuis KM, Staessen JA, Struijker-Boudier HA, Booz GW, Blankesteijn WM (август 2016 г.). «CXCL10 - это циркулирующий воспалительный маркер у пациентов с тяжелой сердечной недостаточностью: пилотное исследование». Журнал кардиоваскулярных трансляционных исследований. 9 (4): 302–14. Дои:10.1007 / s12265-016-9703-3. PMID  27271043. S2CID  41188765.

внешняя ссылка

• Человек CXCL11 расположение генома и CXCL11 страница сведений о гене в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Рани М.Р., Фостер Г.Р., Леунг С., Лиман Д., Старк Г.Р., Рансохофф Р.М. (сентябрь 1996 г.). «Характеристика бета-R1, гена, который селективно индуцируется интерфероном бета (IFN-бета) по сравнению с IFN-альфа». Журнал биологической химии. 271 (37): 22878–84. Дои:10.1074 / jbc.271.37.22878. PMID  8798467.
• Джейкобс К.А., Коллинз-Рэйси Л.А., Колберт М., Дакетт М., Голден-Флит М., Келлехер К., Криз Р., ЛаВалли Э.Р., Мерберг Д., Сполдинг В., Стовер Дж., Уильямсон М.Дж., Маккой Дж. М. (октябрь 1997 г.). «Генетический отбор для выделения кДНК, кодирующих секретируемые белки». Ген. 198 (1–2): 289–96. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00330-2. PMID  9370294.
• Коул К.Э., Стрик К.А., Парадис Т.Дж., Огборн К.Т., Лутшер М., Глэду Р.П., Лин В., Бойд Дж. Г., Мозер Б., Вуд Д. Е., Сахаган Б. Г., Неот К. (июнь 1998 г.). «Интерферон-индуцируемый альфа-хемоаттрактант Т-клеток (I-TAC): новый хемокин CXC, не относящийся к ELR, с сильной активностью в отношении активированных Т-клеток посредством селективного связывания с высоким сродством с CXCR3». Журнал экспериментальной медицины. 187 (12): 2009–21. Дои:10.1084 / jem.187.12.2009. ЧВК  2212354. PMID  9625760.
• Эрдель М., Лайх А., Утерманн Г., Вернер Э. Р., Вернер-Фельмайер Г. (1998). «Ген человека, кодирующий SCYB9B, предполагаемый новый хемокин CXC, картируется на хромосоме 4q21 человека, как близкородственные гены MIG (SCYB9) и INP10 (SCYB10)». Цитогенетика и клеточная генетика. 81 (3–4): 271–2. Дои:10.1159/000015043. PMID  9730616. S2CID  46846304.
• Луо Й, Ким Р., Габузда Д., Ми С., Коллинз-Рэйси Л.А., Лу З., Джейкобс К.А., Дорф М.Э. (декабрь 1998 г.). «CXC-Chemokine, H174: экспрессия в центральной нервной системе». Журнал нейровирологии. 4 (6): 575–85. Дои:10.3109/13550289809114224. PMID  10065899.
• Tensen CP, Flier J, Van Der Raaij-Helmer EM, Sampat-Sardjoepersad S, Van Der Schors RC, Leurs R, Scheper RJ, Boorsma DM, Willemze R (май 1999). «Человеческий IP-9: полученный из кератиноцитов высокоаффинный CXC-хемокиновый лиганд для рецептора IP-10 / Mig (CXCR3)». Журнал следственной дерматологии. 112 (5): 716–22. Дои:10.1046 / j.1523-1747.1999.00581.x. PMID  10233762.
• Laich A, Meyer M, Werner ER, Werner-Felmayer G (май 1999 г.). «Структура и экспрессия гена члена 11 подсемейства малых цитокинов B человека (SCYB11 / ранее SCYB9B, псевдоним I-TAC), клонированного из обработанных IFN-гамма человеческих моноцитов (THP-1)». Журнал исследований интерферона и цитокинов. 19 (5): 505–13. Дои:10.1089/107999099313956. PMID  10386863.
• Tensen CP, Flier J, Rampersad SS, Sampat-Sardjoepersad S, Scheper RJ, Boorsma DM, Willemze R (июль 1999 г.). «Геномная организация, последовательность и регуляция транскрипции человеческого гена CXCL 11 (1)». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Структура и экспрессия гена. 1446 (1–2): 167–72. Дои:10.1016 / s0167-4781 (99) 00084-6. PMID  10395932.
• Loetscher P, Pellegrino A, Gong JH, Mattioli I, Loetscher M, Bardi G, Baggiolini M, Clark-Lewis I (февраль 2001 г.). «Лиганды хемокинового рецептора 3 CXC, I-TAC, Mig и IP10 являются естественными антагонистами CCR3». Журнал биологической химии. 276 (5): 2986–91. Дои:10.1074 / jbc.M005652200. PMID  11110785.
• Lambeir AM, Proost P, Durinx C, Bal G, Senten K, Augustyns K, Scharpé S, Van Damme J, De Meester I (август 2001 г.). «Кинетическое исследование усечения хемокинов с помощью CD26 / дипептидилпептидазы IV показывает поразительную селективность в семействе хемокинов». Журнал биологической химии. 276 (32): 29839–45. Дои:10.1074 / jbc.M103106200. PMID  11390394.
• Hensbergen PJ, van der Raaij-Helmer EM, Dijkman R, van der Schors RC, Werner-Felmayer G, Boorsma DM, Scheper RJ, Willemze R, Tensen CP (сентябрь 2001 г.). «Обработка природных и рекомбинантных хемокинов, нацеленных на CXCR3, и их влияние на биологическую активность». Европейский журнал биохимии. 268 (18): 4992–9. Дои:10.1046 / j.0014-2956.2001.02433.x. PMID  11559369.
• Мохан К., Динг З., Ханли Дж., Иссекутц ТБ (июнь 2002 г.). «IFN-гамма-индуцируемый хемоаттрактант Т-лимфоцитов является мощным стимулятором трансэндотелиальной миграции нормальных Т-лимфоцитов крови: дифференциальная регуляция с помощью IFN-гамма и TNF-альфа». Журнал иммунологии. 168 (12): 6420–8. Дои:10.4049 / jimmunol.168.12.6420. PMID  12055261.
• Basu S, Schaefer TM, Ghosh M, Fuller CL, Reinhart TA (май 2002 г.). «Молекулярное клонирование и секвенирование 25 различных кДНК хемокинов макака-резуса показывает эволюционную консервативность среди семейств хемокинов C, CC, CXC и CX3C». Цитокин. 18 (3): 140–8. Дои:10.1006 / cyto.2002.0875. PMID  12126650.
• Салмаджи А., Гелати М., Дюфур А., Корсини Е., Пагано С., Баккалини Р., Ферреро Е., Скабини С., Силей В., Чусани Е., Де Росси М. (июнь 2002 г.). «Экспрессия и модуляция индуцируемых IFN-гамма хемокинов (IP-10, Mig и I-TAC) в эндотелии мозга человека и астроцитах: возможное значение для иммунной инвазии центральной нервной системы и патогенеза рассеянного склероза». Журнал исследований интерферона и цитокинов. 22 (6): 631–40. Дои:10.1089/10799900260100114. PMID  12162873.
• Рани М.Р., Хибберт Л., Сайзмор Н., Старк Г.Р., Рансохофф Р.М. (октябрь 2002 г.). «Потребность в фосфоинозитид-3-киназе и Akt для опосредованной интерфероном-бета индукции гена бета-R1 (SCYB11)». Журнал биологической химии. 277 (41): 38456–61. Дои:10.1074 / jbc.M203204200. PMID  12169689.
• Као Дж., Кобасигава Дж., Фишбейн М.С., Маклеллан В.Р., Бурдик, доктор медицины, Белперио Дж. А., Стриетер Р.М. (апрель 2003 г.). «Повышенные уровни хемокина CXCR3 ITAC в сыворотке крови связаны с развитием ишемической болезни сердца трансплантата». Тираж. 107 (15): 1958–61. Дои:10.1161 / 01.CIR.0000069270.16498.75. PMID  12695288.
• Сатиш Л., Ягер Д., Уэллс А. (июнь 2003 г.). «Glu-Leu-Arg-отрицательный CXC хемокин интерферон гамма-индуцибельный белок-9 как медиатор эпидермально-дермальной коммуникации во время заживления ран». Журнал следственной дерматологии. 120 (6): 1110–7. Дои:10.1046 / j.1523-1747.2003.12230.x. PMID  12787142.
• Klunker S, Trautmann A, Akdis M, Verhagen J, Schmid-Grendelmeier P, Blaser K, Akdis CA (июль 2003 г.). «Второй этап хемотаксиса после трансэндотелиальной миграции: кератиноциты, подвергающиеся апоптозу, высвобождают IFN-гамма-индуцируемый белок 10, монокин, индуцируемый IFN-гамма, и IFN-гамма-индуцируемый альфа-хемоаттрактант для хемотаксиса Т-клеток по отношению к эпидермису при атопическом дерматите». Журнал иммунологии. 171 (2): 1078–84. Дои:10.4049 / jimmunol.171.2.1078. PMID  12847282.
• Xanthou G, Duchesnes CE, Williams TJ, Pease JE (август 2003 г.). «Функциональные ответы CCR3 регулируются как CXCR3, так и его лигандами CXCL9, CXCL10 и CXCL11». Европейский журнал иммунологии. 33 (8): 2241–50. Дои:10.1002 / eji.200323787. PMID  12884299.