NAB2 - NAB2

NAB2
Идентификаторы
Псевдонимы	NAB2, MADER, NGFI-A-связывающий белок 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 602381 MGI: 107563 ГомолоГен: 4353 Генные карты: NAB2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 12 (человек)[1] Группа 12q13.3 Начинать 57,089,043 бп[1] Конец 57,095,476 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 10 (мышь)[2] Группа 10 D3 | 10 74,6 см Начинать 127,660,918 бп[2] Конец 127,668,568 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание фактора транскрипции • GO: 0001948 связывание с белками • GO: 0001106 транскрипционная корепрессорная активность • идентичное связывание с белками • GO: 0001104 активность корегулятора транскрипции Сотовый компонент • ядро клетки Биологический процесс • Дифференцировка шванновских клеток • миелинизация • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы III • клеточная пролиферация • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • эндохондральная оссификация • регуляция развития эпидермиса • транскрипция, ДНК-шаблон • развитие нервной системы • положительная регуляция активности тау-протеинкиназы Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	4665	17937
Ансамбль	ENSG00000166886	ENSMUSG00000025402
UniProt	Q15742	Q61127
RefSeq (мРНК)	NM_005967 NM_001330305	NM_001122895 NM_008668
RefSeq (белок)	NP_001317234 NP_005958	NP_001116367 NP_032694
Расположение (UCSC)	Chr 12: 57.09 - 57,1 Мб	Chr 10: 127.66 - 127.67 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

NGFI-A-связывающий белок 2 также известный как EGR-1-связывающий белок 2 или же белок замедленного раннего ответа, связанный с меланомой (MADER) - это белок что у людей кодируется NAB2 ген.^[5][6][7]

Функция

Этот ген кодирует член семейства белков, связывающих NGFI-A (NAB), которые функционируют в ядре, подавляя или активируя транскрипция под влиянием некоторых членов EGR (реакция раннего роста) семья трансактиваторы. Белки NAB могут гомо- или гетеро-мультимеризоваться с другими белками EGR или NAB через консервативный N-концевой домен и репрессировать транскрипцию через два частично повторяющихся C-концевых домена. Репрессия транскрипции кодируемым белком частично опосредуется взаимодействиями с нуклеосома комплекс ремоделирования и деактилазы (NuRD). Альтернативно сращивание варианты транскриптов описаны, но их биологическая достоверность не определена.^[7]

Патология

Рекуррентные соматические слияния двух генов, NGFI-A-связывающего белка 2 (NAB2) и STAT6, расположенные в хромосомной области 12q13, были идентифицированы в солитарные фиброзные опухоли.^[8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000166886 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025402 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Сварен Дж., Севетсон Б.Р., Апель Э.Д., Зимонжич Д.Б., Попеску Н.С., Милбрандт Дж. (Август 1996 г.). «NAB2, корепрессор NGFI-A (Egr-1) и Krox20, индуцируется пролиферативными и дифференцированными стимулами». Mol Cell Biol. 16 (7): 3545–53. Дои:10.1128 / MCB.16.7.3545. ЧВК  231349. PMID  8668170.
6. Кирш К. Х., Корради Ю., Джонсон Дж. П. (июль 1996 г.). «Мадер: новый ядерный белок, сверхэкспрессируемый в меланомах человека». Онкоген. 12 (5): 963–71. PMID  8649813.
7. «Ген Entrez: NAB2 NGFI-A-связывающий белок 2 (EGR1-связывающий белок 2)».
8. Kabbinavar, F. F .; Hambleton, J; Mass, R.D .; Hurwitz, H.I .; Bergsland, E; Саркар, С (2005). «Комбинированный анализ эффективности: добавление бевацизумаба к фторурацилу / лейковорину улучшает выживаемость пациентов с метастатическим колоректальным раком». Журнал клинической онкологии. 23 (16): 3706–12. Дои:10.1200 / JCO.2005.00.232. PMID  15867200.

дальнейшее чтение

• Сварен Дж., Апель Э.Д., Симбургер К.С. и др. (1997). «Гены Nab2 и Stat6 имеют общую область терминации транскрипции». Геномика. 41 (1): 33–9. Дои:10.1006 / geno.1997.4609. PMID  9126479.
• Ку З., Вольфраим Л.А., Сварен Дж. И др. (1998). «Транскрипционный корепрессор NAB2 ингибирует индуцированную NGF дифференцировку клеток PC12». J. Cell Biol. 142 (4): 1075–82. Дои:10.1083 / jcb.142.4.1075. ЧВК  2132876. PMID  9722618.
• Сварен Дж., Севетсон Б.Р., Голда Т. и др. (1998). «Новые мутанты корепрессоров NAB усиливают активацию трансактиваторами Egr». EMBO J. 17 (20): 6010–9. Дои:10.1093 / emboj / 17.20.6010. ЧВК  1170927. PMID  9774344.
• Абдулкадир С.А., Ку З., Гарабедян Э. и др. (2001). «Нарушение туморогенеза простаты у мышей с дефицитом Egr1». Nat. Med. 7 (1): 101–7. Дои:10.1038/83231. PMID  11135623. S2CID  7191051.
• Абдулкадир С.А., Карбоун Дж. М., Нотон С. К. и др. (2001). «Частая и ранняя потеря корепрессора EGR1 NAB2 при раке простаты человека». Гм. Патол. 32 (9): 935–9. Дои:10.1053 / hupa.2001.27102. PMID  11567222.
• Венкен К., Ди Мария Э, Беллоне Э и др. (2003). «Поиск мутаций в корепрессорных белках EGR2, NAB1 и NAB2, при периферических невропатиях человека». Нейрогенетика. 4 (1): 37–41. Дои:10.1007 / s10048-001-0124-2. PMID  12030330. S2CID  1928229.
• Люцерна М., Меччерякова Д., Кадл А. и др. (2003). «NAB2, корепрессор EGR-1, ингибирует индукцию гена, опосредованную фактором роста эндотелия сосудов, и ангиогенные ответы эндотелиальных клеток». J. Biol. Chem. 278 (13): 11433–40. Дои:10.1074 / jbc.M204937200. PMID  12427750.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Камбринк Дж, Герлингер М, Джонсон Дж. П. (2005). «Egr-1 индуцирует экспрессию своего корепрессора nab2 путем активации промотора nab2, тем самым создавая петлю отрицательной обратной связи». J. Biol. Chem. 280 (52): 42785–93. Дои:10.1074 / jbc.M511079200. PMID  16260776.
• Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.
• Сринивасан Р., Магер Г.М., Уорд Р.М. и др. (2006). «NAB2 репрессирует транскрипцию, взаимодействуя с субъединицей CHD4 ремоделирования нуклеосом и комплекса деацетилазы (NuRD)». J. Biol. Chem. 281 (22): 15129–37. Дои:10.1074 / jbc.M600775200. PMID  16574654.
• Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.