CLCNKA - CLCNKA
Белок хлоридного канала ClC-Ka это белок что у людей кодируется CLCNKA ген. Для этого гена было обнаружено множество вариантов транскриптов, кодирующих разные изоформы.[5][6]
Функция
Этот ген является членом семейства потенциалозависимых CLC. хлоридные каналы. Предполагается, что кодируемый белок имеет 12 трансмембранных доменов и требует бета-субъединицы, называемой Барттин сформировать функциональный канал. Считается, что он участвует в реабсорбции соли в почках и рециркуляции калия во внутреннем ухе. Ген очень похож на CLCNKB, который расположен на 10 т.п.н. ниже этого гена.[6]
Варианты генов
CLCNKA кодирует один из двух основных хлоридных каналов, обнаруженных в почках, канал ClC-Ka (другим классом является ClC-Kb от CLCNKB). Ген CLCNKA, как и все гены, подвержен изменениям из-за однонуклеотидные полиморфизмы (SNP), в которых одна база (A, T, C или G) случайным образом заменяется другой базой.[7] SNP в кодирующих областях CLCKNA могут иметь последующие изменения в аминокислотной последовательности хлоридного канала ClC-Ka, приводящие к измененным функциональным возможностям и последующим физиологическим изменениям.[7]
Четыре SNP (rs848307, rs1739843, rs1010069 и rs1805152) были связаны с повышенной чувствительностью к соли, демонстрируя нерегулярно большое повышение артериального давления после умеренной соли (Na+), несмотря на регулярную частоту сердечных сокращений, артериальное давление и уровни ренина в плазме до приема соли.[7] Особый интерес представляет общий SNP, приводящий к замене аминокислоты аргинин в 83-м положении на глицин.[8] Этот вариант существует примерно у половины всех кавказцев, в то время как четверть кавказцев гомозиготны по аллелю.[8] Хотя этот SNP в основном изучается в контексте кавказцев, на самом деле он чаще встречается у лиц африканского происхождения, где частота генов составляет 70%.[8] Этот SNP (rs10927887) изначально был связан с застойной сердечной недостаточностью после того, как исследования белка теплового шока HSPB7 показали, что ген CLCNKA находится в нарушение равновесия по сцеплению, что означает, что два гена часто не разделяются во время рекомбинации.[8] Затем было показано, что причиной патологии является вариант CLCNKA.[8]
Патология
Четыре SNP, которые, как было установлено, связаны с чувствительностью к соли, следовательно, предрасполагают к таким сердечно-сосудистым проблемам, как гипертрофия левого желудочка и дисфункция эндотелия.[7] SNP Arg83Gly, в частности, приводит к значительному снижению потока ионов хлора через канал ClC-Ka в тонкой и толстой восходящей конечности нефронов.[8] Экспериментально мембранный потенциал, при котором каналы не показывают чистого движения ионов при данной концентрации хлорида, значительно падает с мутацией, указывая на изменение функции in situ.[8] Это проявляется как хроническое солевое истощение, подобное Синдром Барттера,[8] поскольку реабсорбция натрия сочетается с реабсорбцией хлорида.[7] Потеря соли приводит к уменьшению объема крови и, как следствие, гиперренинемии, ведущей (через конечный продукт - ангиотензин II и альдостерон) к повышению сосудистого тонуса, частоты сердечных сокращений, реабсорбции воды и артериального давления, что в совокупности называется кардиоренальный синдром.[8] Гетерозиготность по этому варианту Arg83Gly увеличивает риск сердечной недостаточности на 27%, а гомозиготность увеличивает риск на 54%.[8] Дополнительная нагрузка на сердце из-за повышенного артериального давления и частоты сердечных сокращений часто проявляется только как патология с дополнительными сердечно-сосудистыми проблемами, такими как гипертония.[8] Лечение гиперренинемии, связанной с SNP, включает в себя препараты, блокирующие систему ренин-ангиотензин-альдостерон, для снятия вышеупомянутой нагрузки на сердце.[8]
Смотрите также
- Хлоридный канал
- BSND, barttin, дополнительная субъединица бета для этого канала
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000186510 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000006216 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ Такеучи Ю., Учида С., Марумо Ф., Сасаки С. (февраль 1996 г.). «Клонирование, распределение тканей и внутрипочечная локализация хлоридных каналов ClC в почках человека». Почка Int. 48 (5): 1497–503. Дои:10.1038 / ки.1995.439. PMID 8544406.
- ^ а б "Entrez Gene: CLCNKA хлоридный канал Ka".
- ^ а б c d е Barlassina C, Dal Fiume C, Lanzani C, Manunta P, Guffanti G, Ruello A, Bianchi G, Del Vecchio L, Macciardi F, Cusi D (июль 2007 г.). «Общие генетические варианты и гаплотипы в почечном гене CLCNKA связаны с чувствительной к соли гипертонией». Гм. Мол. Genet. 16 (13): 1630–8. Дои:10,1093 / hmg / ddm112. PMID 17510212.
- ^ а б c d е ж грамм час я j k л Каппола Т.П., Маткович С.Дж., Ван В., ван Бувен Д., Ли М., Ван Х, Ку Л., Свитцер Н.К., Фанг Дж.С., Рейли М.П., Хаконарсон Х., Нербон Дж.М., Дорн Г.В. (февраль 2011 г.). «Вариант последовательности ДНК с потерей функции в хлоридном канале CLCNKA вовлекает сердечно-почечную ось в индивидуальные вариации риска сердечной недостаточности». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 108 (6): 2456–61. Дои:10.1073 / pnas.1017494108. ЧВК 3038744. PMID 21248228. Сложить резюме – Система здравоохранения Пенсильванского университета.
дальнейшее чтение
- Йенч Т.Дж., Гюнтер В. (1997). «Хлоридные каналы: новая молекулярная картина». BioEssays. 19 (2): 117–26. Дои:10.1002 / bies.950190206. PMID 9046241. S2CID 19904492.
- Киферле С., Фонг П., Бенс М., Вандевалле А., Йенч Т.Дж. (1994). «Два высокогомологичных члена семейства хлоридных каналов ClC в почках крысы и человека». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 91 (15): 6943–7. Дои:10.1073 / пнас.91.15.6943. ЧВК 44314. PMID 8041726.
- Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Сайто-Охара Ф., Учида С., Такеучи Ю., Сасаки С., Хаяси А., Марумо Ф., Икеучи Т. (1997). «Отнесение генов, кодирующих хлоридные каналы человека, CLCNKA и CLCNKB, к 1p36 и CLCN3 к 4q32-q33 путем гибридизации in situ». Геномика. 36 (2): 372–4. Дои:10.1006 / geno.1996.0479. PMID 8812470.
- Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
- Estévez R, Boettger T, Stein V, Birkenhäger R, Otto E, Hildebrandt F, Jentsch TJ (2002). "Барттин - это Cl− бета-субъединица канала, важная для почечного Cl− реабсорбция и внутреннее ухо K+ секреция". Природа. 414 (6863): 558–61. Дои:10.1038/35107099. PMID 11734858. S2CID 4407807.
- Schlingmann KP, Konrad M, Jeck N, Waldegger P, Reinalter SC, Holder M, Seyberth HW, Waldegger S (2004). «Солевое истощение и глухота в результате мутаций в двух хлоридных каналах». N. Engl. J. Med. 350 (13): 1314–9. Дои:10.1056 / NEJMoa032843. PMID 15044642.
- Scholl U, Hebeisen S, Janssen AG, Müller-Newen G, Alekov A, Fahlke C (2006). «Барттин модулирует трафик и функцию каналов ClC-K». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 103 (30): 11411–6. Дои:10.1073 / pnas.0601631103. ЧВК 1544099. PMID 16849430.
- Барлассина С., Даль Фьюме С., Ланзани С., Манунта П., Гуффанти Дж., Руэлло А., Бьянки Дж., Дель Веккьо Л., Маккарди Ф., Куси Д. (2007). «Общие генетические варианты и гаплотипы в почечном гене CLCNKA связаны с чувствительной к соли гипертонией». Гм. Мол. Genet. 16 (13): 1630–8. Дои:10,1093 / hmg / ddm112. PMID 17510212.
- Маркович С., Дутцлер Р. (2007). «Структура цитоплазматического домена хлоридного канала ClC-Ka выявляет консервативный интерфейс взаимодействия». Структура. 15 (6): 715–25. Дои:10.1016 / j.str.2007.04.013. PMID 17562318.
внешняя ссылка
- CLCNKA + белок, + человек в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
- Человек CLCNKA расположение генома и CLCNKA страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.
Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.