CLCA1 - CLCA1

CLCA1
Идентификаторы
Псевдонимы	CLCA1, CACC, CACC1, CLCRG1, CaCC-1, GOB5, hhCaCC-1, принадлежность канала хлорида 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 603906 MGI: 1346342 ГомолоГен: 984 Генные карты: CLCA1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1п22.3 Начните 86,468,368 бп[1] Конец 86,500,259 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 3 (мышь)[2] Группа 3 H2 | 3 69,26 см Начните 145,003,817 бп[2] Конец 145,032,776 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов металлов • пептидазная активность • гидролазная активность • активность хлоридного канала • металлопептидазная активность • металлоэндопептидазная активность • активность внутриклеточного кальциевого активированного хлоридного канала Сотовый компонент • внеклеточная область • неотъемлемый компонент мембраны • неотъемлемый компонент плазматической мембраны • микроворсинки • мембрана из гранул зимогена • мембрана • клеточная мембрана • секреторная гранула • внеклеточный Биологический процесс • транспорт ионов кальция • протеолиз • перенос хлоридов • ионный транспорт • трансмембранный перенос ионов • клеточный ответ на гипоксию • трансмембранный транспорт хлоридов Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	1179	23844
Ансамбль	ENSG00000016490	ENSMUSG00000028255
UniProt	A8K7I4	Q9D7Z6
RefSeq (мРНК)	NM_001285	NM_017474
RefSeq (белок)	NP_001276	NP_059502
Расположение (UCSC)	Chr 1: 86,47 - 86,5 Мб	Chr 3: 145 - 145,03 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Принадлежность канала хлорида 1 это белок что у людей кодируется CLCA1 ген.^[5][6]

Этот ген кодирует член семейства чувствительных к кальцию хлоридных белков. На сегодняшний день все члены этого семейства генов картируются в одной и той же области на хромосоме 1p31-p22 и имеют высокую степень гомологии по размеру, последовательности и предполагаемой структуре, но значительно различаются по своему тканевому распределению. Кодируемый белок экспрессируется как белок-предшественник, который процессируется в две субъединицы, связанные с клеточной поверхностью, хотя сайт, в котором расщепляется предшественник, точно не определен. Кодируемый белок может участвовать в обеспечении проводимости хлоридов, активируемых кальцием, в кишечнике.^[6] Методы прогнозирования структуры белка предполагают, что N-концевой участок белка CLCA1 представляет собой цинковый металлопротеиназа.^[7]

Смотрите также

• Хлоридный канал

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000016490 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028255 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Грубер А.Д., Эльбл Р.К., Джи Х.Л., Шреур К.Д., Фуллер С.М., Паули БЮ (январь 1999 г.). «Геномное клонирование, молекулярная характеристика и функциональный анализ человеческого CLCA1, первого человеческого члена семейства Ca²⁺-активированный Cl⁻ канальные белки ». Геномика. 54 (2): 200–14. Дои:10.1006 / geno.1998.5562. PMID  9828122.
6. «Ген Entrez: канал хлорида CLCA1, активированный кальцием, член семьи 1».
7. Павловски К., Лепистё М., Мейнандер Н. и др. (2006). «Новый консервативный домен гидролазы в семействе CLCA предполагаемых кальций-активируемых хлоридных каналов». Белки. 63 (3): 424–39. Дои:10.1002 / prot.20887. PMID  16470849.

дальнейшее чтение

• Хьюм Дж. Р., Дуан Д., Коллиер М. Л. и др. (2000). «Перенос анионов в сердце». Physiol. Rev. 80 (1): 31–81. PMID  10617765.
• Паули Б.У., Абдель-Гани М., Ченг Х.С. и др. (2001). «Молекулярные характеристики и функциональное разнообразие членов семейства CLCA». Clin. Exp. Pharmacol. Физиол. 27 (11): 901–5. Дои:10.1046 / j.1440-1681.2000.03358.x. PMID  11071307.
• Агнель М., Верма Т., Кулулку Дж. М. (1999). «Идентификация трех новых членов семейства кальций-зависимых хлоридных каналов (CaCC), преимущественно экспрессируемых в пищеварительном тракте и трахее». FEBS Lett. 455 (3): 295–301. Дои:10.1016 / S0014-5793 (99) 00891-1. PMID  10437792.
• Диас Нето Э., Корреа Р.Г., Верджовски-Алмейда С. и др. (2000). «Секвенирование человеческого транскриптома с использованием тегов последовательности, экспрессируемой ORF». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 97 (7): 3491–6. Дои:10.1073 / pnas.97.7.3491. ЧВК  16267. PMID  10737800.
• Лю К.Х., Уильямс Д.А., Макманус К. и др. (2000). «ВИЧ-1 gp120 и хемокины активируют ионные каналы в первичных макрофагах посредством стимуляции CCR5 и CXCR4». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 97 (9): 4832–7. Дои:10.1073 / pnas.090521697. ЧВК  18318. PMID  10758170.
• Тода М, Тулич МК, Левитт Р.К., Хамид К. (2002). «Активированный кальцием хлоридный канал (HCLCA1) сильно связан с экспрессией IL-9 и образованием слизи в бронхиальном эпителии пациентов с астмой». J. Allergy Clin. Иммунол. 109 (2): 246–50. Дои:10.1067 / mai.2002.121555. PMID  11842292.
• Гринвуд И.А., Миллер Л.Дж., Охя С., Горовиц Б. (2002). «Бета-субъединица калиевого канала с большой проводимостью может взаимодействовать и модулировать функциональные свойства активированного кальцием хлоридного канала, CLCA1». J. Biol. Chem. 277 (25): 22119–22. Дои:10.1074 / jbc.C200215200. PMID  11994272.
• Abdel-Ghany M, Cheng HC, Elble RC, Pauli BU (2002). «Киназа фокальной адгезии, активируемая лигированием бета (4) интегрина с mCLCA1, опосредует ранний метастатический рост». J. Biol. Chem. 277 (37): 34391–400. Дои:10.1074 / jbc.M205307200. PMID  12110680.
• Лёвен М.Э., Бекар Л.К., Габриэль С.Е. и др. (2002). «pCLCA1 становится цАМФ-зависимым медиатором проводимости хлорида в клетках Caco-2». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 298 (4): 531–6. Дои:10.1016 / S0006-291X (02) 02498-1. PMID  12408984.
• Чжоу Ю., Шапиро М., Донг К. и др. (2003). «Блокатор хлоридных каналов, активируемый кальцием, подавляет метаплазию бокаловидных клеток и гиперпродукцию слизи». Новартис найден. Symp. 248: 150–65, обсуждение 165–70, 277–82. Дои:10.1002 / 0470860790.ch10. PMID  12568493.
• Абдель-Гани М., Ченг Х.С., Эльбл Р.С. и др. (2004). «Взаимодействующие связывающие домены бета (4) интегрина и кальций-активируемых хлоридных каналов (CLCA) при метастазах». J. Biol. Chem. 278 (49): 49406–16. Дои:10.1074 / jbc.M309086200. PMID  14512419.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Хегаб А.Е., Сакамото Т., Учида Й. и др. (2004). «Полиморфизм гена CLCA1 при хронической обструктивной болезни легких». J. Med. Genet. 41 (3): e27. Дои:10.1136 / jmg.2003.012484. ЧВК  1735703. PMID  14985398.
• Камада Ф., Сузуки Ю., Шао С. и др. (2005). «Связь гена hCLCA1 с астмой у детей и взрослых». Гены иммунной. 5 (7): 540–7. Дои:10.1038 / sj.gene.6364124. PMID  15318163.
• Ритцка М., Станке Ф., Янсен С. и др. (2005). «Локус гена CLCA как модулятор основного желудочно-кишечного дефекта при муковисцидозе». Гм. Genet. 115 (6): 483–91. Дои:10.1007 / s00439-004-1190-у. PMID  15490240.
• Гибсон А., Льюис А.П., Аффлек К. и др. (2005). «hCLCA1 и mCLCA3 являются секретируемыми неинтегральными мембранными белками и, следовательно, не являются ионными каналами». J. Biol. Chem. 280 (29): 27205–12. Дои:10.1074 / jbc.M504654200. PMID  15919655.
• Чон С.М., Пак Х.К., Юн И.С. и др. (2005). "Клонирование и экспрессия Ca²⁺-активированный хлоридный канал из мозга крысы ». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 334 (2): 569–76. Дои:10.1016 / j.bbrc.2005.06.122. PMID  16023076.

внешние ссылки

• CLCA1 + белок, + человеческий в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
• Человек CLCA1 расположение генома и CLCA1 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.