TPCN2 - TPCN2

TPCN2
Идентификаторы
Псевдонимы	TPCN2, SHEP10, TPC2, двухпористый сегментный канал 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 612163 MGI: 2385297 ГомолоГен: 16375 Генные карты: TPCN2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 11 (человек)[1] Группа 11q13.3 Начинать 69,048,932 бп[1] Конец 69,136,316 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 7 (мышь)[2] Группа 7 | 7 F5 Начинать 145,186,524 бп[2] Конец 145,284,011 бп[2]
Онтология генов Молекулярная функция • активность кальциевых каналов • активность потенциалзависимого ионного канала • активность ионного канала • GO: 0001948 связывание с белками • идентичное связывание с белками • связывание протеинкиназы • Активность канала высвобождения кальция, чувствительного к NAADP • активность потенциалзависимых кальциевых каналов Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • мембрана • клеточная мембрана • эндосомная мембрана • лизосома • лизосомальная мембрана Биологический процесс • высвобождение секвестрированного иона кальция в цитозоль • деполяризация мембраны во время потенциала действия • ответ на витамин D • регуляция трансмембранного транспорта ионов • клеточный гомеостаз ионов кальция • ионный транспорт • трансмембранный перенос ионов • регулирование аутофагии • трансмембранный транспорт ионов кальция • лизосомная организация • кальций-опосредованная передача сигналов • транспорт ионов кальция • трансмембранный транспорт • сокращение гладких мышц Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	219931	233979
Ансамбль	ENSG00000162341	ENSMUSG00000048677
UniProt	Q8NHX9	Q8BWC0
RefSeq (мРНК)	NM_139075	NM_146206
RefSeq (белок)	NP_620714	NP_666318
Расположение (UCSC)	Chr 11: 69.05 - 69.14 Мб	Chr 7: 145,19 - 145,28 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Канал 2 с двумя сегментами пор (TPC2) представляет собой белок который у человека кодируется TPCN2 ген.^[5] TPC2 - это ионный канал однако, в отличие от других кальций и натриевые каналы которые имеют четыре гомологичных домена, каждый из которых содержит 6 трансмембранных сегментов (от S1 до S6), TPCN1 содержит только два домена (каждый содержит сегменты от S1 до S6).^[6]

Структура

TPC2 гомологичен TPC1, наиболее охарактеризованному члену семейства TPC. Структура TPC1 ортолог из Arabidopsis thaliana была решена двумя лабораториями.^[7][8] Структуры решены с использованием Рентгеновская кристаллография и содержал складку потенциалзависимый ионный канал и EF руки.

Филовирусные инфекции

Эксперименты с генетическим нокаутом и фармакологическим ингибированием демонстрируют, что Двухпоровые каналы, TPC1 и TPC2, необходимы для заражения филовирусами Эбола и Марбург у мышей.^[9]

Смотрите также

• Двухпористый канал

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000162341 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000048677 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. "Entrez Gene: канал 2 с двумя сегментами пор".
6. Clapham DE, Garbers DL (декабрь 2005 г.). «Международный союз фармакологии. L. Номенклатура и взаимосвязь структур-функций CatSper и двухпоровых каналов». Фармакологические обзоры. 57 (4): 451–4. Дои:10.1124 / пр.57.4.7. PMID  16382101. S2CID  35096827.
7. Го Дж, Цзэн В., Чен Кью, Ли К., Чен Л., Ян И, Цан С., Рен Д., Цзян Ю. (март 2016 г.). «Структура потенциалозависимого двухпорового канала TPC1 из Arabidopsis thaliana». Природа. 531 (7593): 196–201. Дои:10.1038 / природа16446. ЧВК  4841471. PMID  26689363.
8. Кинцер А.Ф., Страуд Р.М. (март 2016 г.). «Структура, ингибирование и регуляция двухпорового канала TPC1 из Arabidopsis thaliana». Природа. 531 (7593): 258–62. Дои:10.1038 / природа17194. ЧВК  4863712. PMID  26961658.
9. Сакурай Ю., Колокольцов А.А., Чен С.К., Тидвелл М.В., Баута В.Е., Клугбауэр Н., Гримм С., Уол-Шотт С., Биль М., Дэйви Р.А. (февраль 2015 г.). «Вирус Эбола. Двухпористые каналы контролируют проникновение вируса Эбола в клетки-хозяева и являются мишенями для лечения заболеваний». Наука. 347 (6225): 995–8. Дои:10.1126 / science.1258758. ЧВК  4550587. PMID  25722412.

дальнейшее чтение

• Сулем П., Гудбьяртссон Д.Ф., Стейси С.Н., Хельгасон А., Рафнар Т., Якобсдоттир М., Стейнберг С., Гуджонссон С.А., Палссон А., Торлейфссон Г., Палссон С., Сигургейрссон Б., Торисдоттир К., Рагнарссон Рэгнарссон Рэдиктс, Шредиктс , Goldstein AM, Tucker MA, Kiemeney LA, Olafsson JH, Gulcher J, Kong A, Thorsteinsdottir U, Stefansson K (июль 2008 г.). «Две недавно выявленные генетические детерминанты пигментации у европейцев». Природа Генетика. 40 (7): 835–7. Дои:10,1038 / нг.160. PMID  18488028. S2CID  13411482.
• Судзуки Ю., Ямасита Р., Широта М., Сакакибара Ю., Чиба Дж., Мидзусима-Сугано Дж., Накай К., Сугано С. (сентябрь 2004 г.). «Сравнение последовательностей генов человека и мыши выявляет гомологичную блочную структуру в промоторных областях». Геномные исследования. 14 (9): 1711–8. Дои:10.1101 / гр.2435604. ЧВК  515316. PMID  15342556.
• Calcraft PJ, Ruas M, Pan Z, Cheng X, Arredouani A, Hao X, Tang J, Rietdorf K, Teboul L, Chuang KT, Lin P, Xiao R, Wang C, Zhu Y, Lin Y, Wyatt CN, Parrington J , Ма Дж., Эванс А.М., Галионе А., Чжу М.Х. (май 2009 г.). «NAADP мобилизует кальций из кислых органелл через двухпоровые каналы». Природа. 459 (7246): 596–600. Дои:10.1038 / природа08030. ЧВК  2761823. PMID  19387438.
• Тейлор Т.Д., Ногучи Х., Тотоки Й., Тойода А, Куроки Й., Дьюар К., Ллойд С., Ито Т, Такеда Т., Ким Д.В., Ше Икс, Барлоу К.Ф., Блум Т., Бруфорд Э., Чанг Дж.Л., Куомо К.А., Эйхлер Э. , Фитцджеральд М.Г., Джаффе Д.Б., ЛаБутти К., Николь Р., Парк Х.С., Моряк С., Сугнез К., Ян Х, Циммер А.Р., Зоди М.С., Биррен Б.В., Нусбаум К., Фудзияма А., Хаттори М., Роджерс Дж., Лендер ES, Сакаки Y (март 2006 г.). «Последовательность ДНК хромосомы 11 человека и анализ, включая идентификацию нового гена». Природа. 440 (7083): 497–500. Дои:10.1038 / природа04632. PMID  16554811.
• Фу Г.К., Ван Дж. Т., Ян Дж., Ау-Ён Дж., Стюв Л.Л. (июль 2004 г.). «Циклическая быстрая амплификация концов кДНК для клонирования частичных генов с высокой пропускной способностью». Геномика. 84 (1): 205–10. Дои:10.1016 / j.ygeno.2004.01.011. PMID  15203218.

внешняя ссылка

• TPCN2 + белок, + человек в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)