Кальций-зависимый хлоридный канал - Calcium-dependent chloride channel
TMEM16 | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Мультяшное изображение хлоридного канала mTMEM16A на основе криоэлектронная микроскопия реконструкция.[1] | |||||||||
Идентификаторы | |||||||||
Символ | Апоктамин | ||||||||
Pfam | PF04547 | ||||||||
ИнтерПро | IPR032394 | ||||||||
TCDB | 1.A.17 | ||||||||
OPM суперсемейство | 369 | ||||||||
Мембранома | 219 | ||||||||
|
В Белки кальций-зависимого хлоридного канала (Ca-ClC) (или же кальциевые хлоридные каналы (CaCCs),[2] разнородные группы ионные каналы, управляемые лигандами за хлористый которые были идентифицированы во многих эпителиальный и эндотелиальная клетка типы, а также в гладкомышечные клетки. В их состав входят белки из нескольких структурно разных семейств: вспомогательный хлоридный канал (CLCA),[3] бестрофин (ЛУЧШИЙ),[4][5] и кальций-зависимые хлоридные каналы аноктаминовые (ANO или TMEM16) каналы]][4][5][6][7] АНО1 высоко экспрессируется в желудочно-кишечном тракте человека интерстициальные клетки Кахаля, которые являются белками, которые служат стимуляторами ритма кишечника для перистальтика.[6] Помимо своей роли в качестве хлоридных каналов, некоторые белки CLCA функционируют как молекулы адгезии, а также могут выполнять роль опухоль подавители.[8] Эти эукариотические белки «необходимы для нормальной секреции электролитов и жидкости, обонятельного восприятия, а также возбудимости нейронов и гладких мышц» у животных.[9][10] Члены семейства Ca-CIC обычно имеют длину от 600 до 1000 аминоацильных остатков (аас) и имеют от 7 до 10 трансмембранных сегментов (ТМС).
Функция
Tmc1 и Tmc2 (TC # s 1.A.17.4.6 и 1.A.17.4.1 соответственно) могут играть роль в слухе и необходимы для нормальной функции волосковых клеток улитки, возможно, как Ca2+ каналы или Ca2+ канальные подразделения (см. также семейство ТК № 1.A.82 ).[11] У мышей, лишенных обоих каналов, отсутствуют механосенсорные потенциалы волосковых клеток.[12] У людей 8 членов этого семейства, 1 - у человека. Дрозофила и 2 в C. elegans. Один из последних двух экспрессируется в механорецепторах.[13] Tmc1 - это чувствительный к натрию катионный канал, необходимый для соли (Na+) химиочувствительность в C. elegans «там, где это требуется для нейрональной активности, вызванной солью, и поведенческого избегания высоких концентраций NaCl».[14]
TMEM16A сверхэкспрессируется в нескольких типах опухолей. Роль TMEM16A в глиомах и возможные лежащие в основе механизмы были проанализированы Liu et al. 2014. Нокдаун TMEM16A подавлял пролиферацию, миграцию и инвазию клеток.[15]
Считается, что каналы семейства Ca-ClC катализируют следующие реакции:[16]
Cl− (выход) ⇌ Cl− (в)
и
Катионы (например, Ca2+) (out) ⇌ Катионы (например, Ca2+) (в)
В людях
CaCCs, которые, как известно, встречаются у людей, включают:
- Аксессуары: CLCA1, CLCA2, CLCA3, и CLCA4
- Аноктамины:[примечание 1] АНО1 и ANO2 (потенциально другие)[17]
- Бестрофины: BEST1, BEST2, BEST3, и BEST4[17]
Смотрите также
Примечания
- ^ Аноктамины выражаются только в эукариоты, с 10 членами в позвоночные.[7] Хотя все аноктамины активируются кальцием, не все члены этого семейства являются ионными каналами, такими как ANO1; некоторые фосфолипидные скрамблазы.[7] ANO1 был первым аноктамином, обнаруженным тремя исследовательскими группами, независимо идентифицировавшими его в 2008 году.[7] Единственный белковый гомолог аноктаминов позвоночных был обнаружен в грибах и дрожжах, Aspergillus fumigatus и Saccharomyces cerevisiae, соответственно.[7]
Рекомендации
- ^ PDB: 5ойб; Паулино С., Калиенкова В., Лам А., Нельднер Ю., Дутцлер Р. (декабрь 2017 г.). «Механизм активации кальциевого хлоридного канала TMEM16A, выявленный крио-ЭМ» (PDF). Природа. 552 (7685): 421–425. Bibcode:2017Натура.552..421П. Дои:10.1038 / природа24652. PMID 29236691. S2CID 4457894.
- ^ Hartzell C, Putzier I, Arreola J (март 2005 г.). «Хлоридные каналы, активируемые кальцием». Ежегодный обзор физиологии. 67: 719–58. Дои:10.1146 / annurev.physiol.67.032003.154341. PMID 15709976.
- ^ «Дополнительный канал хлорида CLCA1 1 [Homo sapiens (человек)]». Ген. Национальный центр биотехнологической информации. 13 января 2015.
- ^ а б Kunzelmann K, Kongsuphol P, Chootip K, Toledo C, Martins JR, Almaca J, Tian Y, Witzgall R, Ousingsawat J, Schreiber R (январь 2011 г.). «Роль бестрофина и аноктамина Ca2 + -активированных каналов Cl- в эпителиальных клетках». Биологическая химия. 392 (1–2): 125–34. Дои:10.1515 / BC.2011.010. PMID 21194364. S2CID 24285022.
- ^ а б Kunzelmann K, Kongsuphol P, Aldehni F, Tian Y, Ousingsawat J, Warth R, Schreiber R (октябрь 2009 г.). «Бестрофин и TMEM16-Ca (2+) активировали Cl (-) каналы с разными функциями». Клеточный кальций. 46 (4): 233–41. Дои:10.1016 / j.ceca.2009.09.003. PMID 19783045.
- ^ а б Сандерс К.М., Чжу М.Х., Бриттон Ф., Ко С.Д., Уорд С.М. (февраль 2012 г.). «Аноктамины и возбудимость гладких мышц желудочно-кишечного тракта». Экспериментальная физиология. 97 (2): 200–6. Дои:10.1113 / expphysiol.2011.058248. ЧВК 3272164. PMID 22002868.
- ^ а б c d е Бруннер Дж. Д., Лим Н. К., Шенк С., Дюрст А., Дутцлер Р. (декабрь 2014 г.). «Рентгеновская структура кальций-активированной липидной скрамблазы TMEM16». Природа. 516 (7530): 207–12. Bibcode:2014Натура.516..207Б. Дои:10.1038 / природа13984. PMID 25383531. S2CID 1396768.
- ^ Эванс С.Р., Торесон В.Б., Бек С.Л. (октябрь 2004 г.). «Молекулярный и функциональный анализ двух новых членов семейства хлоридных каналов, активируемых кальцием, из глаза и кишечника мыши». Журнал биологической химии. 279 (40): 41792–800. Дои:10.1074 / jbc.M408354200. ЧВК 1383427. PMID 15284223.
- ^ Капуто А., Качи Е., Феррера Л., Педемонте Н., Барсанти С., Сондо Е., Пфеффер Ю., Раваццоло Р., Зегарра-Моран О., Галиетта Л. Дж. (Октябрь 2008 г.). «TMEM16A, мембранный белок, связанный с кальций-зависимой активностью хлоридных каналов». Наука. 322 (5901): 590–4. Bibcode:2008Sci ... 322..590C. Дои:10.1126 / science.1163518. PMID 18772398. S2CID 52870095.
- ^ Панг Ц., Юань Х, Рен С., Чен Й, Ан Х, Чжань И (1 января 2014 г.). «TMEM16A / B связанный CaCC: структурные и функциональные идеи». Буквы о белках и пептидах. 21 (1): 94–9. Дои:10.2174/09298665113206660098. PMID 24151904.
- ^ Kim KX, Fettiplace R (январь 2013 г.). «Изменения развития в канале механотрансдуктора волосковых клеток улитки и их регуляция с помощью белков, подобных трансмембранным каналам». Журнал общей физиологии. 141 (1): 141–8. Дои:10.1085 / jgp.201210913. ЧВК 3536526. PMID 23277480.
- ^ Кавасима Ю., Гелеок Г.С., Курима К., Лабай В., Лелли А., Асаи И., Макишима Т., Ву Д.К., Делла Сантина С.К., Холт-младший, Гриффит А.Дж. (декабрь 2011 г.). «Для механотрансдукции в волосковых клетках внутреннего уха мыши необходимы гены, подобные трансмембранным каналам». Журнал клинических исследований. 121 (12): 4796–809. Дои:10.1172 / JCI60405. ЧВК 3223072. PMID 22105175.
- ^ Смит К.Дж., Уотсон Д.Д., Спенсер В.К., О'Брайен Т., Ча Б., Албег А., Трейнин М., Миллер Д.М. (сентябрь 2010 г.). «Покадровая визуализация и профили клеточно-специфической экспрессии выявляют динамическое ветвление и молекулярные детерминанты мульти-дендритного ноцицептора у C. elegans». Биология развития. 345 (1): 18–33. Дои:10.1016 / j.ydbio.2010.05.502. ЧВК 2919608. PMID 20537990.
- ^ Chatzigeorgiou M, Bang S, Hwang SW, Schafer WR (Февраль 2013). «tmc-1 кодирует чувствительный к натрию канал, необходимый для солевой химиочувствительности у C. elegans». Природа. 494 (7435): 95–99. Bibcode:2013Натура 494 ... 95С. Дои:10.1038 / природа11845. ЧВК 4021456. PMID 23364694.
- ^ Лю Дж, Лю Й, Рен Й, Кан Л., Чжан Л. (март 2014 г.). «Трансмембранный белок с неизвестной функцией. Сверхэкспрессия 16A способствует образованию глиомы через сигнальный путь ядерного фактора-κB». Отчеты по молекулярной медицине. 9 (3): 1068–74. Дои:10.3892 / mmr.2014.1888. PMID 24401903.
- ^ "1.A.17 Семейство кальцийзависимых хлоридных каналов (Ca-ClC)". TCDB. Получено 16 апреля 2016.
- ^ а б «Хлоридный канал, активированный кальцием». IUPHAR / BPS Руководство по фармакологии. Получено 7 октября 2015.
дальнейшее чтение
- «TCDB» ПОИСК ». www.tcdb.org. Проверено 16 апреля 2016.
- Миленкович В.М., Брокманн М., Штер Х, Вебер Б.Х., Штраус О. (октябрь 2010 г.). «Эволюция и функциональная дивергенция семейства аноктаминовых мембранных белков». BMC Эволюционная биология. 10: 319. Дои:10.1186/1471-2148-10-319. ЧВК 2974728. PMID 20964844.
- Kunzelmann K, Cabrita I, Wanitchakool P, Ousingsawat J, Sirianant L, Benedetto R, Schreiber R (март 2016 г.). «Модуляция сигналов Ca²⁺: общая тема для TMEM16, Ist2 и TMC». Pflügers Archiv. 468 (3): 475–90. Дои:10.1007 / s00424-015-1767-4. PMID 26700940. S2CID 14374080.
- Капуто А., Качи Е., Феррера Л., Педемонте Н., Барсанти С., Сондо Е., Пфеффер Ю., Раваццоло Р., Зегарра-Моран О., Галиетта Л. Дж. (Октябрь 2008 г.). «TMEM16A, мембранный белок, связанный с кальций-зависимой активностью хлоридных каналов». Наука. 322 (5901): 590–4. Bibcode:2008Sci ... 322..590C. Дои:10.1126 / science.1163518. PMID 18772398. S2CID 52870095.
- Ян Ю.Д., Чо Х, Ку Джи, Так М.Х., Чо И, Шим У.С., Пак С.П., Ли Дж, Ли Би, Ким Б.М., Рауф Р., Шин Ю.К., О У (октябрь 2008 г.). «TMEM16A придает активируемую рецептором кальций-зависимую хлоридную проводимость». Природа. 455 (7217): 1210–5. Bibcode:2008Натура.455.1210Y. Дои:10.1038 / природа07313. PMID 18724360. S2CID 205214858.
- Феррера Л., Капуто А., Убби I, Буссани Е., Зегарра-Моран О., Раваццоло Р., Пагани Ф., Галиетта Л. Дж. (Ноябрь 2009 г.). «Регулирование свойств хлоридных каналов TMEM16A альтернативным сращиванием». Журнал биологической химии. 284 (48): 33360–8. Дои:10.1074 / jbc.M109.046607. ЧВК 2785179. PMID 19819874.
- Galietta LJ (декабрь 2009 г.). «Семейство белков TMEM16: новый класс хлоридных каналов?». Биофизический журнал. 97 (12): 3047–53. Bibcode:2009BpJ .... 97.3047G. Дои:10.1016 / j.bpj.2009.09.024. ЧВК 2793353. PMID 20006941.
- Hwang SJ, Blair PJ, Britton FC, O'Driscoll KE, Hennig G, Bayguinov YR, Rock JR, Harfe BD, Sanders KM, Ward SM (октябрь 2009 г.). «Экспрессия аноктамина 1 / TMEM16A интерстициальными клетками Кахаля является фундаментальной для медленноволновой активности в мышцах желудочно-кишечного тракта». Журнал физиологии. 587 (Pt 20): 4887–904. Дои:10.1113 / jphysiol.2009.176198. ЧВК 2770154. PMID 19687122.
- Шрайбер Р., Ульякина И., Конгсупхол П., Варт Р., Мирза М., Мартинс Дж. Р., Кунцельманн К. (март 2010 г.). «Экспрессия и функция эпителиальных аноктаминов». Журнал биологической химии. 285 (10): 7838–45. Дои:10.1074 / jbc.M109.065367. ЧВК 2844227. PMID 20056604.
По состоянию на это редактирование, в этой статье используется контент из "1.A.13 Семейство каналов эпителиального хлорида (E-ClC)", который лицензирован таким образом, чтобы разрешить повторное использование в соответствии с Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Непортированная лицензия, но не под GFDL. Все соответствующие условия должны быть соблюдены.