Тяжелый острый респираторный синдром коронавирус 2 - Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2

Эта статья о штамме вируса, вызывающем COVID-19. О штамме, вызывающем ОРВИ, см. Коронавирус тяжелого острого респираторного синдрома. Для видов, к которым принадлежат оба штамма, см. Коронавирус, связанный с тяжелым острым респираторным синдромом.

Тяжелый острый респираторный синдром коронавирус 2
Электронная микрофотография вирионов SARS-CoV-2 с видимыми коронами
Просвечивающая электронная микрофотография SARS-CoV-2 вирионы с видимым короны
Иллюстрация вириона SARS-CoV-2
Иллюстрация вириона SARS-CoV-2[1]
  Красные выступы: спайк белки (S)[1]
  Серое покрытие: конверт, состоящий в основном из липидов, которые можно разрушить спиртом или мылом[1]
  Желтые отложения: белки оболочки (E)[1]
  Апельсиновые отложения: мембрана белки (M)[1]
Классификация вирусов е
(без рейтинга):Вирус
Область:Рибовирия
Королевство:Орторнавиры
Тип:Писувирикота
Учебный класс:Pisoniviricetes
Заказ:Нидовиралес
Семья:Coronaviridae
Род:Бетакоронавирус
Подрод:Сарбековирус
Разновидность:
Коронавирус, связанный с тяжелым острым респираторным синдромом
Напряжение:
Тяжелый острый респираторный синдром коронавирус 2
Синонимы
  • 2019-nCoV
Клетки HeLa разработан, чтобы выразить ACE2 становятся восприимчивыми к инфекции SARS-CoV-2.

Тяжелый острый респираторный синдром коронавирус 2 (SARS-CoV-2)[2][3] это напряжение из коронавирус что вызывает коронавирус заболевание 2019 (COVID-19), респираторное заболевание ответственный за COVID-19 пандемия. В просторечии известен как просто коронавирус, ранее на него ссылались предварительное название, 2019 новый коронавирус (2019-nCoV),[4][5][6][7] и также был назван человеческий коронавирус 2019 (HCoV-19 или же hCoV-19).[8][9][10][11] В Всемирная организация здоровья объявил вспышку Чрезвычайная ситуация в области общественного здравоохранения, имеющая международное значение 30 января 2020 года и пандемия 11 марта 2020 г.[12][13]

SARS-CoV-2 - это Балтимор класс IV[14] одноцепочечный РНК-вирус с положительным смыслом[15] то есть заразительный в людях.[16] Как описано в США. Национальные институты здоровья, это преемник SARS-CoV-1,[10][17] напряжение, которое вызвало 2002–2004 гг. Вспышка атипичной пневмонии..

Таксономически, SARS-CoV-2 - это штамм коронавирус, связанный с тяжелым острым респираторным синдромом (SARSr-CoV).[2] Считается, что зоонозный истоки и близки генетическое сходство бороться с коронавирусом, предполагая, что он возник из вирус, переносимый летучими мышами.[18][19][20][9] Пока нет доказательств связи промежуточного хоста, такого как ящер, до его введения людям.[21][22] Вирус демонстрирует небольшое генетическое разнообразие, что указывает на то, что вторичное событие Заражение человека SARS-CoV-2, вероятно, произошло в конце 2019 года.[23] В сентябре 2020 года по данным анализ данных, исследователи сообщили об открытии геном вируса индексный случай.[24][25]

Эпидемиологический Согласно исследованиям, каждая инфекция приводит к 5,7 новым инфекциям, когда никто из членов сообщества не невосприимчивый и нет предупредительные меры взятый.[26] Вирус в основном распространяется между людьми при тесном контакте и через респираторные капли возникает при кашле или чихании.[27][28] Это в основном входит клетки человека путем связывания с рецептором ангиотензинпревращающий фермент 2 (ACE2).[18][29][30][31]

Терминология

Название «2019-nCoV» используется в трехъязычном знаке на Лиссабон медицинское учреждение в феврале 2020 года.
Смотрите также: Связь администрации Трампа во время пандемии COVID-19 § Терминология

Во время первоначальной вспышки в Ухань, Китай, для вируса использовались различные названия; некоторые имена, используемые разными источниками, включали «коронавирус» или «коронавирус Ухани».[32][33] В январе 2020 г. Всемирная организация здравоохранения рекомендован «Новый коронавирус 2019 г.» (2019-nCov)[34][5] как временное название вируса. Это соответствовало руководству ВОЗ от 2015 г.[35] против использования географических местоположений, видов животных или групп людей в названиях болезней и вирусов.[36][37]

11 февраля 2020 г. Международный комитет по таксономии вирусов принято официальное название «Коронавирус тяжелого острого респираторного синдрома 2» (SARS-CoV-2).[21] Чтобы избежать путаницы с болезнью ОРВИ, ВОЗ иногда называет SARS-CoV-2 "вирусом COVID-19" в сообщениях общественного здравоохранения.[38][39] и название HCoV-19 было включено в некоторые исследовательские статьи.[8][9][10]

Широкая общественность часто называет и вирус, и вызываемую им болезнь коронавирусом. Президент США Дональд Трамп называл вирус «китайским вирусом» в твитах, интервью и брифингах для прессы Белого дома, что вызывало некоторую критику за то, что он клеймил болезнь расовым или националистическим подтекстом.[40][41][42]

Вирусология

Инфекция и передача

Основная статья: Передача COVID-19

От человека к человеку коробка передач SARS-CoV-2 было подтверждено 20 января 2020 года во время COVID-19 пандемия.[16][43][44][45] Первоначально предполагалось, что передача происходит в основном через респираторные капли от кашля и чихания на расстоянии около 1,8 метра (6 футов).[28][46] Эксперименты по рассеянию лазерного излучения предполагают Говорящий - как дополнительный способ передачи.[47][48] Другие исследования показали, что вирус также может передаваться по воздуху, с аэрозоли потенциально способный передавать вирус.[49][50][51] Считается, что при передаче от человека человеку в среднем 1000 инфекционных вирионов SARS-CoV-2 инициируют новую инфекцию.[52][53]

Косвенный контакт через загрязненные поверхности еще одна возможная причина заражения.[54] Предварительные исследования показывают, что вирус может сохранять жизнеспособность на пластике (полипропилен ) и нержавеющая сталь (AISI 304 ) до трех суток, но не сохраняется на картоне более суток или на меди более четырех часов;[10] вирус инактивируется мылом, что дестабилизирует его липидный бислой.[55][56] Популярный РНК также был найден в образцы стула и сперма инфицированных людей.[57][58]

Степень заразности вируса во время период инкубации сомнительно, но исследования показали, что глотка достигает пика вирусная нагрузка примерно через четыре дня после заражения[59][60] или первая неделя симптомов, а затем снижается.[61] На 1 Февраль 2020 г. Всемирная организация здоровья (ВОЗ) указали, что "передача от бессимптомный случаи, вероятно, не являются основным фактором передачи ».[62] Однако эпидемиологическая модель начала вспышка в Китае предположил, что "предсимптоматический проливать может быть типичным среди задокументированных инфекций "и что субклинические инфекции могли быть источником большинства инфекций.[63] Это может объяснить, как из 217 на борту круизный лайнер это пристыковано к Монтевидео, только у 24 из 128, у которых был положительный результат на вирусную РНК, наблюдались симптомы.[64] Аналогичным образом, исследование девяноста четырех пациентов, госпитализированных в январе и феврале 2020 года, показало, что пациенты выделяют наибольшее количество вируса за два-три дня до появления симптомов, и что «значительная часть передачи, вероятно, произошла до появления первых симптомов в индексный случай ".[65]

Исследование, проведенное группой исследователей из Университет Северной Каролины обнаружил, что носовая полость по-видимому, является основным первичным очагом заражения с последующим стремление -опосредованное посевом вируса в легкие в патогенезе SARS-CoV-2.[66] Они обнаружили, что существует градиент инфекции от высокого в проксимальном к низкому в дистальных легочных эпителиальных культурах с очаговой инфекцией в ресничных клетках и пневмоцитах 2 типа в дыхательных путях и альвеолярных областях соответственно.[66]

Имеются некоторые свидетельства передачи SARS-CoV-2 от человека животному, включая примеры в кошачьи.[67][68] Некоторые учреждения рекомендовали инфицированным SARS-CoV-2 ограничить контакт с животными.[69][70]

По-прежнему остается много вопросов о повторном заражении и долгосрочном иммунитете.[71] Неизвестно, насколько распространено повторное заражение, но в отчетах указано, что это происходит с разной степенью тяжести.[71] Первым зарегистрированным случаем повторного заражения стал 33-летний мужчина из Гонконга, у которого первый положительный результат был получен 26 марта 2020 года, он был выписан 15 апреля 2020 года после двух отрицательных тестов и снова дал положительный результат 15 августа 2020 года (142 дня спустя). что было подтверждено полногеномным секвенированием, показывающим, что вирусные геномы между эпизодами принадлежат разным клады.[72] Выводы подразумевали, что коллективный иммунитет не может устранить вирус, если повторное заражение не является редкостью и вакцина может быть не в состоянии обеспечить пожизненную защиту от вируса.[72] В другом тематическом исследовании был описан 25-летний мужчина из Невады, у которого 18 апреля 2020 года и 5 июня 2020 года был получен положительный результат на SARS-CoV-2 (разделенных двумя отрицательными тестами). Поскольку геномный анализ показал значительные генетические различия между вариантом SARS-CoV-2, отобранным в эти две даты, авторы тематического исследования определили, что это было повторное заражение.[73] Вторая инфекция мужчины была симптоматически более серьезной, чем первая инфекция, но механизмы, которые могли это объяснить, неизвестны.[73]

Резервуарное и зоонозное происхождение

Передача SARS-CoV-1 и SARS-CoV-2 от млекопитающих в качестве биологических носителей человеку

Первые известные инфекции, вызванные штаммом SARS-CoV-2, были обнаружены в Ухане, Китай.[18] Первоначальный источник передачи вируса человеку остается неясным, как и то, стал ли штамм патогенный до или после вторичное событие.[23][74][9] Поскольку многие из первых людей, инфицированных этим вирусом, были работниками Рынок морепродуктов Хуанань,[75][76] Было высказано предположение, что штамм мог появиться на рынке.[9][77] Однако другие исследования показывают, что посетители, возможно, занесли вирус на рынок, что затем способствовало быстрому распространению инфекций.[23][78] Филогенетический сетевой анализ 160 ранних геномов коронавируса, отобранных с декабря 2019 по февраль 2020 года, показал, что тип вируса, наиболее тесно связанный с коронавирусом летучих мышей, был наиболее распространен в Гуандун, Китай и обозначен типом «А». Преобладающий тип среди образцов из Ухани, «B», более отдаленно связан с коронавирусом летучих мышей, чем наследственный тип «A».[79][80]

Исследования в естественный резервуар штамма вируса, вызвавшего 2002–2004 гг. Вспышка атипичной пневмонии. привело к открытию многих SARS-подобные коронавирусы летучих мышей, большинство из которых происходит в Ринолоф род летучие мыши. Филогенетический анализ показывает, что образцы, взятые из Ринолофус синусовый показывают сходство с SARS-CoV-2 на 80%.[20][81][82] Филогенетический анализ также показывает, что вирус из Ринолофус аффинис, собранные в Провинция Юньнань и обозначенный как RaTG13, на 96% похож на SARS-CoV-2.[18][83]

Образцы взяты из Ринолофус синусовый, разновидность летучие мыши, на 80% похожи на SARS-CoV-2.

Летучие мыши считаются наиболее вероятным естественным резервуаром SARS-CoV-2,[84][85] но различия между коронавирусом летучих мышей и SARS-CoV-2 предполагают, что люди были инфицированы через промежуточного хозяина.[77] Хотя исследования предложили некоторых вероятных кандидатов, количество и личности промежуточных хозяев остаются неопределенными.[86] Почти половина генома штамма имеет филогенетическую линию, отличную от известных родственников.[87]

Китайский панголин
В ящер коронавирус имеет до 92% сходства с SARS-CoV-2.[88]

А филогенетика исследование, опубликованное в 2020 году, показывает, что панголины являются резервуаром для коронавирусов, подобных SARS-CoV-2.[89] Однако на данный момент нет прямых доказательств связи панголинов как промежуточного хозяина SARS-CoV-2.[90] Хотя существует научный консенсус в отношении того, что летучие мыши являются основным источником коронавирусов, CoV панголина является сестрой как RaTG13, так и SARS-CoV-2. На основании сходства последовательности всего генома штамм-кандидат на коронавирус панголина оказался менее похожим, чем RaTG13, но более похожим на SARS-CoV-2, чем другие коронавирусы летучих мышей. Следовательно, исходя из максимальная экономия и текущие данные выборки, определенная популяция летучих мышей с большей вероятностью напрямую передала SARS-CoV-2 людям, чем панголин, в то время как эволюционный предок летучих мышей был источником общих коронавирусов.[88]

А метагеномика исследование, опубликованное в 2019 году, ранее показало, что SARS-CoV, штамм вируса, вызывающего атипичную пневмонию, был наиболее широко распространенным коронавирусом среди выборки Зондские панголины.[91] 7 Февраль 2020, Южно-Китайский сельскохозяйственный университет в Гуанчжоу объявили, что исследователи обнаружили образец панголина с определенным коронавирусом - единственный нуклеиновая кислота последовательность вируса была «99% подобна» последовательности вируса белок -кодирование РНК SARS-CoV-2.[92] Авторы утверждают, что «рецептор-связывающий домен S белок [который привязан к рецептор клеточной поверхности во время заражения] недавно обнаруженного Pangolin-CoV практически идентичен таковому для 2019-nCoV, с одним аминокислота разница."[93] Микробиологи и генетики в Техас независимо нашли доказательства перегруппировка в коронавирусах, что предполагает участие ящеров в происхождении SARS-CoV-2.[94] Большая часть вирусной РНК относится к разновидности коронавирусов летучих мышей.[95] Белок-спайк, по-видимому, является заметным исключением, однако, возможно, приобретенный в результате более позднего рекомбинация событие с коронавирусом панголина.[96] Весь мотив связывания рецептора SARS-CoV-2, по-видимому, был введен путем рекомбинации из коронавирусов панголинов.[97] Такое событие рекомбинации могло стать решающим шагом в развитии способности SARS-CoV-2 инфицировать людей.[97] События рекомбинации были ключевыми шагами в процессе эволюции вирусов, которые привели к появлению новых болезней человека.[98] Структурный анализ рецепторсвязывающего домена (RBD) и человека ангиотензин-превращающий фермент 2 (ACE2) комплекс[99] выявили ключевые мутации в RBD, такие как F486 и N501, которые образуют контакты с ACE2.[100] Эти остатки обнаружены в коронавирусе панголинов.[100]

Панголины находятся под защитой китайского законодательства, но их браконьерство и торговля для использования в традиционная китайская медицина остается обычным явлением в черный рынок.[101][102] Вырубка леса, разведение диких животных и торговля в антисанитарных условиях повышают риск новых зоонозных заболеваний.[103][104][105][106]

Все имеющиеся данные свидетельствуют о том, что SARS-CoV-2 имеет естественное животное происхождение и не является генно-инженерный.[107] Тем не менее нельзя исключать лабораторное происхождение SARS-CoV-2.[108] В соответствии с компьютерное моделирование на сворачивание белка, RBD белка шипа SARS-CoV-2 должен иметь непримечательную аффинность связывания. В действительности, однако, он очень эффективно связывается с рецептором ACE2 человека. Чтобы подвергнуть RBD слиянию, фурин протеазы сначала необходимо расщепить белок S. Протеазы фурина широко распространены в эпителиальных клетках дыхательных путей и легких. Кроме того, остов вируса не похож на какие-либо ранее описанные в научной литературе, используемые для генетической модификации. Возможность того, что вирус мог получить необходимую приспособления через культура клеток в лабораторных условиях оспаривается учеными, утверждающими, что «поколение предсказанных О-связанные гликаны... предложить [а] участие иммунная система."[109][9]

Филогенетика и систематика

Геномная информация
SARS-CoV-2 genome.svg
Геномный организация изолята Wuhan-Hu-1, самого раннего секвенированного образца SARS-CoV-2
NCBI идентификатор генома86693
Размер генома29,903 базиса
Год окончания2020
Браузер генома (UCSC )

SARS-CoV-2 принадлежит к широкому семейству вирусов, известных как коронавирусы.[33] Это положительно-смысловая одноцепочечная РНК (+ ssRNA) вирус с одним линейным сегментом РНК. Другие коронавирусы способны вызывать самые разные заболевания: простуда к более тяжелым заболеваниям, таким как Ближневосточный респираторный синдром (MERS, летальность ~ 34%). Это седьмой известный коронавирус, заражающий людей после 229E, NL63, OC43, HKU1, MERS-CoV, а оригинал SARS-CoV.[110]

Как и штамм коронавируса, связанный с SARS, причастный к вспышке SARS 2003 года, SARS-CoV-2 является членом подрода Сарбековирус (бета-CoV линия B).[111][112] Его последовательность РНК составляет примерно 30 000 базы в длину.[15] SARS-CoV-2 уникален среди известных бета-коронавирусов тем, что включает в себя многоосновный сайт расщепления, характеристика, как известно, увеличивает патогенность и передаваемость другими вирусами.[9][113][114]

При достаточном количестве секвенированных геномы, можно восстановить филогенетическое дерево истории мутаций семейства вирусов. К 12 января 2020 года пять геномов SARS-CoV-2 были выделены из Ухани, о чем сообщила Китайский центр по контролю и профилактике заболеваний (CCDC) и другие учреждения;[15][115] количество геномов увеличилось до 42 к 30 января 2020 года.[116] Филогенетический анализ этих образцов показал, что они «сильно связаны не более чем с семью мутациями по сравнению с общий предок ", подразумевая, что первое заражение человека произошло в ноябре или декабре 2019 года.[116] По состоянию на 7 мая 2020 г. 4690 геномов SARS-CoV-2, взятых на шести континентах, были общедоступны.[117]

11 февраля 2020 года Международный комитет по таксономии вирусов объявил, что в соответствии с существующими правилами, которые вычисляют иерархические отношения между коронавирусами на основе пяти консервативные последовательности нуклеиновых кислот, различий между тем, что тогда называлось 2019-nCoV, и штаммом вируса из вспышки атипичной пневмонии 2003 года было недостаточно, чтобы разделить их вирусные виды. Таким образом, они определили 2019-nCoV как напряжение из Коронавирус, связанный с тяжелым острым респираторным синдромом.[2]

В июле 2020 года ученые сообщили, что более заразный вариант SARS-CoV-2 с пиковый белок вариант G614 заменил D614 как доминирующую форму в пандемии.[118][119] В октябре 2020 года ученые сообщили в препринт это вариант, 20A.EU1, впервые был замечен в Испании в начале лета и стал наиболее частым вариантом во многих европейских странах. Они также иллюстрируют появление и распространение других частых кластеров последовательностей с использованием Nextstrain.[120][121]

В октябре 2020 года исследователи обнаружили возможный перекрывающийся ген названный ORF3d, в вирусе Covid-19 геном. Неизвестно, продуцируется ли белок ORF3d выполняет любую функцию, но вызывает сильный иммунный ответ. ORF3d был идентифицирован ранее, в варианте коронавируса, который поражает панголины.[122][123]

Структурная биология

Рисунок сферического вириона SARSr-CoV, показывающий расположение структурных белков, образующих вирусную оболочку и внутренний нуклеокапсид
Структура SARSr-CoV вирион

Каждый SARS-CoV-2 вирион 50–200 нанометры в диаметре.[76] Как и другие коронавирусы, SARS-CoV-2 имеет четыре структурных белка, известных как S (шип ), E (конверт), M (мембрана ), и н (нуклеокапсид ) белки; белок N содержит геном РНК, а белки S, E и M вместе создают вирусный конверт.[124] Белок-спайк, который был отображен на атомном уровне с помощью криогенная электронная микроскопия,[125][126] белок, который позволяет вирусу прикрепляться и сливаться с мембрана клетки-хозяина;[124] в частности, его субъединица S1 катализирует прикрепление, слияние субъединицы S2.[127]

Спайковый гомотример SARS-CoV-2, фокусирующийся на одной субъединице белка с выделенным доменом связывания ACE2
SARS-CoV-2 шип гомотример с одним субъединица белка выделено. ACE2 связывающий домен пурпурный.

Белковое моделирование эксперименты с белком шипа вируса вскоре показали, что SARS-CoV-2 имеет достаточное сродство к рецептору. ангиотензинпревращающий фермент 2 (ACE2) на человеческие клетки, чтобы использовать их в качестве механизма запись в ячейку.[128] К 22 января 2020 года группа в Китае, работающая с полным геномом вируса, и группа в США, использующая обратная генетика методы независимо и экспериментально продемонстрировали, что ACE2 может действовать как рецептор для SARS-CoV-2.[18][129][29][130] Исследования показали, что SARS-CoV-2 имеет более высокое сродство к человеческому ACE2, чем исходный штамм вируса SARS.[125][131] SARS-CoV-2 также может использовать Basigin чтобы помочь войти в камеру.[132]

Первоначальное праймирование белка шипа трансмембранная протеаза, серин 2 (TMPRSS2) необходим для проникновения SARS-CoV-2.[30] После того, как вирион SARS-CoV-2 прикрепляется к целевой клетке, клетка протеаза TMPRSS2 разрезает спайковый белок вируса, обнажая слитый пептид в субъединице S2 и рецепторе хозяина ACE2.[127] После слияния эндосома образуется вокруг вириона, отделяя его от остальной части клетки-хозяина. Вирион ускользает, когда pH эндосомных капель или когда катепсин, хозяин цистеин протеаза, расщепляет его.[127] Затем вирион высвобождает РНК в клетку и заставляет клетку производить и распространять копии вируса, которые заражают больше клеток.[133]

SARS-CoV-2 производит не менее трех факторы вирулентности которые способствуют отделению новых вирионов от клеток-хозяев и ингибируют иммунная реакция.[124] Включают ли они подавление ACE2, наблюдаемый в аналогичных коронавирусах, продолжает расследование (по состоянию на май 2020 г.).[89]

SARS-CoV-2, возникший из клетки человека
Вирионы SARS-CoV-2, возникающие из клетки человека
Цифровая окраска сканирующие электронные микрофотографии SARS-CoV-2 вирионы (желтый) из клеток человека культурный в лаборатории

Эпидемиология

Основная статья: COVID-19 пандемия
Микрофотография вирусных частиц SARS-CoV-2, выделенных от пациента
Просвечивающая электронная микрофотография вирионов SARS-CoV-2 (красный цвет), выделенных от пациента во время COVID-19 пандемия

На основании низкой изменчивости среди известных SARS-CoV-2 геномный последовательности, считается, что штамм был обнаружен органами здравоохранения в течение нескольких недель после его появления среди населения в конце 2019 года.[23][134] Самый ранний известный в настоящее время случай заражения датируется 17 ноября 2019 г. или, возможно, 1 декабря 2019 г.[135] Впоследствии вирус распространился на все провинции Китая и более чем в 150 других стран Азии, Европы, Северной Америки, Южной Америки, Африки и Океании.[136] Передача вируса от человека человеку подтверждена во всех этих регионах.[137] 30 января 2020 года SARS-CoV-2 был назначен Чрезвычайная ситуация в области общественного здравоохранения, имеющая международное значение ВОЗ,[138][12] а 11 марта 2020 года ВОЗ объявила это пандемия.[13][139]

В базовый номер репродукции () вируса оценивается примерно в 5,7.[26] Это означает, что каждое заражение вирусом, как ожидается, приведет к 5,7 новым заражениям, когда никто из членов сообщества не невосприимчивый и нет предупредительные меры принимаются. Число репродукций может быть выше в густонаселенных условиях, например, на круизные суда.[140] Многие формы профилактические меры могут быть использованы в определенных обстоятельствах для уменьшения распространения вируса.[141]

В материковом Китае зарегистрировано около 82 000 подтвержденных случаев заражения.[136] Хотя доля инфекций, приводящих к подтвержденные случаи [заболевания или прогресс до диагностируемого заболевания остается неясным,[142] Согласно одной математической модели, 25 января 2020 года только в Ухане заразились 75815 человек, в то время как количество подтвержденных случаев во всем мире составляло всего 2015.[143] До 24 февраля 2020 г. более 95% всех смертей от COVID-19 во всем мире произошло в Провинция Хубэй, где расположен Ухань.[144][145] По состоянию на 6 декабря 2020 года процентная доля снизилась до 0.21%.[136]

По состоянию на 6 декабря 2020 года в рамках продолжающейся пандемии было зарегистрировано 66 608 379 подтвержденных случаев инфекции SARS-CoV-2.[136] Общее количество смертей, приписываемых вирусу, составляет 1 530 296 человек.[136] О многих случаях выздоровления от подтвержденных инфекций не сообщается, но по крайней мере 42 866 555 человек выздоровели от подтвержденных инфекций.[136]

Смотрите также

  • Кластер 5, мутированный вариант вируса SARS-CoV-2

Рекомендации

  1. ^ а б c d е Джаймо С. (1 апреля 2020 г.). «Колючая клякса, которую видели во всем мире». Нью-Йорк Таймс. В архиве из оригинала 2 апреля 2020 г.. Получено 6 апреля 2020.
  2. ^ а б c Горбаленя А.Е., Бейкер С.К., Барич Р.С., де Гроот Р.Дж., Дростен С., Гуляева А.А. и др. (Март 2020 г.). «Виды Коронавирус, связанный с тяжелым острым респираторным синдромом: классификация 2019-nCoV и присвоение ему названия SARS-CoV-2». Природная микробиология. 5 (4): 536–544. Дои:10.1038 / s41564-020-0695-z. ЧВК  7095448. PMID  32123347.
  3. ^ «Коронавирусная болезнь под названием Covid-19». BBC News Online. 11 февраля 2020. В архиве из оригинала 15 февраля 2020 г.. Получено 15 февраля 2020.
  4. ^ Определения случаев эпиднадзора за инфицированием человека новым коронавирусом (nCoV): временное руководство, версия 1, январь 2020 г. (Отчет). Всемирная организация здоровья. Январь 2020. HDL:10665/330376. WHO / 2019-nCoV / Surveillance / v2020.1.
  5. ^ а б «Профессионалы здравоохранения: часто задаваемые вопросы и ответы». Соединенные Штаты Центры по контролю и профилактике заболеваний (CDC). 11 февраля 2020. В архиве из оригинала 14 февраля 2020 г.. Получено 15 февраля 2020.
  6. ^ «О новом коронавирусе (2019-nCoV)». Соединенные Штаты Центры по контролю и профилактике заболеваний (CDC). 11 февраля 2020. В архиве из оригинала 11 февраля 2020 г.. Получено 25 февраля 2020.
  7. ^ Harmon A (4 марта 2020 г.). «Мы поговорили с шестью американцами с коронавирусом». Нью-Йорк Таймс. В архиве из оригинала 13 марта 2020 г.. Получено 16 марта 2020.
  8. ^ а б Wong, G .; Bi, Y. H .; Wang, Q.H .; Чен, X. W .; Zhang, Z. G .; Яо, Ю. Г. (2020). «Зоонозное происхождение коронавируса человека 2019 (HCoV-19 / SARS-CoV-2): почему эта работа важна?». Зоологические исследования. 41 (3): 213–219. Дои:10.24272 / j.issn.2095-8137.2020.031. ЧВК  7231470. PMID  32314559.
  9. ^ а б c d е ж грамм Андерсен К.Г., Рамбаут А., Липкин В.И., Холмс Э.К., Гарри РФ (17 марта 2020 г.). «Переписка: проксимальное происхождение SARS-CoV-2». Природа Медицина. 26 (4): 450–452. Дои:10.1038 / s41591-020-0820-9. ЧВК  7095063. PMID  32284615.
  10. ^ а б c d ван Дормален Н., Бушмейкер Т., Моррис Д.Х., Холбрук М.Г., Гэмбл А., Уильямсон Б.Н. и др. (17 марта 2020 г.). «Соответствие: аэрозольная и поверхностная стабильность SARS-CoV-2 по сравнению с SARS-CoV-1». Медицинский журнал Новой Англии. 382 (16): 1564–1567. Дои:10.1056 / NEJMc2004973. ЧВК  7121658. PMID  32182409.
  11. ^ «База данных hCoV-19». Китайский национальный генетический банк. В архиве из оригинала 17 июня 2020 г.. Получено 2 июн 2020.
  12. ^ а б «Заявление о втором заседании Комитета по чрезвычайным ситуациям Международных медико-санитарных правил (2005 г.) в связи со вспышкой нового коронавируса (2019-nCoV)». Всемирная организация здоровья (ВОЗ) (Пресс-релиз). 30 января 2020. В архиве из оригинала на 31 января 2020 г.. Получено 30 января 2020.
  13. ^ а б «Вступительное слово Генерального директора ВОЗ на брифинге для СМИ по COVID-19 - 11 марта 2020 г.». Всемирная организация здоровья (ВОЗ) (Пресс-релиз). 11 марта 2020. В архиве из оригинала 11 марта 2020 г.. Получено 12 марта 2020.
  14. ^ Балтимор, Д. (1971). «Экспрессия геномов вирусов животных». Бактериологические обзоры. 35 (3): 235–241. Дои:10.1128 / MMBR.35.3.235-241.1971. ЧВК  378387. PMID  4329869.
  15. ^ а б c «CoV2020». GISAID EpifluDB. В архиве из оригинала 12 января 2020 г.. Получено 12 января 2020.
  16. ^ а б Чан Дж. Ф., Юань С., Кок К. Х., То К. К., Чу Х, Ян Дж. И др. (Февраль 2020 г.). «Семейный кластер пневмонии, связанный с новым коронавирусом 2019 года, указывающий на передачу от человека к человеку: исследование семейного кластера». Ланцет. 395 (10223): 514–523. Дои:10.1016 / S0140-6736 (20) 30154-9. ЧВК  7159286. PMID  31986261.
  17. ^ «Новый коронавирус стабилен на поверхности в течение нескольких часов». Национальные институты здоровья (NIH). NIH.gov. 17 марта 2020. В архиве из оригинала 23 марта 2020 г.. Получено 4 мая 2020.
  18. ^ а б c d е Чжоу П., Ян XL, Ван XG, Ху Б., Чжан Л., Чжан В. и др. (Февраль 2020 г.). «Вспышка пневмонии, связанная с новым коронавирусом, вероятно, происхождения летучих мышей». Природа. 579 (7798): 270–273. Bibcode:2020Натура.579..270Z. Дои:10.1038 / s41586-020-2012-7. ЧВК  7095418. PMID  32015507.
  19. ^ Perlman S (февраль 2020 г.). «Еще одно десятилетие, еще один коронавирус». Медицинский журнал Новой Англии. 382 (8): 760–762. Дои:10.1056 / NEJMe2001126. ЧВК  7121143. PMID  31978944.
  20. ^ а б Бенвенуто Д., Джованетти М., Чиккоцци А., Спото С., Анджелетти С., Чиккоцци М. (апрель 2020 г.). «Эпидемия нового коронавируса в 2019 году: свидетельства эволюции вируса». Журнал медицинской вирусологии. 92 (4): 455–459. Дои:10.1002 / jmv.25688. ЧВК  7166400. PMID  31994738.
  21. ^ а б Новый коронавирус (2019-nCoV): отчет о ситуации, 22 (Отчет). Всемирная организация здоровья. 11 февраля 2020. HDL:10665/330991.
  22. ^ Shield C (7 февраля 2020 г.). «Коронавирус: от летучих мышей до ящеров, как вирусы достигают нас?». Deutsche Welle. В архиве из оригинала 4 июня 2020 г.. Получено 13 марта 2020.
  23. ^ а б c d Коэн Дж. (Январь 2020 г.). «Рынок морепродуктов в Ухане не может быть источником глобального распространения нового вируса». Наука. Дои:10.1126 / science.abb0611.
  24. ^ Каспермейер, Джозеф (7 ноября 2020 г.). «Нулевой пациент с COVID-19: анализ данных определяет« мать »всех геномов SARS-CoV-2». SciTechDaily. В архиве из оригинала 17 ноября 2020 г.. Получено 7 ноября 2020.
  25. ^ Кумар, Судхир (29 сентября 2020 г.). «Эволюционный портрет предшественника SARS-CoV-2 и его основных ответвлений в пандемии COVID-19». bioRxiv. Дои:10.1101/2020.09.24.311845. ЧВК  7523107. PMID  32995781. В архиве из оригинала 17 ноября 2020 г.. Получено 7 ноября 2020.
  26. ^ а б Sanche, S .; Лин, Ю. Т .; Xu, C .; Romero-Severson, E .; Hengartner, E .; Кэ, Р. (июль 2020 г.). «Высокая контагиозность и быстрое распространение тяжелого острого респираторного синдрома, вызванного коронавирусом 2». Возникающие инфекционные заболевания. 26 (7): 1470–1477. Дои:10.3201 / eid2607.200282. ЧВК  7323562. PMID  32255761.
  27. ^ «Вопросы и ответы о коронавирусах (COVID-19)». Всемирная организация здоровья (ВОЗ). 11 февраля 2020. В архиве из оригинала на 20 января 2020 г.. Получено 24 февраля 2020.
  28. ^ а б «Как распространяется COVID-19». НАС. Центры по контролю и профилактике заболеваний (CDC). 27 января 2020. В архиве из оригинала 28 января 2020 г.. Получено 29 января 2020.
  29. ^ а б Летко М., Марзи А., Мюнстер В. (февраль 2020 г.). «Функциональная оценка входа в клетки и использования рецепторов для SARS-CoV-2 и других бета-коронавирусов линии B». Природная микробиология. 5 (4): 562–569. Дои:10.1038 / s41564-020-0688-у. ЧВК  7095430. PMID  32094589.
  30. ^ а б Hoffman M, Kliene-Weber H, Krüger N, Herrler T., Erichsen S, Schiergens TS, et al. (16 апреля 2020 г.). «Вступление клеток SARS-CoV-2 зависит от ACE2 и TMPRSS2 и блокируется клинически подтвержденным ингибитором протеазы». Клетка. 181 (2): 271–280.e8. Дои:10.1016 / j.cell.2020.02.052. ЧВК  7102627. PMID  32142651.
  31. ^ Ву, Кэтрин Дж. (15 апреля 2020 г.). «Во Вселенной больше вирусов, чем звезд. Почему только некоторые заражают нас? - На Земле существует более квадриллиона квадриллионов отдельных вирусов, но большинство из них не готовы проникнуть в людей. Можем ли мы найти те, которые есть?». Национальное географическое общество. В архиве из оригинала 23 апреля 2020 г.. Получено 18 мая 2020.
  32. ^ Хуан П. (22 января 2020 г.). «Чем отличается уханьский коронавирус с MERS, SARS и простудой?». энергетический ядерный реактор. В архиве из оригинала 2 февраля 2020 г.. Получено 3 февраля 2020.
  33. ^ а б Fox D (24 января 2020 г.). «Что нужно знать об уханьском коронавирусе». Природа. Дои:10.1038 / d41586-020-00209-у.
  34. ^ Всемирная организация здравоохранения (30 января 2020 г.). Новый коронавирус (2019-nCoV): отчет о ситуации, 10 (Отчет). Всемирная организация здоровья. HDL:10665/330775.
  35. ^ "Лучшие практики Всемирной организации здравоохранения по присвоению имен новым инфекционным заболеваниям человека" (PDF). ВОЗ. Май 2015. В архиве (PDF) из оригинала 12 февраля 2020 г.
  36. ^ «Новый коронавирус под названием« Covid-19 »: ВОЗ». СЕГОДНЯ онлайн. В архиве из оригинала 21 марта 2020 г.. Получено 11 февраля 2020.
  37. ^ «Коронавирус распространяет расизм против этнических китайцев и среди них». Экономист. 17 февраля 2020. В архиве из оригинала 17 февраля 2020 г.. Получено 17 февраля 2020.
  38. ^ Hui M (18 марта 2020 г.). «Почему ВОЗ не назовет коронавирус по имени SARS-CoV-2?». Кварцевый. В архиве с оригинала 25 марта 2020 г.. Получено 26 марта 2020.
  39. ^ «Назовите коронавирусную болезнь (COVID-2019) и вирус, который ее вызывает». Всемирная организация здоровья. В архиве из оригинала 28 февраля 2020 г.. Получено 24 февраля 2020. С точки зрения информирования о рисках использование названия SARS может иметь непредвиденные последствия с точки зрения создания ненужного страха для некоторых групп населения. ... По этой и другим причинам ВОЗ начала называть вирус «вирусом, ответственным за COVID-19» или «вирусом COVID-19» при общении с общественностью. Ни одно из этих обозначений [sic] не предназначено для замены официального названия вируса, согласованного ICTV.
  40. ^ Гштальтер, Морган (19 марта 2020 г.). "Официальный представитель ВОЗ предостерегает от называть это" китайским вирусом ", говорит, что" в этом нет никакой вины.'". Холм. В архиве из оригинала 18 апреля 2020 г.. Получено 21 марта 2020.
  41. ^ Шинкман, Пол (17 марта 2020 г.). «Трамп отвечает на жалобы, которые он стигматизирует в Китае из-за коронавируса». Новости США. В архиве из оригинала 29 марта 2020 г.. Получено 21 марта 2020.
  42. ^ Уилл Стейкин (20 июня 2020 г.). «Трамп направляется в Талсу для ответного митинга на фоне пандемии, несмотря на растущие предупреждения экспертов в области здравоохранения». В архиве из оригинала на 20 июня 2020 г.. Получено 20 июн 2020.
  43. ^ Ли Дж, Ю З, Ван Ц., Чжоу З, Цю Ю, Ло Р и др. (Март 2020 г.). «Эпидемия пневмонии, вызванной новым коронавирусом 2019 года (2019-nCoV), и выводы о новых инфекционных заболеваниях в будущем». Микробы и инфекции. 22 (2): 80–85. Дои:10.1016 / j.micinf.2020.02.002. ЧВК  7079563. PMID  32087334. В архиве из оригинала 14 апреля 2020 г.. Получено 19 апреля 2020.
  44. ^ Кесслер, Гленн (17 апреля 2020 г.). «Ложное заявление Трампа о том, что ВОЗ заявила, что коронавирус« не передается »'". Вашингтон Пост. Архивировано из оригинал 17 апреля 2020 г.. Получено 17 апреля 2020.
  45. ^ Куо, Лили (21 января 2020 г.). «Китай подтверждает передачу коронавируса от человека к человеку». Хранитель. В архиве из оригинала 22 марта 2020 г.. Получено 18 апреля 2020.
  46. ^ Эдвардс Э. (25 января 2020 г.). «Как распространяется коронавирус?». Новости NBC. В архиве из оригинала 28 января 2020 г.. Получено 13 марта 2020.
  47. ^ Анфинруд П., Стадницкий В., Bax CE, Bax A (май 2020 г.). «Визуализация капель ротовой жидкости, генерируемых речью, с помощью рассеяния лазерного излучения». Медицинский журнал Новой Англии. 382 (21): 2061–2063. Дои:10.1056 / NEJMc2007800. ЧВК  7179962. PMID  32294341.
  48. ^ Стадницкий В., Bax CE, Bax A, Анфинруд П. (июнь 2020 г.). «Время жизни маленьких речевых капель в воздухе и их потенциальное значение в передаче SARS-CoV-2». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 117 (22): 11875–11877. Дои:10.1073 / pnas.2006874117. ЧВК  7275719. PMID  32404416.
  49. ^ Мандавилли, Апурва]] (4 июля 2020 г.). «239 экспертов с одним большим заявлением: коронавирус передается по воздуху - W.H.O. сопротивляется растущему количеству доказательств того, что вирусные частицы, плавающие в помещении, заразны, - говорят некоторые ученые. Агентство утверждает, что исследование все еще неубедительно».. Нью-Йорк Таймс. В архиве из оригинала 17 ноября 2020 г.. Получено 5 июля 2020.
  50. ^ Зейнеп Туфекчи (30 июля 2020 г.). «Нам нужно поговорить о вентиляции». Атлантический океан. В архиве из оригинала 17 ноября 2020 г.. Получено 8 сентября 2020.
  51. ^ Льюис, Дайани (июль 2020 г.). «Все больше данных свидетельствует о том, что коронавирус передается воздушно-капельным путем, но рекомендации по охране здоровья не подтвердились». Природа. 583 (7817): 510–513. Bibcode:2020Натура 583..510л. Дои:10.1038 / d41586-020-02058-1. PMID  32647382. S2CID  220470431. В архиве из оригинала 14 сентября 2020 г.. Получено 9 октября 2020.
  52. ^ Попа, Александра; и другие. (23 ноября 2020 г.). «Геномная эпидемиология сверхраспространения событий в Австрии раскрывает мутационную динамику и свойства передачи SARS-CoV-2». Научная трансляционная медицина. Дои:10.1126 / scitranslmed.abe2555. Получено 1 декабря 2020.
  53. ^ Прентисс, Мара; и другие. (23 октября 2020 г.). «Сверхраспространение событий без суперраспространителей: использование событий с высокой частотой атак для оценки № для передачи COVID-19 по воздуху». medRxiv. Дои:10.1101/2020.10.21.20216895. Получено 1 декабря 2020.
  54. ^ «Подготовка рабочего места к COVID-19» (PDF). Всемирная организация здоровья. 27 февраля 2020. В архиве (PDF) из оригинала 2 марта 2020 г.. Получено 3 марта 2020.
  55. ^ Ён Э (20 марта 2020 г.). «Почему коронавирус стал таким успешным». Атлантический океан. В архиве из оригинала 20 марта 2020 г.. Получено 20 марта 2020.
  56. ^ Gibbens S (18 марта 2020 г.). «Почему мыло предпочтительнее отбеливателя в борьбе с коронавирусом». Национальная география. В архиве из оригинала 2 апреля 2020 г.. Получено 2 апреля 2020.
  57. ^ Holshue ML, DeBolt C, Lindquist S, Lofy KH, Wiesman J, Bruce H и др. (Март 2020 г.). «Первый случай нового коронавируса 2019 года в США». Медицинский журнал Новой Англии. 382 (10): 929–936. Дои:10.1056 / NEJMoa2001191. ЧВК  7092802. PMID  32004427.
  58. ^ Ли Д., Цзинь М., Бао П, Чжао В., Чжан С. (7 мая 2020 г.). «Клинические характеристики и результаты тестов спермы у мужчин с коронавирусной болезнью 2019». Сеть JAMA открыта. 3 (5): e208292. Дои:10.1001 / jamanetworkopen.2020.8292. ЧВК  7206502. PMID  32379329.
  59. ^ Вельфель Р., Корман В.М., Гуггемос В., Сейлмайер М., Занге С., Мюллер М.А. и др. (Апрель 2020 г.). «Вирусологическая оценка госпитализированных пациентов с COVID-2019». Природа. 581 (7809): 465–469. Bibcode:2020Натура 581..465Вт. Дои:10.1038 / с41586-020-2196-х. PMID  32235945.
  60. ^ Kupferschmidt K (февраль 2020 г.). «Исследование, утверждающее, что новый коронавирус может передаваться от людей без симптомов, было ошибочным». Наука. Дои:10.1126 / science.abb1524.
  61. ^ То KK, Tsang OT, Leung W, Tam AR, Wu T, Lung DC и др. (Март 2020 г.). «Временные профили вирусной нагрузки в образцах слюны из задней части ротоглотки и ответы сывороточных антител во время инфекции SARS-CoV-2: наблюдательное когортное исследование». Ланцетные инфекционные болезни. 20 (5): 565–574. Дои:10.1016 / S1473-3099 (20) 30196-1. ЧВК  7158907. PMID  32213337. В архиве из оригинала 17 апреля 2020 г.. Получено 21 апреля 2020.
  62. ^ Всемирная организация здравоохранения (1 февраля 2020 г.). Новый коронавирус (2019-nCoV): отчет о ситуации, 12 (Отчет). Всемирная организация здоровья. HDL:10665/330777.
  63. ^ Ли Р., Пей С., Чен Б., Сон Й., Чжан Т., Ян В. и др. (16 марта 2020 г.). «Существенная недокументированная инфекция способствует быстрому распространению нового коронавируса (SARS-CoV2)». Наука. 368 (6490): 489–493. Bibcode:2020Sci ... 368..489L. Дои:10.1126 / science.abb3221. ЧВК  7164387. PMID  32179701.
  64. ^ Daily Telegraph, Четверг, 28 мая 2020 г., страница 2, столбец 1, относится к медицинскому журналу Грудная клетка; Грудная клетка Статья за май 2020 г. COVID-19: по стопам Эрнеста Шеклтона В архиве 30 мая 2020 в Wayback Machine
  65. ^ He X, Lau EH, Wu P, Deng X, Wang J, Hao X и др. (15 апреля 2020 г.). «Временная динамика распространения вируса и трансмиссивность COVID-19». Природа Медицина. 26 (5): 672–675. Дои:10.1038 / s41591-020-0869-5. PMID  32296168. В архиве из оригинала 19 апреля 2020 г.. Получено 21 апреля 2020.
  66. ^ а б Hou YJ, Okuda K, Edwards CE, Martinez DR, Asakura T, Dinnon KH и др. (Июль 2020 г.). «Обратная генетика SARS-CoV-2 выявляет переменный градиент инфекции в дыхательных путях». Клетка. 182 (2): 429–446.e14. Дои:10.1016 / j.cell.2020.05.042. ЧВК  7250779. PMID  32526206.
  67. ^ «Вопросы и ответы по COVID-19: МЭБ - Всемирная организация здравоохранения животных». www.oie.int. В архиве из оригинала 31 марта 2020 г.. Получено 16 апреля 2020.
  68. ^ Goldstein J (6 апреля 2020 г.). «Тигр из зоопарка Бронкса заболел коронавирусом». Нью-Йорк Таймс. В архиве из оригинала 9 апреля 2020 г.. Получено 10 апреля 2020.
  69. ^ «Заявление Министерства сельского хозяйства США о подтверждении COVID-19 у тигра в Нью-Йорке». Министерство сельского хозяйства США. 5 апреля 2020. В архиве с оригинала 15 апреля 2020 г.. Получено 16 апреля 2020.
  70. ^ «Если у вас есть животные - коронавирусная болезнь 2019 (COVID-19)». Центры по контролю и профилактике заболеваний (CDC). 13 апреля 2020. В архиве с оригинала на 1 апреля 2020 г.. Получено 16 апреля 2020.
  71. ^ а б Ледфорд, Хайди (4 сентября 2020 г.). «Повторное заражение коронавирусом: три вопроса, которые задают ученые». Природа. 585 (7824): 168–169. Дои:10.1038 / d41586-020-02506-у. PMID  32887957. S2CID  221501940. В архиве из оригинала 17 ноября 2020 г.. Получено 9 октября 2020.
  72. ^ а б То, Кельвин Кай-Ван; Хунг, Иван Фан-Нгай; Ип, Джонатан Даниэль; Чу, Аллен Винг-Хо; Чан, Ван-Муи; Тэм, Энтони Рэймонд; и другие. (25 августа 2020 г.). «Повторное заражение коронавирусной болезнью 2019 (COVID-19) штаммом коронавируса 2 с тяжелым острым респираторным синдромом с филогенетической спецификой, подтвержденным методом полногеномного секвенирования». Клинические инфекционные болезни: ciaa1275. Дои:10.1093 / cid / ciaa1275. ЧВК  7499500. PMID  32840608. S2CID  221308584.
  73. ^ а б Тиллетт, Ричард Л; Севинский, Джоэл Р.; Хартли, Пол Д; Кервин, Хизер; Кроуфорд, Натали; Горзальский, Андрей; и другие. (Октябрь 2020 г.). «Геномные доказательства повторного заражения SARS-CoV-2: тематическое исследование». Ланцетные инфекционные болезни: S1473309920307647. Дои:10.1016 / S1473-3099 (20) 30764-7. ЧВК  7550103. PMID  33058797.
  74. ^ Эшнер К. (28 января 2020 г.). «Мы все еще не уверены, откуда на самом деле появился уханьский коронавирус». Популярная наука. В архиве с оригинала на 30 января 2020 г.. Получено 30 января 2020.
  75. ^ Хуанг Ц., Ван И, Ли Х, Рен Л, Чжао Дж, Ху И и др. (15 февраля 2020 г.). «Клинические особенности пациентов, инфицированных новым коронавирусом 2019 г., в Ухане, Китай». Ланцет. 395 (10223): 497–506. Дои:10.1016 / S0140-6736 (20) 30183-5. ЧВК  7159299. PMID  31986264. В архиве из оригинала на 31 января 2020 г.. Получено 26 марта 2020.
  76. ^ а б Чен Н, Чжоу М., Дун Х, Цюй Дж., Гун Ф, Хан И и др. (15 февраля 2020 г.). «Эпидемиологические и клинические характеристики 99 случаев новой коронавирусной пневмонии 2019 года в Ухане, Китай: описательное исследование». Ланцет. 395 (10223): 507–513. Дои:10.1016 / S0140-6736 (20) 30211-7. ЧВК  7135076. PMID  32007143. В архиве из оригинала на 31 января 2020 г.. Получено 9 марта 2020.
  77. ^ а б Сираноски Д. (26 февраля 2020 г.). «Загадка с животным источником коронавируса сгущается». Природа. 579 (7797): 18–19. Bibcode:2020Натура 579 ... 18С. Дои:10.1038 / d41586-020-00548-w. PMID  32127703.
  78. ^ Ю В.Б., Тан Г.Д., Чжан Л., Корлетт Р.Т. (21 февраля 2020 г.). «Расшифровка эволюции и передачи нового коронавируса пневмонии с использованием полных геномных данных». КитайXiv. Дои:10.12074/202002.00033 (неактивно 11 ноября 2020 г.). В архиве из оригинала 23 февраля 2020 г.. Получено 25 февраля 2020.CS1 maint: DOI неактивен по состоянию на ноябрь 2020 г. (связь)
  79. ^ Форстер П., Форстер Л., Ренфрю С., Форстер М. (8 апреля 2020 г.). «Филогенетический сетевой анализ геномов SARS-CoV-2» (PDF). PNAS. 117 (17): 9241–9243. Дои:10.1073 / pnas.2004999117. ЧВК  7196762. PMID  32269081. В архиве (PDF) из оригинала 16 апреля 2020 г.. Получено 17 апреля 2020.
  80. ^ «COVID-19: генетический сетевой анализ дает« снимок »происхождения пандемии». Кембриджский университет. 9 апреля 2020. В архиве из оригинала 16 апреля 2020 г.. Получено 17 апреля 2020.
  81. ^ "Изолят коронавируса SARS-летучей мыши bat-SL-CoVZC45, полный геном". Национальный центр биотехнологической информации (NCBI). 15 февраля 2020. В архиве из оригинала 4 июня 2020 г.. Получено 15 февраля 2020.
  82. ^ "Изолят коронавируса SARS-летучей мыши bat-SL-CoVZXC21, полный геном". Национальный центр биотехнологической информации (NCBI). 15 февраля 2020. В архиве из оригинала 4 июня 2020 г.. Получено 15 февраля 2020.
  83. ^ «Изолят коронавируса летучих мышей RaTG13, полный геном». Национальный центр биотехнологической информации (NCBI). 10 февраля 2020. В архиве из оригинала 15 мая 2020 г.. Получено 5 марта 2020.
  84. ^ Отчет Совместной миссии ВОЗ и Китая по коронавирусной болезни 2019 (COVID-19) (PDF) (Отчет). Всемирная организация здоровья (ВОЗ). 24 февраля 2020. В архиве (PDF) из оригинала 29 февраля 2020 г.. Получено 5 марта 2020.
  85. ^ Лу Р, Чжао Х, Ли Дж, Ниу П, Ян Б., Ву Х и др. (Февраль 2020 г.). «Геномная характеристика и эпидемиология нового коронавируса 2019 года: значение для происхождения вируса и связывания с рецептором». Ланцет. 395 (10224): 565–574. Дои:10.1016 / S0140-6736 (20) 30251-8. ЧВК  7159086. PMID  32007145.
  86. ^ Ву Д., Ву Т, Лю Цюй, Ян З. (12 марта 2020 г.). «Вспышка SARS-CoV-2: что мы знаем». Международный журнал инфекционных болезней. 94: 44–48. Дои:10.1016 / j.ijid.2020.03.004. ISSN  1201-9712. ЧВК  7102543. PMID  32171952. В архиве из оригинала 9 апреля 2020 г.. Получено 16 апреля 2020.
  87. ^ Paraskevis D, Kostaki EG, Magiorkinis G, Panayiotakopoulos G, Sourvinos G, Tsiodras S (апрель 2020 г.). «Полногеномный эволюционный анализ нового вируса короны (2019-nCoV) отвергает гипотезу возникновения в результате недавнего события рекомбинации». Инфекция, генетика и эволюция. 79: 104212. Дои:10.1016 / j.meegid.2020.104212. ЧВК  7106301. PMID  32004758. В архиве из оригинала 17 ноября 2020 г.. Получено 9 апреля 2020.
  88. ^ а б Чжан Т., Ву Цзянь, Чжан З. (19 марта 2020 г.). «Вероятное происхождение SARS-CoV-2 у панголинов, связанное со вспышкой COVID-19». Текущая биология. 30 (7): 1346–1351.e2. Дои:10.1016 / j.cub.2020.03.022. ЧВК  7156161. PMID  32197085.
  89. ^ а б Бичинг, штат Нью-Джерси, Флетчер Т.Э., Фаулер Р. (22 мая 2020 г.). «Передовой опыт BMJ: коронавирусная болезнь 2019 (COVID-19)» (PDF). BMJ. В архиве (PDF) из оригинала 13 июня 2020 г.. Получено 25 мая 2020.
  90. ^ Ортис-Прадо Э, Симбанья-Ривера К., Гомес-Баррено Л., Рубио-Нейра М., Гуаман Л.П., Кириакидис Н.С. и др. (Сентябрь 2020 г.). «Клиническая, молекулярная и эпидемиологическая характеристика вируса SARS-CoV-2 и коронавирусной болезни 2019 (COVID-19), всесторонний обзор литературы». Диагностическая микробиология и инфекционные болезни. 98 (1): 115094. Дои:10.1016 / j.diagmicrobio.2020.115094. ISSN  0732-8893. ЧВК  7260568. PMID  32623267.
  91. ^ Лю П., Чен В., Чен Дж. П. (октябрь 2019 г.). «Вирусная метагеномика выявила вирус Сендай и коронавирусную инфекцию малайских панголинов (Manis javanica)». Вирусы. 11 (11): 979. Дои:10.3390 / v11110979. ЧВК  6893680. PMID  31652964.
  92. ^ Сираноски Д. (7 февраля 2020 г.). «Панголины распространили китайский коронавирус среди людей?». Природа. Дои:10.1038 / d41586-020-00364-2. S2CID  212825975. В архиве из оригинала 7 февраля 2020 г.. Получено 12 февраля 2020.
  93. ^ Сяо К., Чжай Дж., Фэн Й. (февраль 2020 г.). «Выделение и характеристика коронавируса, подобного 2019-nCoV, от малайских панголинов» (PDF). bioRxiv (препринт). Дои:10.1101/2020.02.17.951335. S2CID  213920763. В архиве (PDF) из оригинала 22 апреля 2020 г.. Получено 5 мая 2020.
  94. ^ Wong MC, Cregeen SJ, Ajami NJ, Petrosino JF (февраль 2020 г.). «Доказательства рекомбинации коронавирусов, указывающие на происхождение nCoV-2019 у панголинов» (PDF). bioRxiv (препринт). Дои:10.1101/2020.02.07.939207. ЧВК  7217297. PMID  32511310. В архиве (PDF) из оригинала 22 апреля 2020 г.. Получено 5 мая 2020.
  95. ^ Ставицки С.П., Жанмонод Р., Миллер А.С., Паладино Л., Гайески Д.Ф., Яффи А.К. и др. (22 мая 2020 г.). «Пандемия нового коронавируса 2019–2020 гг. (Тяжелый острый респираторный синдром - коронавирус 2): совместный документ Междисциплинарной рабочей группы по COVID-19, объединенный Американским колледжем международной академической медицины и Всемирным академическим советом по неотложной медицине». Журнал глобальных инфекционных болезней. 12 (2): 47–93. Дои:10.4103 / jgid.jgid_86_20. ISSN  0974-777X. ЧВК  7384689. PMID  32773996.
  96. ^ Тиммер, Джон (1 июня 2020 г.). «SARS-CoV-2 выглядит как гибрид вирусов двух разных видов». Ars Technica. В архиве из оригинала 5 июня 2020 г.. Получено 6 июн 2020.
  97. ^ а б Ли X, Giorgi EE, Marichannegowda MH, Foley B, Xiao C, Kong X и др. (Июль 2020 г.). «Возникновение SARS-CoV-2 в результате рекомбинации и сильного очищающего отбора». Достижения науки. 6 (27): eabb9153. Bibcode:2020SciA .... 6B9153L. Дои:10.1126 / sciadv.abb9153. ISSN  2375-2548. ЧВК  7458444. PMID  32937441.
  98. ^ Рехман Су, Шафик Л., Ихсан А., Лю Ку (23 марта 2020 г.). «Эволюционная траектория появления нового коронавируса SARS-CoV-2». Патогены. 9 (3): 240. Дои:10.3390 / pathogens9030240. ISSN  2076-0817. ЧВК  7157669. PMID  32210130.
  99. ^ Ян, Ренхонг; Чжан, Юаньюань; Ли, Янин; Ся, Лу; Го, Иньин; Чжоу, Цян (27 марта 2020 г.). «Структурная основа для распознавания SARS-CoV-2 полноразмерным человеческим ACE2». Наука. 367 (6485): 1444–1448. Bibcode:2020Sci ... 367.1444Y. Дои:10.1126 / science.abb2762. ISSN  1095-9203. ЧВК  7164635. PMID  32132184.
  100. ^ а б Хо, Митчелл (30 апреля 2020 г.). «Перспективы разработки нейтрализующих антител против SARS-CoV-2». Антитела терапия. 3 (2): 109–114. Дои:10.1093 / abt / tbaa009. ЧВК  7291920. PMID  32566896. S2CID  219476100. В архиве из оригинала 14 июня 2020 г.. Получено 14 июн 2020.
  101. ^ Келли Джи (1 января 2015 г.). «Панголины: 13 фактов о самом охотящемся животном в мире». Телеграф. В архиве с оригинала на 24 декабря 2019 г.. Получено 9 марта 2020.
  102. ^ Горман Дж (27 февраля 2020 г.). «Запрет Китая на торговлю дикой природой - большой шаг, но есть лазейки, говорят экологи». Нью-Йорк Таймс. В архиве из оригинала 13 марта 2020 г.. Получено 23 марта 2020.
  103. ^ Кэррингтон, Дамиан (27 апреля 2020 г.). «Остановить разрушение природы или пострадать от еще более серьезных пандемий, - говорят ведущие ученые мира». Хранитель. ISSN  0261-3077. В архиве из оригинала 15 мая 2020 г.. Получено 31 мая 2020.
  104. ^ Понтес, Надя (29 апреля 2020 г.). «Как вырубка лесов может привести к еще большему количеству инфекционных заболеваний». DW.COM. В архиве из оригинала 5 мая 2020 г.. Получено 31 мая 2020.
  105. ^ Cheng, Vincent C.C .; Lau, Susanna K. P .; Ву, Патрик С. Ю.; Юэн, Квок Юнг (октябрь 2007 г.). «Коронавирус тяжелого острого респираторного синдрома как агент новой и новой инфекции». Обзоры клинической микробиологии. 20 (4): 660–694. Дои:10.1128 / CMR.00023-07. ISSN  0893-8512. ЧВК  2176051. PMID  17934078.
  106. ^ «Спасение от« эры пандемий »: эксперты предупреждают о грядущих кризисах; предлагают варианты снижения риска». EurekAlert!. 29 октября 2020. В архиве из оригинала 17 ноября 2020 г.. Получено 30 октября 2020.
  107. ^ «Происхождение SARS-CoV-2». www.who.int. В архиве из оригинала 17 ноября 2020 г.. Получено 14 октября 2020.
  108. ^ Сегрето, Россана; Дейгин, Юрий. «Генетическая структура SARS-CoV-2 не исключает лабораторного происхождения». BioEssays. н / д (н / д): 2000240. Дои:10.1002 / bies.202000240.
  109. ^ «Эпидемия коронавируса COVID-19 имеет естественное происхождение, - говорят ученые. Анализ общедоступных данных о последовательности генома SARS ‑ CoV ‑ 2 и родственных вирусов, проведенный Scripps Research, не выявил никаких доказательств того, что вирус был создан в лаборатории или сконструирован иным образом». EurekAlert!. Scripps Research Institute. 17 марта 2020. В архиве из оригинала 3 апреля 2020 г.. Получено 15 апреля 2020.
  110. ^ Zhu N, Zhang D, Wang W, Li X, Yang B, Song J и др. (Февраль 2020 г.). «Новый коронавирус от пациентов с пневмонией в Китае, 2019 г.». Медицинский журнал Новой Англии. 382 (8): 727–733. Дои:10.1056 / NEJMoa2001017. ЧВК  7092803. PMID  31978945.
  111. ^ «Филогения SARS-подобных бета-коронавирусов». следующий штамм. В архиве из оригинала на 20 января 2020 г.. Получено 18 января 2020.
  112. ^ Wong AC, Li X, Lau SK, Woo PC (февраль 2019 г.). «Глобальная эпидемиология коронавирусов летучих мышей». Вирусы. 11 (2): 174. Дои:10.3390 / v11020174. ЧВК  6409556. PMID  30791586.
  113. ^ Walls AC, Park YJ, Tortorici MA, Wall A, McGuire AT, Veesler D (9 марта 2020 г.). «Структура, функция и антигенность гликопротеина шипа SARS-CoV-2». Клетка. 181 (2): 281–292.e6. Дои:10.1016 / j.cell.2020.02.058. ЧВК  7102599. PMID  32155444.
  114. ^ Coutard B, Valle C, de Lamballerie X, Canard B, Seidah NG, Decroly E (февраль 2020 г.). «Спайковый гликопротеин нового коронавируса 2019-nCoV содержит фурин-подобный сайт расщепления, который отсутствует в CoV той же клады». Противовирусные исследования. 176: 104742. Дои:10.1016 / j.antiviral.2020.104742. ЧВК  7114094. PMID  32057769.
  115. ^ «Первоначальный выпуск генома нового коронавируса». Вирусологический. 11 января 2020. В архиве из оригинала 12 января 2020 г.. Получено 12 января 2020.
  116. ^ а б Бедфорд Т., Неер Р., Хэдфилд Н., Ходкрофт Э., Ильцисин М., Мюллер Н. «Геномный анализ распространения nCoV: Ситуационный отчет 2020-01-30». nextstrain.org. В архиве из оригинала 15 марта 2020 г.. Получено 18 марта 2020.
  117. ^ «Геномная эпидемиология нового коронавируса - Глобальная подвыборка». Nextstrain. В архиве из оригинала 20 апреля 2020 г.. Получено 7 мая 2020.
  118. ^ «Новый, более заразный штамм COVID-19 в настоящее время доминирует в глобальных случаях заражения вирусом: исследование». medicalxpress.com. В архиве из оригинала 17 ноября 2020 г.. Получено 16 августа 2020.
  119. ^ Корбер Б., Фишер В.М., Гнанакаран С., Юн Х., Тейлер Дж., Абфальтерер В. и др. (2 июля 2020 г.). «Отслеживание изменений в всплеске SARS-CoV-2: свидетельство того, что D614G увеличивает заразность вируса COVID-19». Клетка. 182 (4): 812–827.e19. Дои:10.1016 / j.cell.2020.06.043. ISSN  0092-8674. ЧВК  7332439. PMID  32697968.
  120. ^ Мередит, Сэм (29 октября 2020 г.). «Согласно исследованиям, новый вариант коронавируса распространяется по Европе». CNBC. Получено 10 ноября 2020.
  121. ^ Ходкрофт, Эмма Б.; Зубер, Мойра; Надо, Сара; Комас, Иньяки; Канделас, Фернандо Гонсалес; Консорциум, SeqCOVID-SPAIN; Стадлер, Таня; Неер, Ричард А. (28 октября 2020 г.). «Появление и распространение варианта SARS-CoV-2 по Европе летом 2020 года». medRxiv. С. 2020.10.25.20219063. Дои:10.1101/2020.10.25.20219063. Получено 10 ноября 2020.
  122. ^ Докрил, Питер (11 ноября 2020 г.). «Ученые только что обнаружили загадочно спрятанный« ген в гене »SARS-CoV-2». ScienceAlert. В архиве из оригинала 17 ноября 2020 г.. Получено 11 ноября 2020.
  123. ^ Нельсон, Чейз В.; и другие. (1 октября 2020 г.). «Динамично развивающийся новый перекрывающийся ген как фактор пандемии SARS-CoV-2». eLife. 9. Дои:10.7554 / eLife.59633. ЧВК  7655111. PMID  33001029. В архиве из оригинала 17 ноября 2020 г.. Получено 11 ноября 2020.
  124. ^ а б c Wu C, Liu Y, Yang Y, Zhang P, Zhong W, Wang Y и др. (Февраль 2020 г.). «Анализ терапевтических целей для SARS-CoV-2 и открытие потенциальных лекарств с помощью вычислительных методов». Акта Фармацевтика Синица B. 10 (5): 766–788. Дои:10.1016 / j.apsb.2020.02.008. ЧВК  7102550. PMID  32292689.
  125. ^ а б Wrapp D, Wang N, Corbett KS, Goldsmith JA, Hsieh CL, Abiona O и др. (Февраль 2020 г.). «Крио-ЭМ структура пика 2019-нКоВ в конформации до слияния». Наука. 367 (6483): 1260–1263. Bibcode:2020Sci ... 367.1260W. Дои:10.1126 / science.abb2507. ЧВК  7164637. PMID  32075877.
  126. ^ Мандельбаум РФ (19 февраля 2020 г.). «Ученые создают на атомном уровне изображение потенциальной ахиллесовой пята нового коронавируса». Gizmodo. В архиве из оригинала 8 марта 2020 г.. Получено 13 марта 2020.
  127. ^ а б c Aronson JK (25 марта 2020 г.). «Коронавирусы - общее введение». Центр доказательной медицины, Департамент первичной медико-санитарной помощи Наффилда, Оксфордский университет. В архиве из оригинала 22 мая 2020 г.. Получено 24 мая 2020.
  128. ^ Сюй Х, Чен П, Ван Дж, Фэн Дж, Чжоу Х, Ли Х и др. (Март 2020 г.). «Эволюция нового коронавируса в результате продолжающейся вспышки в Ухане и моделирование его шипового белка для определения риска передачи инфекции от человека». Наука Китай Науки о жизни. 63 (3): 457–460. Дои:10.1007 / s11427-020-1637-5. ЧВК  7089049. PMID  32009228.
  129. ^ Letko M, Munster V (январь 2020 г.). «Функциональная оценка входа в клетки и использования рецепторов для β-коронавирусов линии B, включая 2019-nCoV» (PDF). bioRxiv (препринт). Дои:10.1101/2020.01.22.915660. ЧВК  7217099. PMID  32511294. В архиве (PDF) из оригинала 22 апреля 2020 г.. Получено 5 мая 2020.
  130. ^ El Sahly HM. «Геномная характеристика нового коронавируса 2019 года». Медицинский журнал Новой Англии. В архиве из оригинала 17 февраля 2020 г.. Получено 9 февраля 2020.
  131. ^ «Новая структура коронавируса выявляет цели для вакцин и лечения». Национальные институты здоровья (НАЦИОНАЛЬНЫЕ ИНСТИТУТЫ ЗДРАВООХРАНЕНИЯ США). 2 марта 2020. В архиве с оригинала на 1 апреля 2020 г.. Получено 3 апреля 2020.
  132. ^ Ван К., Чен В., Чжоу Ю.С., Лян Дж.К., Чжан З., Ду П и др. (14 марта 2020 г.). «SARS-CoV-2 проникает в клетки-хозяева новым путем: белок CD147-spike» (PDF). bioRxiv (препринт). Дои:10.1101/2020.03.14.988345. S2CID  214725955. В архиве (PDF) из оригинала 11 мая 2020 г.. Получено 5 мая 2020.
  133. ^ «Анатомия убийцы: понимание SARS-CoV-2 и лекарств, которые могут уменьшить его силу». Экономист. 12 марта 2020. В архиве из оригинала 14 марта 2020 г.. Получено 14 марта 2020.
  134. ^ Oberholzer M, Febbo P (19 февраля 2020 г.). «Что мы знаем сегодня о коронавирусе SARS-CoV-2 и куда нам идти дальше». Новости генной инженерии и биотехнологии. В архиве из оригинала 14 марта 2020 г.. Получено 13 марта 2020.
  135. ^ Ма Дж (13 марта 2020 г.). «Коронавирус: первый подтвержденный случай заболевания Covid-19 в Китае датируется 17 ноября». Южно-Китайская утренняя почта. В архиве из оригинала 13 марта 2020 г.. Получено 16 марта 2020.
  136. ^ а б c d е ж «Панель мониторинга COVID-19 Центра системных наук и инженерии (CSSE) Университета Джонса Хопкинса (JHU)». ArcGIS. Университет Джона Хопкинса. Получено 6 декабря 2020.
  137. ^ Отчет о ситуации с коронавирусной болезнью 2019 (COVID-19) - 69 (Отчет). Всемирная организация здоровья. 29 марта 2020. HDL:10665/331615.
  138. ^ Wee SL, McNeil Jr. DG, Эрнандес JC (30 января 2020 г.). "W.H.O. объявляет глобальную чрезвычайную ситуацию по мере распространения Уханьского коронавируса". Нью-Йорк Таймс. В архиве с оригинала на 30 января 2020 г.. Получено 30 января 2020.
  139. ^ Маккей Б., Калфас Дж., Ансари Т. (11 марта 2020 г.). «Всемирная организация здравоохранения объявила пандемию коронавируса». Журнал "Уолл Стрит. В архиве из оригинала 11 марта 2020 г.. Получено 12 марта 2020.
  140. ^ Rocklöv J, Sjödin H, Wilder-Smith A (февраль 2020 г.). «Вспышка COVID-19 на круизном лайнере Diamond Princess: оценка эпидемического потенциала и эффективности контрмер общественного здравоохранения». Журнал медицины путешествий. 27 (3). Дои:10.1093 / jtm / taaa030. ЧВК  7107563. PMID  32109273.
  141. ^ Дхама К., Хан С., Тивари Р., Сиркар С., Бхат С., Малик Ю.С. и др. (24 июня 2020 г.). «Коронавирусная болезнь 2019 – COVID-19». Обзоры клинической микробиологии. 33 (4). Дои:10.1128 / CMR.00028-20. ISSN  0893-8512. ЧВК  7405836. PMID  32580969.
  142. ^ Branswell H (30 января 2020 г.). «Ограниченные данные о коронавирусе могут искажать предположения о серьезности». СТАТИСТИКА. В архиве из оригинала на 1 февраля 2020 г.. Получено 13 марта 2020.
  143. ^ Wu JT, Leung K, Leung GM (февраль 2020 г.). «Текущий прогноз и прогнозирование потенциального внутреннего и международного распространения вспышки 2019-нКоВ, возникшей в Ухане, Китай: модельное исследование». Ланцет. 395 (10225): 689–697. Дои:10.1016 / S0140-6736 (20) 30260-9. ЧВК  7159271. PMID  32014114.
  144. ^ Босли С., Маккарри Дж. (30 января 2020 г.). «Смертность от коронавируса в Китае резко возрастает, поскольку страны пытаются эвакуировать граждан». Хранитель. В архиве из оригинала на 6 февраля 2020 г.. Получено 10 марта 2020.
  145. ^ Паулинус А (25 февраля 2020 г.). «Коронавирус: Китай отплатит Африке за охрану здоровья населения». Солнце. В архиве из оригинала 9 марта 2020 г.. Получено 10 марта 2020.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка

Классификация