PRKCI - PRKCI

PRKCI
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1VD2, 1WMH, 1ZRZ, 3A8W, 3A8X, 3Ж8
Идентификаторы
Псевдонимы	PRKCI, DXS1179E, PKCI, nPKC-йота, протеинкиназа С йота
Внешние идентификаторы	OMIM: 600539 MGI: 99260 ГомолоГен: 37667 Генные карты: PRKCI
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 3 (человек)[1] Группа 3q26.2 Начните 170,222,424 бп[1] Конец 170,305,977 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 3 (мышь)[2] Группа 3 A3 | 3 14,65 см Начните 30,995,747 бп[2] Конец 31,052,959 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • трансферазная активность • активность протеинкиназы • связывание нуклеотидов • активность протеинкиназы C • специфическое связывание белкового домена • связывание ионов металлов • киназная активность • активность протеин-серин / треонинкиназы • GO: 0001948 связывание с белками • связывание фосфолипидов • Связывание АТФ Сотовый компонент • цитозоль • эндосома • мембрана • двухклеточное плотное соединение • цитоскелет микротрубочек • Мембрана Гольджи • клеточная мембрана • апикальная часть клетки • Schmidt-Lanterman incisure • апикальная плазматическая мембрана • передний край ячейки • межклеточный мостик • внеклеточная экзосома • ядро клетки • цитоплазма • нуклеоплазма • макромолекулярный комплекс • Коллатераль Шаффера - синапс CA1 • глутаматергический синапс Биологический процесс • отрицательная регуляция апоптотического процесса нейронов • положительное регулирование импорта глюкозы • установление полярности апикальных / базальных клеток • GO: 0007243 внутриклеточная передача сигнала • ответ на интерлейкин-1 • фосфорилирование • Почкование пузырьков Гольджи • организация актиновых филаментов • нацеливание белка на мембрану • отрицательная регуляция процесса апоптоза глиальных клеток • ответ на пептидный гормон • отрицательная регуляция апоптотического процесса • секреция • фосфорилирование белков • локализация клеточного белка • положительная регуляция процесса апоптоза эндотелиальных клеток • положительная регуляция активности фактора транскрипции NF-kappaB • организация цитоскелета • установление или поддержание апикальной / базальной полярности эпителиальных клеток • сборка двухклеточного плотного спая • положительная регуляция развития проекции нейронов • клеточный ответ на стимул инсулина • развитие фоторецепторных клеток глаза • мембранная организация • положительная регуляция пролиферации глиальных клеток • миграция клеток • везикулярный транспорт • организация межклеточного перехода • фосфорилирование пептидил-серина • положительное регулирование локализации белка в плазматической мембране • положительная регуляция сигнального пути Notch • регуляция уровней постсинаптических мембранных рецепторов нейромедиаторов Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	5584	18759
Ансамбль	ENSG00000163558	ENSMUSG00000037643
UniProt	P41743	Q62074
RefSeq (мРНК)	NM_002740	NM_008857
RefSeq (белок)	NP_002731	NP_032883
Расположение (UCSC)	Chr 3: 170.22 - 170.31 Мб	Chr 3: 31 - 31,05 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Протеинкиназа C йотного типа является фермент что у людей кодируется PRKCI ген.^[5][6][7]

Функция

Этот ген кодирует член семейства протеинкиназ С (PKC) серин / треониновых протеинкиназ. Семейство PKC включает по меньшей мере восемь членов, которые по-разному экспрессируются и участвуют в большом количестве клеточных процессов. Эта протеинкиназа не зависит от кальция и фосфолипидов. Он не активируется форболовыми эфирами или диацилглицерином. Эта киназа может быть задействована в кластерах канальцев везикул (VTC) путем прямого взаимодействия с небольшой GTPase RAB2, где эта киназа фосфорилирует глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназу (GAPD / GAPDH) и играет роль в динамике микротрубочек в раннем секреторном пути. Обнаружено, что эта киназа необходима для BCL-ABL-опосредованной устойчивости к лекарственному апоптозу и, следовательно, защищает лейкозные клетки от лекарственного апоптоза. Псевдоген с одним экзоном картирован на хромосоме X.^[7]

Взаимодействия

PRKCI было показано взаимодействовать с участием:

• Центаврин, альфа 1,^[8]
• FRS2,^[9]
• Глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназа,^[10]
• PARD3,^[11][12]
• Фосфоинозитид-зависимая киназа-1,^[13]
• SMG1 (ген),^[14]
• Секвестосома 1,
• KRAS.^[15]
• Виментин ^[16]

^[17]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000163558 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000037643 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Mazzarella R, Ciccodicola A, Esposito T, Arcucci A, Migliaccio C, Jones C, Schlessinger D, D'Urso M, D'Esposito M (апрель 1995 г.). «Ген йота-протеинкиназы С человека (PRKCI) тесно связан с геном BTK в Xq21.3». Геномика. 26 (3): 629–31. Дои:10.1016 / 0888-7543 (95) 80190-В. PMID  7607695.
6. Де Донато М., Галлахер Д.С., Дэвис С.К., Стелли Д.М., Тейлор Дж. Ф. (апрель 2002 г.). «Отнесение PRKCI к хромосоме 1q34 -> q36 крупного рогатого скота с помощью FISH предполагает новое отнесение к хромосоме 3 человека». Цитогенетика и клеточная генетика. 95 (1–2): 79–81. Дои:10.1159/000057021. PMID  11978974. S2CID  40052490.
7. «Ген Entrez: протеинкиназа C PRKCI, йота».
8. Земликова Е., Дюбуа Т., Кераи П., Клоки С., Кроншоу А.Д., Уэйкфилд Р.И., Йоханнес Ф.Дж., Эйткен А. (август 2003 г.). «Центаурин-альфа (1) связывается с изоформами протеинкиназы C и фосфорилируется ими». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 307 (3): 459–65. Дои:10.1016 / s0006-291x (03) 01187-2. PMID  12893243.
9. Лим Ю.П., Лоу BC, Лим Дж., Вонг ES, Гай Г.Р. (июль 1999 г.). «Ассоциация изотипов атипичной протеинкиназы C с докерским белком FRS2 в передаче сигналов фактора роста фибробластов». Журнал биологической химии. 274 (27): 19025–34. Дои:10.1074 / jbc.274.27.19025. PMID  10383403.
10. Тисдейл EJ (февраль 2002 г.). «Глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназа фосфорилируется протеинкиназой Ciota / lambda и играет роль в динамике микротрубочек в раннем секреторном пути». Журнал биологической химии. 277 (5): 3334–41. Дои:10.1074 / jbc.M109744200. PMID  11724794.
11. Санчес П., Де Карсер Дж., Сандовал И.В., Москат Дж., Диас-Меко М.Т. (май 1998 г.). «Локализация изоформ атипичной протеинкиназы C в эндосомах, нацеленных на лизосомы, посредством взаимодействия с p62». Молекулярная и клеточная биология. 18 (5): 3069–80. Дои:10.1128 / mcb.18.5.3069. ЧВК  110686. PMID  9566925.
12. Кодзима М., Нода Й, Такея Р., Сайто Н., Такеучи К., Сумимото Х. (декабрь 2002 г.). «PAR3beta, новый гомолог белка клеточной полярности PAR3, локализуется в плотных контактах». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 299 (4): 641–6. Дои:10.1016 / s0006-291x (02) 02698-0. PMID  12459187.
13. Балендран А., Бионди Р.М., Чунг П.С., Касамайор А., Деак М., Алесси Д.Р. (июль 2000 г.). «Сайт стыковки 3-фосфоинозитид-зависимой протеинкиназы-1 (PDK1) необходим для фосфорилирования протеинкиназы Czeta (PKCzeta) и PKC-родственной киназы 2 с помощью PDK1». Журнал биологической химии. 275 (27): 20806–13. Дои:10.1074 / jbc.M000421200. PMID  10764742.
14. Diaz-Meco MT, Municio MM, Sanchez P, Lozano J, Moscat J (январь 1996 г.). «Лямбда-взаимодействующий белок, новый белок, который специфически взаимодействует с доменом« цинковые пальцы »атипичной протеинкиназы C изотипа лямбда / йота и стимулирует его киназную активность in vitro и in vivo». Молекулярная и клеточная биология. 16 (1): 105–14. Дои:10.1128 / mcb.16.1.105. ЧВК  230983. PMID  8524286.
15. Гуо В., Ву С., Лю Дж., Фанг Б. (сентябрь 2008 г.). «Идентификация небольшой молекулы с синтетической летальностью для K-ras и протеинкиназы C йота». Исследования рака. 68 (18): 7403–8. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-08-1449. ЧВК  2678915. PMID  18794128.
16. Ратнаяке WS, Апостолатос А.Х., Остров Д.А., Асеведо-Дункан М (2017). «Два новых атипичных ингибитора PKC; ACPD и DNDA эффективно уменьшают пролиферацию клеток и эпителиально-мезенхимальный переход метастатической меланомы, вызывая апоптоз». Int. Дж. Онкол. 51 (5): 1370–1382. Дои:10.3892 / ijo.2017.4131. ЧВК  5642393. PMID  29048609.
17. Ratnayake WS, Apostolatos CA, Apostolatos AH, Schutte RJ, Huynh MA, Ostrov DA, Acevedo-Duncan M (2018). «Онкогенный PKC-ι активирует виментин во время эпителиально-мезенхимального перехода при меланоме; исследование, основанное на ингибиторах, специфичных для PKC-ι и PKC-ζ». Сотовые клеи. Мигр. 0 (5): 1–17. Дои:10.1080/19336918.2018.1471323. ЧВК  6363030. PMID  29781749.

дальнейшее чтение

• Судзуки А., Акимото К., Оно С. (январь 2003 г.). «Протеинкиназа C лямбда / йота (PKClambda / йота): изотип PKC, необходимый для развития многоклеточных организмов». Журнал биохимии. 133 (1): 9–16. Дои:10.1093 / jb / mvg018. PMID  12761193.
• Fields AP, Regala RP (июнь 2007 г.). «Протеинкиназа С йота: человеческий онкоген, прогностический маркер и терапевтическая мишень». Фармакологические исследования. 55 (6): 487–97. Дои:10.1016 / j.phrs.2007.04.015. ЧВК  2705893. PMID  17570678.
• Ruegg CL, Strand M (октябрь 1991 г.). «Синтетический пептид с последовательностью, идентичной трансмембранному белку GP41 ВИЧ-1, ингибирует различные пути активации лимфоцитов, зависящие от протеинкиназы C и притока внутриклеточного кальция». Клеточная иммунология. 137 (1): 1–13. Дои:10.1016 / 0008-8749 (91) 90051-C. PMID  1832084.
• Чоудхури И. Х., Коянаги Й., Кобаяши С., Хамамото Ю., Йошияма Х., Йошида Т., Ямамото Н. (май 1990 г.). «ТРА сложного эфира форбола сильно ингибирует индуцированное ВИЧ-1 образование синцитий, но увеличивает производство вируса: возможное участие пути протеинкиназы C». Вирусология. 176 (1): 126–32. Дои:10.1016 / 0042-6822 (90) 90237-Л. PMID  1970444.
• Ruegg CL, Strand M (май 1990 г.). «Ингибирование протеинкиназы С и анти-CD3-индуцированного притока Са2 + в Т-клетки Jurkat синтетическим пептидом с последовательностью, идентичной gp41 ВИЧ-1». Журнал иммунологии. 144 (10): 3928–35. PMID  2139676.
• Якобовиц А., Розенталь А., Capon DJ (апрель 1990 г.). «Для трансактивации экспрессии генов, направленной на LTR ВИЧ-1, с помощью tat требуется протеинкиназа C». Журнал EMBO. 9 (4): 1165–70. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1990.tb08223.x. ЧВК  551792. PMID  2182321.
• Поля А.П., Беднарик Д.П., Хесс А., Мэй В.С. (май 1988 г.). «Вирус иммунодефицита человека индуцирует фосфорилирование рецептора на его клеточной поверхности». Природа. 333 (6170): 278–80. Дои:10.1038 / 333278a0. PMID  3259291. S2CID  4254146.
• Чирмуле Н., Гуневардена Х., Пахва С., Пасека Р., Кальянараман В.С., Пахва С. (август 1995 г.). «Гликопротеины оболочки ВИЧ-1 вызывают активацию активированного белка-1 в CD4 + Т-клетках». Журнал биологической химии. 270 (33): 19364–9. Дои:10.1074 / jbc.270.33.19364. PMID  7642615.
• Ward NE, Gravitt KR, O'Brian CA (январь 1995 г.). «Ингибирование протеинкиназы С синтетическим пептидом, соответствующим остаткам цитоплазматического домена 828-848 гликопротеина оболочки вируса иммунодефицита человека типа 1». Письма о раке. 88 (1): 37–40. Дои:10.1016 / 0304-3835 (94) 03610-У. PMID  7850771.
• Гупта С., Аггарвал С., Ким С., Голлапуди С. (март 1994). «Рекомбинантный gp120 вируса иммунодефицита человека-1 вызывает изменения изоферментов протеинкиназы C - предварительный отчет». Международный журнал иммунофармакологии. 16 (3): 197–204. Дои:10.1016/0192-0561(94)90013-2. PMID  8206685.
• Селби Л.А., Шмитц-Пайффер С., Шенг Й., Байден Т.Дж. (ноябрь 1993 г.). «Молекулярное клонирование и характеристика PKC iota, атипичной изоформы протеинкиназы C, полученной из клеток, секретирующих инсулин». Журнал биологической химии. 268 (32): 24296–302. PMID  8226978.
• Diaz-Meco MT, Municio MM, Sanchez P, Lozano J, Moscat J (январь 1996 г.). «Лямбда-взаимодействующий белок, новый белок, который специфически взаимодействует с доменом« цинковые пальцы »атипичной протеинкиназы C изотипа лямбда / йота и стимулирует его киназную активность in vitro и in vivo». Молекулярная и клеточная биология. 16 (1): 105–14. Дои:10.1128 / MCB.16.1.105. ЧВК  230983. PMID  8524286.
• Parada NA, Cruikshank WW, Danis HL, Ryan TC, Center DM (февраль 1996 г.). «Миграция, индуцированная IL-16 и другими CD4-лигандами, зависит от протеинкиназы C». Клеточная иммунология. 168 (1): 100–6. Дои:10.1006 / cimm.1996.0054. PMID  8599832.
• Конант К., Ма М., Нат А., майор Е. О. (март 1996 г.). «Белок Tat внеклеточного вируса иммунодефицита человека типа 1 связан с увеличением как связывания NF-каппа B, так и активности протеинкиназы C в первичных астроцитах человека». Журнал вирусологии. 70 (3): 1384–9. Дои:10.1128 / JVI.70.3.1384-1389.1996. ЧВК  189957. PMID  8627654.
• Díaz-Meco MT, Municio MM, Frutos S, Sanchez P, Lozano J, Sanz L, Moscat J (сентябрь 1996 г.). «Продукт гена par-4, индуцированного во время апоптоза, избирательно взаимодействует с атипичными изоформами протеинкиназы C». Ячейка. 86 (5): 777–86. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80152-X. PMID  8797824. S2CID  15675524.
• Холмс AM (ноябрь 1996 г.). «Фосфорилирование in vitro белка Tat вируса иммунодефицита человека 1 типа протеинкиназой C: данные о фосфорилировании аминокислотного остатка серин-46». Архивы биохимии и биофизики. 335 (1): 8–12. Дои:10.1006 / abbi.1996.0476. PMID  8914829.
• Мюррей Н.Р., Филдс А.П. (октябрь 1997 г.). «Атипичная протеинкиназа С йота защищает клетки лейкемии человека от апоптоза, вызванного лекарствами». Журнал биологической химии. 272 (44): 27521–4. Дои:10.1074 / jbc.272.44.27521. PMID  9346882.
• Боргатти П., Заули Г., Cantley LC, Capitani S (январь 1998 г.). «Внеклеточный белок Tat ВИЧ-1 индуцирует быструю и селективную активацию протеинкиназы C (PKC) -альфа, а также изоформ -эпсилон и -зета в клетках PC12». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 242 (2): 332–7. Дои:10.1006 / bbrc.1997.7877. PMID  9446795.
• Санчес П., Де Карсер Дж., Сандовал И.В., Москат Дж., Диас-Меко М.Т. (май 1998 г.). «Локализация изоформ атипичной протеинкиназы C в эндосомах, нацеленных на лизосомы, посредством взаимодействия с p62». Молекулярная и клеточная биология. 18 (5): 3069–80. Дои:10.1128 / mcb.18.5.3069. ЧВК  110686. PMID  9566925.