CDK12 - CDK12

CDK12
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4CXA, 4NST, 4UN0, 5ACB
Идентификаторы
Псевдонимы	CDK12, CRK7, CRKR, CRKRS, циклин-зависимая киназа 12, циклин-зависимая киназа 12
Внешние идентификаторы	OMIM: 615514 MGI: 1098802 ГомолоГен: 128632 Генные карты: CDK12
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 17 (человек)[1] Группа 17q12 Начинать 39,461,486 бп[1] Конец 39,564,907 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 D | 11 61,75 см Начинать 98,203,059 бп[2] Конец 98,278,504 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • трансферазная активность • активность протеинкиназы • связывание нуклеотидов • киназная активность • активность протеин-серин / треонинкиназы • GO: 0001948 связывание с белками • Активность киназы карбоксиконцевого домена РНК-полимеразы II • Связывание АТФ • связывание циклина • активность циклин-зависимой протеин-серин / треонинкиназы • связывание фактора транскрипции • связывание протеинкиназы Сотовый компонент • ядерное пятнышко • холоферментный комплекс ядерной циклин-зависимой протеинкиназы • комплекс циклина K-CDK12 • ядро клетки • нуклеоплазма • фибриллярный центр • хромосома • циклин / CDK положительный комплекс фактора элонгации транскрипции • холоферментный комплекс циклинзависимой протеинкиназы • ядерный хроматин Биологический процесс • фосфорилирование С-концевого домена РНК-полимеразы II • фосфорилирование • обработка мРНК • регуляция клеточного цикла • фосфорилирование белков • регуляция сплайсинга РНК • Сплайсинг РНК • аутофосфорилирование • регуляция активности киназы MAP • элонгация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • отрицательная регуляция дифференцировки стволовых клеток • положительная регуляция элонгации транскрипции с промотора РНК-полимеразы II Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	51755	69131
Ансамбль	ENSG00000167258	ENSMUSG00000003119
UniProt	Q9NYV4	Q14AX6
RefSeq (мРНК)	NM_015083 NM_016507	NM_001109626 NM_001109628 NM_026952
RefSeq (белок)	NP_055898 NP_057591	NP_001103096 NP_001103098 NP_081228
Расположение (UCSC)	Chr 17: 39.46 - 39.56 Мб	Chr 11: 98,2 - 98,28 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

CDK12 циклин-зависимая киназа 12 это протеинкиназа что у людей кодируется CDK12 ген.^[5][6][7] Этот фермент является членом циклин-зависимая киназа семейство белков.

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000167258 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000003119 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Нагасе Т., Исикава К., Суяма М., Кикуно Р., Хиросава М., Миядзима Н., Танака А., Котани Н., Номура Н., Охара О. (май 1999 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК Res. 5 (6): 355–64. Дои:10.1093 / днарес / 5.6.355. PMID  10048485.
6. Ко Т.К., Келли Е., Пайнс Дж. (Октябрь 2001 г.). «CrkRS: новая консервативная протеинкиназа, связанная с Cdc2, которая колокализируется со спеклами SC35». J Cell Sci. 114 (Pt 14): 2591–603. PMID  11683387.
7. «Ген Entrez: циклинзависимая киназа 12 CDK12».

внешняя ссылка

• Человек CDK12 расположение генома и CDK12 страница сведений о гене в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Накадзима Д., Окадзаки Н., Ямакава Н. и др. (2003). «Конструирование готовых к экспрессии клонов кДНК для генов KIAA: ручное культивирование 330 клонов кДНК KIAA». ДНК Res. 9 (3): 99–106. Дои:10.1093 / днарес / 9.3.99. PMID  12168954.
• Виссинг Дж., Янш Л., Нимц М. и др. (2007). «Протеомный анализ протеинкиназ с помощью селективного по целевым классам префракционирования и тандемной масс-спектрометрии» (PDF). Мол. Клетка. Протеомика. 6 (3): 537–47. Дои:10.1074 / mcp.T600062-MCP200. PMID  17192257. S2CID  40974821.
• Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.
• Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А. и др. (2006). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Nat. Биотехнология. 24 (10): 1285–92. Дои:10.1038 / nbt1240. PMID  16964243. S2CID  14294292.
• Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (33): 12130–5. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Колланд Ф., Жак Х, Троплин В. и др. (2004). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека». Genome Res. 14 (7): 1324–32. Дои:10.1101 / гр. 2334104. ЧВК  442148. PMID  15231748.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.