Основной фактор роста фибробластов - Basic fibroblast growth factor

FGF2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1BAS, 1BFB, 1BFC, 1BFF, 1BFG, 1BLA, 1BLD, 1CVS, 1EV2, 1FGA, 1FQ9, 1II4, 1IIL, 2BFH, 2FGF, 2М49, 4FGF, 4OEE, 4OEF, 4OEG
Идентификаторы
Псевдонимы	FGF2, BFGF, FGF-2, FGFB, HBGF-2, фактор роста фибробластов 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 134920 MGI: 95516 ГомолоГен: 1521 Генные карты: FGF2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 4 (человек)[1] Группа 4q28.1 Начните 122,826,708 бп[1] Конец 122,898,236 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 3 (мышь)[2] Группа 3 B | 3 18,41 см Начните 37,348,346 бп[2] Конец 37,410,108 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • цитокиновая активность • связывание гепарина • связывание рецептора фактора роста фибробластов • GO: 0001948 связывание с белками • коактиватор транскрипции лиганд-зависимого ядерного рецептора • хемоаттрактантная активность • активность фактора роста • активность протеинтирозинкиназы • Активность фактора обмена Ras-гуанил-нуклеотидов • активность фосфатидилинозитол-4,5-бисфосфат-3-киназы • 1-фосфатидилинозитол-3-киназная активность • рецептор-рецепторное взаимодействие • связывание интегрина Сотовый компонент • внеклеточная область • ядро клетки • внеклеточный Биологический процесс • высвобождение секвестрированного иона кальция в цитозоль • дифференциация клеток • отрицательная регуляция миграции фибробластов • катаболический процесс гиалуроновой кислоты • положительная регуляция пролиферации эндотелиальных клеток • положительная регуляция активности киназы MAP • отрицательная регуляция миграции эндотелиальных клеток кровеносных сосудов • положительное регулирование хемотаксиса эндотелиальных клеток к фактору роста фибробластов • поддержание популяции соматических стволовых клеток • положительная регуляция активности фосфолипазы C • организация внеклеточного матрикса • лечение раны • отрицательная регуляция гибели клеток • регуляция ангиогенеза • развитие нервной системы • миграция клеток, участвующая в прорастании ангиогенеза • Каскад MAPK • положительная регуляция ангиогенеза • положительная регуляция активности фосфатидилинозитол-3-киназы • положительная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • хемотаксис • сигнальный путь рецептора фактора роста фибробластов • дифференцировка хондробластов • развитие многоклеточного организма • зависимая от фактора роста регуляция пролиферации клеток-сателлитов скелетных мышц • ветвление участвует в морфогенезе зачатка мочеточника • положительное регулирование пролиферации клеток сердечной мышцы • активация активности MAPK • эмбриональный морфогенез • ангиогенез • положительная регуляция спецификации клеточной судьбы • морфогенез органов животных • регуляция хемотаксиса эндотелиальных клеток к фактору роста фибробластов • процесс биосинтеза фосфатидилинозита • процесс биосинтеза инозитолфосфата • отрицательная регуляция заживления ран • Передача сигнала белка Ras • положительная регуляция деления клеток • преобразование сигнала • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • положительный хемотаксис • фосфатидилинозитол фосфорилирование • фосфорилирование пептидилтирозина • положительная регуляция прорастающего ангиогенеза • положительное регулирование пролиферации клеток • процесс биосинтеза фосфатидилинозитол-3-фосфата • пролиферация стволовых клеток • регуляция рецепторной активности • положительная регуляция передачи сигналов протеинкиназы B • цитокин-опосредованный сигнальный путь • положительное регулирование миграции эндотелиальных клеток кровеносных сосудов • положительная регуляция каскада ERK1 и ERK2 • положительное регулирование пролиферации клеток гладких мышц сосудов • положительное регулирование пролиферации эндотелиальных клеток сосудов • положительное регулирование миграции клеток, участвующих в прорастании ангиогенеза • паракринная передача сигналов • положительная регуляция процесса биосинтеза ДНК • положительная регуляция хемотаксиса эндотелиальных клеток Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	2247	14173
Ансамбль	ENSG00000138685	ENSMUSG00000037225
UniProt	P09038	P15655
RefSeq (мРНК)	NM_002006 NM_001361665	NM_008006
RefSeq (белок)	NP_001997 NP_001348594	NP_032032
Расположение (UCSC)	Chr 4: 122,83 - 122,9 Мб	Chr 3: 37,35 - 37,41 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

FGF2, также известный как основной фактор роста фибробластов (bFGF) и FGF-β, это фактор роста и сигнальный белок закодировано FGF2 ген.^[5][6] Он синтезируется в основном как полипептид из 155 аминокислот, в результате чего получается белок 18 кДа. Однако существует четыре альтернативных стартовых кодона, которые обеспечивают N-концевые удлинения из 41, 46, 55 или 133 аминокислот, что приводит к образованию белков 22 кДа (всего 196 аминокислот), 22,5 кДа (всего 201 аминокислот), 24 кДа (210 аминокислот). всего) и 34 кДа (всего 288 аминокислот) соответственно.^[7] Как правило, низкомолекулярная (НММ) форма 155 а.о. / 18 кДа считается цитоплазматической и может секретироваться из клетки, тогда как высокомолекулярные (ВММ) формы направляются в ядро ​​клетки.^[8]

Фактор роста фибробластов белок был впервые очищен в 1975 году, но вскоре после этого другие с использованием других условий выделили основной FGF, гепарин-связывающий фактор роста-2 и фактор роста эндотелиальных клеток-2. Секвенирование генов показало, что эта группа фактически является одним и тем же белком FGF2 и является членом семья FGF белки.^[7][9] FGF2 связывается и оказывает эффекты через специфические рецептор фактора роста фибробластов (FGFR) белки, которые сами по себе составляют семейство близкородственных молекул.

Функция

Как и другие члены семейства FGF, основной фактор роста фибробластов обладает широким митогенный и активности клеток, и участвует во множестве биологических процессов, включая эмбриональное развитие, рост клеток, морфогенез, восстановление тканей, рост опухоли и инвазия.

В нормальной ткани bFGF присутствует в подвальные мембраны и в субэндотелиальный внеклеточный матрикс из кровеносный сосуд. Это остается мембрана -связан до тех пор, пока нет сигнальный пептид.

Было высказано предположение, что во время обоих лечение раны нормальных тканей и опухоль развитие, действие гепарансульфат -унижение ферменты активирует bFGF, тем самым опосредуя образование новых кровеносный сосуд, процесс, известный как ангиогенез.

Кроме того, он синтезируется и секретируется человеком. адипоциты а концентрация FGF2 коррелирует с ИМТ в образцах крови. Также было показано, что он действует на преостеобласты - в виде увеличенного распространение - после привязки к рецептор фактора роста фибробластов 1 и активация фосфоинозитид-3-киназа.^[10]

В предварительных исследованиях на животных было показано, что FGF2 защищает сердце от травм, связанных с сердечным приступом, снижает гибель тканей и способствует улучшению функции после реперфузия.^[11]

Последние данные показали, что низкие уровни FGF2 играют ключевую роль в возникновении чрезмерной тревоги.^[12]

Кроме того, FGF2 является критическим компонентом человеческого эмбриональная стволовая клетка питательная среда; фактор роста необходим для того, чтобы клетки оставались в недифференцированном состоянии, хотя механизмы, с помощью которых это происходит, плохо определены. Было продемонстрировано, что он вызывает гремлин экспрессия, которая, в свою очередь, как известно, ингибирует индукцию дифференцировки посредством костные морфогенетические белки.^[13] Это необходимо в системах культивирования, зависимых от клеток, питающихся мышью, а также в системах культивирования, не содержащих сыворотки.^[14] FGF2 в сочетании с BMP4, способствуют дифференцировке стволовых клеток в мезодермальные линии. После дифференцировки клетки, обработанные BMP4 и FGF2, обычно производят большее количество остеогенный и хондрогенный дифференцировка, чем необработанные стволовые клетки.^[15] Однако низкая концентрация bFGF (10 нг / мл) может оказывать ингибирующее действие на остеобласт дифференциация.^[16] Ядерная форма FGF2 участвует в экспорте мРНК^[17]

Взаимодействия

Было показано, что основной фактор роста фибробластов взаимодействовать с казеинкиназа 2, альфа 1,^[18] RPL6,^[19] рибосомальный белок S19^[20] и API5.^[17]

Смотрите также

• Ангиогенез
• Тревожные расстройства
• Цитокин
• Фактор роста фибробластов
• Фактор роста
• Протеазы в ангиогенезе
• Рецептор (биохимия)
• Передача сигнала

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000138685 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000037225 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Dionne CA, Crumley G, Bellot F, Kaplow JM, Searfoss G, Ruta M, Burgess WH, Jaye M, Schlessinger J (сентябрь 1990 г.). «Клонирование и экспрессия двух различных высокоаффинных рецепторов, перекрестно реагирующих с кислотными и основными факторами роста фибробластов». Журнал EMBO. 9 (9): 2685–92. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1990.tb07454.x. ЧВК  551973. PMID  1697263.
6. Ким HS (1998). «Отнесение1 гена основного фактора роста фибробластов человека FGF2 к полосе q26 хромосомы 4 с помощью радиационного гибридного картирования». Цитогенетика и клеточная генетика. 83 (1–2): 73. Дои:10.1159/000015129. PMID  9925931. S2CID  33214466.
7. Флоркевич Р.З., Шибата Ф., Баранкевич Т., Бэрд А., Гонсалес А.М., Флоркевич Э., Шах Н. (декабрь 1991 г.). «Экспрессия гена основного фактора роста фибробластов». Летопись Нью-Йоркской академии наук. 638 (1): 109–26. Дои:10.1111 / j.1749-6632.1991.tb49022.x. PMID  1785797. S2CID  45425517.
8. Коулман С.Дж., Брюс К., Чиони А.М., Кочер Х.М., Гроуз Р.П. (август 2014 г.). «Тонкости передачи сигналов рецептора фактора роста фибробластов». Клиническая наука. 127 (4): 217–31. Дои:10.1042 / CS20140100. PMID  24780002.
9. Берджесс WH, Maciag T (1989). «Семейство белков гепарин-связывающего (фибробластного) фактора роста». Ежегодный обзор биохимии. 58: 575–606. Дои:10.1146 / annurev.bi.58.070189.003043. PMID  2549857.
10. Kühn MC, Willenberg HS, Schott M, Papewalis C, Stumpf U, Flohé S, Scherbaum WA, Schinner S (февраль 2012 г.). «Факторы, секретируемые адипоцитами, увеличивают пролиферацию остеобластов и соотношение OPG / RANKL, влияя на образование остеокластов». Молекулярная и клеточная эндокринология. 349 (2): 180–8. Дои:10.1016 / j.mce.2011.10.018. PMID  22040599. S2CID  2305986.
11. House SL, Bolte C, Zhou M, Doetschman T, Klevitsky R, Newman G, Schultz Jel J (декабрь 2003 г.). «Специфическая для сердца сверхэкспрессия фактора роста фибробластов-2 защищает от дисфункции миокарда и инфаркта на мышиной модели ишемии с низким потоком». Тираж. 108 (25): 3140–8. Дои:10.1161 / 01.CIR.0000105723.91637.1C. PMID  14656920. S2CID  14251918.
12. Перес Дж. А., Клинтон С. М., Тернер Калифорния, Уотсон С. Дж., Акил Х. (май 2009 г.). «Новая роль FGF2 как эндогенного ингибитора тревоги». Журнал неврологии. 29 (19): 6379–87. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.4829-08.2009. ЧВК  2748795. PMID  19439615.
13. Перейра Р.К., Экономидес А.Н., Каналис Э. (декабрь 2000 г.). «Костные морфогенетические белки индуцируют гремлин, белок, ограничивающий их активность в остеобластах». Эндокринология. 141 (12): 4558–63. Дои:10.1210 / en.141.12.4558. PMID  11108268. Архивировано из оригинал на 2012-07-11.
14. Лю И, Сун З, Чжао И, Цинь Х, Цай Дж, Чжан Х, Ю Т, Цзян С., Ван Г, Дин М, Дэн Х (июль 2006 г.). «Новая среда определенного химического состава с добавками bFGF и N2B27 поддерживает недифференцированный рост эмбриональных стволовых клеток человека». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 346 (1): 131–9. Дои:10.1016 / j.bbrc.2006.05.086. PMID  16753134.
15. Ли TJ, Jang J, Kang S, Jin M, Shin H, Kim DW, Kim BS (январь 2013 г.). «Усиление остеогенной и хондрогенной дифференцировки человеческих эмбриональных стволовых клеток путем индукции мезодермального клона с обработкой BMP-4 и FGF2». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 430 (2): 793–7. Дои:10.1016 / j.bbrc.2012.11.067. PMID  23206696.
16. Дель Анхель-Москеда C, Гутьеррес-Пуэнте Y, Лопес-Лосано AP, Ромеро-Завалета RE, Мендиола-Хименес A, Медина-де-ла-Гарса CE, Маркес-M M, Де ла Гарса-Рамос MA (сентябрь 2015 г.). «Эпидермальный фактор роста усиливает остеогенную дифференциацию стволовых клеток пульпы зуба in vitro». Медицина головы и лица. 11: 29. Дои:10.1186 / s13005-015-0086-5. ЧВК  4558932. PMID  26334535.
17. Bong SM, Bae SH, Song B, Gwak H, Yang SW, Kim S, Nam S, Rajalingam K, Oh SJ, Kim TW, Park S, Jang H, Lee BI (июнь 2020 г.). «Регулирование экспорта мРНК посредством взаимодействия API5 и ядерного FGF2». Исследования нуклеиновых кислот. 48 (11): 6340–6352. Дои:10.1093 / нар / gkaa335. ЧВК  7293033. PMID  32383752.
18. Skjerpen CS, Nilsen T, Wesche J, Olsnes S (август 2002 г.). «Связывание вариантов FGF-1 с протеинкиназой CK2 коррелирует с митогенностью». Журнал EMBO. 21 (15): 4058–69. Дои:10.1093 / emboj / cdf402. ЧВК  126148. PMID  12145206.
19. Шен Б., Арезе М., Гуаландрис А., Рифкин Д. Б. (ноябрь 1998 г.). «Внутриклеточная ассоциация FGF-2 с рибосомным белком L6 / TAXREB107». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 252 (2): 524–8. Дои:10.1006 / bbrc.1998.9677. PMID  9826564.
20. Сулет Ф, Аль Саати Т., Рога С., Амальрик Ф., Буш Г. (ноябрь 2001 г.). «Фактор роста фибробластов-2 взаимодействует со свободным рибосомным белком S19». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 289 (2): 591–6. Дои:10.1006 / bbrc.2001.5960. PMID  11716516.

дальнейшее чтение

• Орниц Д.М., Ито Н. (2001). «Факторы роста фибробластов». Геномная биология. 2 (3): ОБЗОРЫ 3005. Дои:10.1186 / gb-2001-2-3-reviews3005. ЧВК  138918. PMID  11276432.
• Орпана А., Сальвен П. (февраль 2002 г.). «Ангиогенные и лимфангиогенные молекулы при гематологических злокачественных новообразованиях». Лейкемия и лимфома. 43 (2): 219–24. Дои:10.1080/10428190290005964. PMID  11999550. S2CID  21908151.
• Мари PJ, Debiais F, Ha E (2003). «Регулирование фенотипа краниальных остеобластов человека с помощью передачи сигналов FGF-2, FGFR-2 и BMP-2». Гистология и гистопатология. 17 (3): 877–85. Дои:10.14670 / HH-17.877. PMID  12168799.
• Чжао XC, Чжан Л.М., Тонг Д.Й., Ан П, Цзян Ц., Чжао П, Чен В.М., Ван Дж. (Март 2013 г.). «Пропофол увеличивает экспрессию основного фактора роста фибробластов после преходящей церебральной ишемии у крыс». Нейрохимические исследования. 38 (3): 530–7. Дои:10.1007 / s11064-012-0945-4. ЧВК  3574197. PMID  23247820.
• Винсент Т., Саклатвала Дж. (Июнь 2006 г.). «Основной фактор роста фибробластов: внеклеточный механотрансдуктор в суставном хряще?». Сделки Биохимического Общества. 34 (Pt 3): 456–7. Дои:10.1042 / BST0340456. PMID  16709186.
• Рибатти Д., Вакка А., Руснати М., Преста М. (2007). «Открытие основного фактора роста фибробластов / фактора роста фибробластов-2 и его роли в гематологических злокачественных новообразованиях». Отзывы о цитокинах и факторах роста. 18 (3–4): 327–34. Дои:10.1016 / j.cytogfr.2007.04.011. PMID  17537668.
• Уотсон Р., Энтони Ф., Пикетт М., Лэмбден П., Массон Г.М., Томас Э.Д. (сентябрь 1992 г.). «Обратная транскрипция с вложенной полимеразной цепной реакцией показывает экспрессию основных транскриптов фактора роста фибробластов в гранулезных и кумулюсных клетках человека от пациентов с оплодотворением in vitro». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 187 (3): 1227–31. Дои:10.1016 / 0006-291X (92) 90434-М. PMID  1417798.
• Чжу X, Комия Х, Чирино А., Фахам С., Фокс GM, Аракава Т., Сюй Б.Т., Рис, округ Колумбия (январь 1991 г.). «Трехмерные структуры кислых и основных факторов роста фибробластов». Наука. 251 (4989): 90–3. Дои:10.1126 / science.1702556. PMID  1702556.
• Эрикссон А.Е., Кузенс Л.С., Уивер Л.Х., Мэтьюз Б.В. (апрель 1991 г.). «Трехмерная структура основного фактора роста фибробластов человека». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 88 (8): 3441–5. Дои:10.1073 / pnas.88.8.3441. ЧВК  51463. PMID  1707542.
• Аго Х, Китагава Й, Фудзисима А, Мацуура Й, Кацубе Y (сентябрь 1991 г.). «Кристаллическая структура основного фактора роста фибробластов при разрешении 1,6 А». Журнал биохимии. 110 (3): 360–3. Дои:10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a123586. PMID  1769963.
• Чжан Д.Д., Кузенс Л.С., Барр П.Дж., Спранг С.Р. (апрель 1991 г.). «Трехмерная структура основного фактора роста фибробластов человека, структурного гомолога интерлейкина 1 бета». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 88 (8): 3446–50. Дои:10.1073 / pnas.88.8.3446. ЧВК  51464. PMID  1849658.
• Ву Д. К., Кан М. К., Сато Г. Х., Окамото Т., Сато Д. Д. (сентябрь 1991 г.). «Характеристика и молекулярное клонирование предполагаемого связывающего белка для факторов роста, связывающих гепарин». Журнал биологической химии. 266 (25): 16778–85. PMID  1885605.
• Фукусима Ю., Байерс М.Г., Фиддес Дж. К., Шоу ТБ (1991). «Ген основного фактора роста фибробластов человека (FGFB) относится к хромосоме 4q25». Цитогенетика и клеточная генетика. 54 (3–4): 159–60. Дои:10.1159/000132983. PMID  2265560.
• Лафаге-Почиталофф М., Галланд Ф, Симонетти Дж, Пратс Х, Маттей М.Г., Бирнбаум Д. (1990). «Ген основного фактора роста фибробластов человека расположен на длинном плече хромосомы 4 на полосах q26-q27». Онкогенные исследования. 5 (3): 241–4. PMID  2320377.
• Story MT, Esch F, Shimasaki S, Sasse J, Jacobs SC, Lawson RK (февраль 1987 г.). «Амино-терминальная последовательность большой формы основного фактора роста фибробластов, выделенного из доброкачественной гиперпластической ткани предстательной железы человека». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 142 (3): 702–9. Дои:10.1016 / 0006-291X (87) 91471-9. PMID  2435284.
• Курокава Т., Сасада Р., Иване М., Игараси К. (март 1987 г.). «Клонирование и экспрессия кДНК, кодирующей основной фактор роста фибробластов человека». Письма FEBS. 213 (1): 189–94. Дои:10.1016/0014-5793(87)81489-8. PMID  2435575. S2CID  28111330.
• Prats H, Kaghad M, Prats AC, Klagsbrun M, Lélias JM, Liauzun P, Chalon P, Tauber JP, Amalric F, Smith JA (март 1989 г.). «Высокомолекулярные формы основного фактора роста фибробластов инициируются альтернативными кодонами CUG». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 86 (6): 1836–40. Дои:10.1073 / pnas.86.6.1836. ЧВК  286799. PMID  2538817.
• Florkiewicz RZ, Sommer A (июнь 1989 г.). «Ген основного фактора роста фибробластов человека кодирует четыре полипептида: три инициируют трансляцию с кодонов, не относящихся к AUG». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 86 (11): 3978–81. Дои:10.1073 / pnas.86.11.3978. ЧВК  287371. PMID  2726761.
• Абрахам Дж. А., Ван Дж. Л., Тумоло А., Мергия А., Фиддес Дж. К. (1987). «Основной фактор роста фибробластов человека: нуклеотидная последовательность, геномная организация и экспрессия в клетках млекопитающих». Симпозиумы Колд-Спринг-Харбор по количественной биологии. 51, Пет. 1: 657–68. Дои:10.1101 / sqb.1986.051.01.078. PMID  3472745.
• Соммер А., Брюер М. Т., Томпсон Р. К., Москателли Д., Преста М., Рифкин Д. Б. (апрель 1987 г.). «Форма человеческого основного фактора роста фибробластов с удлиненным аминоконцом». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 144 (2): 543–50. Дои:10.1016 / S0006-291X (87) 80001-3. PMID  3579930.

внешняя ссылка

• Базовый + Фибробласт + Рост + Фактор в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
• Человек FGF2 расположение генома и FGF2 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.