CSPG5 - CSPG5

CSPG5
Идентификаторы
Псевдонимы	CSPG5, NGC, хондроитинсульфат протеогликан 5
Внешние идентификаторы	OMIM: 606775 MGI: 1352747 ГомолоГен: 4795 Генные карты: CSPG5
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 3 (человек)[1] Группа 3п21.31 Начинать 47,562,238 бп[1] Конец 47,580,792 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 9 (мышь)[2] Группа 9 | 9 F2 Начинать 110,243,783 бп[2] Конец 110,262,576 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • активность фактора роста Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • аппарат Гольджи • мембрана эндоплазматического ретикулума • мембрана • Мембрана Гольджи • клеточная мембрана • неотъемлемый компонент плазматической мембраны • внеклеточная область • поверхность клетки • просвет лизосомы • эндоплазматический ретикулум • Просвет Гольджи • Гольджи-ассоциированная везикулярная мембрана • глутаматергический синапс • ГАМК-ергический синапс • неотъемлемый компонент постсинаптической мембраны Биологический процесс • дифференциация клеток • процесс биосинтеза хондроитинсульфата • модуляция химической синаптической передачи • внутриклеточный транспорт • развитие нервной системы • развитие многоклеточного организма • катаболический процесс хондроитинсульфата • регулирование роста • процесс биосинтеза дерматансульфата • регуляция рецепторной активности • транссинаптическая передача сигналов, модуляция синаптической передачи • регуляция экзоцитоза синаптических везикул • организация цитоскелета • удлинение проекции глиальных клеток • положительная регуляция распространения клеток, зависящих от адгезии субстрата • преобразование сигнала Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	10675	29873
Ансамбль	ENSG00000114646	ENSMUSG00000032482
UniProt	O95196	Q71M36
RefSeq (мРНК)	NM_006574 NM_001206942 NM_001206943 NM_001206944 NM_001206945	NM_001166273 NM_013884
RefSeq (белок)	NP_001193871 NP_001193872 NP_001193873 NP_001193874 NP_006565	NP_001159745 NP_038912
Расположение (UCSC)	Chr 3: 47,56 - 47,58 Мб	Chr 9: 110,24 - 110,26 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Хондроитинсульфат протеогликан 5 это белок что у людей кодируется CSPG5 ген.^[5][6]

Взаимодействия

CSPG5 был показан взаимодействовать с GOPC.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000114646 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032482 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Ясуда Й., Токита Й., Аоно С., Мацуи Ф., Оно Т., Сонта С., Ватанабе Е., Наканиши И., Охира А. (май 1999 г.). «Клонирование и хромосомное картирование человеческого гена нейрогликана C (NGC), нейрального трансмембранного хондроитинсульфатного протеогликана с модулем EGF». Neurosci Res. 32 (4): 313–22. Дои:10.1016 / S0168-0102 (98) 00098-4. PMID  9950058. S2CID  39609929.
6. «Ген Entrez: CSPG5 хондроитинсульфат протеогликан 5 (нейрогликан C)».
7. Хассель, Буркхард; Шрефф Матиас; Стубе Ева-Мария; Блайх Ута; Шумахер Стефан (октябрь 2003 г.). «CALEB / NGC взаимодействует с ассоциированным с Гольджи белком PIST». J. Biol. Chem. Соединенные Штаты. 278 (41): 40136–43. Дои:10.1074 / jbc.M305577200. ISSN  0021-9258. PMID  12885772.

дальнейшее чтение

• Итихара-Танака К., Охира А., Рамсби М., Мурамацу Т. (2006). «Нейрогликан С представляет собой новый рецептор мидкина, участвующий в удлинении процесса олигодендроглиальных клеток-предшественников». J. Biol. Chem. 281 (41): 30857–64. Дои:10.1074 / jbc.M602228200. PMID  16901907.
• Аоно С., Токита Ю., Ясуда Ю. и др. (2006). «Экспрессия и идентификация нового варианта сплайсинга нейрогликана С, трансмембранного хондроитинсульфат протеогликана, в мозге человека». J. Neurosci. Res. 83 (1): 110–8. Дои:10.1002 / jnr.20698. PMID  16299773. S2CID  45306074.
• Кинугаса Й., Исигуро Х., Токита Й. и др. (2004). «Нейрогликан С, новый член семейства нейрегулинов». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 321 (4): 1045–9. Дои:10.1016 / j.bbrc.2004.07.066. PMID  15358134.
• Хассель Б., Шрефф М., Штубе Е.М. и др. (2003). «CALEB / NGC взаимодействует с ассоциированным с Гольджи белком PIST». J. Biol. Chem. 278 (41): 40136–43. Дои:10.1074 / jbc.M305577200. PMID  12885772.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Genome Res. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Genome Res. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.

внешняя ссылка

• Человек CSPG5 расположение генома и CSPG5 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.