Brevican - Brevican

BCAN
Идентификаторы
Псевдонимы	BCAN, BEHAB, CSPG7, Brevican
Внешние идентификаторы	OMIM: 600347 MGI: 1096385 ГомолоГен: 7244 Генные карты: BCAN
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1q23.1 Начните 156,641,390 бп[1] Конец 156,659,532 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 3 (мышь)[2] Группа 3 F1 | 3 38,78 см Начните 87,987,531 бп[2] Конец 88,000,230 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание гиалуроновой кислоты • связывание углеводов • структурная составляющая внеклеточного матрикса Сотовый компонент • мембрана • внеклеточная область • просвет лизосомы • Просвет Гольджи • закрепленный компонент мембраны • внеклеточный матрикс • глутаматергический синапс Биологический процесс • развитие костной системы • процесс биосинтеза хондроитинсульфата • организация внеклеточного матрикса • развитие центральной нервной системы • катаболический процесс хондроитинсульфата • процесс биосинтеза дерматансульфата • развитие гиппокампа • клеточная адгезия • созревание синапсов Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	63827	12032
Ансамбль	ENSG00000132692	ENSMUSG00000004892
UniProt	Q96GW7	Q61361
RefSeq (мРНК)	NM_021948 NM_198427	NM_001109758 NM_007529
RefSeq (белок)	NP_068767 NP_940819	NP_001103228 NP_031555
Расположение (UCSC)	Chr 1: 156.64 - 156.66 Мб	Chr 3: 87.99 - 88 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Основной белок Brevican это белок что у людей кодируется BCAN ген.^[5][6][7] Brevican является членом лектикан семейство белков.

Бревикан локализуется на поверхности нейроны в мозг.^[8] В меланоцитарных клетках экспрессия гена BCAN может регулироваться MITF.^[9]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000132692 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000004892 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Гэри С.К., Церилло, Калифорния, Чианг В.Л., Гоу Дж. Ю, Грей Г., Хокфилд С. «Клонирование кДНК, хромосомная локализация и анализ экспрессии человеческого BEHAB / brevican, протеогликана мозга, регулируемого во время кортикального развития и в глиоме». Ген. 256 (1–2): 139–47. Дои:10.1016 / S0378-1119 (00) 00362-0. PMID  11054543.
6. Номото Х., Оохаши Т., Хиракава С., Уэки Й., Оцуки Х., Ниномия Й. (февраль 2002 г.). «Человеческие гены BRAL1 и BCAN, которые принадлежат суперсемейству линк-модулей, тандемно расположены на хромосоме 1q21-23». Acta Medica Okayama. 56 (1): 25–9. PMID  11873941.
7. "Entrez Gene: BCAN brevican".
8. Фришкнехт Р., Зайденбехер С.И. (июль 2012 г.). «Brevican: ключевой протеогликан в перисинаптическом внеклеточном матриксе мозга». Международный журнал биохимии и клеточной биологии. 44 (7): 1051–4. Дои:10.1016 / j.biocel.2012.03.022. PMID  22537913.
9. Хук К.С., Шлегель Н.С., Эйххофф О.М., Видмер Д.С., Преториус К., Эйнарссон С.О., Валгейрсдоттир С., Бергстейнсдоттир К., Щепски А., Даммер Р., Штайнгримссон Е. (декабрь 2008 г.). «Новые мишени MITF идентифицированы с использованием двухэтапной стратегии ДНК-микрочипов». Исследования пигментных клеток и меланомы. 21 (6): 665–76. Дои:10.1111 / j.1755-148X.2008.00505.x. PMID  19067971.

внешняя ссылка

• Человек BCAN расположение генома и BCAN страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Ху Б., Конг Л.Л., Мэтьюз Р.Т., Виапиано М.С. (сентябрь 2008 г.). «Протеогликан бревикан связывается с фибронектином после протеолитического расщепления и способствует подвижности клеток глиомы». Журнал биологической химии. 283 (36): 24848–59. Дои:10.1074 / jbc.M801433200. ЧВК  3259830. PMID  18611854.
• Зайденбехер К.И., Рихтер К., Раух У., Фесслер Р., Гарнер С.К., Гундельфингер Э.Д. (ноябрь 1995 г.). «Бревикан, хондроитинсульфат протеогликан головного мозга крысы, встречается в виде секретируемых и связанных с гликозилфосфатидилинозитолом изоформ на клеточной поверхности». Журнал биологической химии. 270 (45): 27206–12. Дои:10.1074 / jbc.270.45.27206. PMID  7592978.
• Аспберг А., Миура Р., Бурдулус С., Шимонака М., Хейнегард Д., Шахнер М., Руослахти Е., Ямагути Ю. (сентябрь 1997 г.). «Лектиновые домены лектинов С-типа, семейство агрегирующих хондроитинсульфатных протеогликанов, связывают тенасцин-R посредством белок-белковых взаимодействий независимо от углеводной части». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 94 (19): 10116–21. Дои:10.1073 / пнас.94.19.10116. ЧВК  23322. PMID  9294172.
• Накамура Х, Фудзи Й, Иноки И., Сугимото К., Танзава К., Мацуки Х, Миура Р., Ямагути Й, Окада Y (декабрь 2000 г.). «Бревикан расщепляется матриксными металлопротеиназами и аггреканазой-1 (ADAMTS4) на разных участках». Журнал биологической химии. 275 (49): 38885–90. Дои:10.1074 / jbc.M003875200. PMID  10986281.
• Олин А.И., Моргелин М., Сасаки Т., Тимпл Р., Хейнегорд Д., Аспберг А. (январь 2001 г.). «Протеогликаны аггрекан и версикан образуют сети с фибулином-2 посредством связывания их лектинового домена». Журнал биологической химии. 276 (2): 1253–61. Дои:10.1074 / jbc.M006783200. PMID  11038354.
• Кларк Х.Ф., Гурни А.Л., Абая Э., Бейкер К., Болдуин Д., Кисть Дж., Чен Дж., Чоу Б., Чуи С., Кроули С., Керрелл Б., Деуэл Б., Дауд П., Итон Д., Фостер Дж., Гримальди К., Гу Q , Hass PE, Heldens S, Huang A, Kim HS, Klimowski L, Jin Y, Johnson S, Lee J, Lewis L, Liao D, Mark M, Robbie E, Sanchez C, Schoenfeld J, Seshagiri S, Simmons L, Singh Дж., Смит В., Стинсон Дж., Вагтс А., Вандлен Р., Ватанабе С., Вианд Д., Вудс К., Се М. Х., Янсура Д., Йи С, Ю Дж, Юань Дж, Чжан М, Чжан З, Годдард А., Вуд В. И., Годовски П., Грей А. (октябрь 2003 г.). «Инициатива по открытию секретируемого белка (SPDI), широкомасштабная попытка идентифицировать новые секретируемые и трансмембранные белки человека: биоинформатическая оценка». Геномные исследования. 13 (10): 2265–70. Дои:10.1101 / гр.1293003. ЧВК  403697. PMID  12975309.
• Xu XM, Chen Y, Chen J, Yang S, Gao F, Underhill CB, Creswell K, Zhang L (сентябрь 2003 г.). «Пептид с тремя гиалуронановыми связывающими мотивами подавляет рост опухоли и индуцирует апоптоз». Исследования рака. 63 (18): 5685–90. PMID  14522884.
• Бекку Ю., Су В.Д., Хиракава С., Фесслер Р., Оцука А., Канг Дж. С., Сандерс Дж., Мураками Т., Ниномия Ю., Оохаси Т. (сентябрь 2003 г.). «Молекулярное клонирование Bral2, нового связующего белка, специфичного для мозга, и иммуногистохимическая совместная локализация с бревиканом в перинейрональных сетях». Молекулярная и клеточная нейронауки. 24 (1): 148–59. Дои:10.1016 / S1044-7431 (03) 00133-7. PMID  14550776.
• Дун И, Хан Х, Сюэ И, Дон Б, Го Х, Ху Г, Чжу Ц, Лу И (февраль 2004 г.). «Секретируемая мРНК бревикана экспрессируется в гипофизе взрослой крысы». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 314 (3): 745–8. Дои:10.1016 / j.bbrc.2003.12.151. PMID  14741698.
• Виапиано М.С., Би В.Л., Пипмайер Дж., Хокфилд С., Мэтьюз Р.Т. (август 2005 г.). «Новые опухолеспецифические изоформы BEHAB / brevican, выявленные в злокачественных глиомах человека». Исследования рака. 65 (15): 6726–33. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-05-0585. PMID  16061654.
• Накада М., Миямори Х., Кита Д., Такахаши Т., Ямасита Дж., Сато Х., Миура Р., Ямагути Ю., Окада Ю. (сентябрь 2005 г.). «Глиобластомы человека сверхэкспрессируют ADAMTS-5, который разрушает бревикан». Acta Neuropathologica. 110 (3): 239–46. Дои:10.1007 / s00401-005-1032-6. PMID  16133547.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Дж., Ли С., Альбала Дж. С., Лим Дж., Фраутон С., Лламозас Э, Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж. Зогби HY, Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусет-Штамм Л., Кусик М.Э., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видаль М. (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514.