SIGLEC10 - SIGLEC10

SIGLEC10
Идентификаторы
Псевдонимы	SIGLEC10, PRO940, SIGLEC-10, SLG2, Ig, связывающий сиаловую кислоту, как лектин 10
Внешние идентификаторы	OMIM: 606091 MGI: 2443630 ГомолоГен: 13228 Генные карты: SIGLEC10
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек)[1] Группа 19q13.41 Начинать 51,410,020 бп[1] Конец 51,417,803 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 7 (мышь)[2] Группа 7 | 7 B3 Начинать 43,408,204 бп[2] Конец 43,418,358 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • связывание углеводов • GO: 0001948 связывание с белками • связывание фосфатазы • Привязка домена SH2 Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • внеклеточная область • мембрана • клеточная мембрана Биологический процесс • клеточная адгезия • адаптивный иммунный ответ • иммунная система • врожденная иммунная система • отрицательная регуляция воспалительной реакции на ранение Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	89790	243958
Ансамбль	ENSG00000142512	ENSMUSG00000030468
UniProt	Q96LC7	Q80ZE3
RefSeq (мРНК)	NM_001171156 NM_001171157 NM_001171158 NM_001171159 NM_001171160 NM_001171161 NM_033130 NM_001322105	NM_172900 NM_001382486
RefSeq (белок)	NP_001164627 NP_001164628 NP_001164629 NP_001164630 NP_001164632 NP_001309034 NP_149121	NP_766488 NP_001369415
Расположение (UCSC)	Chr 19: 51.41 - 51.42 Мб	Chr 7: 43.41 - 43.42 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Ig-подобный лектин, связывающий сиаловую кислоту 10 это белок что у людей кодируется SIGLEC10 ген.^[5][6] Siglec-G часто называют мышиным паралогом человеческого Siglec-10. ^[7]

Структура и функции

Как и большинство других Сиглеков, но не все, Сиглек-10 имеет ITIM (Иммунорецепторный ингибиторный мотив на основе тирозина ) в своем цитоплазматическом домене. Сиглек-10 является лигандом для CD52, мишень терапевтического моноклонального антитела Алемтузумаб.^[8] Также сообщается, что он связывается с Белок сосудистой адгезии 1 (VAP-1) и костимуляторной молекуле CD24 также известный как HSA (термостойкий антиген).

Краткое описание семейства генов

SIGLEC являются членами суперсемейства иммуноглобулинов, которые экспрессируются на поверхности клетки. Большинство SIGLEC имеют 1 или несколько ингибиторных мотивов на основе тирозина цитоплазматического иммунного рецептора, или ITIM. SIGLEC обычно экспрессируются на клетках врожденной иммунной системы, за исключением B-клетки, экспрессирующей SIGLEC6 (MIM 604405). [Поставляется OMIM]^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000142512 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030468 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Мандей Дж, Керр С., Ни Дж, Корниш А.Л., Чжан Дж.К., Николл Дж., Флойд Х., Маттей М.Г., Мур П., Лю Д., Крокер П.Р. (апрель 2001 г.). «Идентификация, характеристика и лейкоцитарная экспрессия Siglec-10, нового человеческого рецептора, связывающего сиаловую кислоту». Biochem J. 355 (Pt 2): 489–97. Дои:10.1042/0264-6021:3550489. ЧВК  1221762. PMID  11284738.
6. «Ген Entrez: SIGLEC10, связывающий сиаловую кислоту, Ig-подобный лектин 10».
7. Станчак М.А., Сиддики С.С., Трефны М.П., ​​Томмен Д.С., Болиган К.Ф., фон Гюнтен С., Цанков А., Титце Л., Лардинуа Д., Хайнцельманн-Шварц В., фон Бергвельт-Байлдон М., Чжан В., Ленц Г.Дж., Хан Й, Амос К.И. , Syedbasha M, Egli A, Stenner F, Speiser DE, Varki A, Zippelius A, Läubli H (ноябрь 2018 г.). «Самоассоциированные молекулярные паттерны опосредуют уклонение от противоракового иммунитета, задействуя Siglec на Т-клетках». J. Clin. Вкладывать деньги. 128 (Pt 11): 4912–23. Дои:10.1172 / JCI120612. ЧВК  6205408. PMID  30130255.
8. Кларк, М. и А. Кук (2013). «Положение разоблачено активацией». Нат Иммунол. 14 (7): 696–697. Дои:10.1038 / ni.2646. PMID  23778805. S2CID  11457712.

дальнейшее чтение

• Ли Н, Чжан В., Ван Т. и др. (2001). «Клонирование и характеристика Siglec-10, нового члена, связывающего сиаловую кислоту суперсемейства Ig, из дендритных клеток человека». J. Biol. Chem. 276 (30): 28106–12. Дои:10.1074 / jbc.M100467200. PMID  11358961.
• Юсеф Г. М., Ордон М. Х., Фуссиас Г., Диамандис Е. П. (2001). «Молекулярная характеристика, тканевая экспрессия и картирование нового Siglec-подобного гена (SLG2) с тремя вариантами сплайсинга». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 284 (4): 900–10. Дои:10.1006 / bbrc.2001.5053. PMID  11409878.
• Нагано Т., Йонеда Т., Хатанака Ю. и др. (2002). «Белок, взаимодействующий с филамином А (FILIP), регулирует миграцию кортикальных клеток из зоны желудочков». Nat. Cell Biol. 4 (7): 495–501. Дои:10.1038 / ncb808. PMID  12055638. S2CID  4795393.
• Китциг Ф., Мартинес-Барриоканал А, Лопес-Ботет М., Сайос Дж. (2002). «Клонирование двух новых вариантов сплайсинга Siglec-10 и отображение взаимодействия между Siglec-10 и SHP-1». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 296 (2): 355–62. Дои:10.1016 / S0006-291X (02) 00885-9. PMID  12163025.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Кларк Х.Ф., Герни А.Л., Абая Э. и др. (2003). «Инициатива по открытию секретных белков (SPDI), широкомасштабная попытка идентифицировать новые секретируемые и трансмембранные белки человека: оценка биоинформатики». Genome Res. 13 (10): 2265–70. Дои:10.1101 / гр.1293003. ЧВК  403697. PMID  12975309.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.
• Шафрански К., Шиндлер С., Таудиен С. и др. (2007). «Нарушение правил сплайсинга: динуклеотиды TG функционируют как альтернативные 3'-сайты сплайсинга в U2-зависимых интронах». Геном Биол. 8 (8): R154. Дои:10.1186 / gb-2007-8-8-r154. ЧВК  2374985. PMID  17672918.