SIGLEC5 - SIGLEC5

SIGLEC5
Доступные конструкции PDB Human UniProt search: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2ZG1, 2ZG2, 2ZG3
Идентификаторы
Псевдонимы	SIGLEC5, CD170, CD33L2, OB-BP2, OBBP2, SIGLEC-5, Ig, связывающий сиаловую кислоту, такой как лектин 5
Внешние идентификаторы	OMIM: 604200 ГомолоГен: 55783 Генные карты: SIGLEC5
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек)[1] Группа 19q13.41 Начните 51,611,927 бп[1] Конец 51,645,545 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание углеводов • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • мембрана • клеточная мембрана • секреторная мембрана гранул • мембрана третичных гранул • мембрана гранул, богатая фиколином-1 Биологический процесс • клеточная адгезия • дегрануляция нейтрофилов Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	8778	н / д
Ансамбль	ENSG00000105501	н / д
UniProt	O15389	н / д
RefSeq (мРНК)	NM_003830	н / д
RefSeq (белок)	NP_003821	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 19: 51.61 - 51.65 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	н / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека

Ig-подобный лектин, связывающий сиаловую кислоту 5 это белок что у людей кодируется SIGLEC5 ген.^[3][4] SIGLEC5 также был обозначен CD170 (кластер дифференциации 170).

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000105501 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. Kim HS (июнь 1999 г.). «Отнесение гена человеческого OB-связывающего белка-2 (CD33L2) к хромосоме 19q13.3 с помощью радиационного гибридного картирования». Cytogenet Cell Genet. 84 (1–2): 96. Дои:10.1159/000015227. PMID  10343116. S2CID  10581090.
4. «Ген Entrez: SIGLEC5, связывающий сиаловую кислоту, Ig-подобный лектин 5».

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Корниш А.Л., Фриман С., Форбс Г. и др. (1998). «Характеристика сиглека-5, нового гликопротеина, экспрессируемого на миелоидных клетках, связанных с CD33». Кровь. 92 (6): 2123–32. Дои:10.1182 / кровь.V92.6.2123. PMID  9731071.
• Патель Н., Бринкман-Ван дер Линден ЕС, Альтманн С.В. и др. (1999). «OB-BP1 / Siglec-6. Связывающий лептин и сиаловую кислоту белок суперсемейства иммуноглобулинов». J. Biol. Chem. 274 (32): 22729–38. Дои:10.1074 / jbc.274.32.22729. PMID  10428856.
• Юсеф Г. М., Ордон М. Х., Фуссиас Г., Диамандис Е. П. (2002). «Геномная организация локуса гена сиглека на хромосоме 19q13.4 и клонирование двух новых псевдогенов сиглека». Ген. 286 (2): 259–70. Дои:10.1016 / S0378-1119 (02) 00432-8. PMID  11943481.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Эриксон-Миллер С.Л., Фриман С.Д., Хопсон С.Б. и др. (2003). «Характеристика экспрессии Siglec-5 (CD170) и функциональной активности анти-Siglec-5 антител на человеческих фагоцитах». Exp. Гематол. 31 (5): 382–8. Дои:10.1016 / S0301-472X (03) 00046-8. PMID  12763136.
• Гримвуд Дж., Гордон Л.А., Олсен А. и др. (2004). «Последовательность ДНК и биология хромосомы 19 человека». Природа. 428 (6982): 529–35. Дои:10.1038 / природа02399. PMID  15057824.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Аврил Т., Фриман С.Д., Атрилл Х. и др. (2005). «Сиглек-5 (CD170) может опосредовать ингибирующую передачу сигналов в отсутствие иммунорецепторного тирозинового фосфорилирования ингибиторного мотива» (PDF). J. Biol. Chem. 280 (20): 19843–51. Дои:10.1074 / jbc.M502041200. PMID  15769739. S2CID  44764751.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Рапопорт Е.М., Пазынина Г.В., Саблина М.А. и др. (2006). «Исследование связывания сиаловой кислоты Ig-подобных лектинов (сиглеков) с сульфатированными олигосахаридами». Биохимия Моск. 71 (5): 496–504. Дои:10.1134 / S0006297906050051. PMID  16732727. S2CID  11537303.
• Бидерманн Б., Гил Д., Боуэн Д.Т., Крокер PR (2007). «Анализ семейства сиглеков, связанных с CD33, показывает, что сиглек-9 представляет собой эндоцитарный рецептор, экспрессируемый на подмножествах клеток острого миелоидного лейкоза и отсутствующий в нормальных гемопоэтических предшественниках». Лейк. Res. 31 (2): 211–20. Дои:10.1016 / j.leukres.2006.05.026. PMID  16828866.
• Ангата Т., Хаякава Т., Яманака М. и др. (2006). «Открытие Siglec-14, нового рецептора сиаловой кислоты, претерпевающего согласованную эволюцию с Siglec-5 у приматов». FASEB J. 20 (12): 1964–73. Дои:10.1096 / fj.06-5800com. PMID  17012248. S2CID  13740587.
• Журавлева М.А., Трандем К, Sun PD (2007). «Структурные последствия распознавания сиалогликана, опосредованного сиглек-5». J. Mol. Биол. 375 (2): 437–47. Дои:10.1016 / j.jmb.2007.10.009. ЧВК  2245879. PMID  18022638.

внешняя ссылка

• PDBe-KB предоставляет обзор всей структурной информации, доступной в PDB для человеческого Ig-подобного лектина 5, связывающего сиаловую кислоту (SIGLEC5)