CLEC4M - CLEC4M

CLEC4M
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1K9J, 1SL6, 1XAR, 1XPH, 3JQH
Идентификаторы
Псевдонимы	CLEC4M, CD209L, CD299, DC-SIGN2, DC-SIGNR, DCSIGNR, HP10347, L-SIGN, LSIGN, семейство лектиновых доменов C-типа, 4 члена M
Внешние идентификаторы	OMIM: 605872 MGI: 2157942 ГомолоГен: 129771 Генные карты: CLEC4M
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек)[1] Группа 19p13.2 Начните 7,763,149 бп[1] Конец 7,769,605 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 8 (мышь)[2] Группа 8 | 8 A1.1 Начните 3,743,397 бп[2] Конец 3,748,984 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание пептида с антигеном • активность рецептора вируса • связывание ионов металлов • кальций-зависимое связывание с белками • связывание маннозы • связывание вириона • Активность рецептора ICAM-3 • связывание углеводов • сигнальная активность рецептора • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • цитоплазма • неотъемлемый компонент мембраны • мембрана • клеточная мембрана • неотъемлемый компонент плазматической мембраны • внеклеточная область • клетка-хозяин Биологический процесс • лейкоцитарная клеточная адгезия • клеточное распознавание • GO: 0046795 внутриклеточный транспорт вируса • GO: 0007243 внутриклеточная передача сигнала • процессинг и презентация антигена • эндоцитоз • адаптивный иммунный ответ • иммунная система • вирусная репликация • транспорт пептидного антигена • модуляция вирусом морфологии или физиологии хозяина • врожденная иммунная система • GO: 0022415 вирусный процесс • прикрепление вириона к клетке-хозяину • вирусное проникновение Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	10332	170786
Ансамбль	ENSG00000104938	ENSMUSG00000031494
UniProt	Q9H2X3	Q91ZX1
RefSeq (мРНК)	NM_001144904 NM_001144905 NM_001144906 NM_001144907 NM_001144908 NM_001144909 NM_001144910 NM_001144911 NM_014257 NM_214675 NM_214676	NM_133238
RefSeq (белок)	NP_001138376 NP_001138377 NP_001138378 NP_001138379 NP_001138380 NP_001138381 NP_001138382 NP_001138383 NP_055072	NP_573501
Расположение (UCSC)	Chr 19: 7.76 - 7.77 Мб	Chr 8: 3.74 - 3.75 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

4 член семейства лектиновых доменов C-типа M это белок что у людей кодируется CLEC4M ген.^[5] CLEC4M также был обозначен как CD299 (кластер дифференциации 299).

Этот ген кодирует L-SIGN (молекулы внутриклеточной адгезии, специфичные для печени / лимфатических узлов-3, захватывающие неинтегрин), интегральный мембранный белок типа II, который на 77% идентичен CD209 антиген, ВИЧ gp120-связывающий белок. Этот белок, как и CD209, эффективно связывает обе молекулы межклеточной адгезии 3 (ICAM3 ) и gp120 ВИЧ-1, и усиливает инфицирование Т-клеток ВИЧ-1. Этот ген картирован в 19p13.3 в кластере с генами CD209 и CD23 / FCER2. Для этого гена было обнаружено множество альтернативно сплайсированных вариантов транскриптов, но биологическая ценность некоторых вариантов не была определена.^[6]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000104938 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031494 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Ёкояма-Кобаяси М., Ямагути Т., Секинэ С., Като С. (апрель 1999 г.). «Отбор кДНК, кодирующих предполагаемые мембранные белки типа II на поверхности клетки, из банка полноразмерных кДНК человека». Ген. 228 (1–2): 161–7. Дои:10.1016 / S0378-1119 (99) 00004-9. PMID  10072769.
6. «Ген Entrez: семейство лектиновых доменов С-типа CLEC4M 4, член M».

дальнейшее чтение

• Барибо Ф, Домс Р. У., Пельманн С (2006). «Роль DC-SIGN и DC-SIGNR в инфицировании вирусом ВИЧ и Эбола: могут ли потенциальные терапевтические средства блокировать передачу и распространение вируса?». Мнение эксперта. Ther. Цели. 6 (4): 423–31. Дои:10.1517/14728222.6.4.423. PMID  12223058. S2CID  21541850.
• Беккер Y (2004). «Связывание gp120 ВИЧ-1 с рецепторами дендритных клеток мобилизует вирус к лимфатическим узлам, но индуцированный синтез IL-4 гемопоэтическими клетками FcepsilonRI + повреждает адаптивный иммунитет - обзор, гипотеза и последствия». Гены вирусов. 29 (1): 147–65. Дои:10.1023 / B: VIRU.0000032797.43537.d3. PMID  15215692. S2CID  5666009.
• Лалор П.Ф., Лай В.К., Кербишли С.М. и др. (2006). «Человеческие синусоидальные эндотелиальные клетки печени можно отличить по экспрессии фенотипических маркеров, связанных с их специализированными функциями in vivo». Мир J. Гастроэнтерол. 12 (34): 5429–39. Дои:10.3748 / wjg.v12.i34.5429. ЧВК  4088223. PMID  17006978.
• Кертис Б.М., Шарновске С., Уотсон А.Дж. (1992). «Последовательность и экспрессия ассоциированного с мембраной лектина С-типа, который демонстрирует CD4-независимое связывание гликопротеина оболочки вируса иммунодефицита человека gp120». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 89 (17): 8356–60. Дои:10.1073 / пнас.89.17.8356. ЧВК  49917. PMID  1518869.
• Гаттегно Л., Рамдани А., Жуо Т. и др. (1992). «Лектино-углеводные взаимодействия и инфекционность вируса иммунодефицита человека 1 типа (ВИЧ-1)». AIDS Res. Гм. Ретровирусы. 8 (1): 27–37. Дои:10.1089 / помощь.1992.8.27. PMID  1736938.
• Сойле Э. Дж., Бартен Р., Троусдейл Дж. (2000). «DC-SIGN; родственный ген DC-SIGNR; и CD23 образуют кластер на 19p13». J. Immunol. 165 (6): 2937–42. Дои:10.4049 / jimmunol.165.6.2937. PMID  10975799.
• Pöhlmann S, Soilleux EJ, Baribaud F и др. (2001). «DC-SIGNR, гомолог DC-SIGN, экспрессируемый в эндотелиальных клетках, связывается с вирусами иммунодефицита человека и обезьян и активирует инфекцию в транс». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 98 (5): 2670–5. Дои:10.1073 / pnas.051631398. ЧВК  30196. PMID  11226297.
• Баширова А.А., Гейтенбек Т.Б., Ван Дуйнховен Г.С. и др. (2001). «Специфическая для дендритных клеток молекула межклеточной адгезии, 3-захватывающий неинтегрин (DC-SIGN) -зависимый белок, высоко экспрессируется на синусоидальных эндотелиальных клетках печени человека и способствует инфицированию ВИЧ-1». J. Exp. Med. 193 (6): 671–8. Дои:10.1084 / jem.193.6.671. ЧВК  2193415. PMID  11257134.
• Муммиди С., Катано Дж., Лам Л. и др. (2001). «Обширный репертуар мембраносвязанных и растворимых дендритных клеток, специфичных для ICAM-3-захватывающих неинтегрин 1 (DC-SIGN1) и изоформ DC-SIGN2. Межиндивидуальные различия в экспрессии транскриптов DC-SIGN». J. Biol. Chem. 276 (35): 33196–212. Дои:10.1074 / jbc.M009807200. PMID  11337487.
• Митчелл Д.А., Фадден А.Дж., Дрикамер К. (2001). «Новый механизм распознавания углеводов лектинами C-типа DC-SIGN и DC-SIGNR. Организация субъединиц и связывание с поливалентными лигандами». J. Biol. Chem. 276 (31): 28939–45. Дои:10.1074 / jbc.M104565200. PMID  11384997.
• Файнберг Х., Митчелл Д.А., Дрикамер К., Вайс В.И. (2002). «Структурная основа избирательного распознавания олигосахаридов с помощью DC-SIGN и DC-SIGNR». Наука. 294 (5549): 2163–6. Дои:10.1126 / science.1066371. PMID  11739956. S2CID  25046581.
• Альварес С.П., Ласала Ф., Каррильо Дж. И др. (2002). «Лектины C-типа DC-SIGN и L-SIGN опосредуют проникновение вируса Эбола в клетки цис и транс». Дж. Вирол. 76 (13): 6841–4. Дои:10.1128 / JVI.76.13.6841-6844.2002. ЧВК  136246. PMID  12050398.
• Soilleux EJ, Morris LS, Rushbrook S, et al. (2002). «Экспрессия лектина DC-SIGNR, связывающего вирус иммунодефицита человека (ВИЧ): последствия для ВИЧ-инфекции и иммунитета». Гм. Патол. 33 (6): 652–9. Дои:10.1053 / hupa.2002.124036. PMID  12152166.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Lin G, Simmons G, Pöhlmann S, et al. (2003). «Дифференциальное N-связанное гликозилирование гликопротеинов оболочки вируса иммунодефицита человека и вируса Эбола модулирует взаимодействия с DC-SIGN и DC-SIGNR». Дж. Вирол. 77 (2): 1337–46. Дои:10.1128 / JVI.77.2.1337-1346.2003. ЧВК  140807. PMID  12502850.
• Pöhlmann S, Zhang J, Baribaud F и др. (2003). «Гликопротеины вируса гепатита С взаимодействуют с DC-SIGN и DC-SIGNR». Дж. Вирол. 77 (7): 4070–80. Дои:10.1128 / JVI.77.7.4070-4080.2003. ЧВК  150620. PMID  12634366.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Энгеринг А., ван Влит С.Дж., Хебеда К. и др. (2004). «Динамические популяции дендритных клеток-специфичных ICAM-3, захватывающих неинтегрин-положительные незрелые дендритные клетки, и специфичных для печени / лимфатических узлов ICAM-3, захватывающих неинтегрин-положительные эндотелиальные клетки во внешних зонах паракортикального слоя лимфатических узлов человека». Am. Дж. Патол. 164 (5): 1587–95. Дои:10.1016 / S0002-9440 (10) 63717-0. ЧВК  1615649. PMID  15111305.

внешние ссылки

• CLEC4M + белок, + человек в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
• CLEC4M расположение человеческого гена в Браузер генома UCSC.
• CLEC4M детали человеческого гена в Браузер генома UCSC.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.