MSR1 - MSR1

MSR1
Идентификаторы
Псевдонимы	MSR1, CD204, SCARA1, SR-A, SRA, phSR1, phSR2, рецептор скавенджера макрофагов 1, SR-AI, SR-AII, SR-AIII
Внешние идентификаторы	OMIM: 153622 MGI: 98257 ГомолоГен: 12822 Генные карты: MSR1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 8 (человек)[1] Группа 8p22 Начните 16,107,878 бп[1] Конец 16,567,490 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 8 (мышь)[2] Группа 8 A4 | 8 23,89 см Начните 39,581,685 бп[2] Конец 39,642,673 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность рецептора поглотителя • GO: 0001948 связывание с белками • связывание частиц липопротеинов низкой плотности • связывание бета-амилоида • грузоприемная деятельность Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • мембрана эндоцитарных везикул • цитозоль • клеточная мембрана • коллаген • неотъемлемый компонент плазматической мембраны • мембрана • частица липопротеинов низкой плотности • цитоплазматический пузырек Биологический процесс • транспорт холестерина • клиренс частиц липопротеинов плазмы • клеточный ответ на органическое циклическое соединение • положительная регуляция дифференцировки пенистых клеток, происходящих из макрофагов • эндоцитоз • рецептор-опосредованного эндоцитоза • транспорт липопротеинов • положительное регулирование накопления холестерина • фагоцитоз, поглощение • отрицательная регуляция экспрессии генов • клиренс бета-амилоида Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	4481	20288
Ансамбль	ENSG00000038945	ENSMUSG00000025044
UniProt	P21757	P30204
RefSeq (мРНК)	NM_138716 NM_002445 NM_138715 NM_001363744	NM_001113326 NM_031195
RefSeq (белок)	NP_002436 NP_619729 NP_619730 NP_001350673	NP_001106797 NP_112472
Расположение (UCSC)	Chr 8: 16.11 - 16.57 Мб	Chr 8: 39.58 - 39.64 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Рецептор скавенджера макрофагов 1, также известен как MSR1, это белок который у человека кодируется MSR1 ген.^[5][6] MSR1 также был обозначен CD204 (кластер дифференциации 204).

Функция

Этот ген кодирует класс А макрофаг рецепторы поглотителей, которые включают три различных типа (1, 2, 3), генерируемые альтернативным сплайсингом этого гена. Эти рецепторы или изоформы представляют собой тримерную интегральную мембрану. гликопротеины и были вовлечены во многие физиологические и патологические процессы, связанные с макрофагами, включая атеросклероз, Болезнь Альцгеймера, и защита хоста. Считалось, что они экспрессируются специфично для макрофагов, но недавно было показано, что они присутствуют и на разных классах дендритных клеток.^[7]

Изоформы типа 1 и типа 2 являются функциональными рецепторами и способны опосредовать эндоцитоз модифицированных липопротеины низкой плотности (ЛПНП). Изоформа типа 3 не усваивает модифицированный ЛПНП (ацетил-ЛПНП), несмотря на наличие домена, опосредующего эту функцию в изоформах типов 1 и 2. Он имеет измененную внутриклеточную обработку и попадает в ловушку эндоплазматический ретикулум, что делает его неспособным выполнять эндоцитоз. Изоформа типа 3 может ингибировать функцию изоформ типа 1 и типа 2 при совместной экспрессии, что указывает на доминирующий негативный эффект и предполагает механизм регуляции активности рецепторов скавенджеров в макрофагах.^[5]

Применение биотехнологии

Было показано, что рецептор поглотителя макрофагов опосредует адгезию макрофагов и других клеточных линий к пластику для тканевой культуры.^[8]

Взаимодействия

MSR1 был показан взаимодействовать с участием HSPA1A.^[9]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000038945 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025044 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: рецептор 1 скавенджера макрофагов MSR1».
6. Мацумото А., Наито М., Итакура Х, Икемото С., Асаока Х, Хаякава И., Канамори Х, Абуратани Х, Такаку Ф, Судзуки Х (декабрь 1990 г.). «Рецепторы скавенджеров макрофагов человека: первичная структура, экспрессия и локализация в атеросклеротических поражениях». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 87 (23): 9133–7. Bibcode:1990ПНАС ... 87.9133М. Дои:10.1073 / пнас.87.23.9133. ЧВК  55118. PMID  2251254.
7. Гербер Д.Л., Цао В., Нефедова Ю., Новицкий С.В., Нагарадж С., Тюрин В.А., Корсо А., Чо Х.И., Селис Э., Леннокс Б., Найт С.К., Падья Т., Маккаффри Т.В., Маккаффри Д.С., Антония С., Фишман М., Феррис Р.Л. , Каган В.Е., Габрилович Д.И. (август 2010). «Накопление липидов и дисфункция дендритных клеток при раке». Nat. Med. 16 (8): 880–6. Дои:10,1038 / нм.2172. ЧВК  2917488. PMID  20622859.
8. Роббинс А.К., Хорлик Р.А. (август 1998 г.). «Рецептор поглотителя макрофагов придает прикрепленный фенотип клеткам в культуре». Биотехнологии. 25 (2): 240–4. Дои:10.2144 / 98252st04. PMID  9714883.
9. Накамура, Тошинобу; Хинагата Дзюн-ичи; Танака Тошики; Иманиши Такеши; Вада Юичиро; Кодама Тацухико; Дои Такефуми (январь 2002 г.). «HSP90, HSP70 и GAPDH напрямую взаимодействуют с цитоплазматическим доменом рецепторов скавенджеров макрофагов». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. Соединенные Штаты. 290 (2): 858–64. Дои:10.1006 / bbrc.2001.6271. ISSN  0006-291X. PMID  11785981.

дальнейшее чтение

• Асаока Х, Мацумото А, Итакура Х, Кодама Т (1993). «[Структура и функция рецептора скавенджера макрофагов человека]». Ниппон Риншо. 51 (6): 1677–83. PMID  8391600.
• Наито М., Сузуки Х., Мори Т. и др. (1992). «Коэкспрессия рецепторов скавенджеров макрофагов человека типа I и типа II в макрофагах различных органов и пенистых клеток при атеросклеротических поражениях». Am. Дж. Патол. 141 (3): 591–9. ЧВК  1886699. PMID  1519666.
• Мацумото А., Наито М., Итакура Х. и др. (1991). «Рецепторы скавенджеров макрофагов человека: первичная структура, экспрессия и локализация в атеросклеротических поражениях». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 87 (23): 9133–7. Bibcode:1990ПНАС ... 87.9133М. Дои:10.1073 / пнас.87.23.9133. ЧВК  55118. PMID  2251254.
• Эми М., Асаока Х., Мацумото А. и др. (1993). «Структура, организация и хромосомное картирование гена рецептора скавенджера макрофагов человека». J. Biol. Chem. 268 (3): 2120–5. PMID  8093617.
• Ашкенас Дж., Пенман М., Василе Э. и др. (1993). «Структуры и свойства связывания лиганда с высоким и низким сродством мышиного типа I и рецепторов макрофагов типа II». J. Lipid Res. 34 (6): 983–1000. PMID  8394868.
• Резник Д., Чаттертон Дж. Э., Шварц К. и др. (1996). «Структуры рецепторов макрофагов-поглотителей класса А. Электронно-микроскопическое исследование гибких, многодоменных, волокнистых белков и определение структуры дисульфидных связей в богатой цистеином области рецептора-поглотителя». J. Biol. Chem. 271 (43): 26924–30. Дои:10.1074 / jbc.271.43.26924. PMID  8900177.
• Сюй Х.Й., Хаджар Д.П., Хан К.М., Фальконе ди-джей (1998). «Связывание лиганда с рецептором-поглотителем макрофагов-A индуцирует экспрессию активатора плазминогена урокиназного типа посредством протеинкиназ-зависимого пути передачи сигналов». J. Biol. Chem. 273 (2): 1240–6. Дои:10.1074 / jbc.273.2.1240. PMID  9422792.
• Гоф П.Дж., Гривз Д.Р., Гордон С. (1998). «Встречающаяся в природе изоформа гена рецептора скавенджера макрофагов человека (SR-A), генерируемая альтернативным сплайсингом, блокирует модифицированное поглощение ЛПНП». J. Lipid Res. 39 (3): 531–43. PMID  9548586.
• Teupser D, Thiery J, Seidel D (1999). «Альфа-токоферол подавляет активность рецепторов скавенджеров в макрофагах». Атеросклероз. 144 (1): 109–15. Дои:10.1016 / S0021-9150 (99) 00040-4. PMID  10381284.
• Накамура Т., Хинагата Дж., Танака Т. и др. (2002). «HSP90, HSP70 и GAPDH напрямую взаимодействуют с цитоплазматическим доменом рецепторов скавенджеров макрофагов». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 290 (2): 858–64. Дои:10.1006 / bbrc.2001.6271. PMID  11785981.
• Tomokiyo R, Jinnouchi K, Honda M и др. (2002). «Производство, характеристика и межвидовая реактивность моноклональных антител против рецепторов скавенджеров макрофагов класса А человека». Атеросклероз. 161 (1): 123–32. Дои:10.1016 / S0021-9150 (01) 00624-4. PMID  11882324.
• Сюй Дж., Чжэн С.Л., Комия А. и др. (2002). «Мутации зародышевой линии и варианты последовательности гена рецептора 1-скавенджера макрофагов связаны с риском рака простаты». Nat. Genet. 32 (2): 321–5. Дои:10,1038 / ng994. PMID  12244320. S2CID  13499753.
• Сюй Дж., Чжэн С.Л., Комия А. и др. (2003). «Варианты общей последовательности гена рецептора 1-поглотителя макрофагов связаны с риском рака простаты». Am. J. Hum. Genet. 72 (1): 208–12. Дои:10.1086/345802. ЧВК  378627. PMID  12471593.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Косвиг Н., Райс С., Догерти А., Пост SR (2003). «Адгезия и интернализация, опосредованные рецептором-скавенджером класса А, требуют отдельных цитоплазматических доменов». J. Biol. Chem. 278 (36): 34219–25. Дои:10.1074 / jbc.M303465200. PMID  12819208.
• Миллер Д.К., Чжэн С.Л., Данн Р.Л. и др. (2003). «Мутации зародышевой линии гена рецептора 1 скавенджера макрофагов: ассоциация с риском рака простаты у афроамериканских мужчин». Рак Res. 63 (13): 3486–9. PMID  12839931.
• Ван Л., Макдоннелл С.К., Каннингем Дж. М. и др. (2003). «Отсутствие ассоциации изменения MSR1 зародышевой линии с риском рака простаты». Nat. Genet. 35 (2): 128–9. Дои:10,1038 / ng1239. PMID  12958598. S2CID  30170866.
• Нуппонен Н.Н., Валлен М.Дж., Пончиано Д. и др. (2004). «Мутационный анализ генов чувствительности RNASEL / HPC1, ELAC2 / HPC2 и MSR1 при спорадическом раке простаты». Гены Хромосомы Рак. 39 (2): 119–25. Дои:10.1002 / gcc.10308. PMID  14695991. S2CID  19353783.
• Hillman RT, Green RE, Brenner SE (2005). «Недооцененная роль надзора за РНК». Геном Биол. 5 (2): R8. Дои:10.1186 / gb-2004-5-2-r8. ЧВК  395752. PMID  14759258.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.