CD1A - CD1A

CD1A
Доступные конструкции PDB Human UniProt search: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1ONQ, 1XZ0, 4X6C, 4X6D, 4X6E, 4X6F
Идентификаторы
Псевдонимы	CD1A, CD1, FCB6, HTA1, R4, T6, молекула CD1a
Внешние идентификаторы	OMIM: 188370 ГомолоГен: 113556 Генные карты: CD1A
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1q23.1 Начинать 158,254,424 бп[1] Конец 158,258,269 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание бета-2-микроглобулина • связывание эндогенного липида с антигеном • GO: 0001948 связывание с белками • связывание экзогенного липида с антигеном • липопептидное связывание Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • мембранный плот • эндосома • неотъемлемый компонент плазматической мембраны • эндосомная мембрана • мембрана • клеточная мембрана • поверхность клетки • внеклеточный • внешняя сторона плазматической мембраны Биологический процесс • процессинг и презентация антигена, экзогенный липидный антиген через MHC класса Ib • адаптивный иммунный ответ • иммунная система • иммунная реакция • регуляция иммунного ответа • положительная регуляция цитотоксичности, опосредованной Т-клетками • процессинг и презентация антигена, эндогенный липидный антиген через MHC класса Ib Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	909	н / д
Ансамбль	ENSG00000158477	н / д
UniProt	P06126	н / д
RefSeq (мРНК)	NM_001763 NM_001320652	н / д
RefSeq (белок)	NP_001307581 NP_001754	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 1: 158.25 - 158.26 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	н / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека

CD1a (Cблеск Dдифференциация 1а) человек белок закодировано CD1A ген.^[3]

Этот ген кодирует член Семья CD1 трансмембранных гликопротеинов, которые структурно связаны с главный комплекс гистосовместимости (MHC) и образуют гетеродимеры с бета-2-микроглобулином. Белки CD1 опосредуют представление Т-лимфоцитам в первую очередь липидных и гликолипидных антигенов собственного или микробного происхождения. Геном человека содержит пять генов семейства CD1, организованных в кластер на хромосоме 1. Считается, что члены семейства CD1 различаются по своей клеточной локализации и специфичности в отношении определенных липидных лигандов. Белок, кодируемый этим геном, локализуется на плазматической мембране и в рециркулирующих пузырьках ранней эндоцитарной системы. Альтернативно сплайсированные варианты транскриптов наблюдались, но их биологическая ценность не была определена.^[3] Уровни транскрипта гена CD1A активируются в паренхиме легких курильщиков. ^[4]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000158477 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. «Ген Энтреза: CD1A молекула CD1a».
4. Pintarelli G, Noci S, Maspero D, Pettinicchio A, Dugo M, De Cecco L, Incarbone M, Tosi D, Santambrogio L, Dragani TA, Colombo F (сентябрь 2019 г.). «Сигаретный дым изменяет транскриптом не вовлеченной легочной ткани у пациентов с аденокарциномой легких». Научные отчеты. 9 (1): 13039. Дои:10.1038 / s41598-019-49648-2. ЧВК  6736939. PMID  31506599.

внешняя ссылка

• Человек CD1A расположение генома и CD1A страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.
• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: P06126 (Поверхностный гликопротеин CD1a Т-клеток человека) на PDBe-KB.

дальнейшее чтение

• Мелиан А., Бекман Э.М., Порчелли С.А., Бреннер МБ (1996). «Презентация антигена молекулами класса I, кодируемыми CD1 и MHC». Curr. Мнение. Иммунол. 8 (1): 82–8. Дои:10.1016 / S0952-7915 (96) 80109-9. PMID  8729450.
• Парк С.Х., Бенделак А. (2000). «CD1-ограниченные Т-клеточные ответы и микробная инфекция». Природа. 406 (6797): 788–92. Дои:10.1038/35021233. PMID  10963609.
• Бригл М., Бреннер МБ (2004). «CD1: презентация антигена и функция Т-клеток». Анну. Преп. Иммунол. 22 (1): 817–90. Дои:10.1146 / annurev.immunol.22.012703.104608. PMID  15032598.
• Ковентри Б, Хайнцель С (2004). «CD1a при раке человека: новая роль старой молекулы». Тенденции Иммунол. 25 (5): 242–8. Дои:10.1016 / j.it.2004.03.002. PMID  15099564.
• Moody DB, Zajonc DM, Wilson IA (2005). «Анатомия комплексов CD1-липидный антиген». Nat. Преп. Иммунол. 5 (5): 387–99. Дои:10.1038 / nri1605. PMID  15864273.
• Плита V, Верхассельт B (2006). «Моделирование эффектов тимуса ВИЧ-1 Nef». Curr. ВИЧ Res. 4 (1): 57–64. Дои:10.2174/157016206775197583. PMID  16454711.
• Quaranta MG, Маттиоли Б., Джордани Л., Виора М. (2006). «Иммунорегуляторные эффекты ВИЧ-1 Nef на дендритные клетки и патогенез СПИДа». FASEB J. 20 (13): 2198–208. Дои:10.1096 / fj.06-6260rev. PMID  17077296.
• Оки Р.Дж., Уотсон М.Л., Селдин М.Ф. (1993). «Построение физической карты на хромосоме 1 мыши и человека: сравнение 13 МБ мыши и 11 МБ ДНК человека». Гм. Мол. Genet. 1 (8): 613–20. Дои:10,1093 / hmg / 1,8,613. PMID  1301170.
• Мартин Л.Х., Калаби Ф., Лефевр Ф.А. и др. (1988). «Структура и экспрессия антигенов тимоцитов человека CD1a, CD1b и CD1c». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 84 (24): 9189–93. Дои:10.1073 / пнас.84.24.9189. ЧВК  299718. PMID  2447586.
• Мозли WS, Уотсон ML, Кингсмор С.Ф., Селдин М.Ф. (1989). «CD1 определяет консервативную границу группы сцепления между хромосомами 1 человека и хромосомами 1 и 3 мыши». Иммуногенетика. 30 (5): 378–82. Дои:10.1007 / BF02425278. PMID  2478463.
• Ю. CY, Мильштейн C (1990). «Физическая карта, связывающая пять генов антигена дифференцировки тимоцитов человека CD1». EMBO J. 8 (12): 3727–32. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1989.tb08548.x. ЧВК  402056. PMID  2583117.
• Аруффо А, Сид В (1989). «Экспрессия клонов кДНК, кодирующих тимоцитарные антигены CD1a, b, c, демонстрирует иерархию исключения в фибробластах». J. Immunol. 143 (5): 1723–30. PMID  2701945.
• Лонгли Дж., Краус Дж., Алонсо М., Эдельсон Р. (1989). «Молекулярное клонирование CD1a (T6), маркера эпидермальных дендритных клеток человека, относящегося к молекулам MHC класса I». J. Invest. Дерматол. 92 (4): 628–31. Дои:10.1111 / 1523-1747.ep12712175. PMID  2784820.
• Альбертсон Д.Г., Фишпул Р., Шеррингтон П. и др. (1988). «Чувствительная гибридизация in situ с высоким разрешением с хромосомами человека с использованием зондов, меченных биотином: отнесение генов антигена CD1 тимоцитов человека к хромосоме 1». EMBO J. 7 (9): 2801–5. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1988.tb03135.x. ЧВК  457071. PMID  3053166.
• Калаби Ф., Мильштейн С (1986). «Новое семейство генов, связанных с главным комплексом гистосовместимости человека, не отображаемых на хромосоме 6». Природа. 323 (6088): 540–3. Дои:10.1038 / 323540a0. PMID  3093894.
• Мартин Л.Х., Калаби Ф., Мильштейн С. (1987). «Выделение генов CD1: семейство дифференцировочных антигенов, связанных с основным комплексом гистосовместимости». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 83 (23): 9154–8. Дои:10.1073 / пнас.83.23.9154. ЧВК  387093. PMID  3097645.
• Вулфсон А., Мильштейн С. (1994). «Альтернативный сплайсинг генерирует секреторные изоформы человеческого CD1». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 91 (14): 6683–7. Дои:10.1073 / pnas.91.14.6683. ЧВК  44267. PMID  7517559.
• Хан М., Ханник Л., ДиБрино М., Робинсон М.А. (2000). «Полиморфизм генов CD1 человека». Тканевые антигены. 54 (2): 122–7. Дои:10.1034 / j.1399-0039.1999.540202.x. PMID  10488738.
• Сугита М., Грант Е.П., ван Донселаар Э. и др. (2000). «Отдельные пути презентации антигена молекулами CD1». Иммунитет. 11 (6): 743–52. Дои:10.1016 / S1074-7613 (00) 80148-X. PMID  10626896.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.