ХАДХА - HADHA

ХАДХА
Идентификаторы
Псевдонимы	ХАДХА, гидроксиацил-КоА дегидрогеназа / 3-кетоацил-КоА тиолаза / еноил-КоА гидратаза (трифункциональный белок), альфа-субъединица, ECHA, GBP, HADH, LCEH, LCHAD, MTPA, TP-ALPHA, трифункциональный мультиферментный комплекс гидроксиацил-CoA дегидрогеназы альфа
Внешние идентификаторы	OMIM: 600890 MGI: 2135593 ГомолоГен: 152 Генные карты: ХАДХА
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2п23.3 Начинать 26,190,635 бп[1] Конец 26,244,672 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 5 (мышь)[2] Группа 5 | 5 B1 Начинать 30,118,304 бп[2] Конец 30,155,162 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • связывание жирных ацил-КоА • активность ацетил-КоА C-ацилтрансферазы • GO: 0032403 связывание макромолекулярного комплекса • Привязка NAD • активность еноил-КоА гидратазы • ацетил-КоА C-ацетилтрансферазная активность • активность длинноцепочечной 3-гидроксиацил-КоА дегидрогеназы • GO: 0001948 связывание с белками • каталитическая активность • лиазная активность • оксидоредуктазная активность • активность длинноцепочечной еноил-КоА гидратазы • Активность 3-гидроксиацил-КоА дегидрогеназы Сотовый компонент • митохондрия • митохондриальная внутренняя мембрана • митохондриальный нуклеоид • Мультиферментный комплекс бета-окисления митохондриальных жирных кислот • внеклеточный матрикс Биологический процесс • липидный обмен • метаболический процесс жирных кислот • ответ на инсулин • бета-окисление жирных кислот • метаболизм • ремоделирование ацильной цепи кардиолипина • окислительно-восстановительный процесс • ответ на наркотик Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	3030	97212
Ансамбль	ENSG00000084754	ENSMUSG00000025745
UniProt	P40939	Q8BMS1
RefSeq (мРНК)	NM_000182	NM_178878
RefSeq (белок)	NP_000173	NP_849209
Расположение (UCSC)	Chr 2: 26.19 - 26.24 Мб	Chr 5: 30.12 - 30.16 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Субъединица альфа-трифункционального фермента, митохондриальная также известный как гидроксиацил-КоА дегидрогеназа / 3-кетоацил-КоА тиолаза / еноил-КоА гидратаза (трифункциональный белок), альфа-субъединица это белок что у людей кодируется ХАДХА ген. Мутации в ХАДХА были связаны с трифункциональная белковая недостаточность или же дефицит длинноцепочечной 3-гидроксиацил-кофермента А дегидрогеназы.^[5]

Структура

HADHA - это белок 82,9 кДа, состоящий из 763 аминокислот.^[6][7]

В митохондриальный мембраносвязанный гетерокомплекс состоит из четырех альфа и четырех бета-субъединиц, причем альфа-субъединица катализирует 3-гидроксиацил-КоА дегидрогеназа и еноил-КоА гидратаза виды деятельности. Гены альфа- и бета-субъединиц митохондриального трифункционального белка расположены рядом друг с другом в геноме человека в ориентации «голова к голове».^[5]

Функция

Этот ген кодирует альфа-субъединицу митохондриального трифункционального белка, который катализирует последние три стадии митохондриального бета-окисление длинноцепочечных жирных кислот.^[5] Фермент превращает соединения 2-еноил-КоА со средней и длинной цепью в следующий 3-кетоацил-КоА, когда присутствует только НАД, и ацетил-КоА когда НАД и CoASH присутствуют.^[8] Альфа-субъединица катализирует эту реакцию и присоединяется к HADHB, который катализирует последнюю стадию реакции.^[9]

Клиническое значение

Мутации в этом гене приводят к трифункциональной недостаточности белка или дефицит длинноцепочечной 3-гидроксиацил-кофермента А дегидрогеназы.^[5]

Наиболее распространенной формой мутации является G1528C, в которой гуанин на 1528 позиции заменен на цитозин. Мутация гена создает дефицит белка, который связан с нарушением окисления длинноцепочечные жирные кислоты что может привести к внезапной детской смерти.^[10] Клинические проявления этого дефицита могут включать: миопатия, кардиомиопатия, эпизоды кома, и гипогликемия.^[11] Дефицит длинноцепочечной L-3-гидроксиацил-кофермента A дегидрогеназы связан с некоторыми специфическими для беременности нарушениями, включая преэклампсия, АДРЕСНЫЙ синдром (гемолиз, повышенные ферменты печени, низкие тромбоциты), гиперемезис беременных, острая жировая дистрофия печени при беременности и инфаркт плаценты пола матери.^[12][13] Кроме того, это было связано с Острая жировая дистрофия печени при беременности (AFLP) болезнь.^[14]

С клинической точки зрения HADHA также может быть полезным маркером для прогнозирования устойчивости к определенным типам химиотерапия у пациентов с рак легких.^[15]

Взаимодействия

Было показано, что HADHA имеет 142 двоичных файла. белок-белковые взаимодействия включая 117 сопряженных взаимодействий. ХАДА, кажется, взаимодействует с ГАБАРАП, MAP1LC3B, TRAF6, ГАБАРАПЛ2, ГАБАРАПЛ1, ГАСТ, BCAR3, EPB41, TNFRSF1A, HLA-B, NFKB2, MAP3K1, ИКБКЕ, ПРКАБ1, РИПК3, CD74, NR4A1, cdsA, mtaD, ATXN2L, ABCF2, и MAPK3.^[16]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000084754 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025745 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: гидроксиацил-КоА дегидрогеназа / 3-кетоацил-КоА тиолаза / еноил-КоА гидратаза (трифункциональный белок), альфа-субъединица».
6. Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J , Дуан Х., Улен М., Йейтс Дж. Р., Апвейлер Р., Ге Дж., Хермякоб Х., Пинг П. (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии кардиального протеома и медицины посредством специализированной базы знаний». Циркуляционные исследования. 113 (9): 1043–53. Дои:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. ЧВК  4076475. PMID  23965338.
7. «гидроксиацил-КоА дегидрогеназа / 3-кетоацил-КоА тиолаза / еноил-КоА гидратаза (трифункциональный белок), альфа-субъединица». Атлас кардиоорганических белков (COPaKB).
8. Карпентер К., Поллитт Р.Дж., Миддлтон Б. (март 1992 г.). «Длинноцепочечная 3-гидроксиацил-кофермент А-дегидрогеназа печени человека представляет собой многофункциональный мембраносвязанный фермент бета-окисления митохондрий». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 183 (2): 443–8. Дои:10.1016 / 0006-291х (92) 90501-б. PMID  1550553.
9. Voet DJ, Voet JG, Pratt CW (2010). «Глава 18, Митохондриальный синтез АТФ». Принципы биохимии (4-е изд.). Вайли. п. 669. ISBN  978-0-470-23396-2.
10. IJlst L, Ruiter JP, Hoovers JM, Jakobs ME, Wanders RJ (август 1996). «Распространенная миссенс-мутация G1528C при дефиците длинноцепочечной 3-гидроксиацил-КоА дегидрогеназы. Характеристика и экспрессия мутантного белка, анализ мутаций в геномной ДНК и хромосомная локализация гена альфа-субъединицы митохондриального трифункционального белка». Журнал клинических исследований. 98 (4): 1028–33. Дои:10.1172 / jci118863. ЧВК  507519. PMID  8770876.
11. Rocchiccioli F, Wanders RJ, Aubourg P, Vianey-Liaud C, Ijlst L, Fabre M, Cartier N, Bougneres PF (декабрь 1990 г.). «Дефицит длинноцепочечной 3-гидроксиацил-КоА дегидрогеназы: причина летальной миопатии и кардиомиопатии в раннем детстве». Педиатрические исследования. 28 (6): 657–62. Дои:10.1203/00006450-199012000-00023. PMID  2284166.
12. Ракхеджа Д., Беннетт М.Дж., Роджерс Б.Б. (июль 2002 г.). "Длинноцепочечный L-3-гидроксиацил-кофермент дегидрогеназы дефицит: молекулярный и биохимический обзор". Лабораторные исследования; Журнал технических методов и патологии. 82 (7): 815–24. Дои:10.1097 / 01.lab.0000021175.50201.46. PMID  12118083.
13. Гриффин А.С., Штраус А.В., Беннетт М.Дж., Эрнст Л.М. (сентябрь – октябрь 2012 г.). «Мутации в длинноцепочечном 3-гидроксиацил-коферменте дегидрогеназе связаны с инфарктом материнского дна плаценты / массивным отложением перивиллярного фибрина». Детская патология и патология развития. 15 (5): 368–74. Дои:10.2350 / 12-05-1198-oa.1. PMID  22746996. S2CID  38407420.
14. Ибдах Дж. А., Ян З., Беннетт М. Дж. (Сентябрь – октябрь 2000 г.). «Заболевания печени при беременности и дефекты окисления жирных кислот у плода». Молекулярная генетика и метаболизм. 71 (1–2): 182–9. Дои:10.1006 / мг.2000.3065. PMID  11001809.
15. Кагеяма Т., Нагасио Р., Рюге С., Мацумото Т., Иёда А., Сато И., Масуда Н., Цзян С. X., Саегуса М., Сато Ю. (2011). «HADHA является потенциальным предиктором ответа на химиотерапию на основе платины при раке легких». Азиатско-Тихоокеанский журнал профилактики рака. 12 (12): 3457–63. PMID  22471497.
16. «142 бинарных взаимодействия найдено по запросу HADHA». База данных по молекулярным взаимодействиям IntAct. EMBL-EBI. Получено 2018-08-25.

дальнейшее чтение

• Ракхеджа Д., Беннетт М.Дж., Роджерс Б.Б. (июль 2002 г.). "Длинноцепочечный L-3-гидроксиацил-кофермент дегидрогеназы дефицит: молекулярный и биохимический обзор". Лабораторные исследования. 82 (7): 815–24. Дои:10.1097 / 01.lab.0000021175.50201.46. PMID  12118083.
• Айзекс Дж. Д., Симс Х. Ф., Пауэлл К. К., Беннетт М. Дж., Хейл, Д. Д., Трим, В. Р., Штраус, А. В. (сентябрь 1996 г.). «Острая жировая дистрофия печени у матери при беременности, связанная с дефицитом трифункционального белка плода: молекулярная характеристика нового мутантного аллеля матери». Педиатрические исследования. 40 (3): 393–8. Дои:10.1203/00006450-199609000-00005. PMID  8865274.
• Джиллингем МБ, Матерн Д., Хардинг, Колорадо (октябрь 2009 г.). «Влияние кормления, физических упражнений и генотипа на 3-гидроксиацилкарнитины плазмы у детей с дефицитом ИЧАД». Темы клинического питания. 24 (4): 359–365. Дои:10.1097 / ИНН.0b013e3181c62182. ЧВК  2892921. PMID  20589231.
• Милевска М., Макредмонд Дж., Бирн П.С. (ноябрь 2009 г.). «Идентификация новых спартин-интеракторов показывает, что спартин является многофункциональным белком». Журнал нейрохимии. 111 (4): 1022–30. Дои:10.1111 / j.1471-4159.2009.06382.x. PMID  19765186. S2CID  205621232.
• Уикес Дж., Моррисон К., Маллен А., Уэйт Р., Бартон П., Данн М.Дж. (февраль 2003 г.). «Гиперубиквитинирование белков при дилатационной кардиомиопатии». Протеомика. 3 (2): 208–16. Дои:10.1002 / pmic.200390029. PMID  12601813. S2CID  19874662.
• Богенхаген Д.Ф., Руссо Д., Берк С. (февраль 2008 г.). «Слоистая структура нуклеоидов митохондриальной ДНК человека». Журнал биологической химии. 283 (6): 3665–75. Дои:10.1074 / jbc.M708444200. PMID  18063578.
• Чжан QX, Болдуин GS (октябрь 1994 г.). «Структуры человеческой кДНК и гена, кодирующего 78 кДа гастрин-связывающего белка и родственного псевдогена». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Структура и экспрессия гена. 1219 (2): 567–75. Дои:10.1016/0167-4781(94)90091-4. PMID  7918661.
• IJlst L, Oostheim W., Ruiter JP, Wanders RJ (июль 1997 г.). «Молекулярные основы дефицита длинноцепочечной 3-гидроксиацил-КоА дегидрогеназы: выявление двух новых мутаций». Журнал наследственных метаболических заболеваний. 20 (3): 420–2. Дои:10.1023 / А: 1005310903004. PMID  9266371. S2CID  23046057.
• Яги М., Ли Т., Авано Х., Цудзи М., Таджима Дж., Кобаяши Х., Хасэгава Ю., Ямагути С., Такешима Ю., Мацуо М. (декабрь 2011 г.). «Пациент с митохондриальной трифункциональной недостаточностью белка из-за мутаций в гене HADHB показал рецидивирующую миалгию с раннего детства и был диагностирован в подростковом возрасте». Молекулярная генетика и метаболизм. 104 (4): 556–9. Дои:10.1016 / j.ymgme.2011.09.025. PMID  22000755.

внешняя ссылка

• PDBe-KB предоставляет обзор всей структурной информации, доступной в PDB для субъединицы альфа-митохондриального трифункционального фермента человека (HADHA)

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.