Длинноцепочечная альдегиддегидрогеназа - Long-chain-aldehyde dehydrogenase

ALDH3A2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4QGK
Идентификаторы
Псевдонимы	ALDH3A2, семейство альдегиддегидрогеназ 3, член A2, ALDH10, FALDH, SLS, член семейства альдегиддегидрогеназ 3 A2
Внешние идентификаторы	OMIM: 609523 MGI: 1353452 ГомолоГен: 55458 Генные карты: ALDH3A2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 17 (человек)[1] Группа 17p11.2 Начинать 19,648,136 бп[1] Конец 19,685,760 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 B2 | 11 37,96 см Начинать 61,223,417 бп[2] Конец 61,267,464 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • активность длинноцепочечной альдегиддегидрогеназы • активность оксидазы длинноцепочечного спирта • активность среднецепочечной альдегиддегидрогеназы • оксидоредуктазная активность • активность альдегиддегидрогеназы (НАД) • оксидоредуктазная активность, действующая на альдегидную или оксогруппу доноров, НАД или НАДФ в качестве акцептора • GO: 0001948 связывание с белками • активность гомодимеризации белков • глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназа (НАД +) (нефосфорилирующая) активность • Активность 3-хлораллилальдегиддегидрогеназы Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • мембрана эндоплазматического ретикулума • мембрана • внутриклеточная мембраносвязанная органелла • пероксисома • эндоплазматический ретикулум • пероксисомальная мембрана • мембрана органеллы Биологический процесс • развитие периферической нервной системы • сесквитерпеноидный метаболический процесс • фитоловый метаболический процесс • процесс биосинтеза сфинголипидов • клеточный процесс метаболизма альдегидов • развитие центральной нервной системы • развитие эпидермиса • метаболизм • окислительно-восстановительный процесс • альфа-окисление жирных кислот • гексадеканальный метаболический процесс • липидный обмен • метаболический процесс жирных кислот Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	224	11671
Ансамбль	ENSG00000072210	ENSMUSG00000010025
UniProt	P51648	P47740
RefSeq (мРНК)	NM_000382 NM_001031806 NM_001369136 NM_001369137 NM_001369138 NM_001369139 NM_001369146 NM_001369148	NM_007437 NM_001331114 NM_001331115
RefSeq (белок)	NP_000373 NP_001026976 NP_001356065 NP_001356066 NP_001356067 NP_001356068 NP_001356075 NP_001356077	NP_001318043 NP_001318044 NP_031463
Расположение (UCSC)	Chr 17: 19.65 - 19.69 Мб	Chr 11: 61,22 - 61,27 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Жирный альдегиддегидрогеназа (или же Длинноцепочечная альдегиддегидрогеназа) является альдегиддегидрогеназа фермент, который у человека кодируется геном ALDH3A2 на хромосоме 17. Альдегиддегидрогеназа ферменты действуют, чтобы удалить токсичные альдегиды которые образуются в результате метаболизма алкоголя и перекисного окисления липидов.

Структура

ALDH3A2 принадлежит к альдегиддегидрогеназа надсемейство и представляет собой ассоциированный с мембраной белок, обычно содержащий 485 остатков. Зрелый белок функционирует как димер. Структуру разрешили с помощью рентгеновской кристаллографии с разрешением 2,1 ангстрем. Он содержит элемент в С-концевой области, называемый спиралью «привратника», который примыкает к закрепленному на мембране трансмембранному домену и каталитическому ядру. Спираль привратника, по-видимому, контролирует доступ молекулярных субстратов к каталитическому ядру и обеспечивает эффективный переход между мембранами и каталитическими центрами.^[5]

Функция

ALDH3A2 катализирует окисление длинноцепочечных алифатических альдегидов в жирные кислоты. Известно, что он действует на множество насыщенных и ненасыщенных алифатических альдегидов с длиной от 6 до 24 атомов углерода, а также на дигидрофитал, 20-углеродный альдегид с разветвленной цепью.^[6] Это требует НАД + как кофактор. Закодированный фермент отвечает за преобразование сфингозин-1-фосфат (S1P) продукт разложения гексадеценовой кислоты до гексадеценовой кислоты. ALD3H2 экспрессируется в организме человека. печень и было обнаружено, что он локализует микросома фракция внутри ячейки.^[7]

По меньшей мере, два альтернативное сращивание известны изоформы ALDH3A2. Альтернативный транскрипт отличается дополнительным экзоном и якорями по-разному в эндоплазматическом ретикулуме по сравнению с пероксисомой. ^[8]

Клиническое значение

Мутации и делеции гена ALDH3A2 широко связаны с аутосомно-рецессивным Синдром Шегрена-Ларссона, аутосомно-рецессивный кожно-нервные заболевания.^[9] Множественные мутации были обнаружены в разных семьях, включая те, которые молекулярно нарушают интерфейс димеризации белков или уменьшают мРНК стабильность. Известно, что отсутствие или недостаточность белковых продуктов ALDH3A2 в мутантных клетках вызывает аномальный метаболизм сфингозин-1-фосфата в эфир-связанный глицеролипиды и аномальное накопление предшественников липидов.

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000072210 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000010025 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Келлер М.А., Цандер У., Фукс Дж. Э., Кройц С., Ватчингер К., Мюллер Т., Гольдерер Г., Лидл К. Р., Ральсер М., Кройтлер Б., Вернер Э. Р., Маркес Дж. А. (2014). «Спираль привратника определяет субстратную специфичность фермента синдрома Шегрена-Ларссона жирно-альдегиддегидрогеназы». Nat Commun. 5: 4439. Дои:10.1038 / ncomms5439. ЧВК  4109017. PMID  25047030.
6. Келсон Т.Л., Секор Маквой-младший, Риццо В.Б. (1997). «Жирная альдегиддегидрогеназа печени человека: микросомальная локализация, очистка и биохимическая характеристика». Биохим. Биофиз. Acta. 1335 (1–2): 99–110. Дои:10.1016 / с0304-4165 (96) 00126-2. PMID  9133646.
7. Келсон Т.Л., Секор Маквой-младший, Риццо В.Б. (1997). «Жирная альдегиддегидрогеназа печени человека: микросомальная локализация, очистка и биохимическая характеристика». Биохим. Биофиз. Acta. 1335 (1–2): 99–110. Дои:10.1016 / с0304-4165 (96) 00126-2. PMID  9133646.
8. Роджерс Г.Р., Маркова Н.Г., Де Лаурензи В., Риццо В.Б., Комптон Дж. Г. (1997). «Геномная организация и экспрессия гена жирной альдегиддегидрогеназы человека (FALDH)». Геномика. 39 (2): 127–35. Дои:10.1006 / geno.1996.4501. PMID  9027499.
9. Накахара К., Окуни А., Китамура Т., Абэ К., Наганума Т., Оно Й., Зеллер Р.А., Кихара А. (2012). «Ген синдрома Шегрена-Ларссона кодирует гексадеценальную дегидрогеназу пути деградации сфингозин-1-фосфата». Мол. Клетка. 46 (4): 461–71. Дои:10.1016 / j.molcel.2012.04.033. PMID  22633490.

дальнейшее чтение

• длинноцепочечный альдегид + дегидрогеназа в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)