ALDH3B1 - ALDH3B1

ALDH3B1
Идентификаторы
ПсевдонимыALDH3B1, ALDH4, ALDH7, член семейства альдегиддегидрогеназы 3 B1
Внешние идентификаторыOMIM: 600466 MGI: 1914939 ГомолоГен: 73890 Генные карты: ALDH3B1
Расположение гена (человек)
Хромосома 11 (человек)
Chr.Хромосома 11 (человек)[1]
Хромосома 11 (человек)
Геномное расположение ALDH3B1
Геномное расположение ALDH3B1
Группа11q13.2Начинать68,008,578 бп[1]
Конец68,029,282 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001290059
NM_000694
NM_001030010
NM_001161473
NM_001290058

NM_026316

RefSeq (белок)

NP_000685
NP_001025181
NP_001154945
NP_001276987
NP_001276988

NP_080592

Расположение (UCSC)Chr 11: 68.01 - 68.03 МбChr 19: 3.91 - 3.93 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Семейство альдегиддегидрогеназ 3, член B1 также известный как ALDH3B1 является фермент что у людей кодируется ALDH3B1 ген.[5][6]

Функция

В альдегиддегидрогеназы представляют собой семейство изоферментов, которые могут играть важную роль в детоксикации альдегидов, образующихся в результате метаболизма алкоголя и перекисного окисления липидов. Этот конкретный ген занимает около 20 т.п.н. геномной ДНК и состоит из 9 кодирующих экзонов. Ген кодирует единственный транскрипт размером 2,8 т.п.н., который высоко экспрессируется в почках и легких. Функциональное значение этого гена и клеточная локализация его продукта в настоящее время неизвестны. Для этого гена были обнаружены два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы.[7]

Модельные организмы

Модельные организмы были использованы при изучении функции ALDH3B1. Условный нокаутирующая мышь линия называется Aldh3b1tm1b (EUCOMM) Wtsi был создан на Wellcome Trust Sanger Institute.[8] Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг[9] для определения последствий удаления.[10][11][12][13] Проведены дополнительные проверки: - Углубленное иммунологическое фенотипирование[14] - углубленное фенотипирование костей и хрящей[15]

Aldh3b1 нокаутный фенотип мыши
ХарактеристикаФенотип
Все данные доступны на сайте.[9][14][15]
Лейкоциты периферической крови 6 недельНормальный
Гематология 6 недельНормальный
ИнсулинНормальный
Гомозиготная жизнеспособность на P14Аномальный
Гомозиготная фертильностьНормальный
Масса телаНормальный
Неврологический осмотрНормальный
Сила захватаНормальный
ДисморфологияНормальный
Косвенная калориметрияНормальный
Тест толерантности к глюкозеНормальный
Слуховой ответ ствола мозгаНормальный
DEXAНормальный
РентгенографияНормальный
Морфология глазаНормальный
Клиническая химияНормальный
Гематология 16 недельНормальный
Лейкоциты периферической крови 16 недельНормальный
Вес сердцаНормальный
Сальмонелла инфекционное заболеваниеНормальный
Функция цитотоксических Т-клетокНормальный
Состав эпидермального иммунитетаНормальный

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000006534 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024885 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Сюй Л.К., Чанг В.К., Ёсида А. (декабрь 1994 г.). «Клонирование кДНК, кодирующей человеческий ALDH7, новый член семейства альдегиддегидрогеназ». Ген. 151 (1–2): 285–9. Дои:10.1016/0378-1119(94)90672-6. PMID  7828891.
  6. ^ Сюй Л.К., Чанг В.К., Ёсида А. (апрель 1997 г.). «Гены альдегиддегидрогеназы человека, ALDH7 и ALDH8: геномная организация и сравнение структуры генов». Ген. 189 (1): 89–94. Дои:10.1016 / S0378-1119 (96) 00839-6. PMID  9161417.
  7. ^ «Энтрез Ген: ALDH3B1».
  8. ^ Гердин А.К. (2010). «Программа генетики мыши Сэнгера: характеристика мышей с высокой пропускной способностью». Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID  85911512.
  9. ^ а б «Международный консорциум по фенотипированию мышей».
  10. ^ Скарнес В.К., Розен Б., Вест А.П., Кутсуракис М., Бушелл В., Айер В., Мухика А.О., Томас М., Харроу Дж., Кокс Т., Джексон Д., Северин Дж., Биггс П., Фу Дж., Нефедов М., де Йонг П.Дж., Стюарт AF, Брэдли А. (июнь 2011 г.). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–42. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК  3572410. PMID  21677750.
  11. ^ Долгин Э (июнь 2011 г.). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
  12. ^ Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (январь 2007 г.). «Мышь по всем причинам». Клетка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247. S2CID  18872015.
  13. ^ White JK, Gerdin AK, Karp NA, Ryder E, Buljan M, Bussell JN, Salisbury J, Clare S, Ingham NJ, Podrini C, Houghton R, Estabel J, Bottomley JR, Melvin DG, Sunter D, Adams NC, Sanger Institute Проект генетики мышей, Таннахилл Д., Логан Д.В., Макартур Д.Г., Флинт Дж., Махаджан В.Б., Цанг С.Х., Смит I, Ватт FM, Скарнес В.К., Дуган Джи, Адамс DJ, Рамирес-Солис Р., Брэдли А., Сталь КП (2013) . «Полногеномное поколение и систематическое фенотипирование мышей с нокаутом открывает новые роли для многих генов». Клетка. 154 (2): 452–64. Дои:10.1016 / j.cell.2013.06.022. ЧВК  3717207. PMID  23870131.
  14. ^ а б «Консорциум иммунофенотипирования инфекций и иммунитета (3i)».
  15. ^ а б «Консорциум OBCD».

внешняя ссылка

дальнейшее чтение

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.