L2HGDH - L2HGDH

L2HGDH
Идентификаторы
Псевдонимы	L2HGDH, C14orf160, L2HGA, L-2-гидроксиглутаратдегидрогеназа
Внешние идентификаторы	OMIM: 609584 MGI: 2384968 ГомолоГен: 11767 Генные карты: L2HGDH
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 14 (человек)[1] Группа 14q21.3 Начинать 50,237,563 бп[1] Конец 50,312,229 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 12 (мышь)[2] Группа 12 | 12 C2 Начинать 69,690,433 бп[2] Конец 69,724,873 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • оксидоредуктазная активность • 2-гидроксиглутаратдегидрогеназная активность • (S) оксидазная активность -2-гидроксикислоты Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • митохондриальная внутренняя мембрана • митохондрия • неотъемлемый компонент внутренней митохондриальной мембраны Биологический процесс • метаболический процесс клеточного белка • окислительно-восстановительный процесс • Метаболический процесс 2-оксоглутарата Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	79944	217666
Ансамбль	ENSG00000087299	ENSMUSG00000020988
UniProt	Q9H9P8	Q91YP0
RefSeq (мРНК)	NM_024884	NM_145443
RefSeq (белок)	NP_079160	NP_663418
Расположение (UCSC)	Chr 14: 50.24 - 50.31 Мб	Chr 12: 69.69 - 69.72 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

L-2-гидроксиглутаратдегидрогеназа, митохондриальная является фермент что у людей кодируется L2HGDH ген, также известный как C14orf160, на хромосома 14.^[5][6]

Функция

Этот ген кодирует L-2-гидроксиглутаратдегидрогеназу, a флавинаденин динуклеотид (FAD) -зависимый фермент, окисляющий L-2-гидроксиглутарат в альфа-кетоглутарат в различных тканях млекопитающих. Мутации в этом гене вызывают L-2-гидроксиглутаровая ацидурия, редкое аутосомно-рецессивное нейрометаболическое заболевание, приводящее к умственной отсталости от средней до тяжелой степени.^[6]

L2HGDH кодирует белок размером 50 кДа. Белок L2HGDH содержит митохондриально-направленный транзитный пептид^[7] и локализован на митохондриальная внутренняя мембрана внутри митохондрии внутри клетки. Белок L2HGDH катализирует следующую реакцию и требует флавинаденин динуклеотид (FAD) как кофактор:

(S) -2-гидроксиглутарат + акцептор = 2-оксоглутарат + восстановленный акцептор.^[5]

L-2-гидроксиглутарат производится беспорядочные связи из малатдегидрогеназа на 2-оксоглутарат; белок L2HGDH, таким образом, является примером восстановление метаболитов фермент, потому что он снова превращает бесполезный продукт повреждения L-2-гидроксиглутарат обратно в 2-оксоглутарат.

Клиническое значение

Мутации в гене L2HGDH вызывают L-2-гидроксиглутаровая ацидурия, редкий аутосомно-рецессивный нейрометаболическое расстройство. У лиц с мутациями L2HGDH наблюдается токсическое накопление высокой концентрации L-2-гидроксиглутаровая кислота в плазма и спинномозговая жидкость.^[8] У пациентов было обнаружено не менее 70 болезнетворных вариантов гена L2HGDH.^[9] Пациенты с L-2-гидроксиглутаровая ацидурия связаны с умеренным и тяжелым умственная отсталость, психомоторная отсталость, мозжечковая атаксия, макроцефалия, или же эпилепсия.^[9]

L2HGDH играет роль в опосредовании дифференцировки Т-клеток через свою активность в отношении S-2HG.^[10]

Молекулярные взаимодействия

KLK10^[11]

Смотрите также

• D2HGDH
• 2-гидроксиглутаратсинтаза
• 2-гидроксиглутарат дегидрогеназа
• Гидроксикислота-оксикислота трансгидрогеназа

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000087299 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020988 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Рзем Р., Ван Шафтинген Э., Вейга-да-Кунья М. (январь 2006 г.). «Ген, мутировавший в 1-2-гидроксиглутаровую ацидурию, кодирует 1-2-гидроксиглутаратдегидрогеназу». Биохимия. 88 (1): 113–116. Дои:10.1016 / j.biochi.2005.06.005. PMID  16005139.
6. «Ген Entrez: L2HGDH L-2-гидроксиглутаратдегидрогеназа».
7. «L2HGDH - L-2-гидроксиглутаратдегидрогеназа, митохондриальный предшественник - Homo sapiens (человек) - ген и белок L2HGDH». www.uniprot.org.
8. Вилариньо Л., Тафуло С., Сибилио М., Кок Ф., Фонтана Ф, Диого Л., Венансио М., Феррейра М., Ногейра С., Валонго С., Паренти Дж., Аморим А., Азеведо Л. (январь 2010 г.). «Выявление новых мутаций гена L2HGDH и обновление патологического спектра». Журнал генетики человека. 55 (1): 55–8. Дои:10.1038 / jhg.2009.110. PMID  19911013.
9. Steenweg ME, Jakobs C, Errami A, van Dooren SJ, Adeva Bartolomé MT, Aerssens P и др. (Апрель 2010 г.). «Обзор вариантов гена L-2-гидроксиглутаратдегидрогеназы (L2HGDH): исследование генотипа-фенотипа». Человеческая мутация. 31 (4): 380–90. Дои:10.1002 / humu.21197. PMID  20052767.
10. Tyrakis PA, Palazon A, Macias D, Lee KL, Phan AT, Veliça P, You J, Chia GS, Sim J, Doedens A, Abelanet A, Evans CE, Griffiths JR, Poellinger L, Goldrath AW, Johnson RS (декабрь 2016 г.) ). «S-2-гидроксиглутарат регулирует судьбу CD8 + Т-лимфоцитов». Природа. 540 (7632): 236–241. Дои:10.1038 / природа20165. ЧВК  5149074. PMID  27798602.
11. Huttlin EL, Ting L, Bruckner RJ, Gebreab F, Gygi MP, Szpyt J, et al. (Июль 2015). "Сеть BioPlex: систематическое исследование человеческого взаимодействия". Клетка. 162 (2): 425–40. Дои:10.1016 / j.cell.2015.06.043. ЧВК  4617211. PMID  26186194.

дальнейшее чтение

• Duran M, Kamerling JP, Bakker HD, van Gennip AH, Wadman SK (1981). «L-2-гидроксиглутаровая ацидурия: врожденная ошибка метаболизма?». Журнал наследственных метаболических заболеваний. 3 (4): 109–12. Дои:10.1007 / BF02312543. PMID  6787330.
• Янсен Г.А., Вандерс Р.Дж. (ноябрь 1993 г.). «L-2-гидроксиглутаратдегидрогеназа: определение активности нового фермента в печени крыс и человека. Влияние на L-2-гидроксиглутаровую ацидемию». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Молекулярная основа болезни. 1225 (1): 53–6. Дои:10.1016 / 0925-4439 (93) 90121-г. PMID  8241290.
• Topçu M, Jobard F, Halliez S, Coskun T., Yalçinkayal C, Gerceker FO, Wanders RJ, Prud'homme JF, Lathrop M, Ozguc M, Fischer J (ноябрь 2004 г.). «L-2-гидроксиглутаровая ацидурия: идентификация мутантного гена C14orf160, локализованного на хромосоме 14q22.1». Молекулярная генетика человека. 13 (22): 2803–11. Дои:10,1093 / hmg / ddh300. PMID  15385440.
• Rzem R, Veiga-da-Cunha M, Noël G, Goffette S, Nassogne MC, Tabarki B, Schöller C, Marquardt T., Vikkula M, Van Schaftingen E (ноябрь 2004 г.). «Ген, кодирующий предполагаемую FAD-зависимую L-2-гидроксиглутаратдегидрогеназу, мутирован в L-2-гидроксиглутаровую ацидурию». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 101 (48): 16849–54. Дои:10.1073 / pnas.0404840101. ЧВК  534725. PMID  15548604.
• Вилариньо Л., Кардосо М.Л., Гаспар П., Барбот С., Азеведо Л., Диого Л., Сантос М., Каррильо I, Финеза I, Кок Ф, Чорао Р., Алегрия П., Мартинс Е., Тейшейра Дж., Кабрал Фернандес Х, Верховен Н. GS, Santorelli FM, Кабрал П., Аморим А., Якобс С. (октябрь 2005 г.). «Новые мутации L2HGDH у 21 пациента с L-2-гидроксиглутаровой ацидурией португальского происхождения». Человеческая мутация. 26 (4): 395–6. Дои:10.1002 / humu.9373. PMID  16134148.
• Струйс Е.А., Гибсон К.М., Якобс К. (октябрь 2007 г.). «Новое понимание L-2-гидроксиглутаровой ацидурии: исследования массовых изотопомеров показывают, что 2-оксоглутаровая кислота является метаболическим предшественником L-2-гидроксиглутаровой кислоты». Журнал наследственных метаболических заболеваний. 30 (5): 690–3. Дои:10.1007 / s10545-007-0697-5. PMID  17876720.