Фосфоглюконатдегидрогеназа - Phosphogluconate dehydrogenase

6ПГД
PDB 1pgq EBI.jpg
Кристаллографическая структура комплекса 6-фосфоглюконатдегидрогеназы овцы с аденозин-2'-монофосфатом.[1]
Идентификаторы
Символ6ПГД
PfamPF00393
Pfam кланCL0106
ИнтерПроIPR006114
PROSITEPDOC00390
SCOP22pgd / Объем / СУПФАМ
Фосфоглюконатдегидрогеназа
Идентификаторы
Номер ЕС1.1.1.44
Количество CAS9001-82-5
Базы данных
IntEnzПросмотр IntEnz
БРЕНДАBRENDA запись
ExPASyПросмотр NiceZyme
КЕГГЗапись в KEGG
MetaCycметаболический путь
ПРИАМпрофиль
PDB структурыRCSB PDB PDBe PDBsum
Генная онтологияAmiGO / QuickGO
фосфоглюконатдегидрогеназа
Идентификаторы
СимволPGD
Ген NCBI5226
HGNC8891
OMIM172200
RefSeqNM_002631
UniProtP52209
Прочие данные
Номер ЕС1.1.1.44
LocusChr. 1 p36.3-36.13

6-фосфоглюконатдегидрогеназа (6ПГД) является фермент в пентозофосфатный путь. Он образует рибулоза 5-фосфат от 6-фосфоглюконат:

6-фосфо-D-глюконат + НАД (Ф)+ 6-фосфо-2-дегидро-D-глюконат + НАД (Ф) Н + Н+

Это окислительная карбоксилаза, которая катализирует декарбоксилирование сокращение из 6-фосфоглюконат в рибулоза 5-фосфат в присутствии НАДФ. Эта реакция является составной частью гексоза монофосфатный шунт и пентозофосфатные пути (ППС).[2][3] Прокариотический и эукариотический 6ПГД белки из около 470 аминокислоты чья последовательности находятся очень консервативный.[4] Белок - это гомодимер в которой мономеры действовать самостоятельно:[3] каждый содержит большой, в основном альфа-спиральный домен и меньший бета-альфа-бета-домен, содержащий смешанные параллельные и антипараллельные 6-цепочечные бета-лист.[3] НАДФ связан с расщелиной в небольшом домене, субстрат привязка в соседнем кармане.[3]

Клиническое значение

Мутации в гене, кодирующем этот фермент, приводят к Дефицит 6-фосфоглюконатдегидрогеназы, аутосомный наследственное заболевание, поражающее эритроциты.

Как возможная мишень для лекарства

6PGD участвует в метаболизме раковых клеток, поэтому ведутся поиски ингибиторов 6PGD.[5]

Смотрите также

использованная литература

  1. ^ PDB: 1PGQ​; Адамс MJ, Эллис GH, Говер S, Нейлор CE, Филлипс C (июль 1994). «Кристаллографическое исследование связывания кофермента, аналога кофермента и субстрата в 6-фосфоглюконатдегидрогеназе: влияние на специфичность НАДФ и механизм фермента». Структура. 2 (7): 651–68. Дои:10.1016 / s0969-2126 (00) 00066-6. PMID  7922042.
  2. ^ Broedel SE, Wolf RE (июль 1990 г.). «Генетическая маркировка, клонирование и последовательность ДНК штамма Synechococcus sp., Гена PCC 7942 (gnd), кодирующего 6-фосфоглюконатдегидрогеназу». J. Bacteriol. 172 (7): 4023–31. Дои:10.1128 / jb.172.7.4023-4031.1990. ЧВК  213388. PMID  2113917.
  3. ^ а б c d Адамс М.Дж., Арчибальд И.Г., Багг С.Е., Карне А., Говер С., Хеллиуэлл Дж. Р., Пикерсгилл Р. В., Уайт-SW (1983). «Трехмерная структура 6-фосфоглюконатдегидрогеназы печени барана при разрешении 2,6 A». EMBO J. 2 (6): 1009–14. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1983.tb01535.x. ЧВК  555222. PMID  6641716.
  4. ^ Reizer A, Deutscher J, Saier MH, Reizer J (май 1991 г.). «Анализ оперона глюконата (gnt) Bacillus subtilis». Мол. Микробиол. 5 (5): 1081–9. Дои:10.1111 / j.1365-2958.1991.tb01880.x. PMID  1659648.
  5. ^ 6-Фосфоглюконатдегидрогеназа связывает окислительный PPP, липогенез и рост опухоли путем ингибирования передачи сигналов LKB1-AMPK. 2015 г.
  • Фрэмптон EW, Вуд WA (1961). «Окисление углеводов Pseudomonas fluorescens VI. Превращение 2-кето-6-фосфоглюконата в пируват ». J. Biol. Chem. 236: 2571–2577. PMID  13894458.
Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и ИнтерПро: IPR006114