Протеолиз - Proteolysis
Протеолиз это распад белки на меньшие полипептиды или аминокислоты. Некатализированный, гидролиз из пептидные связи происходит очень медленно и занимает сотни лет. Протеолиз обычно катализированный по сотовой связи ферменты называется протеазы, но также может происходить при внутримолекулярном пищеварении. Низкий pH или высокие температуры также могут вызывать неферментативный протеолиз.
Протеолиз в организмах служит многим целям; Например, пищеварительные ферменты расщепляют белки в пище, чтобы обеспечить организм аминокислотами, в то время как протеолитическая обработка полипептидной цепи после ее синтеза может быть необходима для производства активного белка. Это также важно для регуляции некоторых физиологических и клеточных процессов, а также для предотвращения накопления нежелательных или аномальных белков в клетках. Следовательно, нарушение регуляции протеолиза может вызвать заболевание. Протеолиз используется некоторыми яды.
Протеолиз важен как аналитический инструмент для изучения белков в лаборатории, а также в промышленных условиях, например, при переработке пищевых продуктов и удалении пятен.
Биологические функции
Посттрансляционный протеолитический процессинг
Ограниченный протеолиз полипептида во время или после перевод в синтез белка часто встречается у многих белков. Это может включать удаление N-концевой метионин, сигнальный пептид и / или превращение неактивного или нефункционального белка в активный. Предшественник окончательной функциональной формы белка называется пропротеин, и эти пропротеины могут быть сначала синтезированы как препропротеины. Например, альбумин сначала синтезируется как препроальбумин и содержит нерасщепленный сигнальный пептид. Это образует проальбумин после отщепления сигнального пептида, и дальнейшая обработка для удаления пропептида с 6 N-концевыми остатками дает зрелую форму белка.[1]
Удаление N-концевого метионина
Инициирующий метионин (а у прокариот - fMet ) может быть удален во время трансляции растущего белка. За Кишечная палочка, fMet эффективно удаляется, если второй остаток небольшой и незаряженный, но не, если второй остаток является объемным и заряженным.[2] В обоих прокариоты и эукариоты, экспонированный N-концевой остаток может определять период полужизни белка в соответствии с N-конец правило.
Удаление сигнальной последовательности
Белки, которые должны быть нацелены на конкретную органеллу или для секреции, имеют N-концевой сигнальный пептид который направляет белок к его конечной цели. Этот сигнальный пептид удаляется протеолизом после их транспорта через мембрана.
Расщепление полипротеинов
Некоторые белки и большинство эукариотических полипептидных гормонов синтезируются в виде большого полипептида-предшественника, известного как полипротеин, который требует протеолитического расщепления на отдельные более мелкие полипептидные цепи. Полипротеин проопиомеланокортин (ПОМК) содержит много полипептидных гормонов. Однако характер расщепления POMC может варьироваться в разных тканях, давая разные наборы полипептидных гормонов из одного и того же полипротеина.
Много вирусы также продуцируют свои белки первоначально в виде единой полипептидной цепи, которая транслируется с полицистронный мРНК. Этот полипептид впоследствии расщепляется на отдельные полипептидные цепи.[1] Общие названия полипротеина включают: кляп (группоспецифический антиген ) в ретровирусы и ORF1ab в Нидовиралес. Последнее название относится к тому, что скользкая последовательность в мРНК, кодирующей полипептид, вызывает рибосомальный сдвиг рамки, что приводит к двум разным длинам пептидных цепей (а и ab) при приблизительно фиксированном соотношении.
Расщепление белков-предшественников
Многие белки и гормоны синтезируются в виде их предшественников - зимогены, проферменты, и предгормоны. Эти белки расщепляются, чтобы сформировать свои окончательные активные структуры. Инсулин, например, синтезируется как препроинсулин, что дает проинсулин после того, как сигнальный пептид был расщеплен. Затем проинсулин расщепляется в двух положениях с образованием двух полипептидных цепей, связанных двумя дисульфидные связи. Удаление двух С-концевых остатков из В-цепи затем дает зрелый инсулин. Сворачивание белков происходит в одноцепочечной форме проинсулина, которая способствует образованию в конечном итоге межпептидных дисульфидных связей и, в конечном итоге, внутрипептидных дисульфидных связей, обнаруживаемых в нативной структуре инсулина.
В частности, протеазы синтезируются в неактивной форме, так что они могут безопасно храниться в клетках и быть готовыми к высвобождению в достаточном количестве, когда это необходимо. Это необходимо для того, чтобы протеаза активировалась только в правильном месте или контексте, поскольку неправильная активация этих протеаз может быть очень разрушительной для организма. Протеолиз зимогена дает активный белок; например, когда трипсиноген раскалывается на форму трипсин происходит небольшая перестройка белковой структуры, которая дополняет активный центр протеазы, тем самым активируя белок.
Следовательно, протеолиз может быть методом регулирования биологических процессов путем превращения неактивных белков в активные. Хорошим примером является каскад свертывания крови при этом начальное событие запускает каскад последовательной протеолитической активации многих специфических протеаз, что приводит к свертыванию крови. В система комплемента из иммунная реакция также включает в себя сложную последовательную протеолитическую активацию и взаимодействие, которые приводят к атаке вторгающихся патогенов.
Деградация белков
Расщепление белка может происходить внутриклеточно или внеклеточно. При переваривании пищи пищеварительные ферменты могут выделяться в окружающую среду для внеклеточное пищеварение посредством чего протеолитическое расщепление расщепляет белки на более мелкие пептиды и аминокислоты, так что они могут абсорбироваться и использоваться. У животных пища может обрабатываться внеклеточно в специализированных органы или кишки, но у многих бактерий пища может усваиваться через фагоцитоз. Микробное разложение белка в окружающей среде можно регулировать доступностью питательных веществ. Например, ограничение основных элементов в белках (углерод, азот и сера) вызывает протеолитическую активность гриба. Neurospora crassa[3] а также в сообществах почвенных организмов.[4]
Белки в клетках расщепляются на аминокислоты. Это внутриклеточное разложение белка выполняет несколько функций: оно удаляет поврежденный и аномальный белок и предотвращает их накопление. Он также служит для регулирования клеточных процессов, удаляя ферменты и регуляторные белки, которые больше не нужны. Затем аминокислоты можно повторно использовать для синтеза белка.
Лизосома и протеасома
Внутриклеточная деградация белка может быть достигнута двумя способами - протеолизом в лизосома, или убиквитин -зависимый процесс, направленный на нежелательные белки протеасома. В аутофагия -лизосомный путь обычно является неселективным процессом, но он может стать селективным при голодании, в результате чего белки с пептидной последовательностью KFERQ или подобными селективно разрушаются. Лизосома содержит большое количество протеаз, таких как катепсины.
Опосредованный убиквитином процесс является избирательным. Белки, подверженные деградации, ковалентно связаны с убиквитином. Многие молекулы убиквитина могут быть связаны вместе с белком, предназначенным для разложения. Полиубихнированный белок нацелен на АТФ-зависимый протеазный комплекс, протеасому. Убиквитин высвобождается и используется повторно, в то время как целевой белок разрушается.
Скорость деградации внутриклеточного белка
Разные белки разлагаются с разной скоростью. Аномальные белки быстро разрушаются, тогда как скорость деградации нормальных белков может широко варьироваться в зависимости от их функций. Ферменты в важных точках метаболического контроля могут разлагаться намного быстрее, чем те ферменты, активность которых в основном постоянна при всех физиологических условиях. Один из наиболее быстро разрушающихся белков - это орнитиндекарбоксилаза, период полураспада которого составляет 11 минут. Напротив, другие белки, такие как актин и миозин имеют период полураспада месяц или более, в то время как, по сути, гемоглобин длится всю жизнь эритроцит.[5]
В N-конец правило может частично определять период полужизни белка, а белки с сегментами, богатыми пролин, глютаминовая кислота, серин, и треонин (так называемой Белки PEST ) имеют короткий период полураспада.[6] Другие факторы, предположительно влияющие на скорость разложения, включают скорость дезаминирования глутамина и аспарагин и окисление цистеин, гистидин и метионин, отсутствие стабилизирующих лигандов, присутствие присоединенных углеводных или фосфатных групп, наличие свободной α-аминогруппы, отрицательный заряд белка, а также гибкость и стабильность белка.[5] Белки с большей степенью внутреннее расстройство также имеют короткий период полураспада в клетках,[7] с неупорядоченными сегментами, которые были предложены для облегчения эффективного инициирования деградации протеасома.[8][9]
Скорость протеолиза может также зависеть от физиологического состояния организма, такого как его гормональное состояние, а также статус питания. Во время голодания скорость деградации белка увеличивается.
Пищеварение
В человеческом пищеварение, белки в пище расщепляются на более мелкие пептидные цепи пищеварительные ферменты такие как пепсин, трипсин, химотрипсин, и эластаза и в аминокислоты различными ферментами, такими как карбоксипептидаза, аминопептидаза, и дипептидаза. Необходимо расщепить белки на небольшие пептиды (трипептиды и дипептиды) и аминокислоты, чтобы они могли всасываться в кишечнике, а абсорбированные трипептиды и дипептиды также далее расщепляются на аминокислоты внутриклеточно, прежде чем они попадут в кровоток.[10] Различные ферменты имеют разную специфичность к субстрату; трипсин, например, расщепляет пептидную связь после положительно заряженного остатка (аргинин и лизин ); химотрипсин расщепляет связь после ароматического остатка (фенилаланин, тирозин, и триптофан ); эластаза расщепляет связь после небольшого неполярного остатка, такого как аланин или глицин.
Чтобы предотвратить неправильную или преждевременную активацию пищеварительных ферментов (они могут, например, вызвать самопереваривание поджелудочной железы, вызывая панкреатит ) эти ферменты секретируются в виде неактивного зимогена. Предшественник пепсин, пепсиноген, секретируется желудком и активируется только в кислой среде желудка. В поджелудочная железа секретирует предшественники ряда протеаз, таких как трипсин и химотрипсин. Зимоген трипсина - это трипсиноген, который активируется очень специфической протеазой, энтерокиназа, секретный слизистая оболочка из двенадцатиперстная кишка. После активации трипсин может также расщеплять другие трипсиногены, а также предшественники других протеаз, таких как химотрипсин и карбоксипептидаза, для их активации.
В бактериях используется аналогичная стратегия использования неактивного зимогена или презимогена. Субтилизин, который производится Bacillus subtilis, продуцируется в виде препросубтилизина и высвобождается только в том случае, если сигнальный пептид расщеплен и произошла автокаталитическая протеолитическая активация.
Сотовая регуляция
Протеолиз также участвует в регуляции многих клеточных процессов путем активации или деактивации ферментов, факторов транскрипции и рецепторов, например, в биосинтезе холестерина,[11] или опосредование передачи сигналов тромбина через рецепторы, активируемые протеазой.[12]
Некоторые ферменты в важных точках контроля метаболизма, такие как орнитиндекарбоксилаза, полностью регулируются скоростью синтеза и скоростью разложения. Другие быстро разрушающиеся белки включают белковые продукты протоонкогенов, которые играют центральную роль в регуляции роста клеток.
Регуляция клеточного цикла
Циклины представляют собой группу белков, которые активируют киназы участвует в делении клеток. Разложение циклинов - ключевой этап, который определяет выход из митоз и перейти к следующему клеточный цикл.[13] Циклины накапливаются в ходе клеточного цикла, а затем внезапно исчезают непосредственно перед анафаза митоза. Циклины удаляются через убиквитин-опосредованный протеолитический путь.
Апоптоз
Каспасы являются важной группой протеаз, участвующих в апоптоз или запрограммированная гибель клеток. Предшественники каспазы, прокаспаза, могут быть активированы протеолизом через его ассоциацию с белковым комплексом, который образует апоптосома, или гранзим B, или через рецептор смерти пути.
Автопротеолиз
Автопротеолиз происходит в некоторых белках, в результате чего пептидная связь расщепляется в самокатализирующемся внутримолекулярная реакция. В отличие от зимогены эти автопротеолитические белки участвуют в реакции «единого оборота» и не катализируют дальнейшие реакции после расщепления. Примеры включают разрыв связи Asp-Pro в подмножестве фактор фон Виллебранда домены типа D (VWD)[14][15] и Neisseria meningitidis Самостоятельная обработка домена FrpC,[16] разрыв связи Asn-Pro в Сальмонелла Белок FlhB,[17] Иерсиния Белок YscU,[18] а также расщепление связи Gly-Ser в подмножестве доменов белка спермы морского ежа, энтерокиназы и агрина (SEA).[19] В некоторых случаях автопротеолитическому расщеплению способствует конформационный штамм пептидной связи.[19]
Протеолиз и болезни
Аномальная протеолитическая активность связана со многими заболеваниями.[20] В панкреатит утечка протеаз и их преждевременная активация в поджелудочной железе приводит к самоперевариванию поджелудочная железа. Люди с сахарный диабет могут иметь повышенную лизосомальную активность, а деградация некоторых белков может значительно возрасти. Хронические воспалительные заболевания, такие как ревматоидный артрит может включать высвобождение лизосомальных ферментов во внеклеточное пространство, которые разрушают окружающие ткани. Аномальный протеолиз и образование пептидов, которые агрегируют в клетках, и их неэффективное удаление могут привести к многим возрастным неврологическим заболеваниям, таким как Альцгеймера с.[21]
Протеазы могут регулироваться антипротеазы или ингибиторы протеазы, а дисбаланс между протеазами и антипротеазами может приводить к заболеваниям, например, к разрушению тканей легких в эмфизема вызванный курение табак. Считается, что курение увеличивает нейтрофилы и макрофаги в легких, которые выделяют чрезмерное количество протеолитических ферментов, таких как эластаза, так что они больше не могут подавляться змеи такие как α1-антитрипсин, что приводит к разрушению соединительных тканей в легких. Другие протеазы и их ингибиторы также могут быть вовлечены в это заболевание, например матричные металлопротеиназы (MMP) и тканевые ингибиторы металлопротеиназ (ТИМПы).[22]
Другие заболевания, связанные с аберрантным протеолизом, включают: мышечная дистрофия, дегенеративные кожные заболевания, респираторные и желудочно-кишечные заболевания, и злокачественная опухоль.
Неферментативный протеолиз
Белковые скелеты очень стабильны в воде при нейтральном pH и комнатной температуре, хотя скорость гидролиза различных пептидных связей может варьироваться. Период полураспада пептидной связи в нормальных условиях может составлять от 7 до 350 лет, даже выше для пептидов, защищенных модифицированным концом или внутри белка.[23][24][25] Однако скорость протеолиза может быть значительно увеличена за счет экстремальных значений pH и тепла.
Сильный минеральные кислоты может легко гидролизовать пептидные связи в белке (кислотный гидролиз ). Стандартный способ гидролиза белка или пептида до составляющих его аминокислот для анализа - нагревание до 105 ° C в течение примерно 24 часов в 6M. соляная кислота.[26] Однако некоторые белки устойчивы к кислотному гидролизу. Один хорошо известный пример: рибонуклеаза А, который можно очистить обработкой сырых экстрактов горячим серная кислота так что другие белки разлагаются, а рибонуклеаза А остается нетронутой.[27]
Некоторые химические вещества вызывают протеолиз только после определенных остатков, и их можно использовать для выборочного расщепления белка на более мелкие полипептиды для лабораторного анализа.[28] Например, цианоген бромид расщепляет пептидную связь после метионин. Подобные методы могут использоваться для специального расщепления триптофанил, аспартил, цистеинил, и аспарагинил пептидные связи. Кислоты, такие как трифторуксусная кислота и муравьиная кислота может использоваться для расщепления.
Как и другие биомолекулы, белки могут расщепляться только под действием высокой температуры. При 250 ° C пептидная связь может легко гидролизоваться, а ее период полураспада снижается примерно до минуты.[26][29] Белок также может расщепляться без гидролиза через пиролиз; маленький гетероциклические соединения может начать формироваться при деградации. Выше 500 ° C, полициклические ароматические углеводороды может также образовывать,[30][31] что представляет интерес для изучения генерации канцерогены в табачном дыме и приготовлении пищи на сильном огне.[32][33]
Лабораторные приложения
Протеолиз также используется в исследовательских и диагностических целях:
- Расщепление гибридный белок так что партнер по слиянию и белковая метка используется в экспрессия белка и очищение могут быть удалены. Используемые протеазы обладают высокой степенью специфичности, например: тромбин, энтерокиназа, и Протеаза TEV, так что может быть отщеплена только целевая последовательность.
- Полная инактивация нежелательной ферментативной активности или удаление нежелательных белков. Например, протеиназа К, протеиназа широкого спектра, стабильная в мочевина и SDS, часто используется при приготовлении нуклеиновые кислоты удалить нежелательные нуклеаза загрязняющие вещества, которые в противном случае могут разрушить ДНК или РНК.[34]
- Частичная инактивация или изменение функциональности определенного белка. Например, лечение ДНК-полимераза I с субтилизин дает Кленовский фрагмент, который сохраняет свою полимеразную функцию, но лишен 5'-экзонуклеазной активности.[35]
- Переваривание белков в растворе для протеомный анализ к жидкостная хроматография-масс-спектрометрия (ЖХ-МС). Это также может быть сделано переваривание в геле из белки после разделения гель-электрофорез для идентификации масс-спектрометрии.
- Анализ устойчивости свернутого домена в широком диапазоне условий.[36]
- Повышение успешности проектов кристаллизации[37]
- Производство переваренного белка, используемого в питательной среде для культивирования бактерий и других организмов, например триптон в Лизогениевый бульон.
Ферменты протеазы
Протеазы можно классифицировать в соответствии с каталитической группой, входящей в его активный центр.[38]
- Цистеиновая протеаза
- Сериновая протеаза
- Треониновая протеаза
- Аспарагиновая протеаза
- Глутаминовая протеаза
- Металлопротеиназа
- Аспарагин пептид лиаза
Яды
Некоторые типы яда, например, вырабатываемые ядовитыми змеи, также может вызывать протеолиз. Эти яды, по сути, представляют собой сложные пищеварительные жидкости, которые начинают свою работу вне тела. Протеолитические яды вызывают широкий спектр токсических эффектов,[39] включая эффекты, которые:
- цитотоксический (разрушает клетки)
- гемотоксический (кровопролитный)
- миотоксичный (разрушение мышц)
- геморрагический (кровотечение)
Смотрите также
- Карта протеолиза
- ПРОТОКАРТА протеомная технология для идентификации протеолитических субстратов
- Протеасома
- Переваривание в геле
Рекомендации
- ^ а б Томас Э. Крейтон (1993). Белки: структура и молекулярные свойства (2-е изд.). В. Фриман и компания. стр.78–86. ISBN 978-0-7167-2317-2.
- ^ P H Hirel; М. Дж. Шмиттер; P Dessen; G Fayat; С. Бланке (1989). «Степень удаления N-концевого метионина из белков Escherichia coli определяется длиной боковой цепи предпоследней аминокислоты». Proc Natl Acad Sci U S A. 86 (21): 8247–51. Bibcode:1989PNAS ... 86.8247H. Дои:10.1073 / pnas.86.21.8247. ЧВК 298257. PMID 2682640.
- ^ Hanson, M.A., Marzluf, G.A., 1975. Контроль синтеза одного фермента множеством регуляторных цепей у Neurospora crassa. Proc. Natl. Акад. Sci. США 72, 1240–1244.
- ^ Симс, Г. К. и М. М. Вандер. 2002. Протеолитическая активность при ограничении содержания азота или серы. Appl. Soil Ecol. 568: 1-5.
- ^ а б Томас Э. Крейтон (1993). «Глава 10 - Деградация». Белки: структура и молекулярные свойства (2-е изд.). В. Фриман и компания. стр.463–473. ISBN 978-0-7167-2317-2.
- ^ Voet & Voet (1995). Биохимия (2-е изд.). Джон Вили и сыновья. стр.1010–1014. ISBN 978-0-471-58651-7.
- ^ Tompa, P .; Prilusky, J .; Silman, I .; Сассман, Дж. Л. (2008-05-01). «Структурное нарушение служит слабым сигналом для деградации внутриклеточного белка». Белки. 71 (2): 903–909. Дои:10.1002 / prot.21773. ISSN 1097-0134. PMID 18004785.
- ^ Инобе, Томонао; Матушек, Андреас (01.02.2014). «Парадигмы деградации белков протеасомами». Текущее мнение в структурной биологии. 24: 156–164. Дои:10.1016 / j.sbi.2014.02.002. ISSN 1879-033X. ЧВК 4010099. PMID 24632559.
- ^ ван дер Ли, Робин; Ланг, Бенджамин; Круз, Кай; Гспонер, Йорг; Санчес де Гроот, Наталия; Huynen, Martijn A .; Матушек, Андреас; Фуксрайтер, Моника; Бабу, М. Мадан (25 сентября 2014 г.). «Внутренне нарушенные сегменты влияют на период полужизни белка в клетке и во время эволюции». Отчеты по ячейкам. 8 (6): 1832–1844. Дои:10.1016 / j.celrep.2014.07.055. ISSN 2211-1247. ЧВК 4358326. PMID 25220455.
- ^ Шелковый ДБ (1974). «Отчет о ходе работ. Поглощение пептидов в человеке». Кишечник. 15 (6): 494–501. Дои:10.1136 / гут.15.6.494. ЧВК 1413009. PMID 4604970.
- ^ Майкл С. Браун; Джозеф Л. Гольдштейн (май 1997 г.). «Путь SREBP: регуляция метаболизма холестерина путем протеолиза связанного с мембраной фактора транскрипции». Клетка. 89 (3): 331–340. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80213-5. PMID 9150132. S2CID 17882616.
- ^ Шон Р. Кафлин (2000). «Сигнализация тромбина и рецепторы, активируемые протеазой». Природа. 407 (6801): 258–264. Дои:10.1038/35025229. PMID 11001069. S2CID 4429634.
- ^ Глотцер М., Мюррей А.В., Киршнер М.В. (1991). «Циклин разлагается убиквитиновым путем». Природа. 349 (6305): 132–8. Bibcode:1991Натура.349..132G. Дои:10.1038 / 349132a0. PMID 1846030. S2CID 205003883.
- ^ Lidell, Martin E .; Johansson, Malin E. V .; Ханссон, Гуннар К. (18 апреля 2003 г.). «Автокаталитическое расщепление на С-конце муцина MUC2 человека происходит при низком pH позднего секреторного пути». Журнал биологической химии. 278 (16): 13944–13951. Дои:10.1074 / jbc.M210069200. ISSN 0021-9258. PMID 12582180.
- ^ Би, Мин; Хикокс, Джон Р.; Уинфри, Вирджиния П.; Олсон, Гэри Э; Харди, Дэниел М (2003-10-15). «Процессинг, локализация и связывающая активность зонадгезина предполагают функцию адгезии сперматозоидов к блестящей оболочке во время экзоцитоза акросомы». Биохимический журнал. 375 (Pt 2): 477–488. Дои:10.1042 / BJ20030753. ISSN 0264-6021. ЧВК 1223699. PMID 12882646.
- ^ Садилкова, Ленка; Осичка, Радим; Сульц, Мирослав; Линхартова Ирена; Новак, Петр; Себо, Питер (октябрь 2008 г.). «Одностадийная аффинная очистка рекомбинантных белков с использованием самоизвлекающего модуля из Neisseria meningitidis FrpC». Белковая наука. 17 (10): 1834–1843. Дои:10.1110 / пс 035733.108. ЧВК 2548358. PMID 18662906.
- ^ Минамино, Тору; Макнаб, Роберт М. (1 сентября 2000 г.). «Доменная структура Salmonella FlhB, компонента экспорта жгутиков, ответственного за переключение специфичности субстрата». Журнал бактериологии. 182 (17): 4906–4914. Дои:10.1128 / JB.182.17.4906-4914.2000. ISSN 1098-5530. ЧВК 111371. PMID 10940035.
- ^ Бьёрнфот, Анн-Катрин; Лаванда, Моа; Форсберг, Оке; Вольф-Вац, Ганс (01.07.2009). «Автопротеолиз YscU Yersinia pseudotuberculosis важен для регуляции экспрессии и секреции белков Yop». Журнал бактериологии. 191 (13): 4259–4267. Дои:10.1128 / JB.01730-08. ISSN 0021-9193. ЧВК 2698497. PMID 19395493.
- ^ а б Johansson, Denny G.A .; Макао, Бертил; Сандберг, Андерс; Хярд, Торлейф (4 апреля 2008 г.). «Автопротеолиз домена SEA, ускоренный конформационным напряжением: механистические аспекты». Журнал молекулярной биологии. 377 (4): 1130–1143. Дои:10.1016 / j.jmb.2008.01.050. ISSN 1089-8638. PMID 18314133.
- ^ Кэтлин М. Сакамото (2002). «Убиквитин-зависимый протеолиз: его роль в заболеваниях человека и разработка терапевтических стратегий» (PDF). Молекулярная генетика и метаболизм. 77 (1–2): 44–56. Дои:10.1016 / S1096-7192 (02) 00146-4. PMID 12359129.
- ^ Де Струпер Б. (2010). «Протеазы и протеолиз при болезни Альцгеймера: многофакторный взгляд на процесс болезни». Физиологические обзоры. 90 (2): 465–94. Дои:10.1152 / Physrev.00023.2009. PMID 20393191.
- ^ Аббуд RT1, Вималанатан S (2008). «Патогенез ХОБЛ. Часть I. Роль протеазно-антипротеазного дисбаланса при эмфиземе». Международный журнал туберкулеза и болезней легких. 12 (4): 361–7. PMID 18371259.
- ^ Даниэль. Кане; В. Кларк Стилл (1988). «Гидролиз пептидной связи в нейтральной воде». Варенье. Chem. Soc. 110 (22): 7529–7534. Дои:10.1021 / ja00230a041.
- ^ Радзичка, Анна; Вольфенден, Ричард (январь 1996 г.). "Скорости некаталитического гидролиза пептидных связей в нейтральном растворе и переходное состояние сродства протеаз". Журнал Американского химического общества. 118 (26): 6105–6109. Дои:10.1021 / ja954077c.
- ^ Бернар Теста, Иоахим М. Майер (1 июля 2003 г.). Гидролиз в метаболизме лекарств и пролекарств. Wiley VCH. С. 270–288. ISBN 978-3906390253.CS1 maint: использует параметр авторов (связь)
- ^ а б Томас Э. Крейтон (1993). Белки: структура и молекулярные свойства (2-е изд.). В. Фриман и компания. п.6. ISBN 978-0-7167-2317-2.
- ^ «Рибонуклеаза А». Банк данных белков.
- ^ Брайан Джон Смит (2002). «Глава 71-75». В Джоне М. Уокере (ред.). Справочник по белковым протоколам (2-е изд.). Humana Press. стр.485 –510. Дои:10.1385/1592591698. ISBN 978-0-89603-940-7. S2CID 3692961.
- ^ Белый Р.Х. (1984). «Гидролитическая стабильность биомолекул при высоких температурах и ее значение для жизни при 250 ° C». Природа. 310 (5976): 430–2. Дои:10.1038 / 310430a0. PMID 6462230. S2CID 4315057.
- ^ Рамеш К. Шармаа; В. Джеффри Хана; Джеффри И. Симанб; Мохаммад Р. Хаджалигола (январь 2003 г.). «Образование низкомолекулярных гетероциклов и полициклических ароматических соединений (ПАС) при пиролизе α-аминокислот». Журнал аналитического и прикладного пиролиза. 66 (1–2): 97–121. Дои:10.1016 / S0165-2370 (02) 00108-0.
- ^ Фаббри Д., Адамиано А., Торри С. (2010). «Определение полициклических ароматических углеводородов, выделившихся при пиролизе биомассы, методом ГХ-МС». Анальный Биоанал Химия. 397 (1): 309–17. Дои:10.1007 / s00216-010-3563-5. PMID 20213167. S2CID 33835929.CS1 maint: использует параметр авторов (связь)
- ^ White JL, Conner BT, Perfetti TA, Bombick BR, Avalos JT, Fowler KW, Smith CJ, Doolittle DJ (май 2001 г.). «Влияние температуры пиролиза на мутагенность конденсата табачного дыма». Food Chem Toxicol. 39 (5): 499–505. Дои:10.1016 / s0278-6915 (00) 00155-1. PMID 11313117.
- ^ «Химические вещества в мясе, приготовленном при высоких температурах, и риск рака». Национальный институт рака.
- ^ Hilz H, Wiegers U, Adamietz P (1975). «Стимуляция действия протеиназы К денатурирующими агентами: применение для выделения нуклеиновых кислот и деградации« замаскированных »белков». Европейский журнал биохимии. 56 (1): 103–108. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1975.tb02211.x. PMID 1236799.
- ^ Кленов Х, Хеннингсен I (1970). «Селективное устранение экзонуклеазной активности полимеразы дезоксирибонуклеиновой кислоты из Escherichia coli B путем ограниченного протеолиза». Proc. Natl. Акад. Sci. Соединенные Штаты Америки. 65 (1): 168–175. Bibcode:1970ПНАС ... 65..168К. Дои:10.1073 / pnas.65.1.168. ЧВК 286206. PMID 4905667.
- ^ Minde DP; Морис, Маделон М .; Рюдигер, Стефан Г. Д. (2012). Уверский Владимир Н (ред.). «Определение биофизической стабильности белков в лизатах с помощью анализа быстрого протеолиза, FASTpp». PLOS ONE. 7 (10): e46147. Bibcode:2012PLoSO ... 746147M. Дои:10.1371 / journal.pone.0046147. ЧВК 3463568. PMID 23056252.
- ^ Вернимонт, А; Эдвардс, А (2009). Песня, Хайвэй (ред.). «Протеолиз in situ для образования кристаллов для определения структуры: обновление». PLOS ONE. 4 (4): e5094. Bibcode:2009PLoSO ... 4,5094 Вт. Дои:10.1371 / journal.pone.0005094. ЧВК 2661377. PMID 19352432.
- ^ Кохей Ода (2012). «Новые семейства карбоксилпептидаз: серин-карбоксилпептидазы и глутаминовые пептидазы». Журнал биохимии. 151 (1): 13–25. Дои:10.1093 / jb / mvr129. PMID 22016395.
- ^ Hayes WK. 2005 г. Исследования биологических ролей и разновидностей ядов змей. Университет Лома Линда.
дальнейшее чтение
- Томас Э. Крейтон (1993). Белки: структура и молекулярные свойства (2-е изд.). В. Фриман и компания. ISBN 978-0-7167-2317-2.
внешняя ссылка
- Журнал протеолиза - это журнал с открытым доступом, который представляет собой международный форум для электронной публикации всего спектра высококачественных статей и обзоров во всех областях протеолиза и протеолитических путей.
- Протеолиз MAP от Центра протеолитических путей