Гаплогруппа J-M172 - Haplogroup J-M172

Гаплогруппа J-M172
Возможное время происхождения	32000 лн)
Возраст коалесценции	28000 лн
Возможное место происхождения	Западная Азия
Предок	J-P209
Определение мутаций	M172
Самые высокие частоты	Ингуш 88.8% (Балановский 2011 ), Индийский Веллаларс 38.7%, Чеченцы 56.7% (Балановский 2011 ), Грузины 21% (Уэллс 2001 )-72%, Азербайджанцы 24% (Ди Джакомо 2004 )-48% (Уэллс 2001 ), Иракцы 24%(Аль-Захери 2011 )-25% Аль-Захери 2003 и Санчес 2005, Критяне 35% (Эль-Сибай 2009 ), Уйгуры 34% (Шоу 2010 ), Ягнобис 32% (Уэллс 2001 ), Узбеки 30.4% (Шоу 2010 ), Греки 10%-48%(Мартинес 2007 ), Курды-мусульмане 28.4%(Небель 2001 ), Ливанский 30% (Семино 2004 )[сомнительный – обсуждать](Уэллс 2001 ), Евреи ашкенази 24%(Небель 2001 )-29% (Семино 2004 ), Турки 24% (Cinnioglu 2004 )-40% (Семино 2000 ), Хазара 26,6% (Haber et al, 2012), Кувейт 26% (Кассеми 2009 ) и (Уэллс 2001 ), Киприоты 12.9% (Эль-Сибай 2009 )-37% (Капелли 2005 ), Абхазский 25% (Насидзе 2004 г. ), Иранцы 22.5%(Гругни 2012 )-24%, Балкарцы 24% (Батталья 2008 ), Итальянцы 9%-36%(Капелли 2007 ) и (Семино 2000 ), Армяне 21%(Уэллс 2001 )-24% (Насидзе 2004 г. ), Палестинцы 15% (Небель 2001 )[нужна цитата ]-35%, Мордвины 15.3%, Казанские татары 15.1%, Чувашский 14%, Сефардские евреи 15% (Шен 2004 )-29% (Небель 2001 ), Осетины 16%(Балановский 2011 )-24%(Насидзе 2004 г. ), Черкесы 21.8% (Балановский 2011 ), Мальтийский 21% (Капелли 2005 ), Северная Индия Мусульмане-шииты 18% (Eaaswarkhanth 2009 ), Албанцы 16% (Батталья 2008 )[нужна цитата ], Сирийцы 14% (Ди Джакомо 2004 )-29%[нужна цитата ], и Калаши 9.1%.[требуется полная цитата ]

В генетика человека, Гаплогруппа J-M172 или же J2^{[Филогенетика 1]} это Y-хромосома гаплогруппа который является субклад (филиал) гаплогруппа J-M304.^{[Филогенетика 2]} Гаплогруппа J-M172 распространена в современных популяциях в Западная Азия, Центральная Азия, Южная Азия, Европа и Северная Африка. Считается, что J-M172, возможно, возник между Кавказские горы, Месопотамия и Левант.^[9]^[10]

Далее он разделен на две дополнительные клады, J-M410 и J-M12 (M12, M102, M221, M314).

Происхождение

Дата происхождения гаплогруппы J-M172 оценивается Батини и др. в 2015 году между 19 000 и 24 000 лет до настоящего времени (BP).^[11] Самино и др. в 2004 г. датировано происхождение родительской гаплогруппы, J-P209, от 18 900 до 44 500 YBP.^[12] Древний J-M410, в частности, субклад J-Y12379 *, был обнаружен в мезолит контекст, в зубе из пещеры Котиас Клде на западе Грузия датировка 9.529-9.895 кал. BP.^[13] Этот образец был отнесен к аутосомному компоненту кавказских охотников-собирателей (ХГ).^[14] J-M410, а точнее его субклад J-PF5008, найден также в мезолитическом образце из Пещеры Хоту и Камарбанд находится в Провинция Мазандаран из Иран, относящиеся к 9100-8600 гг. до н. э. (примерно 11000 лн).^[15] Оба образца принадлежат к Триалетский Культура. Вполне вероятно, что к концу последнего оледенения 12000 лет назад люди J2 поселились на большей части территории Анатолии, Южного Кавказа и Ирана.^{[нужна цитата ]}

Заллуа и Уэллс 2004 и аз-Захери 2003 утверждал, что обнаружил самую раннюю известную миграцию J2 из Шумеры к Ханаан.^[9]^[10]^[16] В 2001, Nebel et al. обнаружили, что «Согласно Андерхиллу и др. (2000), Eu 9 (H58) произошел от Eu 10 (H71) через T → G трансверсия в M172 (курсив добавлен), «и что в сегодняшних популяциях Eu 9 (постмутационная форма M172) является самым сильным в Кавказ, Малая Азия и Левант, в то время как Eu 10 становится сильнее и заменяет частоту Eu 9 по мере продвижения на юг в Аравийский полуостров,^[17] так что люди с Кавказа встречались с арабами поблизости и между Месопотамия (ранее Шумеры ) и Пустыня Негев, в качестве "Арабизация "распространились из Аравии в Левант и Турцию, а также многие народы (например, евреи, армяне, ливанцы) вернулись из диаспоры.

По результатам исследования Ди Джакомо 2004, Гаплогруппа J-M172 распространилась в Южную Европу "из Левант или же Анатолия, вероятно, параллельно с развитием сельского хозяйства.^[18] Что касается времени его распространения в Европе, Ди Джакомо указывает на события, которые почтовый-дата неолита, в частности демографический флоруит, связанный с возвышением древнегреческого мира. Semino et al. получили оценки старшего возраста для всего J2 (используя метод Животовского, см. Ди Джакомо), постулировав его первоначальное распространение среди неолитических фермеров с Ближнего Востока. Однако его субкладное распределение, показывающее локализованные пики на Южных Балканах, юге Италии, севере / центральной Италии и на Кавказе, не соответствует единственному сценарию «волны продвижения», выдавая ряд до сих пор плохо изученных постнеолитических процессы, которые создали его текущий образец. Как и Ди Джакомо, южные Балканы бронзового века были предложены Семино 2004 быть важным вектором распространения.^[12]

Распределение

Гаплогруппа J-M172 находится в основном в Плодородный Полумесяц, то Кавказ (Насидзе 2003 ), Анатолия, Италия, то Средиземноморье прибрежный, а Иранское плато (Семино 2004 ). Y-ДНК: J2 (J-M172): Сирид / Нахрейнид Арабид (ы).

Самая высокая зарегистрированная частота J-M172 когда-либо составляла 87,4% среди Ингуш в Малгобек (Балановский 2011 ).

В частности, он находится в Ирак (Аль-Захери 2003 ), Кувейт (Кассеми 2009 ), Сирия (Луис 2004 ), Ливан (Заллуа 2008l ), индюк (Cinnioglu 2004 ), Грузия (Насидзе 2003 ), Азербайджан (Ди Джакомо 2004 ), Северный Кавказ (Насидзе 2004 г. ), Армения (Уэллс 2001 ), Иран (Насидзе 2004 г. ), Израиль (Семино 2004 ), Палестина (Семино 2004 ), Кипр (Капелли 2005 ), Греция (Мартинес 2007 ), Албания (Семино 2000 ), Италия (Капелли 2007 ), и Испания (Ди Джакомо 2003 ), а чаще в Иракцы 24%Аль-Захери 2011, Чеченцы 51.0%-58.0% (Балановский 2011 ), Грузины 21% (Уэллс 2001 )-72% (Уэллс 2001 ), Ливанский 30%(Семино 2004 ), Осетины 24%(Насидзе 2004 г. ), Балкарцы 24% (Батталья 2008 ), Сирийцы 23% (Луис 2004 ), Турки 13% (Cinnioglu 2004 )-40% (Семино 2000 ), Киприоты 12.9% (Эль-Сибай 2009 )-37%(Капелли 2005 ), Армяне 21% (Уэллс 2001 )-24% (Насидзе 2004 г. ), Черкесы 21.8%,(Балановский 2011 ) Иранцы 10% (Насидзе 2004 г. )-25%, (Уэллс 2001 ) Албанцы 16% (Батталья 2008 ), (Семино 2000 ) Итальянцы 9%-36% (Капелли 2007 ), Сефардские евреи 15%(Небель 2001 )-29%, (Семино 2004 ) Мальтийский 21%(Капелли 2005 ), Палестинцы 17%(Семино 2004 ), Саудовцы 14% (Абу-Амеро 2009 ), Иорданцы 14%, Оманцы 10%-15% (Ди Джакомо 2004 ) и (Луис 2004 )и Северной Индии Мусульманин-шиит 18% (Eaaswarkhanth 2009 ).

Северная Африка

Гаплогруппа J2 встречается с низкими частотами в Северной Африке.

Страна / регион	Отбор проб	N	J-M172	Изучать
Тунис	Тунис	62	8	Эль-Сибай 2009
Тунис	Сусс	220	8.2	Фадлауи-Зид 2014
Алжир	Оран	102	4.9	Робино 2008
Египет		124	7.6	Эль-Сибай 2009
Египет		147	12.0	Абу-Амеро 2009
Марокко		221	4.1	Фрегель 2009
Северная Африка	Алжир, Тунис	202	3.5	Фрегель 2009

Центральная Азия

Страна / регион	Отбор проб	N	J-M172	Изучать
Синьцзян	Лоп-уйгуры	64	57.8	Лю 2018
Синьцзян	Уйгуры	50	34	Шоу 2010
Таджикистан	Ягнобис	31	32	Уэллс 2001
Душанбе	Таджики	16	31	Уэллс 2001
Синьцзян	Узбеки	23	30.4	Шоу 2010
Афганистан	Хазара	60	26.6	Хабер 2012
Синьцзян	Кериян уйгуры	39	25.6	Лю 2018
Казахстан	Уйгуры	41	20	Уэллс 2001
Самарканд	Таджики	40	20	Уэллс 2001
Таджикистан	Таджики	38	18.4	Уэллс 2001
Туркменистан	Туркмены	30	17	Уэллс 2001
Синьцзян	Памирские таджики	31	16.1	Шоу 2010
Афганистан	Узбеки	126	16	Ди Кристофаро 2013
Бухара	Узбеки	58	16	Уэллс 2001
Самарканд	Узбеки	45	16	Уэллс 2001
Сурхандарья	Узбеки	68	16	Уэллс 2001
Узбекистан	Узбеки	366	13.4	Уэллс 2001
Казахстан	Казахи	30	13.3	Карафет 2001
Площадь Турфана	Уйгуры	143	9.8	Лю 2011
Хотанский район	Уйгуры	478	9.2	Лю 2011
Чанцзи	Хуэй	175	9.1	Лю 2011
Синьцзян	Долан Уйгуры	76	7.9	Лю 2018
Нинся	Хуэй	65	7.7	Лю 2011

J-M172 встречается с умеренной частотой среди жителей Центральной Азии, таких как Уйгуры, Узбеки, Туркмены, Таджики, Казахи, и Ягнобис. Согласно генетическому исследованию, проведенному в Северо-Западном Китае Shou et al. (2010), заметная высокая частота J-M172 наблюдается особенно у уйгуров 34% и узбеков 30,4% в Синьцзян, Китай. Лю Шуху и другие. (2018) обнаружили J2a1 (L26 / Page55 / PF5110 / S57, L27 / PF5111 / S396) в 43,75% (28/64) и J2a2 (L581 / S398) в 14,06% (9/64) выборки лопских уйгуров из Деревня Карчуга округа Юли (Лопнур), Синьцзян, J2a1b1 (M92, M260 / Страница 14) в 25,64% (10/39) выборке уйгуров Кериян из деревни Дарья Бойи округа Юйтян (Керия), Синьцзян, и J2a1 (L26 / Page55 / PF5110 / S57, L27 / PF5111 / S396) в 3,95% (3/76) и J2a2 (L581 / S398) в 3,95% (3/76) выборки доланских уйгуров из городка Хорикол округа Ават, Синьцзян .^[19]

Гаплогруппа издавна присутствует в Средней Азии и, по-видимому, предшествовала распространению ислама (Шоу 2010 ). Кроме того, непосредственный предок J-M172, а именно J * (J-M304 *, a.k.a. J-P209 *, J-12f2.1 *) также встречается среди Xibo, Казахский, Дунсян и Узбекский люди в Северо-Западном Китае.

В 2015 году два древних образца, принадлежащие J-M172 или J-M410 (J2a), были обнаружены в двух разных археологические сайты в Алтай, восточная Россия: Кытманово и Сары-бел курган. Оба древних образца относятся к Железный век культур на Алтае. Сары-бел J2 / J2a датируется 50 г. до н.э., а образец Кытманово датируется 721-889 гг. Анализ генетических примесей этих образцов также предполагает, что люди были более тесно связаны с Западные евразийцы чем другие Алтайцы того же периода, хотя они, кажется, тоже связаны с современными Тюркские народы региона.^[20]^[21]^[22]

Европа

Страна / регион	Отбор проб	N	J-M172	Изучать
Албания		55	19.9% 11/55	Батталья 2009
Босния и Герцеговина	Сербы	81	8.7	Батталья 2009
Кипр		164	12.9	Эль-Сибай 2009
Греция	Крит	143	35	Эль-Сибай 2009
Иберия		655	7	Фрегель 2009
Иберия		1140	7.7	Адамс 2008
Италия	Сицилия	212	22.6	Эль-Сибай 2009
Италия	Материк	699	20	Капелли 2007
Италия	Центральный Марке	59	35.6	Капелли 2007
Италия	Западная Калабрия	57	35.1	Капелли 2007
Италия	Валь Бадиа	34	8.8	Капелли 2007
Мальта		90	21.1	Эль-Сибай 2009
Португалия	Север, Центр, Юг	303	6.9	Эль-Сибай 2009
Португалия	Трас-ос-Монтес (евреи)	57	24.5	Ногейро 2010
Сардиния		81	9.9	Эль-Сибай 2009
Испания	Майорка	62	8.1	Эль-Сибай 2009
Испания	Севилья	155	7.8	Эль-Сибай 2009
Испания	Леон	60	5	Эль-Сибай 2009
Испания	Ибица	54	3.7	Эль-Сибай 2009
Испания	Кантабрия	70	2.9	Эль-Сибай 2009
Испания	Галиция	292	13	Брион 2004
Испания	Канарские острова	652	10.5	Фрегель 2009

В Европа, частота гаплогруппы J-M172 падает по мере продвижения на север от Средиземноморье. В Италия, J-M172 встречается с региональными частотами в диапазоне от 9% до 36% (Капелли 2007 ). В Греция, он встречается с региональными частотами в диапазоне от 10% до 48%. Согласно недавнему исследованию, примерно 24% турецких мужчин имеют J-M172 (Cinnioglu 2004 ) с региональными частотами от 13% до 40% (Семино 2000 ). В сочетании с J-M267, до половины населения Турции принадлежит к Гаплогруппа J-P209.

Было высказано предположение, что подклад гаплогруппы J-M410 был связан с популяциями на древнем Крите путем изучения взаимосвязи между Анатолийский, Критский, и Греческий популяции со стоянок раннего неолита на Крите. Гаплогруппа J-M12 была связана с Неолит Греция (ок. 8500 - 4300 г. до н.э.) и, как сообщается, были обнаружены на современном Крите (3,1%) и материковой Греции (Македония 7.0%, Фессалия 8.8%, Арголида 1.8%) (Король 2008 ).

Северный Кавказ

Страна / регион	Отбор проб	N	J-M172	Изучать
Кавказ	Абхазский	58	13.8	Балановский 2011
Кавказ	Аварский	115	6	Балановский 2011
Кавказ	Чеченский	330	57	Балановский 2011
Кавказ	Черкесы	142	21.8	Балановский 2011
Кавказ	Даргинс	101	1	Балановский 2011
Кавказ	Ингуш	143	88.8	Балановский 2011
Кавказ	Кайтак	33	3	Балановский 2011
Кавказ	Кумыки	73	21	Юнусбаев 2011
Кавказ	Кубачи	65	0	Балановский 2011
Кавказ	Лезгины	81	2.5	Балановский 2011
Кавказ	Осетины	357	16	Балановский 2011
Кавказ	Шапсуг	100	6	Балановский 2011
Кавказ		1525	28.1	Балановский 2011

J-M172 обнаруживается на очень высоких частотах в некоторых народы из Кавказ: среди Ингуш 87.4% (Балановский 2011 ), Чеченцы 55.2% (Балановский 2011 ), Грузины 21%-72%, (Уэллс 2001 ), Азербайджанцы 24% (Ди Джакомо 2004 )-48%, (Уэллс 2001 ) Абхазский 25%, (Насидзе 2004 г. ) Балкарцы 24% (Батталья 2008 ), Осетины 24% (Насидзе 2004 г. ), Армяне 21% (Уэллс 2001 )-24% (Насидзе 2004 г. ), Черкесы 21.8% (Балановский 2011 ), и другие группы ( Насидзе 2004 г. и Насидзе 2003).

Западная Азия

Страна / регион	Отбор проб	N	J-M172	Изучать
Еврейский	Ашкенази евреи	442	19	Бехар 2004
Иран		92	25	Эль-Сибай 2009
Ирак		154	24	Аль-Захери 2011^[23]
Израиль	Акка	101	18.6	Эль-Сибай 2009
Иордания		273	14.6	Эль-Сибай 2009
Ливан		951	29.4	Эль-Сибай 2009
Оман		121	10.0	Абу-Амеро 2009
Пакистан		176	11.9	Абу-Амеро 2009
Пакистан	Читральский район			Firasat 2007
Катар		72	8.3	Эль-Сибай 2009
Саудовская Аравия		157	14	Абу-Амеро 2009^[24]
Сирия	Сирия	554	20.8	Эль-Сибай 2009
индюк		523	24.2	Эль-Сибай 2009
ОАЭ		164	10.3	Эль-Сибай 2009
Йемен		62	9.6	Эль-Сибай 2009

У сефардских евреев около 15% (Небель 2001 )-29% (Семино 2004 ), гаплогруппы J-M172, а евреи-ашкенази имеют 15% (Шен 2004 )-23% (Семино 2004 ). Об этом сообщалось в раннем исследовании, в котором тестировалось только четыре маркера STR (Маласпина 2001 ) что небольшой образец итальянского Коэнс принадлежал к сети 1.2, раннему обозначению всей клады, теперь известной как J-L26, определяемой делецией в DYS413. Однако большое количество всех еврейских коэнов в мире принадлежит к гаплогруппе J-M267 (см. Модальный гаплотип Коэна ).

Было показано, что гаплогруппа J-M172 имеет более северное распространение на Ближнем Востоке, хотя она существует в значительных количествах в южных регионах Ближнего Востока, меньшее ее количество было обнаружено по сравнению с ее братской гаплогруппой, J-M267, который имеет высокую частоту распространения в южном направлении. Считалось, что исходная популяция J-M172 происходила из Леванта / Сирии (Syrid-J-M172), и что его появление среди современного населения Европы, Центральной Азии и Южной Азии было признаком неолитических земледельцев.Однако, как уже говорилось, сейчас считается, что оно, скорее всего, было распространено волнами в результате постнеолитических процессов.

Южная Азия

Гаплогруппа J2 присутствует в Южная Азия в основном как J2a-M410 и J2b-M102, начиная со времен неолита (9500 YBP).^[25]^[26]J2-M172 оказался значительно выше среди Дравидийский каст на 19%, чем среди Индоевропейский каст на 11%. J2-M172 и J-M410 встречаются 21% среди Дравидийский средние касты, за которыми следуют высшие касты - 18,6% и низшие - 14%.^[27] Среди кастовых групп самая высокая частота J2-M172 наблюдалась среди тамильских Веллаларс Южной Индии - 38,7%.^[27] J2 присутствует и у индейских племен, а у австро-азиатских племен его частота составляет 11%. Среди австро-азиатских племен преобладающие J2 происходит в Асур племя (77,5%), хотя и с размером выборки 40^[25] и в Лодха (35%) из Западная Бенгалия.^[27] J2 также присутствует в Южной Индии. горное племя Тода на уровне 38,46%, хотя размер выборки всего 26,^[28] в Племя андх из Телангана на 35,19%,^[29] в Нарикуравар племя на 57,9%^[25] и в Племя кол из Уттар-Прадеш с частотой 33,34%.^[30] Гаплогруппа J-P209 оказалась более распространенной в Индии. Мусульмане-шииты, из которых 28,7% принадлежат гаплогруппе J, 13,7% - J-M410, 10,6% - J-M267 и 4,4% - J2b (Eaaswarkhanth 2009 ).

В Пакистан, самые высокие частоты J2-M172 наблюдались среди Парсы при 38,89% Дравидийский Говорящий Брахуи на 28,18% и Макрани Белуджи на 24%.^[31] Это также встречается в 18,18% в Макрани Сиддис и на 3% в Карнатака Сиддис.^[31]^[32]

J2-M172 встречается с общей частотой 16,1% у людей Шри-Ланка.^[33] На Мальдивах 22% мальдивского населения оказались положительными по гаплогруппе J2.^[34] Субклады M172, такие как M67 и M92, не были обнаружены ни в индийских, ни в пакистанских образцах, что также может указывать на частичное общее происхождение.^[27]

Распределение субкладов

Гаплогруппа J-M172 подразделяется на две взаимодополняющие подгаплогруппы: J-M410, определяемый M410 генетический маркер, и J-M12, определяемый M12 генетический маркер.

J-M172

J-M172 типичен для популяций Ближний Восток, Южная Европа, Юго-Западная Азия и Кавказ, с умеренным распространением по большей части Центральная Азия, Южная Азия, и Северная Африка.^{[нужна цитата ]}

J-M410

J-M410 * находится в Грузия, Северная Осетия.^{[нужна цитата ]}

J-M47

J-M47 встречается с низкой частотой в Грузия, (Батталья 2008 ) южный Иран (Регейро 2006 ), Катар (Кадены 2008 ) Саудовская Аравия (АбуАмеро 2009 ), Сирия (Ди Джакомо 2004 ), Тунис (Арреди 2004 ), индюк (Ди Джакомо 2004 и Cinnioglu 2004), ОАЭ, (Кадены 2008 ), и Центральная Азия /Сибирь (Андерхилл 2000 ).

J-M67

J-M67 (в более ранних статьях называемый J2f) имеет самые высокие частоты, связанные с Нахские народы. С очень высокой (большей) частотой встречались ингуши в Малгобеке (87,4%), чеченцы в Дагестане (58%), чеченцы в Чечне (56,8%) и чеченцы в Малгобеке, Ингушетия (50,9%) (Балановский 2011 ). На Кавказе он встречается значительно чаще среди грузин (13,3%) (Семино 2004 ), Железные осетины (11,3%), балкарцы Южного Кавказа (6,3%) (Семино 2004 ), Дигорские осетины (5,5%), абхазы (6,9%) и черкесы (5,6%) (Балановский 2011 ). Он также довольно часто встречается в Средиземноморье и на Ближнем Востоке, включая критян (10,2%), северо-центральных итальянцев (9,6%), южных итальянцев (4,2%; только 0,8% среди северных итальянцев), анатолийских турок (2,7%). 5,4%), греки (4-4,3%), албанцы (3,6%), евреи-ашкенази (4,9%), сефарды (2,4%), каталонцы (3,9%), андалузцы (3,2%), калабрийцы (3,3%), албанцы Калабрийцы (8,9%) (см. Ди Джакомо 2004 и Семино 2004).

J-M92 / M260, субклад J-M67, был обнаружен у 25,64% (10/39) выборки кериянских уйгуров из деревни Дарья Бойи округа Ютянь (Керия), Синьцзян.^[19] Эта уйгурская деревня расположена в удаленном оазисе в Пустыня Такламакан.

J-M319

J-M319 встречается с низкой или средней частотой в Критский Греки (Мартинес 2007 и Король 2008), Иракские евреи (Шен 2004 ), и Марокканские евреи (Шен 2004 ).

J-M158

J-M158 (местоположение под L24 не определено) J-M158 обнаруживается с низкой частотой в индюк (Cinnioglu 2004 ), Южная Азия (Сенгупта 2006 и Андерхилл 2000), Индокитай (Андерхилл 2000 ), и Пиренейский полуостров.

Филогенетика

В филогенетике Y-хромосомы субклады являются ветвями гаплогрупп. Эти субклады также определяются однонуклеотидными полиморфизмами (SNP) или уникальными полиморфизмами событий (UEP).

Филогенетическая история

До 2002 года в академической литературе существовало по крайней мере семь систем именования Филогенетического дерева Y-хромосомы. Это привело к значительной путанице. В 2002 году основные исследовательские группы объединились и сформировали Консорциум Y-хромосомы (YCC). Они опубликовали совместный документ, в котором было создано единое новое дерево, которое все согласились использовать. Позже группа гражданских ученых, интересующихся популяционной генетикой и генетической генеалогией, сформировала рабочую группу для создания любительского дерева, стремясь быть, прежде всего, своевременным. В приведенной ниже таблице собраны все эти работы на основе знакового Дерева YCC 2002 года. Это позволяет исследователю, просматривающему ранее опубликованную литературу, быстро перемещаться между номенклатурами.

YCC 2002/2008 (стенография)	(α)	(β)	(γ)	(δ)	(е)	(ζ)	(η)	YCC 2002 (от руки)	YCC 2005 (от руки)	YCC 2008 (от руки)	YCC 2010r (от руки)	ISOGG 2006	ISOGG 2007	ISOGG 2008	ISOGG 2009	ISOGG 2010	ISOGG 2011	ISOGG 2012
J-12f2a	9	VI	Med	23	Eu10	H4	B	J *	J	J	J	-	-	-	-	-	-	J
J-M62	9	VI	Med	23	Eu10	H4	B	J1	J1a	J1a	J1a	-	-	-	-	-	-	Частный
J-M172	9	VI	Med	24	Eu9	H4	B	J2 *	J2	J2	J2	-	-	-	-	-	-	J2
J-M47	9	VI	Med	24	Eu9	H4	B	J2a	J2a	J2a1	J2a4a	-	-	-	-	-	-	J2a1a
J-M68	9	VI	Med	24	Eu9	H4	B	J2b	J2b	J2a3	J2a4c	-	-	-	-	-	-	J2a1c
J-M137	9	VI	Med	24	Eu9	H4	B	J2c	J2c	J2a4	J2a4h2a1	-	-	-	-	-	-	J2a1h2a1a
J-M158	9	VI	Med	24	Eu9	H4	B	J2d	J2d	J2a5	J2a4h1	-	-	-	-	-	-	J2a1h1
J-M12	9	VI	Med	24	Eu9	H4	B	J2e *	J2e	J2b	J2b	-	-	-	-	-	-	J2b
J-M102	9	VI	Med	24	Eu9	H4	B	J2e1 *	J2e1	J2b	J2b	-	-	-	-	-	-	J2b
J-M99	9	VI	Med	24	Eu9	H4	B	J2e1a	J2e1a	J2b2a	J2b2a	-	-	-	-	-	-	Частный
J-M67	9	VI	Med	24	Eu9	H4	B	J2f *	J2f	J2a2	J2a4b	-	-	-	-	-	-	J2a1b
J-M92	9	VI	Med	24	Eu9	H4	B	J2f1	J2f1	J2a2a	J2a4b1	-	-	-	-	-	-	J2a1b1
J-M163	9	VI	Med	24	Eu9	H4	B	J2f2	J2f2	J2a2b	J2a4b2	-	-	-	-	-	-	Частный

Научные публикации

Следующие исследовательские группы в соответствии с их публикациями были представлены в создании Дерева YCC.

α Джоблинг и Тайлер-Смит 2000 и Каладжиева 2001
β Андерхилл 2000
γ Молот 2001
δ Карафет 2001
ε Семино 2000
ζ Вс 1999
η Капелли 2001

Филогенетические деревья

Существует несколько подтвержденных и предполагаемых филогенетических деревьев, доступных для гаплогруппы J-M172. Научно принятый - это консорциум Y-хромосомы (YCC), опубликованный в Karafet 2008 и впоследствии обновленный. Черновик дерева, который показывает развивающуюся науку, предоставил Томас Кран из Центра геномных исследований Хьюстон, Техас. Международное общество генетической генеалогии (ISOGG) также предоставляет любительское дерево.^{[Филогенетика 3]}^{[Филогенетика 4]}

Чертеж дерева Центра геномных исследований

Это Томас Кран из черновика дерева Центра геномных исследований. Предлагаемое дерево для гаплогруппы J-M172 (Krahn и FTDNA 2013 ). Для краткости показаны только первые три уровня субкладов.

M172, L228
- M410, L152, L212, L505, L532, L559
  - PF5008
    - Y182822
      - L581
        Z37823
  - PF4610
    - Z6046
    - L26
- М12, М102, М221, М314, L282
  - M205
  - M241
    - M99
    - M280
    - M321
    - P84
    - L283

Дерево Консорциума Y-хромосомы

Это официальное научное дерево, созданное Консорциумом Y-хромосомы (YCC). Последнее крупное обновление было в 2008 г. (Карафет 2008 ). Последующие обновления производились ежеквартально и раз в два года. Текущая версия является переработкой обновления 2010 года.^[35]

Дерево ISOGG

Ниже приведены субклады гаплогруппы J-M172 с их определяющей мутацией, согласно дерево ISOGG (по состоянию на февраль 2018 г.). Обратите внимание, что идентификаторы на основе происхождения могут быть изменены, поскольку обнаруживаются новые SNP, которые дополняют и дополнительно уточняют дерево. Для краткости показаны только первые три уровня субкладов.

J2 M172 / Страница 28 / PF4908, L228 / PF4895 / S321
- J2a M410, L152, L212 / PF4988, L559 / PF4986
  - J2a1 DYS413≤18, L26 / Страница55 / PF5110 / S57, F4326 / L27 / PF5111 / S396
    - J2a1a M47, M322
    - J2a1b M67 / PF5137 / S51
    - J2a1c M68
    - J2a1d M319
    - J2a1e M339
    - J2a1f M419
    - J2a1g P81 / PF4275
    - J2a1h L24 / S286, L207.1
    - J2a1i L88.2, L198
  - J2a2 L581 / PF5026 / S398
    - J2a2a P279 / PF5065
- J2b L282, M12, M102, M221, M314 / PF4939
  - J2b1 M205
  - J2b2 M241
    - J2b2a L283

Смотрите также

Генетика

Y-ДНК J Субклады

Основное дерево Y-ДНК

Филогенетическое древо человека Гаплогруппы ДНК Y-хромосомы ^{[χ 1]}^{[χ 2]}

"Y-хромосомный Адам "

A0-T ^{[χ 3]}

A1 ^{[χ 4]}

F2

F3

GHIJK

я

J

LT ^{[χ 5]}

K2 ^{[χ 6]}

L

Т

K2a ^{[χ 7]}

K2b ^{[χ 8]}

K2c

K2d

K2e ^{[χ 9]}

K-M2313 ^{[χ 10]}

K2b1 ^{[χ 11]}

п ^{[χ 12]}

НЕТ

S ^{[χ 13]}

M ^{[χ 14]}

P1

P2

Сноски

^ Ван Овен М., Ван Гейстелен А., Кайзер М., Декорте Р., Larmuseau HD (2014). «Видеть лес за деревьями: минимальная эталонная филогения Y-хромосомы человека». Человеческая мутация. 35 (2): 187–91. Дои:10.1002 / humu.22468. PMID 24166809.
^ Международное общество генетической генеалогии (ISOGG; 2015), Дерево гаплогруппы Y-ДНК 2015. (Дата обращения: 1 февраля 2015 г.)
^ Гаплогруппа A0-T также известна как A-L1085 (а ранее как A0'1'2'3'4).
^ Гаплогруппа A1 также известна как A1'2'3'4.
^ Гаплогруппа LT (L298 / P326) также известна как гаплогруппа K1.
^ С 2002 по 2008 гг. Гаплогруппа T-M184 была известна как «Гаплогруппа К2». С тех пор это имя было изменено на K-M526, брат Haplogroup LT.
^ Гаплогруппа K2a (M2308) и ее первичный субклад K-M2313 были отделены от гаплогруппы NO (F549) в 2016 году (это последовало за публикацией: Позник Г.Д., Сюэ У., Мендес Ф.Л. (2016). «Прерывистые всплески в демографии мужчин-мужчин на основе 1244 всемирных последовательностей Y-хромосомы». Природа Генетика. 48 (6): 593–9. Дои:10,1038 / нг.3559. ЧВК 4884158. PMID 27111036. В прошлом другие гаплогруппы, включая NO (M214) и K2e, также были идентифицированы с именем «K2a».
^ Гаплогруппа K2b (M1221 / P331 / PF5911) также известна как MPS гаплогруппы.
^ Гаплогруппа K2e (K-M147) ранее была известна как «гаплогруппа X» и «K2a» (но является дочерней субкладой нынешней K2a).
^ K-M2313 *, у которого пока нет филогенетического названия, был зарегистрирован у двух живых людей, имеющих этнические связи с Индией и Юго-Восточной Азией. Кроме того, K-Y28299, который, по-видимому, является основной ветвью K-M2313, был обнаружен у трех живых людей из Индии. См .: Позник op. соч.; YFull YTree v5.08, 2017, «К-М2335», и; Филодерево, 2017, «Детали маркеров Y-SNP, включенных в минимальное дерево Y» (Дата доступа к этим страницам: 9 декабря 2017 г.)
^ Гаплогруппа K2b1 (P397 / P399) также известна как гаплогруппа MS, но имеет более широкую и сложную внутреннюю структуру.
^ Гаплогруппа P (P295) также известна как K2b2.
^ Гаплогруппа S с 2017 года также известна как K2b1a. (Ранее имя Гаплогруппа S было присвоено K2b1a4.)
^ Гаплогруппа M, по состоянию на 2017 год, также известна как K2b1b. (Ранее имя Гаплогруппа M было присвоено K2b1d.)

Библиография

^ ^[1]
^ Небель А., Филон Д., Бринкманн Б., Маджумдер П.П., Фаерман М., Оппенгейм А. (2001). «Пул Y-хромосомы евреев как часть генетического ландшафта Ближнего Востока». Являюсь. J. Hum. Genet. 69 (5): 1095–112. Дои:10.1086/324070. ЧВК 1274378. PMID 11573163.
^ Маласпина П., Цопаномичалоу М., Думан Т., Стефан М., Сильвестри А., Ринальди Б. и др. (2001). «Многоступенчатый процесс распространения линии Y-хромосомы в Средиземноморье» (PDF). Анна. Гм. Genet. 65 (Pt 4): 339–49. Дои:10.1046 / j.1469-1809.2001.6540339.x. HDL:2108/44448. PMID 11592923. S2CID 221448190.

дальнейшее чтение

Абу-Амеро К.К., Хеллани А., Гонсалес А.М., Ларруга Дж.М., Кабрера В.М., Андерхилл, Пенсильвания (2009). «Разнообразие Y-хромосомы Саудовской Аравии и его связь с соседними регионами». BMC Genetics. 10: 59. Дои:10.1186/1471-2156-10-59. ЧВК 2759955. PMID 19772609.
Аль-Захери Н., Семино О, Бенуцци Дж., Магри С., Пассарино Дж., Торрони А., Сантачиара-Бенеречетти А.С. (2003).«Полиморфизмы Y-хромосомы и мтДНК в Ираке, перекресток раннего расселения людей и постнеолитических миграций». Молекулярная филогенетика и эволюция. 28 (3): 458–72. Дои:10.1016 / S1055-7903 (03) 00039-3. PMID 12927131.
Аль-Захери Н., Пала М., Батталья В., Гругни В., Хамод М.А., Хушиар Кашани Б. и др. (2011). «В поисках генетических следов шумеров: обзор Y-хромосомы и вариаций мтДНК у болотных арабов Ирака». BMC Эволюционная биология. 11: 288. Дои:10.1186/1471-2148-11-288. ЧВК 3215667. PMID 21970613.
Арреди Б., Полони Е.С., Параккини С., Зерджал Т., Фатхаллах Д.М., Макрелуф М., Паскали В.Л., Новеллетто А., Тайлер-Смит С. (2004). «Преимущественно неолитическое происхождение вариации Y-хромосомы ДНК в Северной Африке». Американский журнал генетики человека. 75 (2): 338–45. Дои:10.1086/423147. ЧВК 1216069. PMID 15202071.
Балановский О., Дибирова К., Дыбо А., Мудрак О., Фролова С., Почешхова Е. и др. (2011). «Параллельная эволюция генов и языков в Кавказском регионе». Молекулярная биология и эволюция. 28 (10): 2905–20. Дои:10.1093 / molbev / msr126. ЧВК 3355373. PMID 21571925.
Батталья V, Форнарино С., Аль-Захери Н., Оливьери А., Пала М., Майрес Н.М., Кинг Р.Дж., Рутси С., Марьянович Д., Приморак Д., Хадзиселимович Р., Видович С., Дробник К., Дурмиши Н., Торрони А., Сантачиара-Бенеречет А.С., Андерхилл, Пенсильвания, Семино О (2008). «Y-хромосомное свидетельство культурного распространения сельского хозяйства в Юго-Восточной Европе». Европейский журнал генетики человека. 17 (6): 820–30. Дои:10.1038 / ejhg.2008.249. ЧВК 2947100. PMID 19107149.
Каденас AM, Животовский Л.А., Кавалли-Сфорца LL, Андерхилл П.А., Эррера Р.Дж. (2007). «Разнообразие Y-хромосомы характеризует Оманский залив». Европейский журнал генетики человека. 16 (3): 374–86. Дои:10.1038 / sj.ejhg.5201934. PMID 17928816.
Капелли С., Рыжий Н., Романо В., Кали Ф., Лефранк Г., Делаг В. и др. (2006). "Структура населения в Средиземноморском бассейне: перспектива Y-хромосомы". Анналы генетики человека. 70 (2): 207–25. Дои:10.1111 / j.1529-8817.2005.00224.x. HDL:2108/37090. PMID 16626331. S2CID 25536759.
Капелли С., Бризигелли Ф., Скарниччи Ф., Арреди Б., Калья А, Ветругно Г. и др. (2007). «Генетическая изменчивость Y-хромосомы на итальянском полуострове является клинальной и поддерживает модель примесей для столкновения мезолита и неолита». Молекулярная филогенетика и эволюция. 44 (1): 228–39. Дои:10.1016 / j.ympev.2006.11.030. PMID 17275346.
Cinniolu C, King R, Kivisild T, Kalfolu E, Atasoy S, Cavalleri GL, et al. (2004). «Раскопки гаплотипов Y-хромосомы в Анатолии». Генетика человека. 114 (2): 127–48. Дои:10.1007 / s00439-003-1031-4. PMID 14586639. S2CID 10763736.
Ди Джакомо Ф., Лука Ф., Ананьоу Н., Чаварелла Дж., Корбо Р.М., Креста М., Куччи Ф., Ди Стаси Л., Агостиано В., Гипараки М., Лутрадис А., Мамми 'С., Михалодимитракис Е. Н., Папола Ф., Педичини Г., Плата Э , Терренато Л., Тофанелли С., Маласпина П., Новеллетто А (2003). «Клинические паттерны человеческого Y-хромосомного разнообразия в континентальной Италии и Греции во власти дрейфа и эффектов основателя». Молекулярная филогенетика и эволюция. 28 (3): 387–95. Дои:10.1016 / S1055-7903 (03) 00016-2. PMID 12927125.
Eaaswarkhanth M, Haque I, Ravesh Z, Romero IG, Meganathan PR, Dubey B и др. (2009). «Следы происхождения к югу от Сахары и Ближнего Востока в индийском мусульманском населении». Европейский журнал генетики человека. 18 (3): 354–63. Дои:10.1038 / ejhg.2009.168. ЧВК 2859343. PMID 19809480.
Эль-Сибай М., Платт Д.Е., Хабер М., Сюэ И., Юханна С.К., Уэллс Р.С. и др. (2009). «Географическая структура Y-хромосомного генетического ландшафта Леванта: контраст между прибрежными и внутренними районами». Анналы генетики человека. 73 (6): 568–81. Дои:10.1111 / j.1469-1809.2009.00538.x. ЧВК 3312577. PMID 19686289. В этом документе представлены результаты нескольких исследований: Di Giacomo 2003, Al-Zahery 2003, Flores 2004, Cinnioglu 2004, Capelli 2005, Goncalves 2005, Zalloua 2008, Cadenas 2008
Ди Джакомо Ф., Лука Ф., Попа Л.О., Акар Н., Ананьоу Н., Банико Дж. И др. (2004). «Y-хромосомная гаплогруппа J как признак постнеолитической колонизации Европы». Генетика человека. 115 (5): 357–71. Дои:10.1007 / s00439-004-1168-9. PMID 15322918. S2CID 18482536.
Grugni V, Battaglia V, Hooshiar Kashani B, Parolo S, Al-Zahery N, Achilli A, et al. (2012). Кивисилд Т (ред.). «Древние миграционные события на Ближнем Востоке: новые ключи к изменению Y-хромосомы современных иранцев». PLOS ONE. 7 (7): e41252. Bibcode:2012PLoSO ... 741252G. Дои:10.1371 / journal.pone.0041252. ЧВК 3399854. PMID 22815981.
Haber M, Platt DE, Ashrafian Bonab M, Youhanna SC, Soria-Hernanz DF, Martínez-Cruz B, et al. (2011). Кайзер М (ред.). «Этнические группы Афганистана разделяют наследие Y-хромосомы, структурированное историческими событиями». PLOS ONE. 7 (3): e34288. Bibcode:2012PLoSO ... 734288H. Дои:10.1371 / journal.pone.0034288. ЧВК 3314501. PMID 22470552.
Кинг Р., Андерхилл, Пенсильвания (2002). «Конгруэнтное распределение неолитической расписной керамики и керамических фигурок с линиями Y-хромосомы». Античность. 76 (293): 707–714. Дои:10.1017 / с0003598x00091158.
King RJ, Ozcan SS, Carter T., Kalfolu E, Atasoy S, Triantaphyllidis C и др. (2008). «Дифференциальные анатолийские влияния Y-хромосомы на греческий и критский неолит». Анналы генетики человека. 72 (2): 205–14. Дои:10.1111 / j.1469-1809.2007.00414.x. PMID 18269686. S2CID 22406638.
Луис Дж. Р., Роулд Д. Д., Регейро М., Цейро Б., Синниоглу С., Роземан С. и др. (2004). "Левант против Африканского Рога: свидетельства двунаправленных коридоров миграции людей". Американский журнал генетики человека. 74 (3): 532–44. Дои:10.1086/382286. ЧВК 1182266. PMID 14973781.
Маласпина П., Цопаномичалоу М., Думан Т., Стефан М., Сильвестри А., Ринальди Б. и др. (2001). «Многоступенчатый процесс распространения линии Y-хромосомы в Средиземноморье». Анналы генетики человека. 65 (4): 339–49. Дои:10.1046 / j.1469-1809.2001.6540339.x. HDL:2108/44448. PMID 11592923. S2CID 221448190.
Мартинес Л., Андерхилл П.А., Животовский Л.А., Гайден Т., Москонас Н.К., Чоу CE и др. (2007). «Палеолитическое наследие Y-гаплогруппы преобладает на Критском высокогорном плато». Европейский журнал генетики человека. 15 (4): 485–93. Дои:10.1038 / sj.ejhg.5201769. PMID 17264870.
Насидзе И, Саркисян Т, Керимов А, Стоункинг М (2003). «Проверка гипотез языковой замены на Кавказе: данные по Y-хромосоме». Генетика человека. 112 (3): 255–61. Дои:10.1007 / s00439-002-0874-4. PMID 12596050. S2CID 13232436.
Насидзе I, Ling EY, Quinque D, Dupanloup I, Cordaux R, Rychkov S и др. (2004). «Митохондриальная ДНК и вариация Y-хромосомы на Кавказе». Анналы генетики человека. 68 (3): 205–21. Дои:10.1046 / j.1529-8817.2004.00092.x. PMID 15180701. S2CID 27204150.
Небель А., Филон Д., Бринкманн Б., Маджумдер П.П., Фаерман М., Оппенгейм А. (2001). «Пул Y-хромосомы евреев как часть генетического ландшафта Ближнего Востока». Американский журнал генетики человека. 69 (5): 1095–112. Дои:10.1086/324070. ЧВК 1274378. PMID 11573163.
Регейро М., Каденас А.М., Гайден Т., Андерхилл, Пенсильвания, Эррера Р.Дж. (2006). «Иран: триконтинентальный нексус для миграции, вызванной Y-хромосомой». Человеческая наследственность. 61 (3): 132–43. Дои:10.1159/000093774. PMID 16770078. S2CID 7017701.
Санчес Дж. Дж., Халленберг С., Бёрстинг С., Эрнандес А., Морлинг Н. (2005). «Высокие частоты клонов Y-хромосомы, характеризующиеся E3b1, DYS19-11, DYS392-12 у сомалийских мужчин». Европейский журнал генетики человека. 13 (7): 856–66. Дои:10.1038 / sj.ejhg.5201390. PMID 15756297.
Семино О., Пассарино Г., Офнер П. Дж., Лин А. А., Арбузова С., Бекман Л. Е. и др. (2000). «Генетическое наследие палеолита Homo sapiens sapiens у современных европейцев: перспектива хромосомы Y». Наука. 290 (5494): 1155–9. Bibcode:2000Sci ... 290.1155S. Дои:10.1126 / наука.290.5494.1155. PMID 11073453.
Семино О., Магри С., Бенуцци Дж., Лин А.А., Аль-Захери Н., Батталья В. и др. (2004). "Происхождение, распространение и дифференциация гаплогрупп E и J Y-хромосомы: выводы о неолитизации Европы и более поздних миграционных событиях в Средиземноморском регионе". Американский журнал генетики человека. 74 (5): 1023–34. Дои:10.1086/386295. ЧВК 1181965. PMID 15069642.
Сенгупта С., Животовский Л.А., Кинг Р., Мехди С.К., Эдмондс С.А., Чоу С.Э. и др. (2006). «Полярность и временность распределений Y-хромосомы высокого разрешения в Индии выявляют как аборигенное, так и экзогенное расширение и выявляют незначительное генетическое влияние скотоводов Центральной Азии». Американский журнал генетики человека. 78 (2): 202–21. Дои:10.1086/499411. ЧВК 1380230. PMID 16400607.
Шен П., Лави Т., Кивисилд Т., Чжоу В., Сенгун Д., Гефель Д. и др. (2004). «Реконструкция отцовства и материнства самаритян и других израильских популяций на основе Y-хромосомы и вариации последовательности митохондриальной ДНК». Человеческая мутация. 24 (3): 248–60. Дои:10.1002 / humu.20077. PMID 15300852. S2CID 1571356.
Тофанелли С., Ферри Г., Булаева К., Качагли Л., Онофри В., Таглиоли Л. и др. (2009). «Линия J1-M267 Y знаменует собой доисторические перемещения людей, вызванные климатом». Европейский журнал генетики человека. 17 (11): 1520–4. Дои:10.1038 / ejhg.2009.58. ЧВК 2986692. PMID 19367321.
Андерхилл П.А., Шен П., Линь А.А., Джин Л., Пассарино Дж., Ян У.Х., Кауфман Э, Бонне-Тамир Б., Бертранпетит Дж., Франкалаччи П., Ибрагим М., Дженкинс Т., Кидд Дж. Р., Мехди С. К., Зайелстад М. Т., Уэллс Р.С., Пьяцца А, Дэвис Р.В., Фельдман М.В., Кавалли-Сфорца Л.Л., Офнер П.Дж. (2000). «Вариации последовательности Y-хромосомы и история популяций человека». Природа Генетика. 26 (3): 358–61. Дои:10.1038/81685. PMID 11062480. S2CID 12893406.
Уэллс Р.С., Юлдашева Н., Рузибакиев Р., Андерхилл П.А., Евсеева И., Блю-Смит Дж. И др. (2001). «Евразийский хартленд: континентальный взгляд на разнообразие Y-хромосомы». Труды Национальной академии наук. 98 (18): 10244–9. Bibcode:2001PNAS ... 9810244W. Дои:10.1073 / pnas.171305098. ЧВК 56946. PMID 11526236.
Zalloua PA, Xue Y, Khalife J, Makhoul N, Debiane L, Platt DE, et al. (2008l). «Разнообразие Y-хромосомы в Ливане определяется недавними историческими событиями». Американский журнал генетики человека. 82 (4): 873–82. Дои:10.1016 / j.ajhg.2008.01.020. ЧВК 2427286. PMID 18374297.
Ди Кристофаро Дж., Пеннарун Э., Мазьер С., Майрес Н.М., Лин А.А., Темори С.А. и др. (2013). «Афганский Гиндукуш: там, где сходятся генные потоки Евразийского субконтинента». PLOS ONE. 8 (10): e76748. Bibcode:2013PLoSO ... 876748D. Дои:10.1371 / journal.pone.0076748. ЧВК 3799995. PMID 24204668.
Shou WH, Qiao EF, Wei CY, Dong YL, Tan SJ, Shi H и др. (2010). «Распределение Y-хромосомы среди населения Северо-Западного Китая указывает на значительный вклад скотоводов из Центральной Азии и меньшее влияние западных евразийцев». Журнал генетики человека. 55 (5): 314–22. Дои:10.1038 / jhg.2010.30. PMID 20414255.

внешняя ссылка