Гаплогруппа D-CTS3946 - Haplogroup D-CTS3946

Гаплогруппа D-CTS3946
Возможное время происхождения	83000-64700 лет назад (по оценкам, примерно 73 200 лет назад)
Возможное место происхождения	Африка
Предок	DE
Потомки	D-M174 (D1); D-A5580.2 (D2, также известный как D0);
Определение мутаций	CTS3946, CTS4030 / Z1605

Гаплогруппа D или же D-CTS3946 это Гаплогруппа Y-хромосомы. И D-CTS3946, и E линии также демонстрируют однонуклеотидный полиморфизм M168 который присутствует во всех гаплогрупп Y-хромосомы, кроме А и B, а также YAP + полиморфизм уникального события, что уникально для Гаплогруппа DE. Субклады гаплогруппы D-CTS3946 встречаются в основном в Восточная Азия, хотя они также регулярно с низкой частотой встречаются в Центральная Азия и Юго-Восточная Азия, а также были спорадически обнаружены в Западная африка и Западная Азия.

Обзор

Предполагаемая миграция гаплогруппы D согласно Haber et al.

Гаплогруппа D ранее была названием линии передачи D. D-M174. Тем не менее, исследование (Haber et al. 2019) выявило гаплогруппу, названную «D0», в трех нигерийских выборках. Гаплогруппа «D0» находится за пределами M174, но разделяет с ней 7 SNP, которых нет у E. Авторы рассматривают несколько возможностей, но отчасти из-за вероятной глубоко укоренившейся гаплогруппы «D0», а также недавно рассчитанного раннего времени расхождения для нее и ее родительской гаплогруппы, DE, авторы делают вывод в пользу африканского происхождения D0. DE, а также для общего предка (теперь известного как D-CTS3946 или "D") D0 и D-M174. Согласно Хаберу и др., D0 - это ветвь линии передачи DE рядом с разделением DE, но на ветви D, расходящейся около 71000 лет назад. Авторы находят время расхождения для DE *, E и D0, вероятно, в пределах периода примерно 76000-71000 лет назад, и вероятную дату выхода предков современных евразийцев из Африки (и последующей примеси неандертальцев) позже. , около 50 300–59 400 лет назад, что, по их мнению, также подтверждает африканское происхождение этих гаплогрупп.^[1] Таким образом, предполагается, что D-CTS3946 распространился как внутри, так и за пределами Африки: одна ветвь расходится в D0 в Африке, а другая ветвь за пределами Африки в конечном итоге расходится в D-M174 (то есть с мутацией M174, позже возникшей из D-CTS3946, которая распространился в Азию). «D0» также был назван «D2», а бывший D (D-M174) теперь также был назван «D1» из-за этого открытия.

Три других образца D2 также были обнаружены в Западной Азии (также в 2019 году): два в Саудовской Аравии и один в Сирии. Образец, обнаруженный в Сирии, на сегодняшний день является самым базальным образцом D2. Недавние данные (как также предложено Хабером и др.) Предполагают, что D2 является сильно дивергентной гаплогруппой, близкой к расщеплению DE, но на ветви D и не имеющей мутации M174, присущей другим известным линиям D (принадлежащим ее брату D- M174).^[2]

Филогения субкладов

ISOGG (версия: 14.151).^[3]

DE (ЯП)
- D (CTS3946)
  - D1 (M174 / страница 30, IMS-JST021355)
    - D1a (CTS11577)
      - D1a1 (F6251 / Z27276)
        D1a1a (M15)
        D1a1a1 (F849)
        D1a1a1a (N1)
        D1a1a1a1 (Z27269) Япония, Китай, Тибет^[4]
        D1a1a1a1a (PH4979)
        D1a1a1a1a1 (BY15119 / Z29428)
        D1a1a1a2 (Z31591) Непал (Таманг), Казахстан, Китай (Йи)
        D1a1a2 (F1070) Китай
        D1a1b (P99)Тибет, Монгол, Центральная Азия^[4]
      - D1a2(Z3660)
        D1a2a (M64.1 / Страница 44.1, M55)Япония^[4]
        D1a2a1 (M116.1)
        D1a2a2 (CTS131)
        D1a2a2a (CTS220)
        D1a2a2b (CTS68) Япония (остров Ребун)
        D1a2b (Y34637)Андаманские острова^[5]
    - D1b (L1378) Филиппины^[6]
  - D2 (A5580.2)Нигерия,^[1] Саудовская Аравия, Сирия^[2]

Филогенетическое древо человека Гаплогруппы ДНК Y-хромосомы ^{[χ 1]}^{[χ 2]}

"Y-хромосомный Адам "

A0-T ^{[χ 3]}

A1 ^{[χ 4]}

F2

F3

GHIJK

я

J

LT ^{[χ 5]}

K2 ^{[χ 6]}

L

Т

K2a ^{[χ 7]}

K2b ^{[χ 8]}

K2c

K2d

K2e ^{[χ 9]}

K-M2313 ^{[χ 10]}

K2b1 ^{[χ 11]}

п ^{[χ 12]}

НЕТ

S ^{[χ 13]}

M ^{[χ 14]}

P1

P2

Сноски

^ Ван Овен М., Ван Гейстелен А., Кайзер М., Декорте Р., Larmuseau HD (2014). «Видеть лес за деревьями: минимальная эталонная филогения Y-хромосомы человека». Человеческая мутация. 35 (2): 187–91. Дои:10.1002 / humu.22468. PMID 24166809.
^ Международное общество генетической генеалогии (ISOGG; 2015), Дерево гаплогруппы Y-ДНК 2015. (Дата обращения: 1 февраля 2015 г.)
^ Гаплогруппа A0-T также известна как A-L1085 (а ранее как A0'1'2'3'4).
^ Гаплогруппа A1 также известна как A1'2'3'4.
^ Гаплогруппа LT (L298 / P326) также известна как гаплогруппа K1.
^ Между 2002 и 2008 гг. Гаплогруппа T-M184 была известна как «Гаплогруппа К2». С тех пор это имя было изменено на K-M526, брат Haplogroup LT.
^ Гаплогруппа K2a (M2308) и ее первичный субклад K-M2313 были отделены от гаплогруппы NO (F549) в 2016 году (это последовало за публикацией: Позник GD, Xue Y, Mendez FL, et al. (2016). «Прерывистые всплески в демографии мужчин-мужчин на основе 1244 всемирных последовательностей Y-хромосомы». Природа Генетика. 48 (6): 593–9. Дои:10,1038 / нг.3559. ЧВК 4884158. PMID 27111036. В прошлом другие гаплогруппы, включая NO (M214) и K2e, также были идентифицированы с именем «K2a».
^ Гаплогруппа K2b (M1221 / P331 / PF5911) также известна как MPS гаплогруппы.
^ Гаплогруппа K2e (K-M147) ранее была известна как «гаплогруппа X» и «K2a» (но является дочерней субкладой нынешней K2a).
^ K-M2313 *, у которого еще нет филогенетического названия, был зарегистрирован у двух живых людей, имеющих этнические связи с Индией и Юго-Восточной Азией. Кроме того, K-Y28299, который, по-видимому, является основной ветвью K-M2313, был обнаружен у трех живых людей из Индии. См .: Позник op. соч.; YFull YTree v5.08, 2017, «К-М2335», и; Филодерево, 2017, «Детали маркеров Y-SNP, включенных в минимальное дерево Y» (Дата доступа к этим страницам: 9 декабря 2017 г.)
^ Гаплогруппа K2b1 (P397 / P399) также известна как гаплогруппа MS, но имеет более широкую и сложную внутреннюю структуру.
^ Гаплогруппа P (P295) также известна как K2b2.
^ Гаплогруппа S с 2017 года также известна как K2b1a. (Ранее имя Гаплогруппа S было присвоено K2b1a4.)
^ Гаплогруппа M, по состоянию на 2017 год, также известна как K2b1b. (Ранее имя Гаплогруппа M было присвоено K2b1d.)

Гаплогруппа D-CTS3946 - Haplogroup D-CTS3946

Обзор

Филогения субкладов

Рекомендации