Гаплогруппа M-P256 - Haplogroup M-P256

Гаплогруппа M-M4
Возможное время происхождения	8 200 [3 800–20 600] лет назад (Кайзер 2003 )
Возможное место происхождения	Юго-Восточная Азия - Меланезия[нужна цитата ]
Предок	M-P256
Определение мутаций	M4, M5 / P73, M106, M186, M189, M296, P35[нужна цитата ]

Гаплогруппа M-P256
Возможное время происхождения	32000-47000 лет назад (Scheinfeldt 2006 )
Возможное место происхождения	Wallacea (восточная Индонезия); или же Новая Гвинея
Предок	K2b1
Определение мутаций	P256

Гаплогруппа M, также известный как M-P256 и Гаплогруппа K2b1b (ранее K2b1d) является Гаплогруппа ДНК Y-хромосомы. M-P256 является потомком гаплогруппы Гаплогруппа K2b1, и считается, что впервые он появился между 32000 и 47000 лет назад (Scheinfeldt 2006 ).

M-P256 - наиболее часто встречающаяся гаплогруппа Y-хромосомы в Западное Папуа и западный Папуа - Новая Гвинея (Кайзер 2003 ). Встречается также в соседних частях Меланезия, Индонезия и среди коренные австралийцы.

Это и Гаплогруппа S (B254) - единственные первичные субклады K2b1, также известная как гаплогруппа MS.

Филогенетическая структура

Это филогенетическое дерево субкладов гаплогрупп основано в первую очередь на деревьях, опубликованных ISOGG в 2016 г. (ISOGG 2016 ) и YCC в 2008.(Карафет 2008 )

M * (P256)
- M1 (M4, M5 / P73, M106, M186, M189, M296, P35)
  - M1a(P34_1, P34_2, P34_3, P34_4, P34_5)
    - M1a1 (P51)
    - M1a2 (P94)
  - M1b (P87)
    - M1b1 (M104_1 / P22_1, M104_2 / P22_2)
      - M1b1a (M16)
      - M1b1b (M83)
- M2 (M353, M387)
  - M2a (M177 / SRY9138)
- M3 (P117, P118)

Распределение

M * (M-P256 *)

Парагруппа M-P256 * встречается с низкой заболеваемостью в Новая Гвинея (6,3%) и Флорес (2.5%).^[1]

М1 (М-М4)

Часто встречается в Новая Гвинея и Меланезия, с умеренным распространением в соседних частях Индонезия, Микронезия, и Полинезия.

Уна 100% (Кайзер 2003 )
Кетенгбан 100% (Кайзер 2003 )
Авю 100% (Кайзер 2003 )
Читак 86% (Кайзер 2003 )
Асмат 75% (Кайзер 2003 )
Западное Папуа
- низменности / побережье 77,5% (Кайзер 2003 )
- высокогорье 74,5% (Кайзер 2003 )
Комбай /Коровай 46% (Кайзер 2003 )
Папуа - Новая Гвинея
- побережье 29% (Кайзер 2003 )
- высокогорье 35,5% (Кайзер 2003 )
Толай (Новая Британия) 31% (Кайзер 2003 )
Острова Тробриан 30% (Кайзер 2003 )
Малуку (Молуккские острова) 21% (Кайзер 2003 )
Жители островов Торресова пролива (Австралия): до 2,0%, то есть 0,9% выборок, когда 45% от общего количества считались «некоренными».Нэгл 2015 )

Крайний географический выброс был явно выявлен в исследовании 2012 года, в котором сообщалось о Хазара человек из Мазари-Шариф, Афганистан, с M1 среди выборки из 60 мужчин из Мазари-Шарифа (Хабер 2012 ). У этого хазарейца был SNP M186 (который считается эквивалентом M4).

Старые имена (YCC 2002/2008)	М-М4
Джоблинг и Тайлер-Смит 2000	24
Андерхилл 2000	VIII
Молот 2001	1U
Карафет 2001	37
Семино 2000	Eu16
Вс 1999	H17
Капелли 2001	E
YCC 2002 (от руки)	М *
YCC 2005 (от руки)	M
YCC 2008 (от руки)	M1
YCC 2010r (от руки)	M1

M1a (M-P34)

M1a (M-P34) - наиболее часто встречающаяся гаплогруппа ДНК Y-хромосомы в Западная Новая Гвинея. Он также встречается с умеренной частотой в соседних частях Индонезия (Малуку, Нуса Тенгара ) и повсюду Папуа - Новая Гвинея, включая прибрежные острова (Карафет 2005 и Кайзер 2008).

Старые имена (YCC 2002/2008)	M-P34
Джоблинг и Тайлер-Смит 2000	24
Андерхилл 2000	VIII
Молот 2001	1U
Карафет 2001	37
Семино 2000	Eu16
Вс 1999	H17
Капелли 2001	E
YCC 2002 (от руки)	M1
YCC 2005 (от руки)	M1
YCC 2008 (от руки)	M1a
YCC 2010r (от руки)	M1a

M1b (M-P87)

M1b M-P87 (xM104 / P22) был обнаружен примерно в 18% (20/109) пула образцов из Новая Ирландия, примерно 12% (5/43) образца Лавонгай из Нью-Ганновер, примерно 5% (19/395) пула образцов из Новая Британия (и, в частности, примерно в 24% (15/63) Бейнинг из Восточная Новая Британия ), в одной Сапоса человек с севера Бугенвиль, а у другого человека с северного побережья Папуа - Новая Гвинея (Scheinfeldt 2006 ).

Субклад M1b1 (M104_1 / P22_1, M104_2 / P22_2) часто встречается в популяциях Архипелаг Бисмарка и Остров Бугенвиль, с умеренным распространением в Новая Гвинея, Фиджи, Тонга, Восточная Футуна, и Самоа. (Кайзер 2008 и Scheinfeldt 2006).

Старые имена (YCC 2002/2008)	M-P22
Джоблинг и Тайлер-Смит 2000	24
Андерхилл 2000	VIII
Молот 2001	1U
Карафет 2001	38
Семино 2000	Eu16
Вс 1999	H17
Капелли 2001	E
YCC 2002 (от руки)	M2 *
YCC 2005 (от руки)	M2a
YCC 2008 (от руки)	M1b1
YCC 2010r (от руки)	M1b1

M2 (M-M353)

Обнаружен с низкой частотой в Фиджи и Восточная Футуна (Кайзер 2006 ).

Субклад M2a (M-M177 a.k.a. M-SRY9138) находится в одном Насиой человек с восточного побережья Бугенвиль и у одного человека из Провинция Малаита из Соломоновы острова (Кокс 2006 ).

Исторические названия M-SRY9138 (a.k.a. M-M177) из рецензируемой литературы.

Старые имена (YCC 2002/2008)	K-SRY9138 / M-SRY9138 AKA M-M177
Джоблинг и Тайлер-Смит 2000	23
Андерхилл 2000	VIII
Молот 2001	1E
Карафет 2001	25
Семино 2000	Eu16
Вс 1999	H5
Капелли 2001	F
YCC 2002 (от руки)	K1
YCC 2005 (от руки)	K1
YCC 2008 (от руки)	M2a
YCC 2010r (от руки)	M2a

M3 (M-P117)

M3 (P117, P118) часто встречается в популяциях Новая Британия, а также иногда наблюдается в северных Бугенвиль, Фиджи, и Восточная Футуна (Кайзер 2008 и Scheinfeldt 2006).

Предыдущая филогенетическая история

До 2002 года в академической литературе существовало по крайней мере семь систем именования Филогенетического дерева Y-хромосомы. Это привело к значительной путанице. В 2002 году основные исследовательские группы объединились и сформировали Консорциум Y-хромосомы (YCC). Они опубликовали совместный документ, в котором было создано единое новое дерево, которое все согласились использовать. Позже группа гражданских ученых, интересующихся популяционной генетикой и генетической генеалогией, сформировала рабочую группу для создания любительского дерева, стремясь быть, прежде всего, своевременным. В приведенной ниже таблице собраны все эти работы на основе знакового Дерева YCC 2002 года. Это позволяет исследователю, просматривающему ранее опубликованную литературу, быстро перемещаться между номенклатурами.

YCC 2002/2008 (стенография)	(α)	(β)	(γ)	(δ)	(е)	(ζ)	(η)	YCC 2002 (от руки)	YCC 2005 (от руки)	YCC 2008 (от руки)	YCC 2010r (от руки)	ISOGG 2006	ISOGG 2007	ISOGG 2008	ISOGG 2009	ISOGG 2010	ISOGG 2011	ISOGG 2012
M4	24	VIII	1U	37	Eu16	H17	E	М *	M	M1	M1	-	-	-	-	-	-	-
M-P34	24	VIII	1U	37	Eu16	H17	E	M1	M1	M1a	M1a	-	-	-	-	-	-	-
M-P22 / M-M104	24	VIII	1U	38	Eu16	H17	E	M2 *	M2a	M1b1	M1b1	-	-	-	-	-	-	-
М-М16	24	VIII	1U	39	Eu16	H17	E	M2a	M2a1	M1b1a	M1b1a	-	-	-	-	-	-	-
M-M83	24	VIII	1U	38	Eu16	H17	E	M2b	M2a2	M1b1b	M1b1b	-	-	-	-	-	-	-
K-SRY9138 / M-SRY9138	23	VIII	1E	25	Eu16	H5	F	K1	K1	M2a	M2a	-	-	-	-	-	-	-

Источники

Следующие исследовательские группы в соответствии с их публикациями были представлены в создании Дерева YCC.

α Джоблинг и Тайлер-Смит 2000 и Каладжиева 2001
β Андерхилл 2000
γ Молот 2001
δ Карафет 2001
ε Семино 2000
ζ Вс 1999
η Капелли 2001

В статье Карафета 2008 г. внесен ряд изменений по сравнению с предыдущей. 2006 ISOGG дерево. До открытия маркера P256 текущая подгруппа M-M4 (определяемая маркером M4) ранее представляла всю гаплогруппу M-P256; и подгруппы M2 и M3 ранее классифицировались как подгруппы K1 и K7 родительского Гаплогруппа K.^{[нужна цитата ]}

внешняя ссылка

Распространение гаплогруппы M, из Национальная география

Смотрите также

Филогенетическое древо человека Гаплогруппы ДНК Y-хромосомы ^{[χ 1]}^{[χ 2]}

"Y-хромосомный Адам "

A0-T ^{[χ 3]}

A1 ^{[χ 4]}

F2

F3

GHIJK

я

J

LT ^{[χ 5]}

K2 ^{[χ 6]}

L

Т

K2a ^{[χ 7]}

K2b ^{[χ 8]}

K2c

K2d

K2e ^{[χ 9]}

K-M2313 ^{[χ 10]}

K2b1 ^{[χ 11]}

п ^{[χ 12]}

НЕТ

S ^{[χ 13]}

M ^{[χ 14]}

P1

P2

Сноски

^ Ван Овен М., Ван Гейстелен А., Кайзер М., Декорте Р., Larmuseau HD (2014). «Видеть лес за деревьями: минимальная эталонная филогения Y-хромосомы человека». Человеческая мутация. 35 (2): 187–91. Дои:10.1002 / humu.22468. PMID 24166809.
^ Международное общество генетической генеалогии (ISOGG; 2015), Дерево гаплогруппы Y-ДНК 2015. (Дата обращения: 1 февраля 2015 г.)
^ Гаплогруппа A0-T также известна как A-L1085 (а ранее как A0'1'2'3'4).
^ Гаплогруппа A1 также известна как A1'2'3'4.
^ Гаплогруппа LT (L298 / P326) также известна как гаплогруппа K1.
^ С 2002 по 2008 гг. Гаплогруппа T-M184 была известна как «Гаплогруппа К2». С тех пор это имя было изменено на K-M526, брат Haplogroup LT.
^ Гаплогруппа K2a (M2308) и ее первичный субклад K-M2313 были отделены от гаплогруппы NO (F549) в 2016 году (это последовало за публикацией: Позник Г.Д., Сюэ У., Мендес Ф.Л. и др. (2016). «Прерывистые всплески в демографии мужчин-мужчин, выведенные из 1244 всемирных последовательностей Y-хромосомы». Природа Генетика. 48 (6): 593–9. Дои:10,1038 / нг.3559. ЧВК 4884158. PMID 27111036. В прошлом другие гаплогруппы, включая NO (M214) и K2e, также были идентифицированы с именем «K2a».
^ Гаплогруппа K2b (M1221 / P331 / PF5911) также известна как MPS гаплогруппы.
^ Гаплогруппа K2e (K-M147) ранее была известна как «гаплогруппа X» и «K2a» (но является дочерней субкладой нынешней K2a).
^ K-M2313 *, у которого пока нет филогенетического названия, был зарегистрирован у двух живых людей, имеющих этнические связи с Индией и Юго-Восточной Азией. Кроме того, K-Y28299, который, по-видимому, является основной ветвью K-M2313, был обнаружен у трех живых людей из Индии. См .: Позник op. соч.; YFull YTree v5.08, 2017, «К-М2335», и; Филодерево, 2017, «Детали маркеров Y-SNP, включенных в минимальное дерево Y» (Дата доступа к этим страницам: 9 декабря 2017 г.)
^ Гаплогруппа K2b1 (P397 / P399) также известна как гаплогруппа MS, но имеет более широкую и сложную внутреннюю структуру.
^ Гаплогруппа P (P295) также известна как K2b2.
^ Гаплогруппа S с 2017 года также известна как K2b1a. (Ранее имя Гаплогруппа S было присвоено K2b1a4.)
^ Гаплогруппа M, по состоянию на 2017 год, также известна как K2b1b. (Ранее имя Гаплогруппа M было присвоено K2b1d.)

[karafet_2010-1] а ^б Татьяна М. Карафет, Брайан Холлмарк, Мюррей П. Кокс, Херавати Судойо, Шон Дауни, Дж. Стивен Лансинг и Майкл Ф. Хаммер, «Основное деление Восток-Запад лежит в основе стратификации Y-хромосомы в Индонезии», Молекулярно-биологическая эволюция, (2010), т. 27, нет. 8. С. 1833-1844.

[vanOven2014-2] Ван Овен М., Ван Гейстелен А., Кайзер М., Декорте Р., Larmuseau HD (2014). «Видеть лес за деревьями: минимальная эталонная филогения Y-хромосомы человека». Человеческая мутация. 35 (2): 187–91. Дои:10.1002 / humu.22468. PMID 24166809.

[ISOGG2015-3] Международное общество генетической генеалогии (ISOGG; 2015), Дерево гаплогруппы Y-ДНК 2015. (Дата обращения: 1 февраля 2015 г.)

[A0-T-4] Гаплогруппа A0-T также известна как A-L1085 (а ранее как A0'1'2'3'4).

[A1-5] Гаплогруппа A1 также известна как A1'2'3'4.

[LT-6] Гаплогруппа LT (L298 / P326) также известна как гаплогруппа K1.

[K2-7] С 2002 по 2008 гг. Гаплогруппа T-M184 была известна как «Гаплогруппа К2». С тех пор это имя было изменено на K-M526, брат Haplogroup LT.

[K2a-8] Гаплогруппа K2a (M2308) и ее первичный субклад K-M2313 были отделены от гаплогруппы NO (F549) в 2016 году (это последовало за публикацией: Позник Г.Д., Сюэ У., Мендес Ф.Л. и др. (2016). «Прерывистые всплески в демографии мужчин-мужчин, выведенные из 1244 всемирных последовательностей Y-хромосомы». Природа Генетика. 48 (6): 593–9. Дои:10,1038 / нг.3559. ЧВК 4884158. PMID 27111036. В прошлом другие гаплогруппы, включая NO (M214) и K2e, также были идентифицированы с именем «K2a».

[K2b-9] Гаплогруппа K2b (M1221 / P331 / PF5911) также известна как MPS гаплогруппы.

[K2e-10] Гаплогруппа K2e (K-M147) ранее была известна как «гаплогруппа X» и «K2a» (но является дочерней субкладой нынешней K2a).

[K-M2313-11] K-M2313 *, у которого пока нет филогенетического названия, был зарегистрирован у двух живых людей, имеющих этнические связи с Индией и Юго-Восточной Азией. Кроме того, K-Y28299, который, по-видимому, является основной ветвью K-M2313, был обнаружен у трех живых людей из Индии. См .: Позник op. соч.; YFull YTree v5.08, 2017, «К-М2335», и; Филодерево, 2017, «Детали маркеров Y-SNP, включенных в минимальное дерево Y» (Дата доступа к этим страницам: 9 декабря 2017 г.)

[K2b1-12] Гаплогруппа K2b1 (P397 / P399) также известна как гаплогруппа MS, но имеет более широкую и сложную внутреннюю структуру.

[P-13] Гаплогруппа P (P295) также известна как K2b2.

[S-14] Гаплогруппа S с 2017 года также известна как K2b1a. (Ранее имя Гаплогруппа S было присвоено K2b1a4.)

[M-15] Гаплогруппа M, по состоянию на 2017 год, также известна как K2b1b. (Ранее имя Гаплогруппа M было присвоено K2b1d.)

[1]

[χ 1]

[χ 2]

[χ 3]

[χ 4]

[χ 5]

[χ 6]

[χ 7]

[χ 8]

[χ 9]

[χ 10]

[χ 11]

[χ 12]

[χ 13]

[χ 14]