Гаплогруппа P1 (Y-ДНК) - Haplogroup P1 (Y-DNA)

Гаплогруппа P1 ; (P-M45; K2b2a)
Возможное место происхождения	Юго-Восточная Азия или же Восточная Азия
Предок	п (P-P295)
Потомки	Q (Q-M242) и; р (R-M207).
Определение мутаций	M45 / PF5962

Гаплогруппа P1, также известный как П-М45 и K2b2a, это Гаплогруппа ДНК Y-хромосомы в генетика человека. Определяется SNP M45 и PF5962, P1 является первичной ветвью (субкладом) п (P-P295; K2b2).

Единственными первичными субкладами P1 являются Гаплогруппа Q (Q-M242) и Гаплогруппа R (R-M207). Эти гаплогруппы теперь составляют большинство мужских линий среди Коренные американцы, Европейцы, Центральная Азия и Южная Азия, среди других частей мира.

P1 (M45), вероятно, возник в Восточная Азия или же Юго-Восточная Азия,^[2]^[1] несмотря на то, что базальный P1 * (P1xQ, R) в настоящее время наиболее распространен среди людей в Восточная Сибирь и Центральная Азия.^[5] Обе П* и его предшественник, K2b, достигают самых высоких показателей среди членов Aeta (или Агта) люди Лусон в Филиппины,^[3]^[1] и; Лусон также единственное место, где П*, P1 и гаплогруппа P2 (P-B253; K2b2b), единственный другой первичный субклад P *, были обнаружены вместе.^[6]^[1]^[2] Исследование 2018 г. обнаружило базальный P1 * у двух сибирских особей, датированных Верхний палеолит (~ 31 630 кал. Бар.) С Река Яна археологические раскопки.^[7]

Структура

В субклады гаплогруппы P1 с их определяющей мутацией, согласно дереву ISOGG 2016 года:^[6]

P1 (M45 / PF5962)
- Q (M242)
  - Q1 (L232 / S432)
- р (M207, P224, P227, P229, P232, P280, P285, L248.2, V45)
  - R1 (M173 / P241 / Страница 29)
  - R2 (M479 / PF6107)

Современное распространение

P1 *

Современные популяции с высокими частотами P1 * (или P1xQ, R) расположены в Центральная Азия и Восточная Сибирь:

35,4% среди Тувинец самцы;
35% среди Нивхский и;
28,3% среди Алтай-Кижи.^[5]

Современное Южная Азия популяции также имеют P1 (M45) на низких и средних частотах.^[8] В Южной Азии P-M45 чаще всего встречается среди мусульман Манипур (Pangal, 33%), но это может быть связано с очень небольшим размером выборки (девять человек).

Уровни 14% P-M45 * на острове Корчула в Далмация (современная Хорватия) и 6% на соседнем острове Хвар, может быть связано с иммиграцией в раннесредневековый период такими народами Центральной Азии, как Аварцы.^[9]

Возможно, что многие случаи гаплогруппы P1, зарегистрированные в Центральной Азии, Южной Азии и / или Западной Азии, являются членами редких или менее изученных субкладов гаплогрупп R2 и Q, а не P1 *. как таковой.

Группа населения	Языковая семья	Цитирование	Размер образца	Процент	Комментарии
Тувинский	Тюркский	Даренко 2005	113	35.40	П-М45
Нивхский	Нивхский	Лелл 2001	17	35	П-М45
Алтай-Кижи	Тюркский	Даренко 2005	92	28.3	П-М45
Тоджин	Тюркский	Даренко 2005	36	22.2	П-М45
Чукча	Чукотско-Камчатский	Лелл 2001	24	20.8	П-М45
Коряк	Чукотско-Камчатский	Лелл 2001	27	18.5	П-М45
Юпик	Эскимо-алеутские языки	Лелл 2001	33	18.2	П-М45
Уйгурский	Тюркский	Сюэ 2006	70	17.1	П-М45
Калмыцкий	Монгольский	Даренко 2005	68	11.8	П-М45
туркменский	Тюркский	Уэллс 2001	30	10	П-М45
Сойот	Тюркский	Даренко 2005	34	8.8	П-М45
Урянхай	Монгольский	Като 2004	60	8.3	П-М45
Хакасский	Тюркский	Даренко 2005	53	7.6	П-М45
Казахский	Тюркский	Уэллс 2001	54	5.6	П-М45
Узбекский	Тюркский	Уэллс 2001	366	5.5	П-М45
Хаси-Хмуик	Австроазиатский	Редди 2009	353	5.40	P-M45 (xM173)^§
Мунда	Австроазиатский	Редди 2009	64	10.90	P-M45 (xM173)^§
Никобарцы	Пн-кхмерский	Редди 2009	11	0.00	P-M45 (xM173)^§
Юго-Восточная Азия	Австроазиатский	Редди 2009	257	1.60	P-M45 (xM173)^§
Гаро	Тибето-бирманский	Редди 2009	71	1.40	P-M45 (xM173)^§
Северо-восточная Индия	Тибето-бирманский	Редди 2009	226	3.10	P-M45 (xM173)^§
Восточная Азия	Тибето-бирманский	Редди 2009	214	0.00	P-M45 (xM173)^§
Восточная Индия	различные / неизвестные	Редди 2009	54	18.50	P-M45 (xM173)^§
Южный Талыш (Иран)	Иранский	Насидзе 2009 г.	50	4.00	P-M45 (xM124, xM173)
Северный Талыш (Азербайджан)	Иранский	Насидзе 2009 г.	40	5.00	P-M45 (xM124, xM173)
Мазандарани	Иранский	Насидзе 2009 г.	50	4.00	P-M45 (xM124, xM173)
Гилаки	Иранский	Насидзе 2009 г.	50	0.00	P-M45 (xM124, xM173)
Тегеран	Иранский	Насидзе 2004 г.	80	4.00	P-M45 (xM124, xM173)
Исфахан	Иранский	Насидзе 2004 г.	50	6.00	P-M45 (xM124, xM173)
Бахтиари	Иранский	Насидзе 2008	53	2.00	P-M45 (xM124, xM173)
Иранские арабы	арабский	Насидзе 2008	47	2.00	P-M45 (xM124, xM173)
Северный Иран	Иранский	Регейро 2006	33	9.00	P-M45 (xM124, xM173)
Южный Иран	Иранский	Регейро 2006	117	3.00	P-M45 (xM124, xM173)
Южный Кавказ	Грузинский	Насидзе и Стоункинг 2001	77	3.00	P-M45 (xM124, xM173)
Южный Кавказ	Армянский	Насидзе и Стоункинг 2001	100	2.00	P-M45 (xM124, xM173)
Шерпы из Непала	Тибето-бирманский	Bhandari et al. 2015 г.	582	1.67	P1 (M45) или P (xQ, R1a1, R1b, R2)^†
Шерпы из Тибета	Тибето-бирманский	Bhandari et al. 2015 г.	582	0.64	P1 (M45) или P (xQ, R1a1, R1b, R2)^†
Хвар (Далматинские острова )	хорватский	Барак и др. 2003 г.		14	Возможна ссылка на средневековье Аварский поселенцы.^[9]
Корчула (Далматинские острова)	хорватский	Барак и др. 2003 г.		6	Возможна ссылка на средневековье Аварский поселенцы.^[9]

^§ Может включать членов гаплогруппы R2.
^† Может включать членов гаплогруппы R1 * / R1a *

Группа населения	N	P (xQ, xR)		Q		р		Бумага
		Считать	%	Считать	%	Считать	%
Gope	16	1	6.4					Sahoo 2006
Ория брамин	24	1	4.2					Sahoo 2006
Махишья	17	3	17.6					Sahoo 2006
Бумидж	15	2	13.3					Sahoo 2006
Саора	13	3	23.1					Sahoo 2006
Непальский	7	2	28.6					Sahoo 2006
Мусульмане Манипура	9	3	33.3					Sahoo 2006
Химачал-Прадеш, Раджпут	15	1	6.7					Sahoo 2006
Ламбади	18	4	22.2					Sahoo 2006
Гуджаратский Патель	9	2	22.2					Sahoo 2006
Каткари	19	1	5.3					Sahoo 2006
Мадиа Гонд	14	1	7.1					Sahoo 2006
Камма Чоудари	15	0	0	1	6.7	12	80	Sahoo 2006

Q

Почти универсален в Кеты (95%) Сибири. Очень распространено в досовременном Коренной американец населения, за исключением На-Дене народов, где она достигает 50-90%.

Также часто встречается в 25-50% в современных сибирских популяциях, таких как Нивхи, Селькупов, Тувинцы, Чукча, Сибирские эскимосы, Северная Алтайцы, а в 30% Туркмены.

р

Единственный обнаруженный случай базального R * (т.е. тот, который не принадлежит R1 или R2) - это Мальта Бой.

Субклады R1b, R1a и R2 сейчас доминируют в различных популяциях от Европы до Южной Азии.

Источники

Барак; и другие. (2003). «Наследие Y-хромосомы хорватского населения и его островных изолятов» (PDF). Европейский журнал генетики человека. 11 (7): 535–542. Дои:10.1038 / sj.ejhg.5200992. PMID 12825075. S2CID 15822710.CS1 maint: ref = harv (связь)

внешняя ссылка

Распространение гаплогруппы P, из Генографический проект, Национальная география

Филогенетическое древо человека Гаплогруппы ДНК Y-хромосомы ^{[χ 1]}^{[χ 2]}

"Y-хромосомный Адам "

A0-T ^{[χ 3]}

A1 ^{[χ 4]}

F2

F3

GHIJK

я

J

LT ^{[χ 5]}

K2 ^{[χ 6]}

L

Т

K2a ^{[χ 7]}

K2b ^{[χ 8]}

K2c

K2d

K2e ^{[χ 9]}

K-M2313 ^{[χ 10]}

K2b1 ^{[χ 11]}

п ^{[χ 12]}

НЕТ

S ^{[χ 13]}

M ^{[χ 14]}

P1

P2

Сноски

^ Ван Овен М., Ван Гейстелен А., Кайзер М., Декорте Р., Larmuseau HD (2014). «Видеть лес за деревьями: минимальная эталонная филогения Y-хромосомы человека». Человеческая мутация. 35 (2): 187–91. Дои:10.1002 / humu.22468. PMID 24166809.
^ Международное общество генетической генеалогии (ISOGG; 2015), Дерево гаплогруппы Y-ДНК 2015. (Дата обращения: 1 февраля 2015 г.)
^ Гаплогруппа A0-T также известна как A-L1085 (а ранее как A0'1'2'3'4).
^ Гаплогруппа A1 также известна как A1'2'3'4.
^ Гаплогруппа LT (L298 / P326) также известна как гаплогруппа K1.
^ С 2002 по 2008 гг. Гаплогруппа T-M184 была известна как «Гаплогруппа К2». С тех пор это имя было изменено на K-M526, брат Haplogroup LT.
^ Гаплогруппа K2a (M2308) и ее первичный субклад K-M2313 были отделены от гаплогруппы NO (F549) в 2016 году (это последовало за публикацией: Позник Г.Д., Сюэ У., Мендес Ф.Л. и др. (2016). «Прерывистые всплески в демографии мужчин-мужчин, выведенные из 1244 всемирных последовательностей Y-хромосомы». Природа Генетика. 48 (6): 593–9. Дои:10,1038 / нг.3559. ЧВК 4884158. PMID 27111036. В прошлом другие гаплогруппы, включая NO (M214) и K2e, также были идентифицированы с именем «K2a».
^ Гаплогруппа K2b (M1221 / P331 / PF5911) также известна как MPS гаплогруппы.
^ Гаплогруппа K2e (K-M147) ранее была известна как «гаплогруппа X» и «K2a» (но является дочерней субкладой нынешней K2a).
^ K-M2313 *, у которого пока нет филогенетического названия, был зарегистрирован у двух живых людей, имеющих этнические связи с Индией и Юго-Восточной Азией. Кроме того, K-Y28299, который, по-видимому, является основной ветвью K-M2313, был обнаружен у трех живых людей из Индии. См .: Позник op. соч.; YFull YTree v5.08, 2017, «К-М2335», и; Филодерево, 2017, «Детали маркеров Y-SNP, включенных в минимальное дерево Y» (Дата доступа к этим страницам: 9 декабря 2017 г.)
^ Гаплогруппа K2b1 (P397 / P399) также известна как гаплогруппа MS, но имеет более широкую и сложную внутреннюю структуру.
^ Гаплогруппа P (P295) также известна как K2b2.
^ Гаплогруппа S с 2017 года также известна как K2b1a. (Ранее имя Гаплогруппа S было присвоено K2b1a4.)
^ Гаплогруппа M, по состоянию на 2017 год, также известна как K2b1b. (Ранее имя Гаплогруппа M было присвоено K2b1d.)

[tumonggor-1] а ^б ^c ^d Тумонггор, Карафет и др., 2014, «Изоляция, контакты и социальное поведение сформировали генетическое разнообразие в Западном Тиморе», Журнал генетики человека Vol. 59, № 9 (сентябрь), стр. 494–503.

[heyer-2] а ^б ^c Э. Хейер и др., 2013, "Генетическое разнообразие четырех филиппинских популяций негрито на Лусоне: сравнение эффективных размеров мужского и женского населения и дифференцированная интеграция иммигрантов в общины аета и агта", Человеческая биология, Vol. 85, вып. 1, стр. 201.

[Karafet_2014-3] а ^б Татьяна М Карафет; и другие. (2015). «Улучшенное филогенетическое разрешение и быстрая диверсификация гаплогруппы Y-хромосомы K-M526 в Юго-Восточной Азии» (PDF). Европейский журнал генетики человека. 23 (3): 369–373. Дои:10.1038 / ejhg.2014.106. ЧВК 4326703. PMID 24896152.

[4] Грегори Р. Магун; и другие. (2013-11-22). «Генерация филогении Y-хромосомы с высоким разрешением априори с использованием данных секвенирования следующего поколения». bioRxiv 10.1101/000802.

[zgms.cm.umk.pl-5] а ^б Мирослава Деренко и др. 2005, Контрастные паттерны вариации Y-хромосомы в популяциях Южной Сибири из Байкальского и Алтае-Саянского регионов Zgms.cm.umk.pl

[isogg2016-6] а ^б ISOGG (2016). «Y-ДНК гаплогруппа P». Получено 2016-12-11.

[7] Сикора, Мартин; Питулько, Владимир; Соуза, Витор; Аллентофт, Мортен Э .; Виннер, Лассе; Расмуссен, Саймон; Маргарян, Ашот; Дамгаард, Питер де Баррос; Кастро, Констанца де ла Фуэнте (22.10.2018). «История населения Северо-Восточной Сибири с плейстоцена». bioRxiv: 448829. Дои:10.1101/448829.

[8] Саху, С. (2006). «Предыстория индийских Y-хромосом: оценка сценариев демической диффузии». Труды Национальной академии наук. 103 (4): 843–8. Bibcode:2006ПНАС..103..843С. Дои:10.1073 / pnas.0507714103. ЧВК 1347984. PMID 16415161.

[Francalacci-9] а ^б ^c Паоло Франкалаччи и Дарья Санна, "История и география Y-хромосомы человека в Европе: перспектива SNP", Журнал антропологических наук, т. 86 (2008), стр. 59-89. [Доступ: 24 августа 2017 г.].)

[vanOven2014-10] Ван Овен М., Ван Гейстелен А., Кайзер М., Декорте Р., Larmuseau HD (2014). «Видеть лес за деревьями: минимальная эталонная филогения Y-хромосомы человека». Человеческая мутация. 35 (2): 187–91. Дои:10.1002 / humu.22468. PMID 24166809.

[ISOGG2015-11] Международное общество генетической генеалогии (ISOGG; 2015), Дерево гаплогруппы Y-ДНК 2015. (Дата обращения: 1 февраля 2015 г.)

[A0-T-12] Гаплогруппа A0-T также известна как A-L1085 (а ранее как A0'1'2'3'4).

[A1-13] Гаплогруппа A1 также известна как A1'2'3'4.

[LT-14] Гаплогруппа LT (L298 / P326) также известна как гаплогруппа K1.

[K2-15] С 2002 по 2008 гг. Гаплогруппа T-M184 была известна как «Гаплогруппа К2». С тех пор это имя было изменено на K-M526, брат Haplogroup LT.

[K2a-16] Гаплогруппа K2a (M2308) и ее первичный субклад K-M2313 были отделены от гаплогруппы NO (F549) в 2016 году (это последовало за публикацией: Позник Г.Д., Сюэ У., Мендес Ф.Л. и др. (2016). «Прерывистые всплески в демографии мужчин-мужчин, выведенные из 1244 всемирных последовательностей Y-хромосомы». Природа Генетика. 48 (6): 593–9. Дои:10,1038 / нг.3559. ЧВК 4884158. PMID 27111036. В прошлом другие гаплогруппы, включая NO (M214) и K2e, также были идентифицированы с именем «K2a».

[K2b-17] Гаплогруппа K2b (M1221 / P331 / PF5911) также известна как MPS гаплогруппы.

[K2e-18] Гаплогруппа K2e (K-M147) ранее была известна как «гаплогруппа X» и «K2a» (но является дочерней субкладой нынешней K2a).

[K-M2313-19] K-M2313 *, у которого пока нет филогенетического названия, был зарегистрирован у двух живых людей, имеющих этнические связи с Индией и Юго-Восточной Азией. Кроме того, K-Y28299, который, по-видимому, является основной ветвью K-M2313, был обнаружен у трех живых людей из Индии. См .: Позник op. соч.; YFull YTree v5.08, 2017, «К-М2335», и; Филодерево, 2017, «Детали маркеров Y-SNP, включенных в минимальное дерево Y» (Дата доступа к этим страницам: 9 декабря 2017 г.)

[K2b1-20] Гаплогруппа K2b1 (P397 / P399) также известна как гаплогруппа MS, но имеет более широкую и сложную внутреннюю структуру.

[P-21] Гаплогруппа P (P295) также известна как K2b2.

[S-22] Гаплогруппа S с 2017 года также известна как K2b1a. (Ранее имя Гаплогруппа S было присвоено K2b1a4.)

[M-23] Гаплогруппа M, по состоянию на 2017 год, также известна как K2b1b. (Ранее имя Гаплогруппа M было присвоено K2b1d.)

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[χ 1]

[χ 2]

[χ 3]

[χ 4]

[χ 5]

[χ 6]

[χ 7]

[χ 8]

[χ 9]

[χ 10]

[χ 11]

[χ 12]

[χ 13]

[χ 14]