Генетический маркер - Genetic marker

Цыплята на изображении генетической карты курица. В геноме курицы 39 пар хромосом, а в геноме человека - 23 пары.

А генетический маркер это ген или же Последовательность ДНК с известным местоположением на хромосома которые можно использовать для идентификации людей или разновидность. Его можно описать как вариацию (которая может возникнуть из-за мутации или изменения в геномных локусах), которую можно наблюдать. Генетический маркер может быть короткой последовательностью ДНК, такой как последовательность, окружающая изменение одной пары оснований (однонуклеотидный полиморфизм, SNP) или длинный, например мини-спутники.

Фон

На протяжении многих лет, генное картирование ограничивалась идентификацией организмов по традиционным фенотипическим маркерам. Сюда входят гены, кодирующие легко наблюдаемые характеристики, такие как группа крови или форма семян. Недостаточное количество этих типов характеристик у некоторых организмов ограничивало усилия по картированию, которые могли быть выполнены. Это побудило к разработке генных маркеров, которые могли бы идентифицировать генетические характеристики, которые трудно наблюдать у организмов (например, вариации белков).[1]

Типы

Принцип открытия SFP для исследования генов

Некоторые часто используемые типы генетических маркеров:

Молекулярно-генетические маркеры можно разделить на два класса: а) биохимические маркеры, которые обнаруживают вариации на уровне генных продуктов, такие как изменения белков и аминокислот, и б) молекулярные маркеры, которые обнаруживают вариации на уровне ДНК, такие как изменения нуклеотидов: делеция, дупликация, инверсия и / или вставка. Маркеры могут иметь два типа наследования: доминантный / рецессивный или кодоминантный. Если генетический образец гомозигот можно отличить от гетерозигот, то считается, что маркер является содоминантным. Как правило, содоминантные маркеры более информативны, чем доминантные маркеры.[2]

Использует

Генетические маркеры могут использоваться для изучения взаимосвязи между наследственное заболевание и это генетический причина (например, конкретная мутация из ген что приводит к дефектному белок ). Известно, что фрагменты ДНК, расположенные рядом друг с другом на хромосоме, обычно наследуются вместе. Это свойство позволяет использовать маркер, который затем можно использовать для определения точного паттерна наследования гена, который еще не был точно локализован.

Генетические маркеры используются в генеалогическое тестирование ДНК за генетическая генеалогия определить генетическая дистанция между людьми или популяциями. Однородительские маркеры (на митохондриальный или же Y хромосома ДНК) изучаются для оценки материнского или отцовского родословная. Аутосомный маркеры используются для всех предков.

Генетические маркеры должны быть легко идентифицируемыми, связанными с конкретным локус, и очень полиморфный, потому что гомозиготы не предоставляем никакой информации. Обнаружение маркера может быть прямым путем секвенирования РНК или косвенным использованием аллозимы.

Некоторые из методов, используемых для изучения геном или же филогенетика являются RFLP, AFLP, RAPD, SSR. Их можно использовать для создания генетических карт любого изучаемого организма.

Был спор о том, что передается агент CTVT (трансмиссивная венерическая опухоль собак ) был. Многие исследователи выдвинули гипотезу, что вирусоподобные частицы ответственны за трансформацию клетки, в то время как другие полагали, что сама клетка способна инфицировать других собак как аллотрансплантат. С помощью генетических маркеров исследователи смогли предоставить убедительные доказательства того, что раковые опухолевые клетки превратились в трансмиссивного паразита. Кроме того, молекулярно-генетические маркеры были использованы для решения вопроса о естественной передаче, породе происхождения (филогенетика ), и возраст опухоли собаки.[3]

Генетические маркеры также использовались для измерения геномной реакции на отбор у домашнего скота. Естественный и искусственный отбор приводит к изменению генетического состава клетки. Присутствие различных аллелей из-за искаженной сегрегации по генетическим маркерам указывает на разницу между отобранным и невыборным домашним скотом.[4]

Рекомендации

  1. ^ Бенджамин А. Пирс (27 декабря 2013 г.). Генетика: концептуальный подход. Macmillan Learning. ISBN  978-1-4641-0946-1.
  2. ^ Н. Маниканда Бупати (2012-12-12). Генетическое картирование и отбор с помощью маркеров: основы, практика и преимущества. Springer Science & Business Media. С. 60–. ISBN  978-81-322-0958-4.
  3. ^ Murgia C, Причард Дж. К., Ким С.Ю., Фассати А., Вайс Р.А. Клональное происхождение и эволюция трансмиссивного рака. Клетка. 2006 11 августа; 126 (3): 477-87.
  4. ^ Гомес-Райя Л., Олсен Х.Г., Лингаас Ф., Клунгланд Х., Воге Д.И., Ольсакер И., Талле С.Б., Осланд М., Льен С. (ноябрь 2002 г.). «Использование генетических маркеров для измерения геномного ответа на селекцию в животноводстве». Генетика. 162 (3): 1381–8. ЧВК  1462338. PMID  12454081.

Смотрите также

дальнейшее чтение


внешняя ссылка

СМИ, связанные с Генетические маркеры в Wikimedia Commons