ПФКМ - PFKM

ПФКМ
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4OMT
Идентификаторы
Псевдонимы	ПФКМ, ATP-PFK, GSD7, PFK-1, PFK1, PFKA, PFKX, PPP1R122, фосфофруктокиназа, мышца
Внешние идентификаторы	OMIM: 610681 MGI: 97548 ГомолоГен: 20101 Генные карты: ПФКМ
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 15 (мышь)[1] Группа 15 | 15 F1 Начните 98,092,589 бп[1] Конец 98,132,451 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • трансферазная активность • связывание нуклеотидов • активность гомодимеризации белков • связывание ионов металлов • киназная активность • связывание фруктозы • связывание киназы • связывание с С-концом белка • каталитическая активность • GO: 0001948 связывание с белками • идентичное связывание с белками • активность фосфофруктокиназы • Связывание АТФ • 6-фосфофруктокиназная активность • Привязка AMP • связывание моносахаридов • связывание фруктозо-6-фосфата Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • 6-фосфофруктокиназный комплекс • основная часть спермы • апикальная плазматическая мембрана • ядро клетки • мембрана Биологический процесс • процесс метаболизма фруктозо-6-фосфата • гликолиз из запасного полисахарида через глюкозо-1-фосфат • гликолитический процесс • клеточный гомеостаз мышечных клеток • гомеостаз глюкозы • фосфорилирование • канонический гликолиз • фосфорилирование углеводов • катаболический процесс гликогена • олигомеризация белков • метаболизм • положительное регулирование секреции инсулина • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • гликолитический процесс через фруктозо-6-фосфат • катаболический процесс глюкозы • процесс метаболизма фруктозо-1,6-бисфосфата • гомотетрамеризация белков Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	5213	18642
Ансамбль	ENSG00000152556	ENSMUSG00000033065
UniProt	P08237	P47857
RefSeq (мРНК)	NM_000289 NM_001166686 NM_001166687 NM_001166688	NM_001163487 NM_001163488 NM_021514 NM_001357688
RefSeq (белок)	NP_000280 NP_001160158 NP_001160159 NP_001160160 NP_001341664 NP_001341666 NP_001341667 NP_001341668 NP_001341669 NP_001341670 NP_001341671 NP_001341672 NP_001341673 NP_001341674 NP_001341675 NP_001341676 NP_001341677 NP_001341665 NP_001350548	NP_001156959 NP_001156960 NP_067489 NP_001344617
Расположение (UCSC)	н / д	Chr 15: 98.09 - 98.13 Мб
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

6-фосфофруктокиназа, мышечный тип является фермент что у людей кодируется ПФКМ ген на хромосоме 12. Три фосфофруктокиназа изоферменты существуют у человека: мышцы, печень и тромбоцит. Эти изоферменты функционируют как подразделения млекопитающих тетрамер фосфофруктокиназа, которая катализирует то фосфорилирование из фруктозо-6-фосфат к фруктозо-1,6-бисфосфат. Состав тетрамера варьируется в зависимости от типа ткани. Этот ген кодирует изофермент мышечного типа. Мутации в этом гене были связаны с болезнь накопления гликогена типа VII, также известная как болезнь Таруи. Альтернативно сращивание Были описаны варианты транскриптов [предоставлено RefSeq, ноябрь 2009 г.]^[4]

Структура

Ген

Этот ген находится на хромосоме 12.^[4] Кодирующая область в ПФКМ только 68% сходства с типом печени ПФКЛ.^[5]

Протеин

Этот белок массой 85 кДа является одним из двух типов субъединиц, которые включают семь тетрамерных изоферментов PFK.^[6][7] Изофермент мышц (ПФК-1 ) состоит исключительно из PFKM.^[6][8][9]PFK печени (PFK-5) содержит только субъединицу второго типа, PFKL, тогда как PFK эритроцита включает пять изоферментов, состоящих из различных комбинаций PFKM и PFKL.^[6][7][9] Эти субъединицы произошли от общего прокариотический предок через дупликация гена и мутации. Как правило, N-концевой субъединиц осуществляет свою каталитическую активность, в то время как C-терминал содержит аллостерический лиганд участок связывания.^[10] В частности, сайт связывания ингибитора PFK цитрат находится в С-концевой области PFKL.^[11]

Функция

Этот ген кодирует одну из трех белковых субъединиц PFK, которые экспрессируются и объединяются с образованием тетрамерной PFK тканеспецифическим образом. Как субъединица PFK, PFKL участвует в катализе фосфорилирования фруктозо-6-фосфата до фруктозо-1,6-бисфосфата. Эта необратимая реакция служит основным этапом гликолиза, ограничивающим скорость.^{[6][9][10][12]}

Хотя субъединица PFKM в основном включается в мышечные и эритроцитарные PFK, PFKM также экспрессируется в сердце, мозг, и яички.^[13]

Клиническое значение

Поскольку эритроцитарный PFK состоит как из PFKL, так и из PFKM, это гетерогенный состав приписывается дифференциальной активности PFK и участию органов, наблюдаемых в некоторых наследственных состояниях дефицита PFK, при которых миопатия или гемолиз или оба могут возникнуть, например, гликогеноз VII типа, также известный как болезнь Таруи.^[6][9][14] Примечательно, что мутации в ПФКМ было показано, что они вызывают болезнь Таруи из-за гомозиготности каталитически неактивных субъединиц М.^[7][14] Подтверждено, что PFKM участвует в дефиците PFK в мышцах с ранним началом гиперурикемии.^[7]

Несмотря на то, что PFKM управляет гликолизом, его сверхэкспрессия связана с диабет 2 типа и инсулин сопротивление в скелетных мышцах. Одно возможное объяснение предполагает, что сверхэкспрессия предназначена для компенсации аллостерическое торможение из PFK1 в результате избытка окисление бесплатно жирные кислоты и накопление цитрата и ацетил-КоА.^[14]

Взаимодействия

ПФКМ был показан взаимодействовать с участием ATP6V0A4.^[15]

Интерактивная карта проезда

Нажмите на гены, белки и метаболиты ниже, чтобы ссылки на соответствующие статьи.^{[§ 1]}

[[Файл:

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

| {{{bSize}}} px | alt = Гликолиз и глюконеогенез редактировать ]]

Гликолиз и глюконеогенез редактировать

1. Интерактивную карту путей можно редактировать на WikiPathways: «ГликолизГлюконеогенез_WP534».

Смотрите также

• ПФК
• ПФК-1
• ПФКЛ
• ПФКП

использованная литература

1. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000033065 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Энтрез Ген: фосфофруктокиназа PFKM, мышца».
5. Леванон Д., Дансигер Э, Дафни Н., Бернштейн Ю., Элсон А., Моэнс В., Брандейс М., Гронер И. (декабрь 1989 г.). «Первичная структура фосфофруктокиназы типа печени человека и ее сравнение с другими типами ПФК». ДНК. 8 (10): 733–43. Дои:10.1089 / dna.1989.8.733. PMID  2533063.
6. Вора С., Матрос С., Дарем С., Пиомелли С. (январь 1980 г.). «Изоферменты фосфофруктокиназы человека: идентификация и субъединичная структурная характеристика новой системы». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 77 (1): 62–6. Bibcode:1980PNAS ... 77 ... 62В. Дои:10.1073 / pnas.77.1.62. ЧВК  348208. PMID  6444721.
7. Вора С., Дэвидсон М., Симан С., Миранда А.Ф., Нобл Н.А., Танака К.Р., Френкель Е.П., Димауро С. (декабрь 1983 г.). «Неоднородность молекулярных повреждений при наследственной недостаточности фосфофруктокиназы». Журнал клинических исследований. 72 (6): 1995–2006. Дои:10.1172 / JCI111164. ЧВК  437040. PMID  6227635.
8. Костер Дж. Ф., Сли Р. Г., Ван Беркель Т. Дж. (Апрель 1980 г.). «Изоферменты фосфофруктокиназы человека». Clinica Chimica Acta; Международный журнал клинической химии. 103 (2): 169–73. Дои:10.1016/0009-8981(80)90210-7. PMID  6445244.
9. Musumeci O, Bruno C, Mongini T, Rodolico C, Aguennouz M, Barca E, Amati A, Cassandrini D, Serlenga L, Vita G, Toscano A (апрель 2012 г.). «Клинические особенности и новые молекулярные данные при дефиците мышечной фосфофруктокиназы (GSD типа VII)». Нервно-мышечные расстройства. 22 (4): 325–30. Дои:10.1016 / j.nmd.2011.10.022. PMID  22133655. S2CID  20133199.
10. Брюзер А., Кирхбергер Дж., Клоос М., Стрэтер Н., Шёнеберг Т. (май 2012 г.). «Функциональная связь сайтов связывания адениновых нуклеотидов в мышечной 6-фосфофруктокиназе млекопитающих». Журнал биологической химии. 287 (21): 17546–53. Дои:10.1074 / jbc.M112.347153. ЧВК  3366854. PMID  22474333.
11. Усеник А., Легиша М. (23 ноября 2010 г.). «Эволюция сайтов связывания аллостерического цитрата на 6-фосфофрукто-1-киназе». PLOS ONE. 5 (11): e15447. Bibcode:2010PLoSO ... 515447U. Дои:10.1371 / journal.pone.0015447. ЧВК  2990764. PMID  21124851.
12. Грэм Д.Б., Беккер С.Э., Доан А., Гоэль Дж., Виллабланка Э. Дж., Найтс Д., Мок А., Нг А.С., Дюнч Дж. Г., Рут ДЭ, Клиш CB, Ксавьер Р.Дж. (21 июля 2015 г.). «Функциональная геномика выявляет негативные регуляторные узлы, контролирующие окислительный взрыв фагоцитов». Nature Communications. 6: 7838. Bibcode:2015 НатКо ... 6,7838 г. Дои:10.1038 / ncomms8838. ЧВК  4518307. PMID  26194095.
13. Кан А., Мейенхофер М.С., Коттро Д., Лагранж Дж. Л., Дрейфус Дж. К. (апрель 1979 г.). «Изоферменты фосфофруктокиназы (ФФК) человека. I. Исследования тканей взрослого человека». Генетика человека. 48 (1): 93–108. Дои:10.1007 / bf00273280. PMID  156693. S2CID  23300861.
14. Кейлдсон С., Фадиста Дж., Ладенвалл К., Хедман ÅК, Эльгзыри Т., Смолл К.С., Грундберг Э., Ника А.С., Гласс Д., Ричардс Дж. Б., Барретт А., Нисбет Дж., Чжэн Х. Ф., Рённ Т., Стрём К., Эрикссон К. Ф., Прокопенко И. , Спектор Т.Д., Дермитзакис Е.Т., Делукас П., Маккарти М.И., Рунг Дж., Груп Л., Фрэнкс П.В., Линдгрен К.М., Ханссон О. (март 2014 г.). «Экспрессия фосфофруктокиназы в скелетных мышцах зависит от генетической изменчивости и связана с чувствительностью к инсулину». Сахарный диабет. 63 (3): 1154–65. Дои:10.2337 / db13-1301. ЧВК  3931395. PMID  24306210.
15. Су И, Чжоу А., Аль-Ламки Р.С., Карет Ф.Е. (май 2003 г.). «А-субъединица Н + -АТФазы V-типа взаимодействует с фосфофруктокиназой-1 у человека». Журнал биологической химии. 278 (22): 20013–8. Дои:10.1074 / jbc.M210077200. PMID  12649290.

дальнейшее чтение

• Рабен Н., Шерман Дж. Б. (1995). «Мутации в гене мышечной фосфофруктокиназы». Человеческая мутация. 6 (1): 1–6. Дои:10.1002 / humu.1380060102. PMID  7550225.
• Кан А., Этиембл Дж., Мейенхофер М.С., Бовин П. (июнь 1975 г.). «Дефицит фосфофруктокиназы эритроцитов, связанный с нестабильным вариантом мышечной фосфофруктокиназы». Clinica Chimica Acta; Международный журнал клинической химии. 61 (3): 415–9. Дои:10.1016/0009-8981(75)90434-9. PMID  125160.
• Чжао З.З., Маленчик Д.А., Андерсон С.Р. (февраль 1991 г.). «Белок-индуцированная инактивация и фосфорилирование фосфофруктокиназы мышц кролика». Биохимия. 30 (8): 2204–16. Дои:10.1021 / bi00222a026. PMID  1825608.
• Ямасаки Т., Накадзима Х., Коно Н., Хотта К., Ямада К., Имаи Э., Кувадзима М., Ногучи Т., Танака Т., Таруи С. (август 1991 г.). «Структура всего гена, кодирующего мышечную фосфофруктокиназу человека: система с двумя промоторами». Ген. 104 (2): 277–82. Дои:10.1016 / 0378-1119 (91) 90262-А. PMID  1833270.
• Шарма П.М., Редди Г.Р., Бабиор Б.М., Маклахлан А. (июнь 1990 г.). «Альтернативный сплайсинг транскрипта, кодирующего мышечный изофермент фосфофруктокиназы человека». Журнал биологической химии. 265 (16): 9006–10. PMID  2140567.
• Накадзима Х., Коно Н., Ямасаки Т., Хотта К., Кавачи М., Кувадзима М., Ногучи Т., Танака Т., Таруи С. (июнь 1990 г.). «Генетический дефект дефицита мышечной фосфофруктокиназы. Аномальное сплайсинг гена мышечной фосфофруктокиназы из-за точечной мутации в 5'-сайте сплайсинга». Журнал биологической химии. 265 (16): 9392–5. PMID  2140573.
• Вальдес BC, Чен З., Соса М.Г., Юнатан Э.С., Чанг С.Х. (март 1989 г.). «Ген 6-фосфофрукто-1-киназы человека имеет дополнительный интрон перед стартовым кодоном». Ген. 76 (1): 167–9. Дои:10.1016 / 0378-1119 (89) 90019-Х. PMID  2526044.
• Шарма П.М., Редди Г.Р., Вора С., Бабиор Б.М., Маклахлан А. (апрель 1989 г.). «Клонирование и экспрессия кДНК мышечной фосфофруктокиназы человека». Ген. 77 (1): 177–83. Дои:10.1016/0378-1119(89)90372-7. PMID  2526045.
• Накадзима Х., Ногучи Т., Ямасаки Т., Коно Н., Танака Т., Таруи С. (октябрь 1987 г.). «Клонирование кДНК мышечной фосфофруктокиназы человека». Письма FEBS. 223 (1): 113–6. Дои:10.1016/0014-5793(87)80519-7. PMID  2822475. S2CID  42849336.
• Вора С., Матрос С., Дарем С., Пиомелли С. (январь 1980 г.). «Изоферменты фосфофруктокиназы человека: идентификация и субъединичная структурная характеристика новой системы». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 77 (1): 62–6. Bibcode:1980PNAS ... 77 ... 62В. Дои:10.1073 / pnas.77.1.62. ЧВК  348208. PMID  6444721.
• Кан А., Вейл Д., Коттро Д., Дрейфус Дж. К. (февраль 1981 г.). «Дефицит мышечной фосфофруктокиназы у человека: проявление дефекта в клетках крови и культивируемых фибробластах». Анналы генетики человека. 45 (Pt 1): 5–14. Дои:10.1111 / j.1469-1809.1981.tb00300.x. PMID  6459054. S2CID  39444994.
• Васконселос О., Сивакумар К., Далакас М.К., Кесадо М., Нагл Дж., Леон-Монзон М., Дубник М., Гайдусек, округ Колумбия, Голдфарб Л.Г. (октябрь 1995 г.). «Нонсенс мутация в гене мышечной субъединицы фосфофруктокиназы, связанная с сохранением интрона 10 в одном из изолированных транскриптов у пациентов-евреев-ашкенази с болезнью Таруи». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 92 (22): 10322–6. Bibcode:1995ПНАС ... 9210322В. Дои:10.1073 / пнас.92.22.10322. ЧВК  40788. PMID  7479776.
• Tsujino S, Servidei S, Tonin P, Shanske S, Azan G, DiMauro S (май 1994). «Выявление трех новых мутаций у итальянских пациентов, не являющихся ашкенази, с дефицитом мышечной фосфофруктокиназы». Американский журнал генетики человека. 54 (5): 812–9. ЧВК  1918246. PMID  7513946.
• Рабен Н., Эксельберт Р., Шпигель Р., Шерман Дж. Б., Накадзима Х., Плотц П., Хайниш Дж. (Январь 1995 г.). «Функциональная экспрессия мутантной фосфофруктокиназы человека в дрожжах: генетические дефекты у французских канадских и швейцарских пациентов с дефицитом фосфофруктокиназы». Американский журнал генетики человека. 56 (1): 131–41. ЧВК  1801305. PMID  7825568.
• Рабен Н., Шерман Дж., Миллер Ф., Мена Х., Плотц П. (март 1993 г.). «Мутация соединения 5'-сплайсинга, приводящая к делеции экзона в еврейской семье ашкеназов с дефицитом фосфофруктокиназы (болезнь Таруи)». Журнал биологической химии. 268 (7): 4963–7. PMID  8444874.
• Ховард Т.Д., Акоц Г., Боуден Д.В. (май 1996 г.). «Физическое и генетическое картирование гена мышечной фосфофруктокиназы (PFKM): переназначение хромосоме 12q человека». Геномика. 34 (1): 122–7. Дои:10.1006 / geno.1996.0250. PMID  8661033.
• Хамагути Т., Накадзима Х, Ногути Т., Накагава С., Кувадзима М., Коно Н., Таруи С., Мацудзава И. (1997). «Новая миссенс-мутация (W686C) гена фосфофруктокиназы-M у японского пациента с легкой формой гликогеноза VII». Человеческая мутация. 8 (3): 273–5. Дои:10.1002 / (SICI) 1098-1004 (1996) 8: 3 <273 :: AID-HUMU13> 3.0.CO; 2- #. PMID  8889589.
• Scherer PE, Lisanti MP (август 1997 г.). «Ассоциация фосфофруктокиназы-M с кавеолином-3 в дифференцированных скелетных мышечных трубках. Динамическое регулирование внеклеточной глюкозой и внутриклеточными метаболитами». Журнал биологической химии. 272 (33): 20698–705. Дои:10.1074 / jbc.272.33.20698. PMID  9252390.
• Ристоу М., Воргерд М., Мёлиг М., Шатц Х., Пфайфер А. (декабрь 1997 г.). «Дефицит фосфофрукто-1-киназы / мышечного подтипа у людей снижает секрецию инсулина и вызывает резистентность к инсулину». Журнал клинических исследований. 100 (11): 2833–41. Дои:10.1172 / JCI119831. ЧВК  508489. PMID  9389749.