Экзорибонуклеаза - Exoribonuclease
An экзорибонуклеаза является экзонуклеаза рибонуклеаза, которые являются ферментами, разрушающими РНК удалив терминал нуклеотиды либо из 5 'конец или 3 'конец молекулы РНК. Ферменты, удаляющие нуклеотиды с 5 'конца, называются 5'-3 'экзорибонуклеазы, а ферменты, удаляющие нуклеотиды с 3 'конца, называются 3'-5 'экзорибонуклеазы.
Экзорибонуклеазы могут использовать воду для разрыва нуклеотидно-нуклеотидной связи (что называется гидролитической активностью) или неорганический фосфат (что называется фосфоролитической активностью). Гидролитические экзорибонуклеазы классифицируются как Номер ЕС 3.1 и фосфоролитические экзорибонуклеазы под номером ЕС 2.7.7. Поскольку фосфоролитические ферменты используют неорганический фосфат для расщепления связей, которые они освобождают нуклеотиддифосфаты, тогда как гидролитические ферменты (которые используют воду) высвобождают нуклеотидные монофосфаты.
Экзорибонуклеазы существуют во всех царствах жизни, бактерии, археи, и эукариоты. Экзорибонуклеазы участвуют в деградации многих различных видов РНК, включая информационная РНК, переносить РНК, рибосомная РНК и miRNA. Экзорибонуклеазы могут быть одиночными белками (такими как РНКаза D или же РНКаза PH ), но также могут быть комплексами из нескольких белков, таких как экзосомальный комплекс (в котором представлены четыре основных семейства экзорибонуклеаз).
Основные семьи
| Семья | Примеры участников | Распределение | Каталитическая активность |
|---|---|---|---|
| RNR | РНКаза R | Большинство бактерий, все эукариоты | 3'-5 'гидролитический |
| РНКаза II | |||
| Rrp44 | |||
| DEDD | РНКаза D | Некоторые бактерии, все эукариоты | 3'-5 'гидролитический |
| РНКаза Т | |||
| PM / Scl-100 | |||
| Олигорибонуклеаза | |||
| RBN | РНКаза BN | Определенные бактерии | 3'-5 'гидролитический |
| PDX | PNPase | Все королевства | 3'-5 'фосфоролитический |
| PM / Scl-75 | |||
| РНКаза PH | |||
| RRP4 | Rrp4 | Все эукариоты, большинство архей | 3'-5 'гидролитический |
| 5PX | Экзорибонуклеаза I | Все эукариоты | 5'-3 'гидролитический |
| Экзорибонуклеаза II |
Смотрите также
Рекомендации
- Zuo Y; Deutscher MP. (2001). «Суперсемейства экзорибонуклеаз: структурный анализ и филогенетическое распределение». Нуклеиновые кислоты Res. 29 (5): 1017–26. Дои:10.1093 / nar / 29.5.1017. ЧВК 56904. PMID 11222749.
внешняя ссылка
- Экзорибонуклеазы в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)