ПРИМ2 - PRIM2

ПРИМ2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3L9Q, 3 квартал 36 г., 4БПУ, 4BPW, 4BPX, 4RR2, 5F0Q, 5EXR, 5F0S
Идентификаторы
Псевдонимы	ПРИМ2, PRIM2A, p58, субъединица 2 примазы (ДНК), субъединица 2 ДНК-примазы
Внешние идентификаторы	OMIM: 176636 MGI: 97758 ГомолоГен: 731 Генные карты: ПРИМ2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6п11.2 Начинать 57,314,805 бп[1] Конец 57,646,850 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 1 (мышь)[2] Группа 1 12,7 см | 1 млрд Начинать 33,453,810 бп[2] Конец 33,669,795 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • ДНК-направленная активность 5'-3 'РНК-полимеразы • трансферазная активность • Связывание ДНК • 4 железа, 4 связки серы • железо-серное кластерное связывание • нуклеотидилтрансферазная активность • связывание ионов металлов • связывание одноцепочечной ДНК • ДНК-направленная активность ДНК-полимеразы • ДНК-примаза активность • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • нуклеоплазма • альфа-ДНК-полимераза: комплекс примазы Биологический процесс • Репликация ДНК • Репликация ДНК, синтез праймера РНК • Процесс биосинтеза ДНК • поддержание теломер посредством полуконсервативной репликации • G1 / S переход митотического клеточного цикла • Инициирование репликации ДНК Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	5558	19076
Ансамбль	ENSG00000146143	ENSMUSG00000026134
UniProt	P49643	P33610
RefSeq (мРНК)	NM_000947 NM_001282487 NM_001282488	NM_008922
RefSeq (белок)	NP_000938 NP_001269416 NP_001269417	NP_032948
Расположение (UCSC)	Chr 6: 57.31 - 57.65 Мб	Chr 1: 33.45 - 33.67 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Большая субъединица ДНК-примазы является фермент что у людей кодируется ПРИМ2 ген.^[5][6]

Репликация ДНК в эукариотические клетки осуществляется сложным аппаратом хромосомной репликации, в котором ДНК-полимераза альфа и прима являются двумя ключевыми ферментативными компонентами. Primase, который является гетеродимер малой субъединицы и большой субъединицы, синтезирует малые праймеры РНК для Фрагменты Окадзаки производится во время прерывистой репликации ДНК. Белок, кодируемый этим геном, представляет собой большую субъединицу примазы 58 кДа.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000146143 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026134 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Сиратори А., Окумура К., Ногами М., Тагучи Х., Онозаки Т., Иноуэ Т., Андо Т., Сибата Т., Изуми М., Миядзава Х. и др. (Февраль 1996 г.). «Присвоение генов субъединицы 49 кДа (PRIM1) и 58 кДа (PRIM2A и PRIM2B) примазы ДНК человека полосам хромосомы 1q44 и 6p11.1-p12». Геномика. 28 (2): 350–3. Дои:10.1006 / geno.1995.1155. PMID  8530050.
6. «Ген Entrez: примаза PRIM2A, полипептид 2A, 58 кДа».

дальнейшее чтение

• Stadlbauer F, Brueckner A, Rehfuess C и др. (1994). «Репликация ДНК in vitro рекомбинантной ДНК-полимеразой-альфа-примазой». Евро. J. Biochem. 222 (3): 781–93. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1994.tb18925.x. PMID  8026492.
• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Конструирование и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК с обогащением по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Колл Дж. М., Хики Р. Дж., Кронки Е. А. и др. (1998). «Картирование специфических белок-белковых взаимодействий внутри основного компонента синтезомы ДНК клеток груди». Онкол. Res. 9 (11–12): 629–39. PMID  9563011.
• Шнайдер А., Смит Р. В., Каутц А. Р. и др. (1998). «Примазная активность человеческой ДНК-полимеразы альфа-примазы. Двухвалентные катионы стабилизируют ферментативную активность субъединицы p48». J. Biol. Chem. 273 (34): 21608–15. Дои:10.1074 / jbc.273.34.21608. PMID  9705292.
• Арези Б., Кирк Б.В., Коупленд В.К., Кучта Р.Д. (1999). «Взаимодействие ДНК с человеческой ДНК-примазой, отслеживаемое фотоактивируемыми сшивающими агентами: последствия для роли субъединицы p58». Биохимия. 38 (39): 12899–907. Дои:10.1021 / bi9908991. PMID  10504261.
• Смит Р. У., Нашойер HP (2002). «Контроль комплексообразования ДНК-полимеразы альфа-примазы и внеклеточной репликации ДНК с помощью C-концевых аминокислот самой большой субъединицы p180». FEBS Lett. 527 (1–3): 143–6. Дои:10.1016 / S0014-5793 (02) 03197-6. PMID  12220650. S2CID  27852377.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Мунгалл А.Дж., Палмер С.А., Симс С.К. и др. (2003). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы 6 человека». Природа. 425 (6960): 805–11. Bibcode:2003Натура.425..805М. Дои:10.1038 / природа02055. PMID  14574404.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Раш Дж., Мориц А., Ли К.А. и др. (2005). «Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». Nat. Биотехнология. 23 (1): 94–101. Дои:10.1038 / nbt1046. PMID  15592455. S2CID  7200157.

внешняя ссылка

• PDBe-KB предоставляет обзор всей структурной информации, доступной в PDB для большой субъединицы человеческой ДНК-примазы (PRIM2)