ORC5 - ORC5

ORC5
Идентификаторы
Псевдонимы	ORC5, ORC5L, ORC5P, ORC5T, PPP1R117, субъединица комплекса распознавания происхождения 5
Внешние идентификаторы	OMIM: 602331 MGI: 1347044 ГомолоГен: 37636 Генные карты: ORC5
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 7 (человек)[1] Группа 7q22.1-q22.2 Начните 104,126,341 бп[1] Конец 104,208,047 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 5 (мышь)[2] Группа 5 | 5 A3 Начните 22,486,485 бп[2] Конец 22,550,429 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание нуклеотидов • Связывание с ориджином репликации ДНК • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание АТФ • молекулярная функция Сотовый компонент • комплекс распознавания ядерной точки репликации • комплекс распознавания происхождения • ядерная хромосома, теломерная область • ядро клетки • нуклеоплазма • цитозоль Биологический процесс • Фаза G1 • Репликация ДНК • Инициирование репликации ДНК • G1 / S переход митотического клеточного цикла Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	5001	26429
Ансамбль	ENSG00000164815	ENSMUSG00000029012
UniProt	O43913	Q9WUV0
RefSeq (мРНК)	NM_001197292 NM_002553 NM_181747	NM_011959
RefSeq (белок)	NP_002544 NP_859531	NP_036089
Расположение (UCSC)	Chr 7: 104,13 - 104,21 Мб	Chr 5: 22.49 - 22.55 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Субъединица 5 комплекса распознавания происхождения это белок что у людей кодируется ORC5 (ORC5L) ген.^[5][6][7]

Функция

В комплекс распознавания происхождения (ORC) представляет собой высококонсервативный комплекс из шести субъединиц белка, необходимый для инициации репликации ДНК в эукариотических клетках. Исследования на дрожжах показали, что ORC специфически связывается с источниками репликации и служит платформой для сборки дополнительных факторов инициации, таких как Cdc6 и белки Mcm. Белок, кодируемый этим геном, является субъединицей комплекса ORC. Было показано, что он образует основной комплекс с ORC2L, -3L и 4L. Описаны альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие разные изоформы.^[7]

Взаимодействия

ORC5 был показан взаимодействовать с:

• MCM2,^[8]
• MCM3,^[8]
• MCM4,^[8]
• MCM7,^[8]
• ORC1,^[8]
• ORC2,^{[8][9][10][11]}
• ORC3,^{[8][10][11][12]} и
• ORC4.^[8][9][10]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000164815 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029012 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Ишиаи М., Дин Ф. Б., Окумура К., Абэ М., Мун К. Ю., Амин А. А., Каготани К., Тагучи Х., Мураками И., Ханаока Ф., О'Доннелл М., Гурвиц Дж., Эки Т. (декабрь 1997 г.). «Выделение гомологов человека и делящихся дрожжей субъединицы ORC5 комплекса распознавания происхождения почкующихся дрожжей: гомолог человека (ORC5L) картируется в 7q22». Геномика. 46 (2): 294–8. Дои:10.1006 / geno.1997.5003. PMID  9417919.
6. Тугал Т., Зоу-Ян XH, Гэвин К., Паппин Д., Канас Б., Кобаяши Р., Хант Т., Стиллман Б. (декабрь 1998 г.). «Субъединицы Orc4p и Orc5p Xenopus и комплекса распознавания происхождения человека связаны с Orc1p и Cdc6p». Журнал биологической химии. 273 (49): 32421–9. Дои:10.1074 / jbc.273.49.32421. PMID  9829972.
7. «Ген Entrez: комплекс распознавания происхождения ORC5L, субъединица 5-подобная (дрожжи)».
8. Kneissl M, Pütter V, Szalay AA, Grummt F (март 2003 г.). «Взаимодействие и сборка мышиных пререпликативных сложных белков в клетках дрожжей и мышей». Журнал молекулярной биологии. 327 (1): 111–28. Дои:10.1016 / с0022-2836 (03) 00079-2. PMID  12614612.
9. Quintana DG, Thome KC, Hou ZH, Ligon AH, Morton CC, Dutta A (октябрь 1998 г.). «ORC5L, новый член комплекса распознавания происхождения человека, удален при лейомиоме матки и злокачественных миелоидных заболеваниях». Журнал биологической химии. 273 (42): 27137–45. Дои:10.1074 / jbc.273.42.27137. PMID  9765232.
10. Дхар С.К., Дельмолино Л., Датта А. (август 2001 г.). «Архитектура комплекса распознавания происхождения человека». Журнал биологической химии. 276 (31): 29067–71. Дои:10.1074 / jbc.M103078200. PMID  11395502.
11. Vashee S, Simancek P, Challberg MD, Kelly TJ (июль 2001 г.). «Сборка комплекса распознавания происхождения человека». Журнал биологической химии. 276 (28): 26666–73. Дои:10.1074 / jbc.M102493200. PMID  11323433.
12. Пинто С., Кинтана Д.Г., Смит П., Михалек Р.М., Хоу Ж.Х., Бойнтон С., Джонс С.Дж., Хендрикс М., Велинзон К., Вольшлегель Д.А., Остин Р.Дж., Лейн В.С., Талли Т., Датта А. (май 1999 г.). «latheo кодирует субъединицу исходного комплекса распознавания и нарушает пролиферацию нейронов и обонятельную память взрослых при мутанте». Нейрон. 23 (1): 45–54. Дои:10.1016 / s0896-6273 (00) 80752-7. PMID  10402192. S2CID  781511.

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Клемм Р.Д., Остин Р.Дж., Белл С.П. (февраль 1997 г.). «Координированное связывание АТФ и исходной ДНК регулирует АТФазную активность комплекса распознавания происхождения». Ячейка. 88 (4): 493–502. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81889-9. PMID  9038340. S2CID  12927727.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Quintana DG, Thome KC, Hou ZH, Ligon AH, Morton CC, Dutta A (октябрь 1998 г.). «ORC5L, новый член комплекса распознавания происхождения человека, удален при лейомиоме матки и злокачественных миелоидных заболеваниях». Журнал биологической химии. 273 (42): 27137–45. Дои:10.1074 / jbc.273.42.27137. PMID  9765232.
• Цзян В., Макдональд Д., Хоуп Т.Дж., Хантер Т. (октябрь 1999 г.). «Комплекс протеинкиназы Cdc7-Dbf4 млекопитающих необходим для инициации репликации ДНК». Журнал EMBO. 18 (20): 5703–13. Дои:10.1093 / emboj / 18.20.5703. ЧВК  1171637. PMID  10523313.
• Том KC, Дхар С.К., Кинтана Д.Г., Дельмолино Л., Шахсафаэй А., Датта А. (ноябрь 2000 г.). «Подмножества субъединиц комплекса распознавания происхождения человека (ORC) экспрессируются в непролиферирующих клетках и связываются с белками, не являющимися ORC». Журнал биологической химии. 275 (45): 35233–41. Дои:10.1074 / jbc.M005765200. PMID  10954718.
• Vashee S, Simancek P, Challberg MD, Kelly TJ (июль 2001 г.). «Сборка комплекса распознавания происхождения человека». Журнал биологической химии. 276 (28): 26666–73. Дои:10.1074 / jbc.M102493200. PMID  11323433.
• Fröhling S, Nakabayashi K, Scherer SW, Döhner H, Döhner K (апрель 2001 г.). «Мутационный анализ гена субъединицы 5 комплекса распознавания происхождения (ORC5L) у взрослых пациентов с миелоидными лейкозами, демонстрирующими делеции полосы хромосомы 7q22». Генетика человека. 108 (4): 304–9. Дои:10.1007 / s004390100498. PMID  11379876. S2CID  23879624.
• Дхар С.К., Дельмолино Л., Датта А. (август 2001 г.). «Архитектура комплекса распознавания происхождения человека». Журнал биологической химии. 276 (31): 29067–71. Дои:10.1074 / jbc.M103078200. PMID  11395502.
• Kneissl M, Pütter V, Szalay AA, Grummt F (март 2003 г.). «Взаимодействие и сборка мышиных пререпликативных сложных белков в клетках дрожжей и мышей». Журнал молекулярной биологии. 327 (1): 111–28. Дои:10.1016 / S0022-2836 (03) 00079-2. PMID  12614612.
• Рамачандран Н., Хейнсворт Э., Бхуллар Б., Эйзенштейн С., Розен Б., Лау А. Ю., Уолтер Дж. К., Ла Баер Дж. (Июль 2004 г.). «Самособирающиеся белковые микроматрицы». Наука. 305 (5680): 86–90. Дои:10.1126 / science.1097639. PMID  15232106. S2CID  20936301.