ORC1 - ORC1

ORC1
Идентификаторы
Псевдонимы	ORC1, HSORC1L, PARC1, субъединица 1 комплекса распознавания происхождения
Внешние идентификаторы	OMIM: 601902 MGI: 1328337 ГомолоГен: 31221 Генные карты: ORC1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1п32.3 Начинать 52,372,829 бп[1] Конец 52,404,423 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 4 (мышь)[2] Группа 4 | 4 C7 Начинать 108,579,423 бп[2] Конец 108,614,833 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • связывание нуклеотидов • связывание хроматина • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание АТФ • Связывание с ориджином репликации ДНК • связывание ионов металлов Сотовый компонент • комплекс распознавания ядерной точки репликации • клеточная мембрана • ядрышко • комплекс распознавания происхождения • ядро клетки • ядерная хромосома, теломерная область • нуклеоплазма • цитозоль Биологический процесс • Фаза G1 • Репликация ДНК • регуляция транскрипции, вовлеченная в G1 / S переход митотического клеточного цикла • Инициирование репликации ДНК • G1 / S переход митотического клеточного цикла • GO: 0007067 митотический клеточный цикл • контрольная точка репликации митотической ДНК Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	4998	18392
Ансамбль	ENSG00000085840	ENSMUSG00000028587
UniProt	Q13415	Q9Z1N2
RefSeq (мРНК)	NM_001190818 NM_001190819 NM_004153	NM_001014425 NM_011015
RefSeq (белок)	NP_001177747 NP_001177748 NP_004144	NP_035145
Расположение (UCSC)	Chr 1: 52.37 - 52,4 Мб	Chr 4: 108,58 - 108,61 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Субъединица 1 комплекса распознавания происхождения это белок что у людей кодируется ORC1 ген.^[5][6]

Функция

В комплекс распознавания происхождения (ORC) представляет собой высококонсервативный белковый комплекс из шести субъединиц, необходимый для инициации Репликация ДНК в эукариотических клетках. Исследования на дрожжах показали, что ORC специфически связывается с источниками репликации и служит платформой для сборки пререпликационный комплекс, который включает дополнительные факторы инициирования, такие как Cdc6 и Mcm белки. Белок, кодируемый этим геном, является самой крупной субъединицей комплекса распознавания источника. В то время как другие субъединицы ORC стабильны на всем протяжении клеточный цикл, уровни этого белка меняются в течение клеточного цикла, который, как было показано, контролируется убиквитин-опосредованный протеолиз после инициации репликации ДНК. Установлено, что этот белок избирательно фосфорилированный в течение митоз. Также сообщается, что он взаимодействует с MYST гистонацетилтрансфераза 2 (MYST2 / HBO1), белок, участвующий в контроле подавления транскрипции.^[6]

Взаимодействия

ORC1 был показан взаимодействовать с:

• CDC45-родственный белок^[7] и
• CDC6,^[7][8]
• Связанная с 7-м циклом деления клетки протеинкиназа,^[7]
• Циклинзависимая киназа 2,^[9]
• MCM2,^[7]
• MCM4,^[7]
• MCM6,^[7]
• MCM7,^[7]
• MYST2,^[10]
• ORC2,^{[7][11][12][9]}
• ORC4,^[7]
• ORC5,^[7] и
• SKP2.^[9]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000085840 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028587 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Эки Т., Окумура К., Амин А., Ишиаи М., Абэ М., Ногами М., Тагучи Х., Гурвиц Дж., Мураками И., Ханаока Ф. (сентябрь 1996 г.). «Картирование человеческого гомолога (ORC1L) гена субъединицы 1 комплекса распознавания дрожжевого происхождения на полосу 1p32 хромосомы». Геномика. 36 (3): 559–61. Дои:10.1006 / geno.1996.0511. PMID  8884289.
6. «Ген Entrez: комплекс распознавания происхождения ORC1L, субъединица 1-подобная (дрожжи)».
7. Kneissl M, Pütter V, Szalay AA, Grummt F (март 2003 г.). «Взаимодействие и сборка мышиных пререпликативных сложных белков в клетках дрожжей и мышей». Журнал молекулярной биологии. 327 (1): 111–28. Дои:10.1016 / с0022-2836 (03) 00079-2. PMID  12614612.
8. Саха П., Чен Дж., Том KC, Лоулис С.Дж., Хоу Ж.Х., Хендрикс М., Парвин Дж. Д., Датта А. (май 1998 г.). «CDC6 / Cdc18 человека связывается с Orc1 и циклин-cdk и выборочно удаляется из ядра в начале S-фазы». Молекулярная и клеточная биология. 18 (5): 2758–67. Дои:10.1128 / mcb.18.5.2758. ЧВК  110655. PMID  9566895.
9. Мендес Дж., Зоу-Ян XH, Ким С.И., Хидака М., Танси В.П., Стиллман Б. (март 2002 г.). «Большая субъединица комплекса распознавания происхождения человека разрушается убиквитин-опосредованным протеолизом после инициации репликации ДНК». Молекулярная клетка. 9 (3): 481–91. Дои:10.1016 / с1097-2765 (02) 00467-7. PMID  11931757.
10. Иидзука М., Стиллман Б. (август 1999 г.). «Гистонацетилтрансфераза HBO1 взаимодействует с субъединицей ORC1 человеческого белка-инициатора». Журнал биологической химии. 274 (33): 23027–34. Дои:10.1074 / jbc.274.33.23027. PMID  10438470.
11. Fujita M, Ishimi Y, Nakamura H, Kiyono T, Tsurumi T. (март 2002 г.). «Ядерная организация белков инициации репликации ДНК в клетках млекопитающих». Журнал биологической химии. 277 (12): 10354–61. Дои:10.1074 / jbc.M111398200. PMID  11779870.
12. Vashee S, Simancek P, Challberg MD, Kelly TJ (июль 2001 г.). «Сборка комплекса распознавания происхождения человека». Журнал биологической химии. 276 (28): 26666–73. Дои:10.1074 / jbc.M102493200. PMID  11323433.

дальнейшее чтение

• Гэвин К.А., Хидака М., Стиллман Б. (декабрь 1995 г.). «Консервативные белки-инициаторы у эукариот». Наука. 270 (5242): 1667–71. Дои:10.1126 / science.270.5242.1667. PMID  7502077.
• Охтани К., ДеГрегори Дж., Леоне Дж., Херендин Д. Р., Келли Т. Дж., Невинс Дж. Р. (декабрь 1996 г.). «Экспрессия гена HsOrc1, гомолога ORC1 человека, регулируется пролиферацией клеток через фактор транскрипции E2F». Молекулярная и клеточная биология. 16 (12): 6977–84. Дои:10.1128 / mcb.16.12.6977. ЧВК  231701. PMID  8943353.
• Саха П., Чен Дж., Том KC, Лоулис С.Дж., Хоу Ж.Х., Хендрикс М., Парвин Дж. Д., Датта А. (май 1998 г.). «CDC6 / Cdc18 человека связывается с Orc1 и циклин-cdk и выборочно удаляется из ядра в начале S-фазы». Молекулярная и клеточная биология. 18 (5): 2758–67. Дои:10.1128 / mcb.18.5.2758. ЧВК  110655. PMID  9566895.
• Иидзука М., Стиллман Б. (август 1999 г.). «Гистонацетилтрансфераза HBO1 взаимодействует с субъединицей ORC1 человеческого белка-инициатора». Журнал биологической химии. 274 (33): 23027–34. Дои:10.1074 / jbc.274.33.23027. PMID  10438470.
• Цзян В., Макдональд Д., Хоуп Т.Дж., Хантер Т. (октябрь 1999 г.). «Комплекс протеинкиназы Cdc7-Dbf4 млекопитающих необходим для инициации репликации ДНК». Журнал EMBO. 18 (20): 5703–13. Дои:10.1093 / emboj / 18.20.5703. ЧВК  1171637. PMID  10523313.
• Тацуми Ю., Цуримото Т., Сирахиге К., Йошикава Х., Обусе С. (февраль 2000 г.). «Ассоциация комплекса распознавания происхождения человека 1 с ДНК хроматина и ядерными структурами, устойчивыми к нуклеазам». Журнал биологической химии. 275 (8): 5904–10. Дои:10.1074 / jbc.275.8.5904. PMID  10681582.
• Том К.С., Дхар С.К., Кинтана Д.Г., Дельмолино Л., Шахсафаэй А., Датта А. (ноябрь 2000 г.). «Подмножества субъединиц комплекса распознавания происхождения человека (ORC) экспрессируются в непролиферирующих клетках и связываются с белками, не являющимися ORC». Журнал биологической химии. 275 (45): 35233–41. Дои:10.1074 / jbc.M005765200. PMID  10954718.
• Vashee S, Simancek P, Challberg MD, Kelly TJ (июль 2001 г.). «Сборка комплекса распознавания происхождения человека». Журнал биологической химии. 276 (28): 26666–73. Дои:10.1074 / jbc.M102493200. PMID  11323433.
• Ламан Х., Питерс Дж., Джонс Н. (декабрь 2001 г.). «Циклин-опосредованный экспорт человеческого Orc1». Экспериментальные исследования клеток. 271 (2): 230–7. Дои:10.1006 / excr.2001.5360. PMID  11716535.
• Fujita M, Ishimi Y, Nakamura H, Kiyono T., Tsurumi T. (март 2002 г.). «Ядерная организация белков инициации репликации ДНК в клетках млекопитающих». Журнал биологической химии. 277 (12): 10354–61. Дои:10.1074 / jbc.M111398200. PMID  11779870.
• Ладенбургер Э.М., Келлер С., Книпперс Р. (февраль 2002 г.). «Идентификация области связывания для белков 1 и 2 комплекса распознавания происхождения человека, которая совпадает с точкой начала репликации ДНК». Молекулярная и клеточная биология. 22 (4): 1036–48. Дои:10.1128 / MCB.22.4.1036-1048.2002. ЧВК  134626. PMID  11809796.
• Мендес Дж., Зоу-Ян XH, Ким С.И., Хидака М., Тэнси В.П., Стиллман Б. (март 2002 г.). «Большая субъединица комплекса распознавания происхождения человека разрушается убиквитин-опосредованным протеолизом после инициации репликации ДНК». Молекулярная клетка. 9 (3): 481–91. Дои:10.1016 / S1097-2765 (02) 00467-7. PMID  11931757.
• Kneissl M, Pütter V, Szalay AA, Grummt F (март 2003 г.). «Взаимодействие и сборка мышиных пререпликативных сложных белков в клетках дрожжей и мышей». Журнал молекулярной биологии. 327 (1): 111–28. Дои:10.1016 / S0022-2836 (03) 00079-2. PMID  12614612.
• Охта С., Тацуми Ю., Фудзита М., Цуримото Т., Обусе С. (октябрь 2003 г.). «Цикл ORC1 в клетках человека: II. Динамические изменения в комплексе ORC человека во время клеточного цикла». Журнал биологической химии. 278 (42): 41535–40. Дои:10.1074 / jbc.M307535200. PMID  12909626.
• Тацуми Й., Охта С., Кимура Х., Цуримото Т., Обусе С. (октябрь 2003 г.). «Цикл ORC1 в клетках человека: I. Регулируемые клеточным циклом колебания ORC1 человека». Журнал биологической химии. 278 (42): 41528–34. Дои:10.1074 / jbc.M307534200. PMID  12909627.
• Абдурашидова Г., Данаилов МБ, Очем А., Триоло Г., Джелиова В., Радулеску С., Виндигни А., Рива С., Фаласки А. (август 2003 г.). «Локализация белков, связанных с источником репликации ДНК человека в клеточном цикле». Журнал EMBO. 22 (16): 4294–303. Дои:10.1093 / emboj / cdg404. ЧВК  175794. PMID  12912926.
• Рамачандран Н., Хейнсворт Э., Бхуллар Б., Эйзенштейн С., Розен Б., Лау А. Ю., Уолтер Дж. К., Ла Баер Дж. (Июль 2004 г.). «Самособирающиеся белковые микрочипы». Наука. 305 (5680): 86–90. Дои:10.1126 / science.1097639. PMID  15232106.
• Lidonnici MR, Rossi R, Paixão S, Mendoza-Maldonado R, Paolinelli R, Arcangeli C, Giacca M, Biamonti G, Montecucco A (октябрь 2004 г.). «Субъядерное распределение самой большой субъединицы комплекса распознавания происхождения человека во время клеточного цикла». Журнал клеточной науки. 117 (Pt 22): 5221–31. Дои:10.1242 / jcs.01405. PMID  15454574.

внешняя ссылка

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: Q13415 (Субъединица 1 комплекса распознавания происхождения человека) на PDBe-KB.
• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: Q9Z1N2 (Субъединица 1 комплекса распознавания происхождения мыши) на PDBe-KB.