ORC2 - ORC2

ORC2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 5C8H
Идентификаторы
Псевдонимы	ORC2, ORC2L, субъединица 2 комплекса распознавания происхождения
Внешние идентификаторы	OMIM: 601182 MGI: 1328306 ГомолоГен: 4512 Генные карты: ORC2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2q33.1 Начните 200,908,977 бп[1] Конец 200,963,680 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 1 (мышь)[2] Группа 1 | 1 C1.3 Начните 58,462,771 бп[2] Конец 58,505,109 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание с ориджином репликации ДНК Сотовый компонент • гетерохроматин • конденсированная внутренняя кинетохора хромосомы • комплекс распознавания ядерной точки репликации • центросома • хроматин • комплекс распознавания происхождения • мембрана • ядерная хромосома, теломерная область • нуклеоплазма • ядро клетки Биологический процесс • Фаза G1 • Репликация ДНК • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • Инициирование репликации ДНК • G1 / S переход митотического клеточного цикла Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	4999	18393
Ансамбль	ENSG00000115942	ENSMUSG00000026037
UniProt	Q13416	Q60862
RefSeq (мРНК)	NM_006190	NM_001025378 NM_001271526 NM_008765
RefSeq (белок)	NP_006181	NP_001020549 NP_001258455 NP_032791
Расположение (UCSC)	Chr 2: 200.91 - 200.96 Мб	Chr 1: 58.46 - 58.51 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Субъединица 2 комплекса распознавания происхождения
Идентификаторы
Символ	ORC2
Pfam	PF04084
ИнтерПро	IPR007220
Доступные белковые структуры: Pfam   структуры / ECOD   PDB RCSB PDB; PDBe; PDBj PDBsum резюме структуры

Субъединица 2 комплекса распознавания происхождения это белок который закодирован ORC2 (ORC2L) ген в людях.^[5][6]

Функция

В комплекс распознавания происхождения (ORC) представляет собой высококонсервативный белковый комплекс из шести субъединиц, необходимый для инициации репликации ДНК в эукариотических клетках. Исследования на дрожжах показали, что ORC специфически связывается с источниками репликации и служит платформой для сборки дополнительных факторов инициации, таких как Cdc6 и белки Mcm. Белок, кодируемый этим геном, является субъединицей комплекса ORC. Этот белок образует основной комплекс с ORC3, ORC4, и ORC5. Он также взаимодействует с CDC45L и MCM10, которые, как известно, важны для инициации репликации ДНК. Было продемонстрировано, что этот белок специфически связывается с источником репликации вируса Эпштейна-Барра в клетках человека, и считается, что он необходим для репликации ДНК из вирусного ориджина репликации.^[6]

Взаимодействия

ORC2 был показан взаимодействовать с участием:

• CDC6,^[7][8]
• DBF4,^[7]
• MCM10,^[9]
• MCM2^[7]
• MCM4,^[7]
• MCM5,^[7]
• MCM6,^[7]
• MCM7,^[7]
• ORC1,^{[7][10][11][12]}
• ORC3,^{[7][11][13][14][15]}
• ORC4,^{[7][11][13][16]}
• ORC5,^{[7][11][13][17]}
• ORC6,^[7][11] и
• Белок репликации A1.^[7]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000115942 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026037 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Takahara K, Bong M, Brevard R, Eddy RL, Haley LL, Sait SJ, Shows TB, Hoffman GG, Greenspan DS (октябрь 1996 г.). «Мышиные и человеческие гомологи дрожжевого ориджина репликационного комплекса распознавания субъединицы ORC2 и хромосомная локализация родственного человеческого гена ORC2L». Геномика. 31 (1): 119–122. Дои:10.1006 / geno.1996.0018. PMID  8808289.
6. «Ген Entrez: комплекс распознавания происхождения ORC2L, субъединица 2-подобная (дрожжи)».
7. Kneissl M, Pütter V, Szalay AA, Grummt F (март 2003 г.). «Взаимодействие и сборка мышиных пререпликативных сложных белков в клетках дрожжей и мышей». J. Mol. Биол. 327 (1): 111–28. Дои:10.1016 / с0022-2836 (03) 00079-2. PMID  12614612.
8. Мендес Дж, Стиллман Б. (ноябрь 2000 г.). «Хроматиновая ассоциация комплекса распознавания человеческого происхождения, cdc6 и поддерживающих белков минихромосом во время клеточного цикла: сборка пререпликационных комплексов в позднем митозе». Мол. Cell. Биол. 20 (22): 8602–12. Дои:10.1128 / mcb.20.22.8602-8612.2000. ЧВК  102165. PMID  11046155.
9. Идзуми М., Янаги К., Мизуно Т., Йокои М., Кавасаки Ю., Мун К.Ю., Гурвиц Дж., Ятагай Ф., Ханаока Ф. (декабрь 2000 г.). «Человеческий гомолог Saccharomyces cerevisiae Mcm10 взаимодействует с факторами репликации и диссоциирует от ядерных структур, устойчивых к нуклеазам, в фазе G (2)». Нуклеиновые кислоты Res. 28 (23): 4769–77. Дои:10.1093 / nar / 28.23.4769. ЧВК  115166. PMID  11095689.
10. Fujita M, Ishimi Y, Nakamura H, Kiyono T., Tsurumi T. (март 2002 г.). «Ядерная организация белков инициации репликации ДНК в клетках млекопитающих». J. Biol. Chem. 277 (12): 10354–61. Дои:10.1074 / jbc.M111398200. PMID  11779870.
11. Vashee S, Simancek P, Challberg MD, Kelly TJ (июль 2001 г.). «Сборка комплекса распознавания происхождения человека». J. Biol. Chem. 276 (28): 26666–73. Дои:10.1074 / jbc.M102493200. PMID  11323433.
12. Мендес Дж., Зоу-Ян XH, Ким С.И., Хидака М., Танси В.П., Стиллман Б. (март 2002 г.). «Большая субъединица комплекса распознавания происхождения человека разрушается убиквитин-опосредованным протеолизом после инициации репликации ДНК». Мол. Ячейка. 9 (3): 481–91. Дои:10.1016 / с1097-2765 (02) 00467-7. PMID  11931757.
13. Дхар С.К., Дельмолино Л., Датта А. (август 2001 г.). «Архитектура комплекса распознавания происхождения человека». J. Biol. Chem. 276 (31): 29067–71. Дои:10.1074 / jbc.M103078200. PMID  11395502.
14. Мацуока С., Баллиф Б.А., Смогоржевска А., Макдональд Э.Р., Хуров К.Э., Луо Дж., Бакаларски К.Э., Чжао З., Солимини Н., Леренталь Ю., Шайло И., Гиги С.П., Элледж С.Дж. (май 2007 г.). «Анализ субстрата ATM и ATR выявляет обширные белковые сети, реагирующие на повреждение ДНК». Наука. 316 (5828): 1160–6. Дои:10.1126 / наука.1140321. PMID  17525332. S2CID  16648052.
15. Пинто С., Кинтана Д.Г., Смит П., Михалек Р.М., Хоу Ж.Х., Бойнтон С., Джонс С.Дж., Хендрикс М., Велинзон К., Вольшлегель Д.А., Остин Р.Дж., Лейн В.С., Талли Т., Датта А. (май 1999 г.). «latheo кодирует субъединицу исходного комплекса распознавания и нарушает пролиферацию нейронов и обонятельную память взрослых при мутанте». Нейрон. 23 (1): 45–54. Дои:10.1016 / s0896-6273 (00) 80752-7. PMID  10402192. S2CID  781511.
16. Quintana DG, Hou Zh, Thome KC, Hendricks M, Saha P, Dutta A (ноябрь 1997 г.). «Идентификация HsORC4, члена комплекса распознавания репликации человека». J. Biol. Chem. 272 (45): 28247–51. Дои:10.1074 / jbc.272.45.28247. PMID  9353276.
17. Quintana DG, Thome KC, Hou Zh, Ligon AH, Morton CC, Dutta A (октябрь 1998 г.). «ORC5L, новый член комплекса распознавания происхождения человека, удален при лейомиоме матки и злокачественных миелоидных заболеваниях». J. Biol. Chem. 273 (42): 27137–45. Дои:10.1074 / jbc.273.42.27137. PMID  9765232.

дальнейшее чтение

• Гэвин К.А., Хидака М., Стиллман Б. (1996). «Консервативные белки-инициаторы у эукариот». Наука. 270 (5242): 1667–1671. Дои:10.1126 / science.270.5242.1667. PMID  7502077. S2CID  43633493.
• Саха П., Томе К.С., Ямагути Р., Хоу З., Веремович С., Датта А. (1998). "Человеческий гомолог Saccharomyces cerevisiae CDC45". J. Biol. Chem. 273 (29): 18205–18209. Дои:10.1074 / jbc.273.29.18205. PMID  9660782.
• Ритци М., Баак М., Мусал С., Романовски П., Ласки Р.А., Книпперс Р. (1998). «Поддерживающие белки минихромосомы человека и белок комплекса 2 распознавания происхождения человека на хроматине». J. Biol. Chem. 273 (38): 24543–24549. Дои:10.1074 / jbc.273.38.24543. PMID  9733749.
• Пинто С., Кинтана Д. Г., Смит П., Михалек Р. М., Хоу Ж. Х., Бойнтон С., Джонс С. Дж., Хендрикс М., Велинзон К., Вольшлегель Д. А., Остин Р. Дж., Лейн В. С., Талли Т., Датта А. (1999). «latheo кодирует субъединицу исходного комплекса распознавания и нарушает пролиферацию нейронов и обонятельную память взрослых при мутанте». Нейрон. 23 (1): 45–54. Дои:10.1016 / S0896-6273 (00) 80752-7. PMID  10402192. S2CID  781511.
• Цзян В., Макдональд Д., Хоуп Т.Дж., Хантер Т. (1999). «Комплекс протеинкиназы Cdc7-Dbf4 млекопитающих необходим для инициации репликации ДНК». EMBO J. 18 (20): 5703–5713. Дои:10.1093 / emboj / 18.20.5703. ЧВК  1171637. PMID  10523313.
• Натале Д.А., Ли СиДжей, Сан WH, DePamphilis ML (2000). «Избирательная нестабильность белка Orc1 объясняет отсутствие комплексов распознавания функционального происхождения во время перехода M-G (1) у млекопитающих». EMBO J. 19 (11): 2728–2738. Дои:10.1093 / emboj / 19.11.2728. ЧВК  212765. PMID  10835370.
• Томе К.С., Дхар С.К., Кинтана Д.Г., Дельмолино Л., Шахсафаэй А., Датта А. (2001). «Подмножества субъединиц комплекса распознавания происхождения человека (ORC) экспрессируются в непролиферирующих клетках и связываются с белками, не являющимися ORC». J. Biol. Chem. 275 (45): 35233–35241. Дои:10.1074 / jbc.M005765200. PMID  10954718.
• Идзуми М., Янаги К., Мизуно Т., Йокои М., Кавасаки Ю., Мун К.Ю., Гурвиц Дж., Ятагай Ф., Ханаока Ф. (2001). «Человеческий гомолог Saccharomyces cerevisiae Mcm10 взаимодействует с факторами репликации и диссоциирует от ядерных структур, устойчивых к нуклеазам, в фазе G (2)». Нуклеиновые кислоты Res. 28 (23): 4769–4777. Дои:10.1093 / nar / 28.23.4769. ЧВК  115166. PMID  11095689.
• Vashee S, Simancek P, Challberg MD, Kelly TJ (2001). «Сборка комплекса распознавания происхождения человека». J. Biol. Chem. 276 (28): 26666–26673. Дои:10.1074 / jbc.M102493200. PMID  11323433.
• Дхар С.К., Дельмолино Л., Датта А. (2001). «Архитектура комплекса распознавания происхождения человека». J. Biol. Chem. 276 (31): 29067–29071. Дои:10.1074 / jbc.M103078200. PMID  11395502.
• Дхар С.К., Йошида К., Мачида Ю., Хайра П., Чаудхури Б., Вольшлегель Дж. А., Леффак М., Йейтс Дж., Датта А. (2001). «Репликация из oriP вируса Эпштейна-Барра требует ORC человека и ингибируется геминином». Ячейка. 106 (3): 287–296. Дои:10.1016 / S0092-8674 (01) 00458-5. PMID  11509178. S2CID  12479646.
• Идзуми М, Ятагай Ф, Ханаока Ф (2002). «Зависимый от клеточного цикла протеолиз и фосфорилирование Mcm10 человека». J. Biol. Chem. 276 (51): 48526–31. Дои:10.1074 / jbc.M107190200. PMID  11602595.
• Fujita M, Ishimi Y, Nakamura H, Kiyono T, Tsurumi T. (2002). «Ядерная организация белков инициации репликации ДНК в клетках млекопитающих». J. Biol. Chem. 277 (12): 10354–10361. Дои:10.1074 / jbc.M111398200. PMID  11779870.
• Schaarschmidt D, Ladenburger EM, Keller C, Knippers R (2002). "Белки Mcm человека в начале репликации во время фазового перехода G1 в S". Нуклеиновые кислоты Res. 30 (19): 4176–4185. Дои:10.1093 / нар / gkf532. ЧВК  140533. PMID  12364596.
• Matheos D, Ruiz MT, Price GB, Zannis-Hadjopoulos M (2002). «Ku-антиген, ориджин-специфический связывающий белок, который связывается с белками репликации, необходим для репликации ДНК млекопитающих». Биохим. Биофиз. Acta. 1578 (1–3): 59–72. Дои:10.1016 / S0167-4781 (02) 00497-9. PMID  12393188.
• Kneissl M, Pütter V, Szalay AA, Grummt F (2003). «Взаимодействие и сборка мышиных пререпликативных сложных белков в клетках дрожжей и мышей». J. Mol. Биол. 327 (1): 111–128. Дои:10.1016 / S0022-2836 (03) 00079-2. PMID  12614612.

внешние ссылки

• PDBe-KB предоставляет обзор всей структурной информации, доступной в PDB для субъединицы 2 комплекса распознавания происхождения человека (ORC2)