Экзосомный комплекс - Exosome complex

Не путать с Экзосома (везикула).

"Ленточный вид" экзосомного комплекса человека. PDB 2NN6 Увидеть легенда ниже. Канал, через который проходит РНК во время деградации, виден в центре белкового комплекса.

В экзосомальный комплекс (или же PM / Scl комплекс, часто просто называют экзосома) является мульти-белок внутриклеточный сложный способны разрушать различные типы РНК (рибонуклеиновая кислота) молекулы. Комплексы экзосом обнаружены в обоих эукариотический клетки и археи, пока в бактерии более простой комплекс, называемый деградосома выполняет аналогичные функции.

Ядро экзосомы содержит шестичленную кольцевую структуру, к которой присоединены другие белки. В эукариотических клетках экзосомный комплекс присутствует в цитоплазма, ядро, и особенно ядрышко, хотя различные белки взаимодействуют с экзосомным комплексом в этих компартментах, регулируя активность комплекса по деградации РНК до субстраты специфичны для этих клеточных компартментов. Субстраты экзосомы включают: информационная РНК, рибосомная РНК, и многие виды малые РНК. Экзосома выполняет экзорибонуклеолитическую функцию, что означает, что она разрушает РНК, начиная с одного конца ( 3 ′ конец в данном случае), а у эукариот также выполняет эндорибонуклеолитическую функцию, то есть расщепляет РНК на сайтах внутри молекулы.

Некоторые белки экзосомы являются мишенью для аутоантитела у пациентов со специфическими аутоиммунные заболевания (особенно Синдром перекрытия PM / Scl ) и немного антиметаболический химиотерапия за рак функции, блокируя активность экзосомы. Кроме того, мутации в компонент экзосомы 3 причина понтоцеребеллярная гипоплазия и спинной заболевание двигательного нейрона.

Открытие

Экзосома была впервые обнаружена как РНКаза в 1997 г. в зародышевых дрожжах Saccharomyces cerevisiae, часто используемый модельный организм.[1] Вскоре после этого, в 1999 году, стало ясно, что экзосома на самом деле является дрожжевым эквивалентом уже описанного комплекса в человеческих клетках, называемого PM / Scl комплекс, который был идентифицирован как аутоантиген у пациентов с определенными аутоиммунные заболевания годами ранее (см. ниже ).[2] Очистка этого «комплекса PM / Scl» позволила идентифицировать большее количество белков экзосом человека и в конечном итоге охарактеризовать все компоненты в комплексе.[3][4] В 2001 году рост количества данные генома то, что стало доступным, позволило предсказать белки экзосом у архей, хотя потребуется еще 2 года, прежде чем будет очищен первый комплекс экзосом из организма архей.[5][6]

Структура

Основные белки

Вид сверху и сбоку Кристальная структура комплекса экзосом человека. Посмотреть полный легенда ниже.

Ядро комплекса имеет кольцевую структуру, состоящую из шести белков, которые принадлежат к одному классу РНКаз, РНКаза PH -подобные белки.[7] В архее есть два разных PH-подобных белка (называемые Rrp41 и Rrp42), каждый из которых присутствует три раза в чередующемся порядке. Комплексы экзосом эукариот состоят из шести различных белков, образующих кольцевую структуру.[8][9] Из этих шести эукариотических белков три напоминают архейный белок Rrp41, а остальные три белка больше похожи на архейный белок Rrp42.[10]

Субъединицы и организация комплексов экзосом архей (слева) и эукариот (справа). Разные белки пронумерованы, что показывает, что экзосома архей содержит 4 разных белка, а экзосома эукариот - девять разных белков. Посмотреть полный легенда ниже.

На вершине этого кольца расположены три белка, у которых есть S1 Связывание РНК домен (RBD). Два белка дополнительно имеют K-гомология (KH) область.[7] У эукариот три разных белка «S1» связаны с кольцом, тогда как у архей один или два разных белка «S1» могут быть частью экзосомы (хотя к комплексу всегда присоединены три субъединицы S1).[11]

Эта кольцевая структура очень похожа на структуру белков. РНКаза PH и PNPase. У бактерий протеин РНКаза PH, которая участвует в тРНК процессинг образует гексамерное кольцо, состоящее из шести идентичных белков РНКазы PH.[12][13]В случае PNPase, которая представляет собой фосфоролитический белок, разрушающий РНК, обнаруженный в бактерии и хлоропласты и митохондрии У некоторых эукариотических организмов два домена PH РНКазы и оба домена связывания РНК S1 и KH являются частью одного белка, который образует тримерный комплекс, который принимает структуру, почти идентичную структуре экзосомы.[14] Из-за такого высокого сходства как в доменах, так и в структуре эти комплексы считаются эволюционно связаны и имеют общий предок.[15] РНКаза PH-подобные белки экзосомы, PNPase и RNase PH принадлежат к семейству РНКаз РНКазы PH и являются фосфоролитическими. экзорибонуклеазы, что означает, что они используют неорганический фосфат удалить нуклеотиды из 3 'конец из РНК молекулы.[7]

Связанные белки

Помимо этих девяти основных белков экзосом, два других белка часто ассоциируются с комплексом у эукариотических организмов. Одним из них является Rrp44, гидролитическая РНКаза, которая принадлежит к РНКаза R семейство гидролитических экзорибонуклеазы (нуклеазы, которые используют воду для расщепления нуклеотидных связей). Помимо того, что Rrp44 является экзорибонуклеолитическим ферментом, он также обладает эндорибонуклеолитической активностью, которая находится в отдельном домене белка.[16][17] В дрожжах Rrp44 связан с все комплексов экзосом и играет решающую роль в активности комплекса экзосом дрожжей.[18] Хотя человеческий гомолог этого белка существует, долгое время не было обнаружено доказательств того, что его человеческий гомолог был связан с комплексом экзосом человека.[7] В 2010 году, однако, было обнаружено, что у человека есть три гомолога Rrp44, и два из них могут быть связаны с комплексом экзосом. Эти два белка, скорее всего, разрушают разные РНК-субстраты из-за их разной клеточной локализации, причем один локализуется в цитоплазме (Dis3L1), а другой - в ядре (Dis3).[19][20]

«Ленточный вид» частичной структуры субъединицы экзосомы дрожжей Rrp6, 2hbj с α-спирали в красном и β-листы желтым.

Второй распространенный ассоциированный белок называется Rrp6 (в дрожжах) или PM / Scl-100 (в человеческом). Как и Rrp44, этот белок является гидролитической экзорибонуклеазой, но в данном случае РНКаза D семейство белков.[21] Белок PM / Scl-100 чаще всего является частью комплексов экзосом в ядре клеток, но также может образовывать часть комплекса цитоплазматических экзосом.[22]

Регуляторные белки

Помимо этих двух прочно связанных белковых субъединиц, многие белки взаимодействуют с экзосомным комплексом как в цитоплазме, так и в ядре клеток. Эти слабо связанные белки могут регулировать активность и специфичность комплекса экзосом. В цитоплазме экзосома взаимодействует с Богатый элемент AU (ARE) связывающие белки (например, KRSP и TTP), которые могут способствовать или предотвращать деградацию мРНК. Ядерная экзосома ассоциируется с РНК-связывающими белками (например, MPP6 / Mpp6 и C1D / Rrp47 у людей / дрожжей), которые необходимы для обработки определенных субстратов.[7]

Помимо отдельных белков, с экзосомой взаимодействуют другие белковые комплексы. Один из них - цитоплазматический Горнолыжный комплекс, который включает РНК геликаза (Ski2) и участвует в деградации мРНК.[23] В ядре процессинг рРНК и мяРНК экзосомой опосредуется ТРАМПОВЫЙ комплекс, который содержит как РНК-геликазу (Mtr4), так и полиаденилирование (Trf4) активность.[24]

Функция

Ферментативная функция

Диаграммы реакций гидролитической (слева) и фосфоролитической (справа) 3'-концевой деградации РНК.

Как указано выше, экзосомный комплекс содержит множество белков с рибонуклеазными доменами. Точная природа этих рибонуклеазных доменов изменилась в процессе эволюции от бактериальных к архейным и эукариотическим комплексам, поскольку различные активности были приобретены и утрачены. Экзосома в основном представляет собой 3'-5 ' экзорибонуклеаза, что означает, что он разрушает молекулы РНК из их 3 'конец. Экзорибонуклеазы, содержащиеся в комплексах экзосом, являются либо фосфоролитическими (белки, подобные РНКазе PH), либо, у эукариот, гидролитическими (белки домена РНКазы R и РНКазы D). Фосфоролитические ферменты используют неорганический фосфат для расщепления фосфодиэфирные связи - выпуск нуклеотиддифосфаты. Гидролитические ферменты используют воду для гидролизовать эти облигации - выпуск нуклеотидные монофосфаты.

У архей субъединица комплекса Rrp41 представляет собой фосфоролитическую экзорибонуклеазу. Три копии этого белка присутствуют в кольце и отвечают за активность комплекса.[9] У эукариот ни одна из субъединиц РНКазы PH не сохранила эту каталитическую активность, что означает, что структура ядра-кольца экзосомы человека не имеет ферментативно активного белка.[25] Несмотря на эту потерю каталитической активности, структура основной экзосомы очень консервативна от архей до человека, что позволяет предположить, что комплекс выполняет жизненно важную клеточную функцию. У эукариот отсутствие фосфоролитической активности компенсируется присутствием гидролитических ферментов, которые ответственны за рибонуклеазную активность экзосомы у таких организмов.[26][27][28]

Как указано выше, гидролитические белки Rrp6 и Rrp44 связаны с экзосомой у дрожжей и у человека, помимо Rrp6, два разных белка, Dis3 и Dis3L1, могут быть связаны в положении дрожжевого белка Rrp44.[19][20] Хотя первоначально считалось, что белки домена S1 обладают 3'-5'-гидролитической экзорибонуклеазной активностью, существование этой активности недавно было поставлено под сомнение, и эти белки могли играть лишь роль в связывании субстратов до их деградации комплексом.[26]

Схематическое изображение комплексов экзосом архей (слева) и эукариот (справа) с наиболее часто встречающимися ассоциированными белками. Звездочкой отмечены цветом субъединицы каждого комплекса, обладающие каталитической активностью. Видеть ниже для полной легенды.

Субстраты

Экзосома участвует в деградации и обработка из широкого разнообразия видов РНК. в цитоплазма ячеек, он участвует в обороте информационная РНК (мРНК) молекулы. Комплекс может разрушать молекулы мРНК, которые были помечены для деградации, потому что они содержат ошибки, через взаимодействия с белками из бессмысленный распад или же безостановочный распад пути. Альтернативным способом мРНК деградируют как часть их нормальный оборот. Несколько белков, которые стабилизируют или дестабилизируют молекулы мРНК за счет связывания с богатыми AU элементами в 3 'непереведенный регион мРНК взаимодействуют с экзосомным комплексом.[29][30][31] в ядро, экзосома необходима для правильной обработки нескольких малая ядерная Молекулы РНК.[32] Наконец, ядрышко это место, где находится большинство комплексов экзосом. Там он играет роль в обработке 5.8S рибосомная РНК (первая идентифицированная функция экзосомы) и нескольких малые ядрышковые РНК.[1][32][33]

Хотя в большинстве клеток есть другие ферменты, которые могут разлагать РНК, либо из 3' или из 5 'конец РНК экзосомный комплекс необходим для выживания клеток. Когда выражение белков экзосом искусственно снижается или останавливается, например, РНК-интерференция рост прекращается, и клетки в конечном итоге умирают. Оба основных белка комплекса экзосом, а также два основных ассоциированных белка являются важными белками.[34] Бактерии не имеют комплекса экзосом; однако аналогичные функции выполняет более простой комплекс, который включает белок PNPase, называется деградосома.[35]

Две основные субъединицы экзосомы архей (Rrp41 и Rrp42), связанные с небольшой молекулой РНК (показаны красным).

Экзосома - ключевой комплекс в контроле качества клеточной РНК. В отличие от прокариот, эукариоты обладают высокоактивными системами наблюдения за РНК, которые распознают необработанные и неправильно процессированные комплексы РНК-белок (например, рибосомы ) до их выхода из ядра. Предполагается, что эта система предотвращает вмешательство аберрантных комплексов в важные клеточные процессы, такие как синтез белка.[36]

Помимо процессинга, обмена и наблюдения РНК, экзосома важна для деградации так называемых загадочные нестабильные расшифровки (CUT), которые производятся из тысяч локусов в геноме дрожжей.[37][38] Важность этих нестабильных РНК и их деградация все еще неясны, но похожие виды РНК также были обнаружены в клетках человека.[39]

Болезнь

Аутоиммунитет

Экзосомный комплекс является целью аутоантитела у пациентов, страдающих различными аутоиммунные заболевания. Эти аутоантитела в основном обнаруживаются у людей, страдающих Синдром перекрытия PM / Scl, аутоиммунное заболевание, при котором у пациентов наблюдаются симптомы обоих склеродермия и либо полимиозит или же дерматомиозит.[40] Аутоантитела можно обнаружить в сыворотка пациентов с помощью различных анализов. В прошлом наиболее часто используемыми методами были двойная иммунодиффузия используя теленка вилочковая железа экстракты, иммунофлуоресценция на клетках HEp-2 или иммунопреципитация из экстрактов клеток человека. В анализах иммунопреципитации с сывороткой из антиэкзосом-положительной сыворотки осаждается особый набор белков. Еще за много лет до того, как был идентифицирован комплекс экзосом, этот паттерн был назван PM / Scl комплекс.[41] Иммунофлуоресценция с использованием сывороток этих пациентов обычно показывает типичное окрашивание ядрышко клеток, что вызвало предположение, что антиген, распознаваемый аутоантителами, может быть важным в рибосомах. синтез.[42] В последнее время, рекомбинантный белки экзосом стали доступны, и они были использованы для разработки линейных иммуноанализов (LIA) и иммуноферментные анализы (ELISA) для обнаружения этих антител.[7]

При этих заболеваниях антитела в основном направлены против двух белков комплекса, называемых PM / Scl-100 (белок, подобный РНКазе D) и PM / Scl-75 (один из РНКазных PH-подобных белков из кольца) и антитела, распознающие эти белки, обнаруживаются примерно у 30% пациентов с синдромом перекрытия PM / Scl.[43] Хотя эти два белка являются основной мишенью для аутоантител, другие субъединицы экзосом и ассоциированные белки (например, C1D) могут быть нацелены у этих пациентов.[44][45] В настоящее время наиболее чувствительным способом обнаружения этих антител является использование пептид, полученный из белка PM / Scl-100, в качестве антигена в ELISA, а не полноценные белки. С помощью этого метода аутоантитела обнаруживаются у 55% ​​пациентов с синдромом перекрытия PM / Scl, но они также могут быть обнаружены у пациентов, страдающих склеродермией, полимиозитом или дерматомиозитом.[46]

Поскольку аутотела обнаруживаются в основном у пациентов с характеристиками нескольких различных аутоиммунных заболеваний, клинические симптомы из этих пациентов могут широко варьироваться. Наиболее часто наблюдаемые симптомы являются типичными симптомами отдельных аутоиммунных заболеваний и включают: Феномен Рейно, артрит, миозит и склеродермия.[47] Лечение этих пациентов симптоматическое и аналогично лечению отдельного аутоиммунного заболевания, часто включающего либо иммунодепрессивный или иммуномодулирующие препараты.[48]

Лечение рака

Было показано, что экзосома ингибируется антиметаболит фторурацил, наркотик, используемый в химиотерапия из рак. Это один из самых успешных препаратов для лечения твердых опухоли. В дрожжевых клетках, обработанных фторурацилом, были обнаружены дефекты процессинга рибосомной РНК, идентичные тем, которые наблюдались, когда активность экзосомы блокировалась молекулярно-биологический стратегии. Отсутствие правильного процессинга рибосомной РНК смертельно для клеток, что объясняет антиметаболический эффект препарата.[49]

Неврологические расстройства

Мутации в компонент экзосомы 3 вызвать инфантильный спинномозговой заболевание двигательного нейрона, атрофия мозжечка, прогрессирующая микроцефалия и глубокая глобальная задержка развития, в соответствии с понтоцеребеллярная гипоплазия тип 1Б (PCH1B; MIM 614678 ).[50]

Список подразделений

ЛегендаОбщее названиеДоменыЧеловекДрожжи (С. cerevisiae)АрхеиМВт (кД)Человеческий генДрожжевой ген
1Csl4S1 RBDhCsl4Csl4p / Ski4pCsl421–32EXOSC1YNL232W
2Rrp4S1 / KH RBDhRrp4Rrp4pRrp428–39EXOSC2YHR069C
3Rrp40S1 / KH RBDhRrp40Rrp40p(Rrp4)А27–32EXOSC3YOL142W
4Rrp41РНКаза PHhRrp41Rrp41p / Ski6pRrp41C26–28EXOSC4YGR195W
5Rrp46РНКаза PHhRrp46Rrp46p(Rrp41)А,C25–28EXOSC5YGR095C
6Mtr3РНКаза PHhMtr3Mtr3p(Rrp41)А,C24–37EXOSC6YGR158C
7Rrp42РНКаза PHhRrp42Rrp42pRrp4229–32EXOSC7YDL111C
8Rrp43РНКаза PHOIP2Rrp43p(Rrp42)А30–44EXOSC8YCR035C
9Rrp45РНКаза PHPM / Scl-75Rrp45p(Rrp42)А34–49EXOSC9YDR280W
10Rrp6РНКаза DPM / Scl-100CRrp6pCн / д84–100EXOSC10YOR001W
11Rrp44РНКаза RDis3B,C

Dis3L1B,C

Rrp44p / Dis3pCн / д105–113DIS3

DIS3L1

YOL021C
  • А У архей несколько белков экзосом присутствуют во множестве копий, чтобы сформировать полное ядро ​​комплекса экзосом.
  • B У человека в этой позиции могут быть связаны два разных белка. В цитоплазме клеток Dis3L1 связан с экзосомой, тогда как в ядре Dis3 может связываться с основным комплексом.
  • C Способствует рибонуклеолитической активности комплекса.

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б Mitchell, P; Петфальски, Э; Шевченко, А; Манн, М; Толлервей, Д. (1997). «Экзосома: консервативный комплекс процессинга эукариотической РНК, содержащий несколько 3 '→ 5' экзорибонуклеаз». Клетка. 91 (4): 457–466. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80432-8. PMID  9390555. S2CID  16035676.
  2. ^ Allmang, C; Петфальски, Э; Подтелейников А; Манн, М; Толлервей, Д; Митчелл, П. (1999). «Экзосома дрожжей и человеческий PM-Scl представляют собой родственные комплексы 3 '-> 5' экзонуклеаз». Гены и развитие. 13 (16): 2148–58. Дои:10.1101 / gad.13.16.2148. ЧВК  316947. PMID  10465791.
  3. ^ Брауэр, Р. Allmang, C; Raijmakers, R; Ван Аарссен, Ю. Эгбертс, Западная Вирджиния; Петфальски, Э; Van Venrooij, WJ; Толлервей, Д; Pruijn, GJ (2001). «Три новых компонента экзосомы человека». Журнал биологической химии. 276 (9): 6177–84. Дои:10.1074 / jbc.M007603200. PMID  11110791.
  4. ^ Chen, CY; Gherzi, R; Онг, ЮВ; Чан, ЭЛ; Raijmakers, R; Pruijn, GJ; Stoecklin, G; Мороний, C; и другие. (2001). «Связывающие белки AU рекрутируют экзосому для разрушения мРНК, содержащих ARE». Клетка. 107 (4): 451–64. Дои:10.1016 / S0092-8674 (01) 00578-5. PMID  11719186. S2CID  14817671.
  5. ^ Кунин Э.В.; Wolf, YI; Аравинд, L (2001). «Прогнозирование экзосомы архей и ее связей с протеасомой и механизмами трансляции и транскрипции с помощью сравнительно-геномного подхода». Геномные исследования. 11 (2): 240–52. Дои:10.1101 / гр.162001. ЧВК  311015. PMID  11157787.
  6. ^ Евгеньева-Хакенберг, Э; Уолтер, П.; Hochleitner, E; Lottspeich, F; Клуг, Г. (2003). «Экзосомоподобный комплекс у Sulfolobus solfataricus». Отчеты EMBO. 4 (9): 889–93. Дои:10.1038 / sj.embor.embor929. ЧВК  1326366. PMID  12947419.
  7. ^ а б c d е ж Шильдерс, G; Ван Дейк, Э; Raijmakers, R; Pruijn, GJ (2006). Клеточная и молекулярная биология экзосомы: как создать или разрушить РНК. Международный обзор цитологии. 251. С. 159–208. Дои:10.1016 / S0074-7696 (06) 51005-8. ISBN  9780123646552. PMID  16939780.
  8. ^ Lorentzen, E; Уолтер, П.; Фрибург, S; Евгеньева-Хакенберг, Э; Klug, G; Конти, Э (2005). «Ядро экзосомы архей представляет собой гексамерную кольцевую структуру с тремя каталитическими субъединицами». Структурная и молекулярная биология природы. 12 (7): 575–81. Дои:10.1038 / nsmb952. PMID  15951817. S2CID  2003922.
  9. ^ а б Шен, В; Киледжиан, М. (2006). «Взгляд на убийство: структура экзосомы РНК». Клетка. 127 (6): 1093–5. Дои:10.1016 / j.cell.2006.11.035. ЧВК  1986773. PMID  17174886.
  10. ^ Raijmakers, R; Эгбертс, Западная Вирджиния; Van Venrooij, WJ; Pruijn, GJ (2002). «Белковые взаимодействия между компонентами экзосом человека поддерживают сборку субъединиц РНКазы PH в шестичленное кольцо, подобное PNPase». Журнал молекулярной биологии. 323 (4): 653–63. Дои:10.1016 / S0022-2836 (02) 00947-6. PMID  12419256.
  11. ^ Уолтер, П.; Klein, F; Lorentzen, E; Ilchmann, A; Klug, G; Евгеньева-Хакенберг, Э (2006). «Характеристика природных и восстановленных комплексов экзосом из гипертермофильных архей Sulfolobus solfataricus». Молекулярная микробиология. 62 (4): 1076–89. Дои:10.1111 / j.1365-2958.2006.05393.x. PMID  17078816. S2CID  27114625.
  12. ^ Ishii, R; Нуреки, О; Ёкояма, S (2003). «Кристаллическая структура фермента процессинга тРНК РНКазы PH из Aquifex aeolicus». Журнал биологической химии. 278 (34): 32397–404. Дои:10.1074 / jbc.M300639200. PMID  12746447.
  13. ^ Харлоу, LS; Кадзиола, А; Дженсен, KF; Ларсен, S (2004). «Кристаллическая структура фосфоролитической экзорибонуклеазы РНКазы PH из Bacillus subtilis и последствия для ее четвертичной структуры и связывания тРНК». Белковая наука. 13 (3): 668–77. Дои:10.1110 / пс. 03477004. ЧВК  2286726. PMID  14767080.
  14. ^ Симмонс, М.Ф .; Джонс, GH; Луизи, Б.Ф. (2000). «Дублированная складка является структурной основой каталитической активности, процессивности и регуляции полинуклеотидфосфорилазы». Структура. 8 (11): 1215–26. Дои:10.1016 / S0969-2126 (00) 00521-9. PMID  11080643.
  15. ^ Линь-Чао, S; Chiou, NT; Шустер, Г. (2007). «ПНФаза, экзосома и РНК-геликазы как строительные компоненты эволюционно консервативных машин деградации РНК». Журнал биомедицинских наук. 14 (4): 523–32. Дои:10.1007 / s11373-007-9178-у. PMID  17514363.
  16. ^ Лебретон, А; Томецки, Р; Дзембовский, А; Серафин, Б. (2008). «Эндонуклеолитическое расщепление РНК эукариотической экзосомой» (PDF). Природа. 456 (7224): 993–6. Bibcode:2008Натура.456..993л. Дои:10.1038 / природа07480. PMID  19060886. S2CID  1808371.
  17. ^ Шнайдер, К; Leung, E; Браун, Дж; Толлервей, D (2009). «N-концевой PIN-домен субъединицы экзосомы Rrp44 обладает эндонуклеазной активностью и связывает Rrp44 с основной экзосомой дрожжей». Исследования нуклеиновых кислот. 37 (4): 1127–40. Дои:10.1093 / нар / gkn1020. ЧВК  2651783. PMID  19129231.
  18. ^ Шнайдер, К; Андерсон, JT; Толлервей, Д. (2007). «Субъединица экзосомы Rrp44 играет непосредственную роль в распознавании субстрата РНК». Молекулярная клетка. 27 (2): 324–31. Дои:10.1016 / j.molcel.2007.06.006. PMID  17643380.
  19. ^ а б Staals, RH; Bronkhorst, AW; Шильдерс, G; Сломович, С; Шустер, G; Черт возьми, AJ; Raijmakers, R; Pruijn, GJ (2010). «Dis3-like 1: новая экзорибонуклеаза, связанная с экзосомой человека». Журнал EMBO. 29 (14): 2358–67. Дои:10.1038 / emboj.2010.122. ЧВК  2910272. PMID  20531389.
  20. ^ а б Томецки, Р; Кристиансен, MS; Lykke-Andersen, S; Хлебовски, А; Ларсен, КМ; Szczesny, RJ; Drazkowska, K; Пастула, А; и другие. (2010). «Экзосома ядра человека взаимодействует с дифференциально локализованными процессивными РНКазами: hDIS3 и hDIS3L». Журнал EMBO. 29 (14): 2342–57. Дои:10.1038 / emboj.2010.121. ЧВК  2910271. PMID  20531386.
  21. ^ Миан, IS (1997). «Сравнительный анализ последовательностей рибонуклеаз HII, III, II PH и D». Исследования нуклеиновых кислот. 25 (16): 3187–3195. Дои:10.1093 / nar / 25.16.3187. ЧВК  146874. PMID  9241229.
  22. ^ Raijmakers, R; Шильдерс, G; Pruijn, GJ (2004). «Экзосома, молекулярная машина для контролируемой деградации РНК как в ядре, так и в цитоплазме». Европейский журнал клеточной биологии. 83 (5): 175–83. Дои:10.1078/0171-9335-00385. PMID  15346807.
  23. ^ Ван, L; Льюис, MS; Джонсон, AW (2005). «Взаимодействие доменов в комплексе Ski2 / 3/8 и между лыжным комплексом и Ski7p». РНК. 11 (8): 1291–302. Дои:10.1261 / rna.2060405. ЧВК  1370812. PMID  16043509.
  24. ^ ЛаКава, Дж; Хаусли, Дж; Савяну, К; Петфальски, Э; Томпсон, Э; Жакье, А; Толлервей, Д. (2005). «Расщепление РНК экзосомой стимулируется ядерным комплексом полиаденилирования». Клетка. 121 (5): 713–24. Дои:10.1016 / j.cell.2005.04.029. PMID  15935758. S2CID  14898055.
  25. ^ Лю, Q; Greimann, JC; Лима, CD (2007). «Опечатка: восстановление, активность и структура экзосомы эукариотической РНК». Клетка. 131 (1): 188–189. Дои:10.1016 / j.cell.2007.09.019.
  26. ^ а б Дзембовский, А; Lorentzen, E; Conti, E; Серафин, Б. (2007). «Единственная субъединица, Dis3, по сути, отвечает за активность ядра экзосомы дрожжей». Структурная и молекулярная биология природы. 14 (1): 15–22. Дои:10.1038 / nsmb1184. PMID  17173052. S2CID  24691764.
  27. ^ Лю, Q; Greimann, JC; Лима, CD (2006). «Реконструкция, деятельность и структура экзосомы эукариотической РНК». Клетка. 127 (6): 1223–37. Дои:10.1016 / j.cell.2006.10.037. PMID  17174896. S2CID  62785677.
  28. ^ Lorentzen, E; Конти, Э (2005). «Структурная основа распознавания 3'-конца РНК и экзорибонуклеолитического расщепления ядром РНКазы PH экзосомы». Молекулярная клетка. 20 (3): 473–81. Дои:10.1016 / j.molcel.2005.10.020. PMID  16285928.
  29. ^ LeJeune, F; Ли, Х; Maquat, LE (2003). «Нонсенс-опосредованный распад мРНК в клетках млекопитающих включает декапирование, деаденилирование и экзонуклеолитическую активность». Молекулярная клетка. 12 (3): 675–87. Дои:10.1016 / S1097-2765 (03) 00349-6. PMID  14527413.
  30. ^ Уилсон, Массачусетс; Мо, S; Ван Хоф, А (2007). «Геномный скрининг дрожжей выявляет новые аспекты непрерывного метаболизма мРНК». Генетика. 177 (2): 773–84. Дои:10.1534 / генетика.107.073205. ЧВК  2034642. PMID  17660569.
  31. ^ Lin, WJ; Даффи, А; Чен, CY (2007). «Локализация мРНК, содержащей AU-богатые элементы, в цитоплазматических гранулах, содержащих субъединицы экзосомы». Журнал биологической химии. 282 (27): 19958–68. Дои:10.1074 / jbc.M702281200. PMID  17470429.
  32. ^ а б Allmang, C; Куфель, Дж; Chanfreau, G; Mitchell, P; Петфальски, Э; Толлервей, Д. (1999). «Функции экзосомы в синтезе рРНК, мяРНК и мяРНК». EMBO Журнал. 18 (19): 5399–410. Дои:10.1093 / emboj / 18.19.5399. ЧВК  1171609. PMID  10508172.
  33. ^ Шильдерс, G; Raijmakers, R; Raats, JM; Pruijn, GJ (2005). «MPP6 представляет собой связанный с экзосомами РНК-связывающий белок, участвующий в созревании 5.8S рРНК». Исследования нуклеиновых кислот. 33 (21): 6795–804. Дои:10.1093 / нар / gki982. ЧВК  1310903. PMID  16396833.
  34. ^ van Dijk, EL; Шильдерс, G; Pruijn, GJ (2007). «Для роста клеток человека требуется функциональная цитоплазматическая экзосома, которая участвует в различных путях распада мРНК». РНК. 13 (7): 1027–35. Дои:10.1261 / rna.575107. ЧВК  1894934. PMID  17545563.
  35. ^ Карпусис AJ, AJ (2002). «Деградосома РНК Escherichia coli: структура, функция и взаимосвязь в других рибонуклеолитических мультиферментных комплексах». Biochem. Soc. Транс. 30 (2): 150–5. Дои:10.1042 / BST0300150. PMID  12035760.
  36. ^ Хаусли Дж., ЛаКава Дж., Толлервей Д. (июль 2006 г.). «Контроль качества РНК экзосомой». Nat. Преподобный Мол. Cell Biol. 7 (7): 529–39. Дои:10.1038 / nrm1964. PMID  16829983. S2CID  22499032.
  37. ^ Wyers F, F; Rougemaille, M; Бадис, G; и другие. (Июнь 2005 г.). «Транскрипты Cryptic pol II деградируют с помощью пути контроля ядерного качества с участием новой поли (A) полимеразы». Клетка. 121 (5): 725–37. Дои:10.1016 / j.cell.2005.04.030. PMID  15935759. S2CID  1390706.
  38. ^ Нил Х., Малабат К., д'Обентон-Карафа Ю., Сюй З., Стейнмец Л. М., Жакье А. (февраль 2009 г.). «Широко распространенные двунаправленные промоторы являются основным источником криптических транскриптов в дрожжах». Природа. 457 (7232): 1038–42. Bibcode:2009Натура.457.1038N. Дои:10.1038 / природа07747. PMID  19169244. S2CID  4329373.
  39. ^ Preker P, P; Нильсен, Дж; Каммлер, S; и другие. (Декабрь 2008 г.). «Истощение экзосом РНК обнаруживает транскрипцию выше активных промоторов человека». Наука. 322 (5909): 1851–4. Bibcode:2008Научный ... 322.1851П. Дои:10.1126 / science.1164096. PMID  19056938.
  40. ^ Дж. Э. Поуп, Дж. Э. (2002). «Синдромы перекрытия склеродермии». Текущее мнение в ревматологии. 14 (6): 704–10. Дои:10.1097/00002281-200211000-00013. PMID  12410095.
  41. ^ Гелпи, С; Альгуэро, А; Анхелес Мартинес, М; Видаль, S; Хуарес, К; Родригес-Санчес, JL (1991). «Идентификация белковых компонентов, реактивных с аутоантителами против PM / Scl». Клиническая и экспериментальная иммунология. 81 (1): 59–64. Дои:10.1111 / j.1365-2249.1990.tb05291.x. ЧВК  1535032. PMID  2199097.
  42. ^ Таргофф, Индиана; Райхлин, М. (1985). «Ядрышковая локализация антигена PM-Scl». Артрит и ревматизм. 28 (2): 226–30. Дои:10.1002 / арт.1780280221. PMID  3918546.
  43. ^ Raijmakers, R; Ренц, М; Wiemann, C; Эгбертс, Западная Вирджиния; Силиг, HP; Van Venrooij, WJ; Pruijn, GJ (2004). «PM-Scl-75 является основным аутоантигеном у пациентов с синдромом перекрытия полимиозита / склеродермии». Артрит и ревматизм. 50 (2): 565–9. Дои:10.1002 / арт.20056. PMID  14872500.
  44. ^ Брауэр, Р. Ври Эгбертс, WT; Hengstman, GJ; Raijmakers, R; Van Engelen, BG; Силиг, HP; Ренц, М; Mierau, R; и другие. (2002). «Аутоантитела, направленные к новым компонентам комплекса PM / Scl, экзосомы человека». Исследования и лечение артрита. 4 (2): 134–8. Дои:10.1186 / ar389. ЧВК  83843. PMID  11879549.
  45. ^ Шильдерс, G; Эгбертс, Западная Вирджиния; Raijmakers, R; Pruijn, GJ (2007). «C1D является основной мишенью для аутоантител у пациентов с синдромом перекрытия полимиозита и склеродермии». Артрит и ревматизм. 56 (7): 2449–54. Дои:10.1002 / арт.22710. PMID  17599775.
  46. ^ Mahler, M; Raijmakers, R; Dähnrich, C; Blüthner, M; Фрицлер, MJ (2005). «Клиническая оценка аутоантител к новому пептидному антигену PM / Scl». Исследования и лечение артрита. 7 (3): R704–13. Дои:10.1186 / ar1729. ЧВК  1174964. PMID  15899056.
  47. ^ Mahler, M; Райджмейкерс, Р. (2007). «Новые аспекты аутоантител к комплексу PM / Scl: клинические, генетические и диагностические выводы». Отзывы об аутоиммунности. 6 (7): 432–7. Дои:10.1016 / j.autrev.2007.01.013. PMID  17643929.
  48. ^ Яблонская, S; Блащик, М. (1998). «Склеромиозит: синдром перекрытия склеродермии / полимиозита». Клиническая ревматология. 17 (6): 465–7. Дои:10.1007 / BF01451281. PMID  9890673. S2CID  39237322.
  49. ^ Lum, PY; Броня, CD; Степанянц СБ; Кавет, G; Вольф, МК; Батлер, JS; Hinshaw, JC; Гарнье, П; и другие. (2004). «Обнаружение способов действия терапевтических соединений с использованием полногеномного скрининга гетерозигот дрожжей». Клетка. 116 (1): 121–37. Дои:10.1016 / S0092-8674 (03) 01035-3. PMID  14718172. S2CID  11922219.
  50. ^ Wan, J .; Yourshaw, M .; Mamsa, H .; Rudnik-Schöneborn, S .; Menezes, M. P .; Hong, J. E .; Leong, D. W .; Senderek, J .; Салман, М. С .; Chitayat, D .; Seeman, P .; Von Moers, A .; Graul-Neumann, L .; Корнберг, А. Дж .; Castro-Gago, M .; Собридо, М. А. Дж. С .; Sanefuji, M .; Shieh, P. B .; Salamon, N .; Kim, R.C .; Винтерс, Х. В .; Chen, Z .; Зеррес, К .; Райан, М. М .; Nelson, S. F .; Джен, Дж. К. (2012). «Мутации в гене компонента экзосомы РНК EXOSC3 вызывают понтоцеребеллярную гипоплазию и дегенерацию спинномозговых мотонейронов». Природа Генетика. 44 (6): 704–708. Дои:10,1038 / нг.2254. ЧВК  3366034. PMID  22544365.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка