Компонент экзосомы 4 - Exosome component 4

EXOSC4
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2NN6
Идентификаторы
Псевдонимы	EXOSC4, RRP41, RRP41A, Rrp41p, SKI6, Ski6p, hRrp41p, p12A, компонент экзосомы 4
Внешние идентификаторы	OMIM: 606491 MGI: 1923576 ГомолоГен: 6017 Генные карты: EXOSC4
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 8 (человек)[1] Группа 8q24.3 Начните 144,078,648 бп[1] Конец 144,080,648 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 15 (мышь)[2] Группа 15 | 15 D3 Начните 76,327,397 бп[2] Конец 76,330,677 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • активность экзорибонуклеазы • Привязка элементов AU-rich • 3'-5'-экзорибонуклеазная активность • Связывание РНК • Связывание мРНК 3'-UTR AU-богатой области Сотовый компонент • цитоплазматическая экзосома (комплекс РНКазы) • транскрипционно активный хроматин • ядерная экзосома (РНКазный комплекс) • цитоплазма • экзосома (комплекс РНКазы) • ядрышко • ядро клетки • нуклеоплазма • цитозоль • цитоскелет промежуточных филаментов Биологический процесс • защитный ответ на вирус • рРНК 3'-конец процессинга • катаболический процесс рРНК • зависимый от полиаденилирования процессинг 3'-конца snoRNA • 3'-конец процессинга мяРНК U4 • ядерно-транскрибируемая мРНК, катаболический процесс, экзонуклеолитический, 3'-5 ' • положительное регулирование роста клеток • ядерно-транскрибируемый катаболический процесс мРНК • Дезаминирование ДНК • созревание 5.8S рРНК • регуляция стабильности мРНК • наблюдение за ядерной мРНК • экзонуклеолитическая транскрибируемая ядерной мРНК катаболический процесс, вовлеченный в зависимый от деаденилирования распад • катаболический процесс мРНК гистонов • обработка рРНК • Гидролиз фосфодиэфирной связи РНК, экзонуклеолитический Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	54512	109075
Ансамбль	ENSG00000178896	ENSMUSG00000034259
UniProt	Q9NPD3	Q921I9
RefSeq (мРНК)	NM_019037	NM_175399
RefSeq (белок)	NP_061910	NP_780608
Расположение (UCSC)	Chr 8: 144.08 - 144.08 Мб	Chr 15: 76.33 - 76.33 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Компонент экзосомы 4, также известен как EXOSC4, это человек ген, который является частью экзосомальный комплекс.^[5]

Взаимодействия

Было показано, что компонент экзосомы 4 взаимодействовать с Компонент экзосомы 2.^[6]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000178896 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000034259 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Энтрез Ген: экзосомный компонент 4 EXOSC4».
6. Райджмакерс Р., Эгбертс В.В., ван Венроой В.Дж., Пруейн Г.Дж. (2002). «Белковые взаимодействия между компонентами экзосом человека поддерживают сборку субъединиц РНКазы PH в шестичленное кольцо, подобное PNPase». J. Mol. Биол. 323 (4): 653–63. Дои:10.1016 / S0022-2836 (02) 00947-6. PMID  12419256.

дальнейшее чтение

• Аллманг Ч., Петфальски Э., Подтелейников А. и др. (1999). «Экзосома дрожжей и человеческий PM-Scl представляют собой родственные комплексы 3 '-> 5' экзонуклеаз». Genes Dev. 13 (16): 2148–58. Дои:10.1101 / gad.13.16.2148. ЧВК  316947. PMID  10465791.
• Брауэр Р., Аллманг С., Райджмейкерс Р. и др. (2001). «Три новых компонента экзосомы человека». J. Biol. Chem. 276 (9): 6177–84. Дои:10.1074 / jbc.M007603200. PMID  11110791.
• Chen CY, Gherzi R, Ong SE и др. (2002). «Связывающие белки AU рекрутируют экзосому для разрушения мРНК, содержащих ARE». Ячейка. 107 (4): 451–64. Дои:10.1016 / S0092-8674 (01) 00578-5. PMID  11719186. S2CID  14817671.
• Андерсен Дж. С., Лион CE, Фокс А. Х. и др. (2002). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека». Curr. Биол. 12 (1): 1–11. Дои:10.1016 / S0960-9822 (01) 00650-9. PMID  11790298. S2CID  14132033.
• Райджмейкерс Р., Нордман Ю.Е., ван Венройдж В.Дж., Пруейн Г.Дж. (2002). «Белок-белковые взаимодействия hCsl4p с другими субъединицами экзосом человека». J. Mol. Биол. 315 (4): 809–18. Дои:10.1006 / jmbi.2001.5265. PMID  11812149.
• Брауэр Р., Ври Эгбертс В. Т., Хенгстман Г. Дж. И др. (2002). «Аутоантитела, направленные к новым компонентам комплекса PM / Scl, экзосомы человека». Артрит Res. 4 (2): 134–8. Дои:10.1186 / ar389. ЧВК  83843. PMID  11879549.
• Райджмакерс Р., Эгбертс В.В., ван Венроой В.Дж., Пруейн Г.Дж. (2002). «Белковые взаимодействия между компонентами экзосом человека поддерживают сборку субъединиц РНКазы PH в шестичленное кольцо, подобное PNPase». J. Mol. Биол. 323 (4): 653–63. Дои:10.1016 / S0022-2836 (02) 00947-6. PMID  12419256.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Райджмакерс Р., Эгбертс В.В., ван Венройдж В.Дж., Пруейн Г.Дж. (2003). «Ассоциация человеческого аутоантигена PM / Scl-75 с экзосомой зависит от недавно идентифицированного N-конца». J. Biol. Chem. 278 (33): 30698–704. Дои:10.1074 / jbc.M302488200. PMID  12788944.
• Lejeune F, Li X, Maquat LE (2003). «Нонсенс-опосредованный распад мРНК в клетках млекопитающих включает декапирование, деаденилирование и экзонуклеолитическую активность». Мол. Ячейка. 12 (3): 675–87. Дои:10.1016 / S1097-2765 (03) 00349-6. PMID  14527413.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Ленер Б, Сандерсон CM (2004). «Структура взаимодействия белков для деградации мРНК человека». Genome Res. 14 (7): 1315–23. Дои:10.1101 / gr.2122004. ЧВК  442147. PMID  15231747.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Андерсен Дж. С., Лам Ю. В., Леунг А. К. и др. (2005). «Динамика нуклеолярного протеома». Природа. 433 (7021): 77–83. Дои:10.1038 / природа03207. PMID  15635413. S2CID  4344740.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• О Дж. Х., Ян Дж., Хан И и др. (2006). «Транскриптомный анализ рака желудка человека». Мамм. Геном. 16 (12): 942–54. Дои:10.1007 / s00335-005-0075-2. PMID  16341674. S2CID  69278.
• ван Дейк Э.Л., Шильдерс Г, Пруейн ГДж (2007). «Для роста клеток человека требуется функциональная цитоплазматическая экзосома, которая участвует в различных путях распада мРНК». РНК. 13 (7): 1027–35. Дои:10.1261 / rna.575107. ЧВК  1894934. PMID  17545563.