Компонент экзосомы 9 - Exosome component 9

EXOSC9
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2NN6
Идентификаторы
Псевдонимы	EXOSC9, PM / Scl-75, PMSCL1, RRP45, Rrp45p, p5, p6, компонент экзосомы 9, PCH1D
Внешние идентификаторы	OMIM: 606180 MGI: 1355319 ГомолоГен: 3693 Генные карты: EXOSC9
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 4 (человек)[1] Группа 4q27 Начните 121,801,317 бп[1] Конец 121,817,021 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 3 (мышь)[2] Группа 3 | 3 млрд Начните 36,552,606 бп[2] Конец 36,565,727 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • 3'-5'-экзорибонуклеазная активность • активность экзорибонуклеазы • Привязка элементов AU-rich • GO: 0001948 связывание с белками • РНК-полимераза II, активирующая связывание фактора транскрипции • Связывание РНК • Связывание мРНК 3'-UTR AU-богатой области Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • экзосома (комплекс РНКазы) • ядерная экзосома (РНКазный комплекс) • ядерная хромосома • ядрышко • внеклеточная экзосома • ядро клетки • нуклеоплазма • цитоплазматическая экзосома (комплекс РНКазы) Биологический процесс • Обработка РНК • регуляция стабильности мРНК • зависимый от ядерного полиаденилирования катаболический процесс рРНК • ядерно-транскрибируемый катаболический процесс мРНК • положительное регулирование роста клеток • наблюдение за ядерной мРНК • иммунная реакция • экзонуклеолитическая транскрибируемая ядерной мРНК катаболический процесс, вовлеченный в зависимый от деаденилирования распад • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • обработка рРНК • экзонуклеолитическая обрезка для получения зрелого 3'-конца 5.8S рРНК из трицистронного транскрипта рРНК (SSU-рРНК, 5.8S рРНК, LSU-рРНК) • ядерно-транскрибируемая мРНК, катаболический процесс, экзонуклеолитический, 3'-5 ' • 3'-конец процессинга мяРНК U1 • 3'-конец процессинга мяРНК U4 • Процессинг 3'-конца мяРНК U5 • зависимый от ядерного полиаденилирования катаболический процесс тРНК • зависимый от ядерного полиаденилирования катаболический процесс мРНК • катаболический процесс рРНК Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	5393	50911
Ансамбль	ENSG00000123737	ENSMUSG00000027714
UniProt	Q06265	Q9JHI7
RefSeq (мРНК)	NM_001034194 NM_005033	NM_019393
RefSeq (белок)	NP_001029366 NP_005024	NP_062266
Расположение (UCSC)	Chr 4: 121,8 - 121,82 Мб	Chr 3: 36,55 - 36,57 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Компонент экзосомы 9, также известен как EXOSC9, это человек ген, белковый продукт которого входит в состав экзосомальный комплекс и является аутоантигеном у пациентов с определенными аутоиммунными заболеваниями, в первую очередь склеромиозит.^[5]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000123737 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000027714 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Энтрез Ген: экзосомный компонент 9 EXOSC9».

дальнейшее чтение

• Альдеруччо Ф, Чан Э.К., Тан Э.М. (1991). «Молекулярная характеристика аутоантигена PM-Scl при синдроме перекрытия полимиозита / склеродермии: уникальная и полная человеческая кДНК, кодирующая кажущийся кислый белок 75 кДа ядрышкового комплекса». J. Exp. Med. 173 (4): 941–52. Дои:10.1084 / jem.173.4.941. ЧВК  2190817. PMID  2007859.
• Аллманг Ч., Петфальски Э., Подтелейников А. и др. (1999). «Экзосома дрожжей и человеческий PM-Scl представляют собой родственные комплексы 3 '→ 5' экзонуклеаз». Genes Dev. 13 (16): 2148–58. Дои:10.1101 / gad.13.16.2148. ЧВК  316947. PMID  10465791.
• Брауэр Р., Аллманг С., Райджмейкерс Р. и др. (2001). «Три новых компонента экзосомы человека». J. Biol. Chem. 276 (9): 6177–84. Дои:10.1074 / jbc.M007603200. PMID  11110791.
• Chen CY, Gherzi R, Ong SE и др. (2002). «Связывающие белки AU рекрутируют экзосому для разрушения мРНК, содержащих ARE». Ячейка. 107 (4): 451–64. Дои:10.1016 / S0092-8674 (01) 00578-5. PMID  11719186. S2CID  14817671.
• Мукерджи Д., Гао М., О'Коннор Дж. П. и др. (2002). «Экзосома млекопитающих опосредует эффективную деградацию мРНК, которые содержат элементы, богатые AU». EMBO J. 21 (1–2): 165–74. Дои:10.1093 / emboj / 21.1.165. ЧВК  125812. PMID  11782436.
• Райджмейкерс Р., Нордман Ю.Е., ван Венройдж В.Дж., Пруейн Г.Дж. (2002). «Белок-белковые взаимодействия hCsl4p с другими субъединицами экзосом человека». J. Mol. Биол. 315 (4): 809–18. Дои:10.1006 / jmbi.2001.5265. PMID  11812149.
• Брауэр Р., Ври Эгбертс В. Т., Хенгстман Г. Дж. И др. (2002). «Аутоантитела, направленные к новым компонентам комплекса PM / Scl, экзосомы человека». Артрит Res. 4 (2): 134–8. Дои:10.1186 / ar389. ЧВК  83843. PMID  11879549.
• Райджмакерс Р., Эгбертс В.В., ван Венроой В.Дж., Пруейн Г.Дж. (2002). «Белковые взаимодействия между компонентами экзосом человека поддерживают сборку субъединиц РНКазы PH в шестичленное кольцо, подобное PNPase». J. Mol. Биол. 323 (4): 653–63. Дои:10.1016 / S0022-2836 (02) 00947-6. PMID  12419256.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Райджмакерс Р., Эгбертс В.В., ван Венройдж В.Дж., Пруейн Г.Дж. (2003). «Ассоциация человеческого аутоантигена PM / Scl-75 с экзосомой зависит от недавно идентифицированного N-конца». J. Biol. Chem. 278 (33): 30698–704. Дои:10.1074 / jbc.M302488200. PMID  12788944.
• Ленер Б., Семпл Дж. И., Браун С. Е. и др. (2004). «Анализ высокопроизводительной двугибридной дрожжевой системы и ее использование для прогнозирования функции внутриклеточных белков, кодируемых в области III класса MHC человека». Геномика. 83 (1): 153–67. Дои:10.1016 / S0888-7543 (03) 00235-0. PMID  14667819.
• Райджмейкерс Р., Ренц М., Виманн С. и др. (2004). «PM-Scl-75 является основным аутоантигеном у пациентов с синдромом перекрытия полимиозита / склеродермии». Ревматоидный артрит. 50 (2): 565–9. Дои:10.1002 / арт.20056. PMID  14872500.
• Ленер Б, Сандерсон CM (2004). «Структура взаимодействия белков для деградации мРНК человека». Genome Res. 14 (7): 1315–23. Дои:10.1101 / gr.2122004. ЧВК  442147. PMID  15231747.
• Андерсен Дж. С., Лам Ю. В., Леунг А. К. и др. (2005). «Динамика нуклеолярного протеома». Природа. 433 (7021): 77–83. Дои:10.1038 / природа03207. PMID  15635413. S2CID  4344740.
• Цанг Х. Т., Коннелл Дж. У., Браун С. Е. и др. (2006). «Систематический анализ человеческих взаимодействий с белками CHMP: дополнительные белки, содержащие домен MIT, связываются с множеством компонентов человеческого комплекса ESCRT III». Геномика. 88 (3): 333–46. Дои:10.1016 / j.ygeno.2006.04.003. PMID  16730941.
• Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Ячейка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.
• ван Дейк Э.Л., Шильдерс Г, Пруейн ГДж (2007). «Для роста клеток человека требуется функциональная цитоплазматическая экзосома, которая участвует в различных путях распада мРНК». РНК. 13 (7): 1027–35. Дои:10.1261 / rna.575107. ЧВК  1894934. PMID  17545563.